图2。距离和方向依赖性的选择性和Cyclin D1-CDK4/6复合物的降解。(a)DTAC距离库的示意图。(b)Western印迹(WB)分析显示,在用指定的DTAC变体以指定浓度处理的U-251细胞中细胞周期蛋白D1和CDK4/6降解14小时。结果代表了三个独立实验。(c)与距离依赖性DTAC治疗后对照组相比,相对细胞周期蛋白D1,CDK4和CDK6水平的定量。显示的数据是三个独立实验的平均值±SD。(d)DTAC方向库的示意图。(e)WB分析显示,在指定浓度的U-251细胞中,用指定的方向变体(DTAC-V5至DTAC-V9)处理的U-251细胞中的细胞周期蛋白D1和CDK4/6降解,持续14小时。结果代表了三个独立实验。(f)与对照组相比,用方向依赖性DTAC进行对照组进行了相对细胞周期蛋白D1,CDK4和CDK6水平的定量。显示的数据是三个独立实验的平均值±SD。
注意:C1D8 PK数据是从0-8 h收集的,从0-8 h,QD收集0-24 h。在12小时的时间点再次使用了出价的预剂量样品。对于出价,将第一个剂量后的数据绘制在0-12 h之间,然后从12-24小时再次绘制,以在第二剂剂量后复制轮廓。50 mg QD(n = 5); 50 mg竞标(n = 19); 75 mg QD(n = 19); 125 mg QD(n = 20); 150 mg QD(n = 5)。平均值±SD CDK2 IC 50 = 570±468(n = 66);平均值±SD CDK1 IC 50 = 5488±1759(n = 6)(全血分析)。*由PredicinesCore估算的副本编号
细胞周期依赖性激酶 (CDK) 是一组丝氨酸/苏氨酸激酶,它们与称为细胞周期蛋白的调节亚基相互作用以发挥其活性。1,2 这些 CDK 在调节细胞周期进程和转录方面至关重要(►图 1)。3,4 在人类细胞中已鉴定出 20 种 CDK(CDK1 – 20)和 29 种细胞周期蛋白。5 其中,CDK1、CDK2、CDK4 和 CDK6 在细胞周期调控中起关键作用,而 CDK7 – 9、11 – 13、19 和 20 主要在转录调控中起关键作用。2,4,6,7 值得注意的是,许多 CDK 具有多种催化底物并参与各种细胞过程。例如,CDK7 是一种在细胞周期期间激活 CDK 的激酶,也是转录期间 RNA 聚合酶 II 的调节剂。 CDK5 被广泛认为是调节神经元功能和细胞迁移的关键因素。8 癌症的一个标志性特征是细胞周期失调,导致不受控制和过度的细胞
细胞周期蛋白依赖性激酶 4 和 6 抑制剂 (CDK4/6is) 彻底改变了乳腺癌治疗。然而,只有不到 50% 的患者有客观反应,几乎所有患者在治疗期间都会产生耐药性。为了阐明潜在机制,我们基于癌症中多蛋白组装体的参考图谱,构建了一个可解释的深度学习模型,以了解对 palbociclib(一种 CDK4/6i)的反应。该模型确定了八个核心组装体,它们整合了 90 个基因中罕见和常见的变异,以对 palbociclib 敏感和 palbociclib 耐药的细胞系进行分层。预测结果可转化为患者和患者来源的异种移植,而单基因生物标志物则不能。大多数预测组装体都可以通过 CRISPR-Cas9 基因破坏来调节 CDK4/6i 反应。经过验证的组装体与细胞周期控制、生长因子信号传导和组蛋白调节复合物有关,我们表明该复合物通过激活组蛋白修饰因子 KAT6A 和 TBL1XR1 以及转录因子 RUNX1 来促进 S 期进入。这项研究可以综合评估肿瘤的基因谱如何调节 CDK4/6i 抗性。
