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激活大肠杆菌中的无声糖酵解旁路
所有活生物体在其中央代谢中都有类似的反应，为所有19个基本构件和降低力量提供了前体。确定糖酵解20的替代代谢途径是否可以在大肠杆菌中运行，我们在硅设计，合理的工程和自适应21实验室进化中互补。首先，我们使用了一个基因组规模模型，并在该生物体的22个代谢网络中鉴定了两种潜在途径，取代了规范的Embden-Meyerhof-Parnas（EMP）糖酵解，将23个转化为有机酸的磷酸化。这些糖酵解路线之一是通过甲基乙二醇（通过丝氨酸生物合成和降解）进行的。然后，我们在大肠杆菌菌株中实施了两种途径25具有缺陷的EMP糖酵解。令人惊讶的是，通过甲基乙二醇的途径立即在26个三氧磷酸异构酶缺失菌株中培养在甘油上。相比之下，在磷酸甘油酸激酶27缺失菌株中，对于实现功能性28甲基甘氨酸途径的过表达是必要的。此外，我们设计了“丝氨酸分流”，该“丝氨酸分流”通过丝氨酸生物合成和降解转换为丙酮酸，绕过烯醇酶缺失。最后，为了探索30种这些替代方案中的哪些替代方法，我们使用烯醇酶缺失菌株进行了自适应实验室31进化研究。证明进化的突变体使用丝氨酸分流。32我们的研究揭示了代谢途径的灵活性重新定位，以建立新的代谢产物链接和重新连接33中央代谢。34
大肠杆菌和志贺氏菌的抗生素敏感性测试...
抗生素敏感性测试是一种测试细菌对抗生素反应的方法。这项研究旨在确定抗生素针对微生物活性的有效性。使用两种方法，即扩散方法和稀释方法进行灵敏度测试。使用纸盘（Kirby-bauer）对大肠杆菌和Shigella Sonnei细菌与阿莫西林，新霉素和磺酰胺抗生素进行扩散法进行了扩散法。所需的数据是抑制区的直径。结果表明，大肠杆菌对阿莫西林敏感，但对磺酰胺和新霉素有抵抗力。同时，Shigella Sonnei对阿莫西林，新霉素和磺胺酰胺具有抵抗力。此外，使用液体稀释法测试了稀释法以测试阿莫西林对大肠杆菌细菌的效力。所需的数据是带有液体培养基的测试管，没有显示浊度。结果表明，阿莫西林对大肠杆菌的最小抑制浓度为0.25％。基于使用扩散和稀释方法的抗生素敏感性测试的结果，可以得出结论，阿莫西林对大肠杆菌细菌具有很高的有效性，最小抑制浓度为0.25％，而志贺氏菌对抗生素的耐药性具有抗性。
大肠杆菌在癌症治疗中的创新策略
摘要背景和目标：基于大肠杆菌 (E. coli) 的新型癌症疗法最近引起了广泛关注。本研究研究了具有转基因大肠杆菌治疗癌症的潜力。方法：进行本系统综述以收集有关基于大肠杆菌的癌症疗法的相关文献。本研究搜索了多个数据库以查找临床前研究和早期临床试验。这些研究包括用于癌症治疗的转基因大肠杆菌的体外和体内评估。此外，本研究评估了基于大肠杆菌的疗法与其他疗法结合并使用个性化方法治疗癌症的潜力。结果：在仔细审查了 13,064 篇出版物后，经过筛选过程，纳入了 301 项研究进行定量分析，其中包括 44 篇文章。该综述表明，活的肿瘤靶向细菌有可能彻底改变癌症治疗。尽管传统癌症治疗面临挑战，但大肠杆菌提供了一种可以在肿瘤内积聚和增加的替代策略。大肠杆菌可通过基因操作和合成生物工程携带多种抗癌剂，使其成为定制治疗方法的理想载体。研究人员发现它们可用作单一疗法或联合疗法，为增强临床效果提供多方面的解决方案。多项针对肿瘤的大肠杆菌临床试验正在进行中，表明理论前景已转化为实际应用。结论：总而言之，活的靶向肿瘤细菌可能能够解决现有癌症治疗的局限性。其抗肿瘤免疫反应的选择性、可编程性和诱导抗肿瘤免疫反应的能力表明了显著的进步。尽管存在这些挑战，但正在进行的临床试验表明，大肠杆菌融入癌症治疗方案的方式发生了切实的转变。需要进行更多的研究和开发，以充分利用这些新的靶向抗癌策略。关键词：大肠杆菌、癌症治疗、系统评价、体外、体内资金：无。*本作品已根据 CC BY-NC-SA 许可发表。版权所有 © 作者 引用本文为：Ameli N、Shahriari A、Yousefi M、Alaghi A、Gorgestani O、Hatami B。大肠杆菌在癌症治疗中的创新策略：系统评价。伊朗红新月会医学杂志，2024，20.1-13。一、简介
在香蕉皮中的大肠杆菌生存...
