靶向细胞周期依赖性激酶 7 (CDK7) 为癌症治疗提供了一种有趣的治疗选择,因为这种激酶参与调节细胞周期和转录。在这里,我们描述了一种新的三取代吡唑并[4,3- d ]嘧啶衍生物 LGR6768,它在纳摩尔范围内抑制 CDK7,并在整个 CDK 家族中表现出良好的选择性。我们使用 X 射线晶体学以 2.6 Å 分辨率确定了与 LGR6768 复合的完全活性 CDK2/细胞周期蛋白 A2 的结构,揭示了活性位点内的保守相互作用。结构分析和与对接至 CDK7 的 LGR6768 的比较解释了观察到的生化选择性,这与联苯部分的构象差异有关。在细胞实验中,LGR6768 通过抑制细胞周期 CDK 和 RNA 聚合酶 II 的羧基末端结构域的磷酸化来影响细胞周期和转录的调节。LGR6768 限制了几种白血病细胞系的增殖,引发了与 CDK7 抑制相关的蛋白质和 mRNA 水平的显著变化,并在剂量和时间依赖性实验中诱导了细胞凋亡。我们的工作支持了先前的发现,并为选择性 CDK7 抑制剂的开发提供了进一步的信息。
摘要 细胞周期依赖性激酶 7 (CDK7) 与细胞周期蛋白 H 和 MAT1 一起形成 CDK 活化复合物 (CAK),通过细胞周期 CDK 的 T 环磷酸化指导细胞周期进程。CAK 也是通用转录因子 TFIIH 的组成部分。CDK7 介导的 RNA 聚合酶 II (Pol II) 在活性基因启动子处的磷酸化允许转录。细胞周期失调是癌症的已知标志,通过多种机制对转录过程进行异常控制在许多癌症中也很常见。此外,CDK7 水平在许多癌症类型中升高并与临床结果相关,表明与正常组织相比,对 CDK7 活性的依赖性更大。这些发现将 CDK7 确定为癌症治疗靶点,最近的几篇出版物报道了选择性 CDK7 抑制剂 (CDK7i) 对多种癌症类型具有活性。临床前研究表明,CDK7i 可导致细胞周期停滞、凋亡和转录抑制,特别是癌症中超增强子相关基因的转录抑制,并已证明其具有克服癌症治疗耐药性的潜力。此外,CDK7i 与其他靶向癌症疗法(包括 BET 抑制剂、BCL2 抑制剂和激素疗法)的组合已在模型系统中显示出疗效。四种 CDK7i,ICEC0942 (CT7001)、SY-1365、SY-5609 和 LY3405105,现已进入 I/II 期临床试验。在这里,我们描述了导致选择性 CDK7i 开发的工作、最先进的临床候选药物的现状,并讨论了它们作为癌症治疗的潜在重要性,包括单一疗法和联合治疗。ClinicalTrials.gov 标识符:NCT03363893;NCT03134638;NCT04247126; NCT03770494。
本演讲和随附的口头介绍(本文共同称为“演示”)包含明确和暗示的前瞻性陈述,涉及实质性风险和不确定性。本演讲中包含的所有陈述,除了历史事实的陈述外,包括有关Exscientia plc期望的陈述(“我们”,“我们”,“我们”,“我们的”,“我们的”或“ Exscientia”),我们的战略,未来运营,未来财务状况,预测,预计,预计,成本,成本,成本,计划,潜在的市场和潜在的市场和竞争机会,竞争机会,竞争机会,市场趋势,市场趋势,对市场的机会,对象,对象,对目标,对目标,以及对目标,以及对目标,以及对目标,以及对目标,以及对目标,以及对目标,以及对目标,以及对目标,以及目标,以及目标,以及目标,以及对目标,以及目标,以及目标。“预期”,“相信”,“估计”,“期望”,“预期”,“五月”,“可能”,“可能”,“计划”,“计划”,“项目”,“目标”,“潜在”,“潜在”,“意志”,“意志”,“可能”,“应该”,“应该”,类似的表达方式和类似的表情旨在识别所有前瞻性的陈述,尽管所有前瞻性陈述都包含这些识别词。前瞻性陈述基于我们管理层的信念和假设以及当前可用于管理层的信息。此类陈述受风险和不确定性的约束,实际结果可能与由于各种重要因素所致的前瞻性陈述中所示或暗示的结果有重大不同。我们实际上可能没有实现我们的前瞻性陈述中披露的计划,意图或期望,并且您不应过分依赖我们的前瞻性陈述。
a。CDK7底物(RNAP II)在用DMSO(对照)处理的HCT116细胞中或通过免疫印迹测量的指示化合物。b。通过免疫印迹在处理过的HCT 116细胞中癌基因C-MYC和DNA双链断裂标记H2AX的表达。C.细胞增殖(C -BRDU分析)和D,处理后的HCT 116细胞中的细胞凋亡分析(Annexin V/7AAD染色)。e。在用DMSO(对照)处理的MDA-MB-231(TNBC)细胞中,在MDA-MB-231(TNBC)细胞中的凋亡制造商(裂解的caspase 3和裂解PARP1)的表达表达或通过免疫印迹测量的指示化合物。