a 巴勒莫大学生物、化学和制药科学与技术系,意大利巴勒莫 90123 b 麻省总医院,哈佛医学院,美国马萨诸塞州波士顿 02114 c 英国剑桥癌症研究中心,Hills Road,剑桥 CB2 0QQ,英国 d 新加坡国立大学杨潞龄医学院药理学系,新加坡 117600,新加坡 e 新加坡国立大学杨潞龄医学院新加坡国立大学癌症研究中心,新加坡 119077,新加坡 f 京都大学医学院,日本京都 g 古斯塔夫·鲁西癌症中心,儿童和青少年肿瘤学系,INSERM U1015,巴黎萨克雷大学,法国维尔瑞夫 h 实验治疗学组,Vall d ′ Hebron 肿瘤研究所,西班牙巴塞罗那 i 卡迪夫大学和 Velindre 癌症中心,博物馆大道,卡迪夫 CF10 3AX,英国 j 南洋理工大学李光前医学院(LKCMedicine),实验医学大楼,636921,新加坡 k 新加坡国家癌症中心癌症遗传学服务(CGS),168583,新加坡 l 约翰霍普金斯大学公共卫生学院生物化学与分子生物学系,美国马里兰州巴尔的摩 m 安格利亚鲁斯金大学生命科学学院,英国剑桥 n 伦敦帝国理工学院癌症分部,英国伦敦汉默史密斯校区 o 新加坡国立大学杨潞龄医学院生理学系,117593,新加坡 p 新加坡国立大学杨潞龄医学院健康长寿转化计划,117456,新加坡 q 加利福尼亚大学格芬医学院肿瘤学系,美国加利福尼亚州洛杉矶 r 伦敦大学学院 MRC 分子细胞生物学实验室,英国伦敦 WC1E 6BT Therapeutics Pte Ltd,A*STARTCentral,139955,新加坡
CDK13相关疾病是由CDK13基因中的变化(变体)引起的。在遗传条件下常见,每个人的影响都不同(Bostwick,2019; Sifrim 2016)。是什么导致CDK13相关疾病?基因是在我们的成长和发展中具有重要作用的指示。它们是由DNA制成的,并被掺入称为染色体的有组织结构中。染色体因此包含我们的遗传信息。染色体位于我们的细胞内,即身体的构建块。CDK13-相关疾病是由特异性变化(称为致病变体)引起的,称为CDK13的基因的DNA序列(CDK13是基因的全名Cyclin-center-center-center-激酶13)引起的。CDK13基因位于7号染色体的短“ P”臂上,该区域称为P14.1,如下图所示。我们的细胞中有两个染色体的两个副本,因此我们也有两个CDK13基因的副本。CDK13仅影响CDK13基因的一个副本时,就会发生。第二份副本是完全功能的。这被称为常染色体显性,因为所有编号的染色体都称为常染色体和遗传条件,而当仅一个常染色体基因的一个副本受到影响时,就会称为遗传体。
一名 80 岁女性,既往有高血压、焦虑、抑郁和转移性乳腺癌病史,正在接受 CDK4/6 抑制剂和内分泌治疗,因运动时呼吸困难到急诊室就诊。图 1 显示了从诊断出乳腺癌到出现运动时呼吸困难的时间线。近期病史表明,她在与肿瘤科医生约诊时出现左下肢水肿。两天后,她在紧急护理中心被诊断出患有深静脉血栓形成 (DVT),并被转至急诊室,在那里开始使用利伐沙班。当时的胸部 X 光片显示肺炎征兆,因此患者也开始使用抗生素。五天后她出院。最近一次出院六天后,患者出现运动时呼吸困难,再次到急诊室就诊。就诊时,她的血压为 189/79,并且缺氧,SpO 2 为 80%,需要通过鼻导管补充 2 升氧气。实验室检查显示 D-二聚体升高令人担忧,为 1668。
