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基因检测：产前无细胞 DNA 检测
ACOG 于 2024 年 3 月发布了一份实践咨询，其中指出：“尽管当前的 ACOG 指南不建议根据成本效益分析常规使用无创产前检测 (NIPT) 来确定胎儿 Rh(D) 状态，但在 RhIg 短缺的实践环境中，使用 NIPT 优先使用 RhIg 并节省 RhIg 供应是一种合理的考虑。如果 cfDNA 检测结果证实胎儿为 Rh(D) 阴性，则无需在产前（因出血、流产、流产或妊娠 28 周）常规注射 RhIg。”
引用Dreyer GJ，Drabbels JJM，De Fijter JW，Van Kooten C，Reinders Mej和Heidt S（2023）Allogen
间充质基质细胞（MSC）疗法对肾脏移植引起了显着兴趣。MSC治疗已在几种临床研究环境中进行了研究，无论是诱导疗法，急性排斥反应或支持维持治疗，允许断奶以断奶的免疫抑制药物（1-5）。在肾脏移植的情况下，对于大多数临床研究，已应用自体MSC治疗（3，5-7）。但是，由于制造MSC产品需要数周的时间，因此在临床环境中使用“现成”同种异体MSC更为可行。在海王星研究中，移植后6个月注入同种异体MSC（8）。在这项1B研究中，选择第三方MSC不具有反复的人白细胞抗原（HLA）与肾脏供体的不匹配，以最大程度地降低抗Donor免疫反应的风险。这项研究证明了HLA选择的第三方MSC在肾脏移植受者中输注的安全性与输注后他克莫司龙槽水平较低（MSC IFFUSION 6.1（±1.7）ng/mL相比，与MSC Iffusion 3.0（±0.9）Ng/ml相比）。MSC被认为可以促进移植后的免疫耐受性，并具有免疫调节和抗炎性弹药特性（4、9、10）。但是，MSC治疗的作用机理仍未完全阐明。临床前鼠研究表明，潜在的局部作用机理不太可能是由于大多数MSC在肺的微脉管系统中积累，并且在输注后几个小时内无法检测到（11，12）。Dazzi等人小组的鼠类研究。几项研究表明，旁分泌作用因子（例如细胞因子，生长因子和免疫调节蛋白）的分泌（13-16）。另一种建议的作用机理是MSC在肺中被单核细胞吞噬，并且这些单核细胞在MSC的免疫调节作用的介导，分布和传播中起重要作用（17）。确定输注后不久将MSC降解（10）。此外，他们发现凋亡过程对于MSC的免疫调节作用至关重要。假定这部分取决于吞噬凋亡MSC后的吞噬细胞衍生的吲哚胺2,3-二氧酶（IDO）活性。尽管有这些临床前数据，但在临床环境中输注时MSC的细胞死亡证明很少。最近，无细胞的DNA（CFDNA）已被鉴定为固体器官移植中排斥反应的有趣生物标志物（18）。CFDNA的存在部分是由于主动分泌，但最重要的来源是细胞经历细胞凋亡或坏死。因此，供体衍生的CFDNA可以用作细胞损伤和细胞死亡的读数，并作为移植排斥的间接度量（19-21）。在2017年，发表了DART试验的结果（22）。在这项研究中，肾移植后测量了供体衍生的无细胞DNA（DD-CFDNA），并用作
早期的胆单元的生成测序...
