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螺纹吞噬作用诱导者在复发三重...
摘要：（1）背景：三阴性乳腺癌（TNBC）是乳腺癌的独特亚组，表现出高水平的复发，而新辅助化疗在其治疗管理中是有益的。抗PD-L1免疫疗法改善了新辅助治疗在TNBC中的作用。（2）方法：在铁毒性引起的诱导剂治疗下开发了用于综合的磁法分析的免疫调节和与螺旋病相关的R包装：用螺旋病诱导剂刺激的TNBC细胞（GSE173905（GSE173905）（GSE173905）（GSE154425），单细胞数据（GSE154425），单细胞数据（GESE191911912246）和群体specetrients and Specter sexpsertry sexpsertry stractrienty。临床结合分析是用乳腺肿瘤（TCGA和代理队列）进行的。Protein-level validation was investigated through protein atlas proteome experiments.（3）结果：Erastin/rsl3投动诱导者在TNBC细胞中上调CD274（MDA-MB-231和HCC38）。In breast cancer, CD274 expression is associated with overall survival.表现出高表达CD274的乳腺肿瘤上调了一些与预后相关的铁铁蛋白驱动因素：IDO1，IFNG和TNFAIP3。在蛋白质水平上，在盐霉素治疗下，在乳腺癌干细胞中确定了CD274和TNFAIP3的诱导。在用环磷酰胺处理的4T1肿瘤中，发现CD274的单细胞表达在髓样和淋巴样纤维化细胞中增加，与其受体PDCD1无关。在乳腺肿瘤转录组分层患者预后计算的CD274铁凋亡驱动器评分：在基础亚组中观察到较低的分数，其复发性风险得分较高（OnCotypEDX，GGI和GGI和Gene70评分）。在TNBC亚组中发现了代表队列中的CD274，IDO1，IFNG和TNFAIP3。发现CD274的铁质驱动器评分与总体生存有关，与TNM分类和年龄诊断无关。在蛋白质水平（4）结论中确定了在乳房导管癌的活检中CD274，TNFAIP3，IFNG和IDO1的肿瘤表达：在蛋白质水平（4）结论：螺旋菌病诱导的PD-L1在TNBC细胞中升级PD-L1在TNBC细胞中已知是一种有效的免疫疗法疗程的tnbc患者。基础和TNBC肿瘤高度表达的CD274和铁毒驱动因素：IFNG，TNFAIP3和IDO1。CD274铁质驱动器评分与预后和乳腺癌复发的风险有关。对于反复发作的TNBC提出了抗PD-L1免疫疗法的铁凋亡诱导剂的潜在协同作用。
t细胞流得分= 0.008346×expccl5 + 0。
0.008346 × EXP CCL5 + 0.072293 × EXP CD27 + 0.042853 × EXP CD274 - 0.0239 × EXP CD276 + 0.031021 × EXP CD8A + 0.151253 × EXP CMKLR1 + 0.074135 × EXP CXCL9 + 0.004313 × EXP CXCR6 + 0.020091×Exp HLA-DQA1 + 0.058806×EXP HLA-DRB1 + 0.07175×EXP HLA-E + 0.060679×EXP IDO1 + 0.123895×EXP IDO1 ×EXP PSMB10 + 0.250229×EXP Stat1 + 0.084767×Exp Tigit。2。癌症免疫周期：七个步骤抗癌免疫的状态
神经肿瘤学
摘要背景。开发合理的联合疗法是克服胶质母细胞瘤 (GBM) 固有治疗耐药性的关键。我们旨在通过用溴结构域和额外末端基序 (BET) 蛋白抑制剂扰乱 GBM 细胞来发现新的可用药物靶点，以揭示可能对第二种药物敏感的癌症相关弱点。BET 蛋白是表观遗传调节剂，与癌症中的原癌基因过表达有关。方法。用 BET 抑制剂 (BETi) JQ1 在 48 小时内处理 GBM 衍生的球线，然后进行 RNA 测序。通过染色质免疫沉淀后测序 (ChIP-seq) 研究了四种染色质标记。在体外和原位异种移植中对感兴趣的特征进行了功能验证。评估了联合疗法的协同作用。结果。 JQ1 显著调节的癌症相关通路包括干扰素 α (IFN- α ) 反应基因和对组蛋白去乙酰化酶抑制剂 (HDACi) 的反应特征。IFN 特征让人联想到由 CD274 (PD-L1) 组成的 GBM 衍生的 IFN 特征。功能通路分析表明，JQ1 直接作用于 IFN 反应基因的转录水平，而不是通过典型的 JAK/STAT 通路。这与 JQ1 调节的表达以及 BRD4 和 Pol II 在 IFN 特征基因处的占有率一致，支持直接的机制相互作用。最后，我们表明 HDACi 与 JQ1 相结合可协同降低 GS 系的细胞活力。结论。我们的方法确定了 BETi 诱导的癌症相关通路中的脆弱性，可能适合协同组合疗法，例如与 HDACi 结合。 BETi 对 GBM 细胞中 IFN 反应基因（包括 CD274）的直接抑制作用表明肿瘤免疫格局的调节，值得进一步研究。
Cas12a 针对多重基因组的优化
图 1. 现有 Cas12a CRISPRa 技术的评估。A) 采用两种不同的 Cas12a 核酸酶失活突变的 CRISPRa 构建体的比较。通过转导五天后表达 CD4 的细胞百分比来测量激活程度。B) 针对采用直接与 dCas12a (D908A) 连接的 TAD 组合的 12 种 CRISPRa 构建体变体，以基线表达为标准对 CD4 平均荧光强度 (MFI)。C) 示意图描绘了基于流式细胞术的平铺筛选的概览，该筛选用于识别其他活性 Cas12a CRISPRa 指南。D) 根据指南靶位点相对于 CD4、CD26、CD97 和 CD274 的转录起始位点 (TSS) 的位置绘制了每个指南在技术重复中的绝对最小 LFC 的 Z 分数。
单核细胞中Pd-1相似性基因的存在可能...
