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生物药学通报 45(1): 19-26 (2022)
随着结构生物学和数据挖掘的发展，计算机辅助药物设计（CADD）在新药研发的各个环节中发挥着重要作用。反向对接是一种基于CADD中分子对接的虚拟筛选方法，因其能够寻找能够与给定配体分子结合的大分子靶标，被广泛应用于药物重新定位、药物拯救和中药研究中。本文揭示了反向对接的原理，总结了常见的靶标蛋白数据库和对接步骤，并列举了反向对接在药物重新定位、药物不良反应、中药和2019冠状病毒病（COVID-19）治疗中的应用。希望我们的工作能给从事药物开发的研究人员一些启发。
DFW 国际机场 2015 年设计标准手册 - 第 2 版
航空公司搬迁标识要求 机场图像元素 CADD 标准手册 CADD 标准详图单元库 建筑和防火标准 规范的解决和修订 创始人广场中心开发标准 DFW 机场航站楼开发计划 DFW 道路标识协议标准 DFW 天然气勘探筛选标准 国际商务园区租赁开发标准 建筑物测量标准 办公空间标准 租车设计标准手册 南门广场开发标准 标识手册第 1 卷 - 航站楼 标识手册第 2 卷 - 路边标识手册第 3 卷 - 停车标识手册第 4 卷 - 道路地面交通走廊标准 TRIP 相关项目、A、B、C 和 E 航站楼租户设计手册 非 TRIP 相关项目、A、B、C 和 E 航站楼租户设计手册 D 航站楼租户设计手册 厕所标准
达拉斯沃斯堡国际机场 2015 年设计标准手册 - 修订版 2
航空公司搬迁标识要求 机场图像元素 CADD 标准手册 CADD 标准详图单元库 建筑和防火标准 法规决议和修订 创始人广场中心开发标准 DFW 机场航站楼开发计划 DFW 道路标识协议标准 DFW 天然气勘探筛选标准 国际商务园区租赁开发标准 建筑物测量标准 办公空间标准 租车设计标准手册 南门广场开发标准 标识手册第 1 卷 - 航站楼 标识手册第 2 卷 - 路边标识手册第 3 卷 - 停车标识手册第 4 卷 - 道路地面交通走廊标准 TRIP 相关项目租户设计手册，A、B、C 和 E 航站楼 非 TRIP 相关项目租户设计手册，A、B、C 和 E 航站楼 D 航站楼租户设计手册 厕所标准
虚拟设计和施工要求 - 港务局
本虚拟设计和施工 (VDC) 要求介绍了支持纽约和新泽西港务局 (“港务局”) 实施建筑信息模型 (BIM) 和计算机辅助设计和绘图 (CADD) 的信息、管理和技术规范。港务局的要求适用于项目的整个生命周期，从概念设计到施工、收尾和运营。
计算机辅助药物设计综述
药物设计、发现和评价中的计算方法。一般来说，药物发现需要很长的时间（约 12 年）和数十亿美元的资金。它包括创建新分子、将分子对接至靶蛋白、分析分子相互作用、估计结合强度和药物特性。计算机辅助药物设计 (CADD) 具有成本效益，并且无需进行一些生物学试验。它主要包括两种类型的药物设计，即基于结构的药物设计和基于配体的药物设计。通过它，我们可以了解药物受体相互作用。基于结构的药物设计包括结合位点识别、对接和储存、虚拟筛选、化合物选择、先导优化。基于配体的药物设计包括定量结构活性关系、药理学建模和基于结构的药物设计所遵循的步骤。我们可以看到，CADD 有助于识别药物的合适特性及其兼容性，从而轻松进行临床前试验。
通过计算机辅助药物设计开发新型 Lin28 抑制剂
Lin28 是癌症干细胞基因网络的关键调节因子，可促进各种肿瘤的治疗耐药性肿瘤进展。然而，目前还没有一种 Lin28 抑制剂被批准用于治疗癌症患者，这促使人们探索新型化合物作为临床试验的候选药物。在本文中，我们将计算机辅助药物设计 (CADD) 与定量生化和生物测定相结合。这些努力导致发现 Ln268 是一种候选药物，它可以阻止 Lin28 与其 RNA 底物结合并抑制 Lin28 活性。Ln268 抑制了 Lin28 介导的癌细胞增殖和球体生长。核磁共振波谱的结果证实，Ln268 扰乱了 Lin28 锌指结构域的构象，验证了 CADD 的合理药物设计。Ln268 的抑制作用依赖于癌细胞中 Lin28 蛋白的表达，突显了 Ln268 有限的脱靶效应。此外，Ln268 可与多种化疗药物协同抑制肿瘤细胞生长。总之，Ln268 是针对 Lin28 的有希望的候选药物，值得进一步研究用于癌症治疗。
计算机辅助药物设计
Student¹，助理教授，校长1。摘要：医学设计，发现和钦佩的计算方法。一般而言，医学发现大约需要12次和比隆的资本时间。它包括创建新的动作，将靶向蛋白质靶向，分析分子贸易，估计结合强度和药品包裹。计算机支持的药物设计（CADD）具有成本效益，并且没有一些自然试验。结构接地医学设计（SBDD）和配体接地医学设计（LBDD）是计算机支持的医学设计（CADD）方法的两种类型。sbdd样式剖析了大分子靶标3维结构信息（通常是蛋白质或RNA），以识别至关重要的斑点和关系，这些斑点和关系对于它们的独立自然功能很重要。LBDD样式集中在已知的抗生素配体上，以建立其生理化学包裹与抗生素条件之间的关系，这些抗生素与抗生素条件相关的抗生素调节是一种结构 - 劳存关系（SAR），可用于优化已知药物或指导新药物与高级劳动的设计的信息。