•Prodegy平台用于开发一系列少数(CRBN)介导的CDK4/6双功能降解器,包括开发候选BTX-9341。•通过cas9-grna复合物的核反射产生基因敲除细胞系。•通过用BTX-9341处理的细胞的蛋白质裂解物的免疫印迹分析了靶降解6小时或所示。•经过24小时的治疗后或通过指示的免疫印迹,通过细胞西部分析了磷酸化的RB。•在碘化丙啶染色后通过流式细胞仪治疗24小时后,进行了细胞周期分析。•通过10天菌落形成测定后,通过CellTiter-Glo 2.0分析(Promega)测量细胞增殖。•媒介物,CDK4/6抑制剂和BTX-9341在BALB/C裸鼠异种皮下或颅内模型中口服。
“低白细胞计数(中性粒细胞减少)。低白细胞计数在服用ibrance时非常普遍,可能导致严重的感染会导致死亡。”
通过选择性CDK4/6抑制剂在HR+/HER2-乳腺癌中选择性抑制细胞周期进展的选择性抑制作用。通过选择性抑制CDK2扩大对细胞周期的控制提供了癌症中新型的治疗机会,包括靶向CCNE1扩增肿瘤和对ER+乳腺癌中CDK4 \ 6抑制剂的抵抗力。PF-07104091是临床研究,是临床研究的第一类CDK2选择抑制剂。使用PF-07104091进行临床前研究,确定了CDK2抑制在疾病中的治疗影响,并突出了CDK2在控制癌细胞增殖中的不同机械作用。 在CCNE1扩增的卵巢癌模型中,CDK2在控制RB1磷酸化和G1检查点中起主要作用。 用PF-07104091抑制CDK2诱导G1生长停滞,并控制肿瘤异种移植作为单药治疗。 在ER+乳腺癌模型中,CDK2在控制RB1磷酸化的控制中起支持作用,并与CDK4 \ 6合作。 与CDK4 \ 6抑制作用结合使用CDK2 KO作为CDK4 \ 6抑制作用的主要敏化剂,并支持Cyclin E \ CDK2复合物作为对CDK4 \ 6抑制剂的抗CDK4 \ 6抑制剂的驱动力,整个基因组CRIS敲除(KO)和CRISPR激活筛选与CDK4 \ 6抑制作用建立了CDK2 KO作为抑制CDK4 \ 6抑制作用。使用PF-07104091进行临床前研究,确定了CDK2抑制在疾病中的治疗影响,并突出了CDK2在控制癌细胞增殖中的不同机械作用。在CCNE1扩增的卵巢癌模型中,CDK2在控制RB1磷酸化和G1检查点中起主要作用。用PF-07104091抑制CDK2诱导G1生长停滞,并控制肿瘤异种移植作为单药治疗。 在ER+乳腺癌模型中,CDK2在控制RB1磷酸化的控制中起支持作用,并与CDK4 \ 6合作。 与CDK4 \ 6抑制作用结合使用CDK2 KO作为CDK4 \ 6抑制作用的主要敏化剂,并支持Cyclin E \ CDK2复合物作为对CDK4 \ 6抑制剂的抗CDK4 \ 6抑制剂的驱动力,整个基因组CRIS敲除(KO)和CRISPR激活筛选与CDK4 \ 6抑制作用建立了CDK2 KO作为抑制CDK4 \ 6抑制作用。用PF-07104091抑制CDK2诱导G1生长停滞,并控制肿瘤异种移植作为单药治疗。在ER+乳腺癌模型中,CDK2在控制RB1磷酸化的控制中起支持作用,并与CDK4 \ 6合作。整个基因组CRIS敲除(KO)和CRISPR激活筛选与CDK4 \ 6抑制作用建立了CDK2 KO作为抑制CDK4 \ 6抑制作用。PF-07104091 combined with CDK4\6 inhibitor palbociclib or CDK4-selective inhibitor PF-07220060 synergistically controls proliferation of ER+ BC cells in vitro and induces tumor regression in ER+ BC xenograft models, including PDX models with acquired resistance to CDK4\6 inhibitors and endocrine therapy.