图1。三个小聚合酶核酶基序的发现和进化。(a)选择构造的格式用于初始选择回合(回合1至3或1至5),库是通过柔性链接器链接到杂交标签的六聚体标签的。生物素化引物可以捕获活性连接酶(在图中进行了详细描述S1-S2)。(b)在后期回合中使用的选择构建体的格式(3至11或5至11),需要三磷酸化的三核苷酸(Triplet)底物的聚合。在选择过程中,三胞胎(xxx)的序列(xxx)和由模板(x'x'x')编码的三重态数(y)在选择过程中变化(表S1中的详细信息)。(c)序列和预测从显示迭代三重三重连接的库中发现的三个核酶的二级结构,即三重酶聚合酶活性。在绿色中,源自随机库部分的核苷酸。在灰色的核苷酸中,源自恒定区域(接头和引物结合位点)。(d)在(b)中显示的(c)中显示的核酶的迭代三重聚会聚合,带有xxx = gcg和x'x'x'= cgc,y = 3。反应条件:50 nm核酶 - 基底,50 nm引物BCY3P10GA,50 nm模板T6FP10GAGCG3,5μMPPPGCG三胞胎,0.05%Tween 20,200 mm Kcl,50 mm Kcl,50 mm mgcl 2,50 mm mgcl 2,50 mm ches-koh,ph 9,3天,3天,以-77°°°°°°°°核酶与模板杂交。(E)序列和预测源自1-40克隆的QT51核酶的二级结构。黑色圆圈表示从1-40个祖先序列突变的6个残基;三角形表示2-核苷酸缺失。(f)60核苷酸序列的合成,该序列由CGU三重态的20个重复组成。Reaction conditions: 0.25 μM primer F10, 0.25 μM template tP10CGU20, 0.25 μM ribozyme, 10 μM pppCGU triplet, QT51 in 0.05% Tween 20, 50 mM MgCl 2 , 50 mM CHES-KOH, pH 9, 5TU+t1.5 in 200 mM MgCl 2 , 50 mM Tris-Cl, pH 8.3, 2 weeks在-7°C冷冻。核酶未与模板杂交。