关键字：计算机辅助药物设计，Inimilico设计，配体，药物发现3.介绍：几个抗生素胶囊可用，机械使用的杏仁时间比其他最大胶囊的时间更长，人类与环绕的微型有机体对感染的斗争是正在进行的，并且可能正在进行中，并且可能是为了供您使用。为此做出贡献是抗生素耐药性的一致上推力，导致需要品牌打屁股的新抗生素（1,2）.closer来设计最近的抗生素，计算机辅助药物布局（CADD）可以与湿行战略相结合，以阐明湿lab策略以阐明耐药的目标，以搜索新的目标，并搜索新的小说和新的小说。解决抗生素耐药性问题的重要机会是确定最近的抗生素目标，该目标构成了对细菌生存至关重要的新型机制。作为一个实例，研究人员的生物信息学策略在计算上显示了许多数据库，并认识到7种参与细菌代谢途径的酶，除了在麦膜上放置在膜上的15种非同顺型蛋白质外，在gram nice细菌中，葡萄球菌（SA），这表明它们是潜在的目的。这种发现也可能有助于克服这种细菌常见抗生素的抗性，例如甲氧西林，氟喹诺酮类和黄唑烷酮。如今，诊断为新型抗生素靶标的A的一个例子是蛋白质血红素氧酶，与细菌的血红素代谢有关，以吸引铁。已有效地应用了CADD技术，以发现铜绿假单胞菌和奈瑟氏菌脑膜化肽的细菌血红素氧酶的抑制剂，从而使血红素氧酶作为抗菌对象的潜在位置（4,5）。
药物设计和发现的方法karyn ...
一般而言，抽象的药物发现需要高昂的成本，尤其是很长的时间，大约为11 - 16年。这是因为药物开发必须经过一系列完整的研究过程才能获得全面的数据。然而，根据社区对优质药物的可用性的需求，具有良好的功效和安全性，使用计算系统的药物开发技术的开发。这符合各个学科之间的科学和协作的发展。可用于计算药物发现的方法包括基于结构的药物设计和基于配体的药物设计，这些药物被证明可以加速并增加寻找新药的可能性。本文旨在概述几种用于药物发现开发的方法，尤其是计算的好处。数据是从28个主要发表期刊和28种支持文献中收集的。本文讨论了两种计算方法，尤其是从应用程序方面，预计在药物发现和开发领域将在时间和成本方面更有效。传统的新药物开发方法大约需要11 - 16年，但是使用计算方法可以将药物发现阶段缩短到9 - 13年。关键字：药物发现，基于配体的CADD，基于结构的CADD
将量子计算纳入药物设计工作流程的见解
尽管许多量子计算 (QC) 方法都有望在理论上优于传统方法，但量子硬件仍然有限。因此，在计算机辅助药物设计 (CADD) 中利用近期 QC 需要明智地划分经典计算和量子计算。我们提出了 HypaCADD，这是一种混合经典量子工作流程，用于寻找与蛋白质结合的配体，同时考虑基因突变。我们明确确定了我们药物设计工作流程中目前可以通过 QC 替换的模块：非直观地，我们将突变影响预测因子确定为最佳候选者。因此，HypaCADD 将经典对接和分子动力学与量子机器学习 (QML) 相结合，以推断突变的影响。我们以 SARS-CoV-2 蛋白酶和相关突变体为例进行了案例研究。我们使用由量子比特旋转门构建的神经网络将经典机器学习模块映射到 QC 上。我们已经在模拟和两台商用量子计算机上实现了这一点。我们发现 QML 模型的性能可以与经典基线相媲美，甚至更好。总之，HypaCADD 为利用 QC 实现 CADD 提供了一种成功的策略。
WWAD：最全面的小分子全球批准的治疗药物数据库
每年，全球批准了50多名新的治疗剂用于医疗用途。尽管生物制剂批准的数量增加，但目前可用的大多数药物都是化学实体（De la Torre and Albericio，2024年）。由于研究成本较低（Wouters等，2020），更广泛的应用范围和对患者的可用性，因此小分子药物的开发继续受到青睐（Makurvet，2021年）。但是，药物开发是一个长期的过程，平均需要10 - 15年，将药物带入市场的成本可能为25亿美元（Catacutan等人，2024年）。在药物发现过程中，计算机辅助药物设计（CADD）方法的广泛应用允许减少时间和财务成本（Athanasiou and Cournia，2019年）。对现有治疗剂的了解，包括其结构，生物学活性，物理化学参数等，是CADD方法开发和应用的必要组成部分。目前，可以通过万维网获得许多包含有关批准药物信息的可自由访问的策划化学数据库（DB）（Masoudi-Sobhanzadeh等，2020； Elkashlan等，2023）。这些资源中的大多数仅包含有关在美国和欧洲批准的药物的数据。但是，其他国家 /地区的当局第一次批准了多达30％的药物（Wu等，2021），并且现有DBS经常缺少此信息。在自由使用的资源中缺乏本地授权的药物信息不允许研究人员在CADD方法的开发和应用中使用这些知识。在2024年7月，无法在广泛使用的资源药品银行（https://go.drugbank.com）中找到用于抗oronavirus药物的Simnotrelvir和Litrelvir的记录，这些药物在2023年在中国获得了批准，尽管在2023年获得了批准（Zhu，2023年； Zhug co ef; Zheng et; Zheng et; Zheng et and 2024，ther。它显着限制了所研究的药物治疗化学空间，并降低了已知的结构活性关系。因此，迫切需要