图 4:(A) N=10 个原发性卵巢癌样本中,DMSO 标准化基线或随着 GTAEXS-617 浓度增加而治疗时的癌细胞数量。(B) 基线和体外 GTAEXS-617 治疗浓度增加时的癌细胞分数;患者样本反应的主观分组与 (A) 中的剂量反应曲线相关。显示箱线图和异常值。(C) 在使用浓度增加的 GTAEXS-617 和 CDK4/6 抑制剂 palbociclib 治疗后,DMSO 标准化免疫细胞 (黑色) 或癌细胞 (蓝色) 的相对细胞数量;N=10 的箱线图。
此预印本的版权所有者此版本于 2022 年 6 月 29 日发布。;https://doi.org/10.1101/2022.06.29.497030 doi:bioRxiv preprint
1 QURIENT CO.,LTD。,C-DONG,242 PANGYO-RO,C801 BUNDANG-GU,SEONGNAM-SI 13487,大韩民国2临床和分子Virolosgy研究所,Friedrich-Alexander-UniversitätErlangen-Nürnürnürnürnürnürnürnürnürnürnürnürnürnürnürnürnürnürnürnürnürnürnürnürnürnürnürnürnürnürnürnürnürnürnürnürnürnürnürnürnürnürnürnürnürnürnounberg(faangen)scherny 34,4.1105病毒学研究所,弗雷伊大学柏林,罗伯特 - 冯·斯特拉斯 - 斯特拉斯7-13,14163柏林,德国4铅索发现中心,奥托 - 霍恩 - 斯特拉斯,15,442227德国多特蒙德,德国多特,5 manfred.marschall@fau.de;电话。: +49-91-3185-36096†这些作者对这项工作也同样贡献。‡当前地址:Kanaph Therapeutics Inc.,112-901,58,Mokgam-Ro,Gwangmyeong-Si 14295,大韩民国。§当前地址:MitoMmune Therapeutics,13楼,108,Bongeunsa-Ro,Gangnam-Gu 06123,韩国首尔,韩国共和国。∥当前地址:功能性免疫组学,大学医院Tübingen,Hoppe-Seyler-Straße3,72076Tübingen,德国。
图1:(a)全局队列特征。HG/LG-SOC:高级/低级浆液卵巢癌; NSCLC:非小细胞肺癌。(B1)患者反应曲线的例子:药物毒性归一化为DMSO控制。曲线平滑度和斜率决定了图2所示的浓度的总药物反应评分(TDR)。1-3(b2)umoune免疫细胞特异性毒性为‘617(免疫TDR)。CT-7001和SY-5609:CDK7I; Abemaciclib:CDK4/6i。(c)总体癌症队列'617癌症特异性毒性。
摘要 - 目的:我们研究了乳腺癌中CDK和预后的表达。材料和方法:吞噬数据库检查了乳腺癌中的CDK基因表达。使用Kaplan-Meier绘图师分析了怀里恶性增长患者CDK的先见优先价值。在GEPIA数据库中分析了肿瘤分期中CDK的表达变化。使用KEGG数据集分析了CDK在DNA复制和细胞周期中的作用。使用CBIOPORTAL数据库,研究了乳腺癌中CDK基因表达与CDK之间的关联。Encori数据库用于研究针对CDK的miRNA。结果:oncomine数据表明,乳腺癌患者中CDK1,CDK5和CDK20的表达被上调,而CDK2和CDK6中的mRNA表达水平降低,CDK3,CDK4和CDK7〜19不是表达数据。GEPIA数据库的结果表明,CDK1,CDK2,CDK4,CDK5,CDK5,CDK7,CDK8和CDK20在乳腺癌组织中的表达水平大于正常组织,并且CDK1和CDK5的表达水平明显差异,而前者中的CDK3和CDK1的表达水平则低于latter latter latter的表达水平。Kaplan-Meier绘图仪数据显示,CDK1,CDK3,CDK4和CDK20与乳腺癌个体的沮丧的预后有关,而CDK8中的mRNA水平与生存后的进展有关。结论:CDK1,CDK2C,CDK4,CDK5,CDK7,CDK8和CDK20可以用作乳腺癌患者的分子标记,或通过靶向CDK来作为乳腺癌治疗的潜在靶标。
细胞周期依赖性激酶 (CDK) 是一组丝氨酸/苏氨酸激酶,它们与称为细胞周期蛋白的调节亚基相互作用以发挥其活性。1,2 这些 CDK 在调节细胞周期进程和转录方面至关重要(►图 1)。3,4 在人类细胞中已鉴定出 20 种 CDK(CDK1 – 20)和 29 种细胞周期蛋白。5 其中,CDK1、CDK2、CDK4 和 CDK6 在细胞周期调控中起关键作用,而 CDK7 – 9、11 – 13、19 和 20 主要在转录调控中起关键作用。2,4,6,7 值得注意的是,许多 CDK 具有多种催化底物并参与各种细胞过程。例如,CDK7 是一种在细胞周期期间激活 CDK 的激酶,也是转录期间 RNA 聚合酶 II 的调节剂。 CDK5 被广泛认为是调节神经元功能和细胞迁移的关键因素。8 癌症的一个标志性特征是细胞周期失调,导致不受控制和过度的细胞