抽象目标尽管成像和病理评估取得了重大进展，但良性和恶性胆道狭窄之间的早期分化仍然具有挑战性。内窥镜逆行胆管造影术（ERCP）用于研究胆道狭窄，使胆汁的收集。我们测试了下一代测序（NGS）突变无细胞DNA（CFDNA）的诊断潜力。设计了一组可疑胆汁狭窄的患者（n = 68）的前瞻性队列。使用对临床实验室实施开放的NGS面板，将初始病理诊断的性能与在第一次ERCP时收集的胆汁CFDNA的突变分析（oncomine pan-Cancancer无细胞的无细胞测定法）进行了比较。导致初始病理诊断将这些狭窄分类为良性（n = 26），不确定（n = 9）或恶性（n = 33）。该诊断的敏感性和特异性分别为60％和100％，因为在最初良性或不确定狭窄的26个随访中，有26个和八个。对我们的NGS分析的恶性肿瘤的敏感性和特异性，此处称为Bilemut，分别为96.4％和69.2％。重要的是，在扩展随访后，四个双双阳性阳性中的一个发生了胰腺癌。值得注意的是，在初始诊断良性或不确定狭窄的患者中，双肿瘤的恶性肿瘤的敏感性为100％。对30个配对胆汁和组织样品的分析也证明了双血片的出色表现。在初始诊断阶段实施BILEMUT的胆道狭窄可以显着改善恶性肿瘤的检测，减少患者临床治疗的延迟，并帮助选择靶向疗法的患者。
血浆衍生的无细胞DNA作为早期检测，预后和个性化治疗尿路上皮癌的生物标志物
摘要：膀胱癌（BC）是美国最常见的恶性肿瘤之一，每年有80,000例新病例和16,000例死亡。尿路上皮癌（UC）是最常见的组织学，占病例的90％。BC的管理均复杂。因此，美国泌尿外科协会（AUA）建议患者在治疗期间和治疗后接受密切监测。此监视以膀胱镜检查或成像测试的形式，这可能是侵入性且昂贵的测试。考虑到这一点，最近有很多努力寻求膀胱癌监测的补充。无细胞DNA（CFDNA）或从垂死细胞释放的DNA，循环肿瘤DNA（CTDNA）或从肿瘤细胞释放的突变DNA，可以分析以检测和表征肿瘤的分子特征。研究表明，在BC Care领域中使用CTDNA的结果有希望的结果。进行了一项PubMed文献综述，研究了在BC检测，预测和监测复发中讨论CFDNA和CTDNA的研究。使用的关键词包括膀胱癌，无细胞DNA，循环肿瘤DNA，尿路上皮癌和液体活检。研究表明，CTDNA可以作为早期和晚期晚期的预后指标，有助于大手术前的风险分层，有助于检测疾病进展和转移性复发，并可以评估可能对免疫疗法反应的患者。需要进一步的前瞻性，随机试验，以阐明BC护理进步方面的真正潜在ctDNA。ctDNA的好处不仅限于卑诗省，因为研究还表明了其作为上累uctut trup trains Neoadjuvant化学疗法的生物标志物的希望。但是，CTDNA存在一些局限性，需要改善CTDNA特异性检测方法和BC特异性突变，然后才能实现广泛利用。
高级生物信息学家
治疗。在这方面，NBC是研究最小侵入性生物标志物或液体活检的公认的世界领导者，用于改善癌症管理。 我们的生物标志物研究将临床，分子和计算科学整合到一个高度收敛的程序中。 高级计算生物学对生物标志物议程至关重要。 生物信息学家加入NBC的一个激动人心的机会。 您将与临床医生，生物学家，工程师和计算科学家组成的多学科团队一起分析由患者血液样本引起的基因组，表观基因组和转录组数据；包括CFDNA，CFRNA和循环肿瘤细胞。 主要重点是开发和应用广泛的计算工具来对液体活检的数据进行测序，以开发和验证新型的生物标志物，以帮助更好地表征患者肿瘤。 关于你：在这方面，NBC是研究最小侵入性生物标志物或液体活检的公认的世界领导者，用于改善癌症管理。我们的生物标志物研究将临床，分子和计算科学整合到一个高度收敛的程序中。高级计算生物学对生物标志物议程至关重要。生物信息学家加入NBC的一个激动人心的机会。您将与临床医生，生物学家，工程师和计算科学家组成的多学科团队一起分析由患者血液样本引起的基因组，表观基因组和转录组数据；包括CFDNA，CFRNA和循环肿瘤细胞。主要重点是开发和应用广泛的计算工具来对液体活检的数据进行测序，以开发和验证新型的生物标志物，以帮助更好地表征患者肿瘤。关于你：
无细胞DNA检测肾脏同种异体移植排斥