抽象引入的介绍，通过生物信息信息分析，在1型糖尿病（T1DM）患者中与程序性细胞死亡蛋白-1（PD-1）共享顺序和结构相似性的相应基因。研究设计和方法在人类蛋白序列数据库中筛选所有具有免疫球蛋白V-stet结构域的蛋白质，并在基因序列数据库中获得了相应的基因。GSE154609，其中包含来自T1DM和健康对照患者的外周血CD14+单核细胞样品。差异结果和相似基因相交。基因和基因组途径的基因本体论和京都百科全书的分析用于使用R套件“群集剖面”来预测潜在功能。使用t检验，在癌症基因组胰腺癌数据集和GTEX数据库中分析了相交基因的表达差异。使用Kaplan-erier生存分析分析了胰腺癌患者的整体生存和无疾病进展之间的相关性。结果2068具有免疫球蛋白V-stet结构域的蛋白质类似于PD-1和307相应的基因。1705与健康对照组相比，T1DM患者上调差异表达的基因（DEG）和1335个下调的DEG。总共21个基因与307 Pd-1相似性基因重叠，其中7个上调和14个下调。，胰腺癌患者的13个基因的mRNA水平显着增加。肌瘤3和HHLA2的高表达与胰腺癌患者的总体存活率较短显着相关，而FGFRL1，CD274和SPEG的高表达与胰腺癌患者的无病无病生存率显着相关。 结论的结论基因编码与PD-1相似的免疫球蛋白V-stet结构域可能有助于T1DM的发生。 这些基因，Myom3和SPEG的可能是胰腺癌预后的潜在生物标志物。肌瘤3和HHLA2的高表达与胰腺癌患者的总体存活率较短显着相关，而FGFRL1，CD274和SPEG的高表达与胰腺癌患者的无病无病生存率显着相关。结论的结论基因编码与PD-1相似的免疫球蛋白V-stet结构域可能有助于T1DM的发生。可能是胰腺癌预后的潜在生物标志物。
CRABP2（细胞视黄酸结合蛋白2D）
目的：CRABP2（Cellula Retinoi Aci Bindin Protei 2D）过表达可促进多种肿瘤进展，但对肺腺癌（LUAD）中CRABP2的综合分析研究较少。方法：利用TCGA、GEO、GEPIA2、UALCAN、Kaplan Meier plotter、LinkedOmics、TIMER、CCLE、Metascape等大型公共数据库和在线分析工具进行大数据挖掘分析，利用RNA干扰技术、CCK8检测、流式细胞术及凋亡检测、Western blot等进行体外实验。结果：研究通过对丽水市中心医院640例LUAD患者及640例健康对照血浆样本的分析，发现早期（IA期）LUAD患者血浆中CRABP2的表达水平高于对照组（平均31.6587±13.8541 ng/mL vs. 13.9328±5.5805 ng/mL，p<0.0001）。受试者工作特征曲线显示，CRABP2对预测早期LUAD具有一定的准确性，灵敏度为70.98%，特异度为94.53%，临界值为0.6551 ng/mL，曲线下面积为0.839（95%CI：0.817-0.859，p<0.0001）。与正常肺组织相比，CRABP2在LUAD中显著高表达（p<0.05）。LUAD中CRABP2高表达提示LUAD患者总生存期（95%CI：1.04-1.46，HR：1.23，p=0.018）和首次进展（95%CI：1.10-1.65，HR=1.35，p=0.0032）预后不良。CRABP2可能通过促进G2/M期转变、抑制细胞凋亡、参与免疫微环境调控等作用，促进LUAD的进展。CRABP2高表达会抑制免疫效应细胞的募集，促进免疫抑制细胞比例的增加，从而促进LUAD的进展。 LUAD中CRABP2的低表达可能使CD274(PD-L1)、HAVCR2和PDCD1LG2(PD-L2)的表达增强，而CRABP2的高表达可能使CTLA4、LAG3、PDCD1(PD-1)、TIGIT和IGSF8的表达增强。结论：CRABP2可能是LUAD诊断、治疗及预后的重要生物标志物。LUAD中CRABP2高表达的患者使用针对CD274、HAVCR2和PDCD1LG2的抑制剂治疗疗效可能不理想，而使用针对CTLA4、LAG3、PDCD1、TIGIT和IGSF8的抑制剂治疗疗效可能更好。大多数CRABP2高表达的癌症患者可能受益于免疫检查点抑制剂治疗。我们的研究结果为LUAD的诊断和治疗奠定了积极基础。