该图显示了根据ABMR特征（G Banff评分[Glomerulitis]，PTC Banff评分[Perubular Capilaritis]，C4D移植物沉积）和TCMR特征（I Banff Score [I Banff Score [tstitial Subrammation]，T Banff得分[Tububulitis]和theflymation fromperam frofferm forftermation 。 这些分数中的每一个范围为0到3，得分较高，表明更严重的病变。 t条表示标准错误。 每个点对应于单个DD-CFDNA值。 数据表示为平均值+/- SEM。 使用两侧的Kruskal-Wallis测试进行了两组之间的比较，并进行了调整以进行多个比较。 该图显示了DD-CFDNA的增量，并显示了病变的严重程度。 扩展数据图 5。 这些分数中的每一个范围为0到3，得分较高，表明更严重的病变。 t条表示标准错误。 每个点对应于单个DD-CFDNA值。 数据表示为平均值+/- SEM。 使用两侧的Kruskal-Wallis测试进行了两组之间的比较，并进行了调整以进行多个比较。 该图显示了DD-CFDNA的增量，并显示了病变的严重程度。 扩展数据图 5。 这些分数中的每一个范围为0到3，得分较高，表明更严重的病变。 t条表示标准错误。 每个点对应于单个DD-CFDNA值。 数据表示为平均值+/- SEM。 使用两侧的Kruskal-Wallis测试进行了两组之间的比较，并进行了调整以进行多个比较。 该图显示了DD-CFDNA的增量，并显示了病变的严重程度。 扩展数据图 5。 这些分数中的每一个范围为0到3，得分较高，表明更严重的病变。 t条表示标准错误。 每个点对应于单个DD-CFDNA值。 数据表示为平均值+/- SEM。 使用两侧的Kruskal-Wallis测试进行了两组之间的比较，并进行了调整以进行多个比较。 该图显示了DD-CFDNA的增量，并显示了病变的严重程度。 扩展数据图 5。 这些分数中的每一个范围为0到3，得分较高，表明更严重的病变。 t条表示标准错误。 每个点对应于单个DD-CFDNA值。 数据表示为平均值+/- SEM。 使用两侧的Kruskal-Wallis测试进行了两组之间的比较，并进行了调整以进行多个比较。 该图显示了DD-CFDNA的增量，并显示了病变的严重程度。 扩展数据图 5。 这些分数中的每一个范围为0到3，得分较高，表明更严重的病变。 t条表示标准错误。 每个点对应于单个DD-CFDNA值。 数据表示为平均值+/- SEM。 使用两侧的Kruskal-Wallis测试进行了两组之间的比较，并进行了调整以进行多个比较。 该图显示了DD-CFDNA的增量，并显示了病变的严重程度。 扩展数据图 5。 这些分数中的每一个范围为0到3，得分较高，表明更严重的病变。 t条表示标准错误。 每个点对应于单个DD-CFDNA值。 数据表示为平均值+/- SEM。 使用两侧的Kruskal-Wallis测试进行了两组之间的比较，并进行了调整以进行多个比较。 该图显示了DD-CFDNA的增量，并显示了病变的严重程度。 扩展数据图 5。 这些分数中的每一个范围为0到3，得分较高，表明更严重的病变。 t条表示标准错误。 每个点对应于单个DD-CFDNA值。 数据表示为平均值+/- SEM。 使用两侧的Kruskal-Wallis测试进行了两组之间的比较，并进行了调整以进行多个比较。 该图显示了DD-CFDNA的增量，并显示了病变的严重程度。 扩展数据图 5。这些分数中的每一个范围为0到3，得分较高，表明更严重的病变。t条表示标准错误。每个点对应于单个DD-CFDNA值。数据表示为平均值+/- SEM。使用两侧的Kruskal-Wallis测试进行了两组之间的比较，并进行了调整以进行多个比较。该图显示了DD-CFDNA的增量，并显示了病变的严重程度。扩展数据图5
关于下一代测序（NGS）检验的临床指导
下一代测序（NGS）是一种无培养的方法，用于分析样品中的微生物。这些测试在患者标本（例如血清，组织或CSF）中全部或一部分微生物基因的序列。本综述将重点介绍NGS测试的临床使用，包括Karius测试，华盛顿大学Broad-range PCR和Delve Bio（以前是UCSF的下一代精度诊断中心）CSF CFDNA。有关多重分子面板的临床使用的单独指南，请访问UNMC临床微生物学网站：https：//www.unmc.edu/intmed/intmed/Intmed/divisions/id/asp/clinicalmicro.html需要进行感染性疾病以获得下一代序列。只有ID临床医生才能在一个图表中订购这些测试，因此它们有助于解释结果和管理决策。缩写：
扭曲工程T4 DNA连接酶
拥挤的药物可在提高速度和效率的可选努力中使用了粘性拥挤剂，例如聚乙烯甘油（PEG），以增加底物的局部浓度并推动反应前进。但是，这种拥挤的代理可能会增加变异性或对于自动分配系统而言很难使用。此外，在克隆反应中使用拥挤剂需要在转换之前进行纯化步骤，这增加了动手的时间和处理。我们研究了在0％，2.5％和5％PEG 8000的情况下，各个连接酶对CFDNA底物的疗效。我们引用了电文件图的痕迹以识别3个连续的峰：底物，底物 + 1个适配器和底物 + 2个双侧适配器。如图5所示，扭曲工程的T4 DNA连接酶可以将大部分底物转换为所需的双连接峰独立于拥挤剂输入。