荷兰南亚人与2型糖尿病的荷兰Europids之间的炎症途径差异
Results: South Asians, compared to Europids, had higher mRNA levels of B-cell markers ( CD19 , CD79A , CD79B , CR2 , CXCR5 , IGHD , MS4A1 , PAX5 ; all fold change > 1.3, false discovery rate [FDR] < 0.008) and interferon (IFN)-signaling genes ( CD274 , GBP1 , GBP2 , GBP5 ，fcgr1a/b/cp，ifi16，ifit3，ifitm1，ifitm3，tap1;在南亚人中，IFN信号通路是顶级规范途径（z得分2.6; p <.001），并且伴随着较高的血浆IFN-γ水平（FC = 1.5，FDR = 0.01）。值得注意的是，女性（20/182 [11％]）基因表达的种族差异要比男性（2/182 [1％]）。结论：与患有T2D的Europid患者相比，南亚T2D患者的IFN信号途径更为激活，女性比男性更为明显。我们推测，与欧洲人相比，更激活的IFN信号途径可能会导致南亚T2D的更快进展。关键词：B淋巴细胞，种族，基因表达，干扰素伽玛，代谢综合征
肿瘤特异性 GPX4 降解增强铁死亡......
脂质过氧化依赖性铁死亡已成为一种新兴的肿瘤治疗策略。然而，目前的策略不仅选择性地诱导恶性细胞中的铁死亡，而且还同时触发免疫细胞中的铁死亡，这可能会损害抗肿瘤免疫力。在这里，我们使用 In-Cell Western 检测结合无偏药物筛选，确定化合物 N6F11 是一种铁死亡诱导剂，可触发谷胱甘肽过氧化物酶 4 (GPX4)（一种关键的铁死亡抑制剂）的降解，特别是在癌细胞中。N6F11 不会导致免疫细胞（包括树突状细胞、T 细胞、自然杀伤细胞和中性粒细胞）中的 GPX4 降解。从机制上讲，N6F11 与癌细胞中 E3 泛素连接酶三联基序 25 (TRIM25) 的 RING 结构域结合，从而触发 TRIM25 介导的 K48 连接 GPX4 泛素化，导致其蛋白酶体降解。从功能上讲，N6F11 治疗导致铁死亡癌细胞死亡，从而启动由 CD8 + T 细胞介导的 HMGB1 依赖性抗肿瘤免疫。N6F11 还增强了晚期癌症模型中针对 CD274/PD-L1 的免疫检查点阻断，包括由 KRAS 和 TP53 突变驱动的胰腺癌基因工程小鼠模型。这些发现可能建立一种安全有效的策略来增强铁死亡驱动的抗肿瘤免疫。
引用本文：Sajad Goudarzi、Mohamad Vosough Ghanbari、Jalil Rohani、Razieh Ghodsi 和 Fatemeh B. Rassouli（2024 年 10 月 7 日）：开发新药
摘要成人 T 细胞白血病/淋巴瘤 (ATL) 存活率低，这凸显了对创新治疗药物的迫切需求。虽然已经记录了 HDACis 在几种血液系统肿瘤中的药代动力学，但关于其对抗 ATL 的活性的研究仍存在明显差距。鉴于缺氧会对淋巴瘤细胞产生不可预测的影响，本研究旨在首次评估 MS-275 和新型类似物在缺氧条件下对 ATL 细胞的毒性作用。进行了蛋白质-蛋白质相互作用和基因集富集分析，评估了 HIF1A 和下游靶标的表达，并对 MS-275 和新型类似物与 HIF-1 a 进行了分子对接。对于体外研究，首先合成 MS-275 的苯甲酰胺类似物，然后评估缺氧条件下 MT-2 细胞的活力。富集分析证实了 HIF-1 信号通路中枢基因的参与，火山图显示 HIF1A、GAL3ST1 和 CD274 过度表达。分子对接表明 MS-275 和 HIF-1 a PAS-B 结构域的类似物之间存在有利的相互作用。alamarBlue 测定结果表明 MS-275 和类似物显著 (p < 0.001) 降低了缺氧条件下 MT-2 细胞的活力。本研究结果有望开发针对缺氧引起的 ATL 变化的新药。