评估了次氯酸钠对香蕉卫生的功效，并评估了从哥斯达黎加到美国的模拟出口运输过程中大肠杆菌对香蕉的生存。香蕉（Musa spp。，AAA组，Cavendish子组）被大肠杆菌ATCC 25922（7 log cfu/g）接种，然后将五分钟浸入次氯酸钠溶液中（0、50、50、100、100、150和200 ppm）在模拟的出口运输条件下（14±1°C；相对湿度为85–90％；聚集在聚乙烯袋和纸板箱中）的在模拟出口传输条件下（14±1°C； 85–90％的相对湿度）监测了在香蕉表面上的大肠杆菌群体。 大肠杆菌在储存的0、1、5、7、12和14天以35±2°C孵育24小时以0、1、5、7、12和14天的储存。试验一式三份进行。 次氯酸钠浓度为100 ppm或更高的大肠杆菌减少至少3型。 在100至200 ppm的消毒剂之间没有发现显着差异（P≥0.05）。 储存时间显着影响（p≤0.05）大肠杆菌种群。 大约3-log在模拟出口传输条件下（14±1°C； 85–90％的相对湿度）监测了在香蕉表面上的大肠杆菌群体。大肠杆菌在储存的0、1、5、7、12和14天以35±2°C孵育24小时以0、1、5、7、12和14天的储存。试验一式三份进行。次氯酸钠浓度为100 ppm或更高的大肠杆菌减少至少3型。在100至200 ppm的消毒剂之间没有发现显着差异（P≥0.05）。储存时间显着影响（p≤0.05）大肠杆菌种群。大约3-log
大肠杆菌旋转酶超涂料抑制测定
使用该酶的浓度。应在将使用的DMSO的最终浓度下进行酶的初始滴定（请参见上面的注1）。可以使用5-10％（v/v）DMSO（最终浓度），但这将导致活动巨大损失。在存在DMSO的情况下，需要添加更多酶，以允许其抑制作用。例如，如果酶在5％DMSO的存在下仅具有50％的活性，则是两倍（即2U）将需要添加以获得完整的超螺旋。在这种情况下，可能需要添加更多的抑制剂才能获得50％的抑制作用。4）稀释缓冲液含有高浓度的甘油，因此添加了总稀释缓冲液
反刍生物过滤器的大肠杆菌中的合成甲烷植物
反刍动物的排放量负责导致全球变暖的人为温室气体的很大一部分。牛的甲烷排放量是弥漫性的，难以治疗，但是，已经提出了几种溶液，可以降低从牛发出的低（v/v）甲烷流，最高约30％。Wageningen大学和研究国际基因工程机竞赛提出的新型Cattlelyst生物滤器旨在通过引擎盖系统和两个在三层安全机制下收集和转化从牛发出的甲烷和氨和氨。目标是将大肠杆菌施加到合适的合成甲烷肉芽菌中。在本文中，试图在合适的甲肉营养菌株SM1或C1SAUX中表达合成甲烷营养。所得的产物是一个PSEVA2610-SMMO质粒，其中包含SMMO的亚基，并在MMOX基因中复制。无法实现其他伴侣的质粒，并且未显示SM1和C1SAUX菌株的甲基营养生长。最后，该假设既没有得到证实或拒绝。生物过滤器的合成甲烷植物正在成为一种越来越相关的技术来解决低浓度的甲烷，因为本文中探讨了多种技术进步。预计生物滤器设计的改进，例如在引擎盖中浓缩甲烷，多孔填料材料以及具有工程性的特定培养物，可以使生物过滤器成为实现全球甲烷承诺的有用工具。
DNA聚合酶I（大肠杆菌）-ABO
DNA聚合酶I（大肠杆菌）是一种固有的3´→5´（校对）和5´→3´核酸酶活性的不可用疗法的DNA聚合酶，此外还具有较低和非特异性核糖核酸酶H活性。5´→3´外核酸酶Acɵvity在生长的DNA链之前去除核驱动器，从而可以进行划痕 - 翻译。因此，DNA聚合酶I（大肠杆菌）不显示链脱位活性，可用于通过尼克翻译来标记DNA，并与DNase I或第二链cDNA合成，或与RNase H. DNA聚合酶I（E. coli）接受Modified nitified nucified Nucified Nucified Nicified Nicified Nicified Nicified 生物素 - ，二氧素蛋白，荧光标记的核苷酸）作为DNA合成的底物。生物素 - ，二氧素蛋白，荧光标记的核苷酸）作为DNA合成的底物。
diaphorin，一种由亚洲柑橘cyllid的细菌内共生菌产生的聚酮化合物，不利地影响了来自Escherichia coli和bacillich coli和bacillus bacillus coli和bacillus bacillus coli
diaphorin是由“ candidatus profftella armatura”（伽马马环状）产生的聚酮化合物，这是重要的农业害虫的强制性互助者，亚洲柑橘cyllid psyllid-ina-ina citri- citri（hemiptera）。我们先前的研究表明，diaphorin在d的生理浓度下。citri，抑制枯草芽孢杆菌（Firmicutes）的生长和细胞分裂，但促进了大肠杆菌（γ-蛋白酶菌）的生长和代谢活性。这种独特的diaphorin特性可以帮助D。citri，可能会影响“念珠菌自由杆菌属”的传播。 （字母杆菌），最具破坏性柑橘疾病的病原体。此外，可以利用该特性来促进微生物生产工业材料的效率。但是，此活动的基础机制尚不清楚。diaphorin属于Pederin-型化合物的家族，该家族通过与真核生物核糖体结合来抑制真核生物中的蛋白质合成。因此，作为评估diaphorin对细菌基因表达的直接影响的第一步，这项研究检查了使用b的核糖体使用diaphorin对体外翻译的影响。枯草和e。大肠杆菌，量化绿色荧光蛋白的产生。结果表明涉及b的基因表达。枯草和e。大肠杆菌核糖体以及五毫米透明蛋白分别为29.6％和13.1％，而不是对照。这表明diaphorin对b的不良影响。枯草液至少部分地归因于其对基因表达的抑制作用。此外，由于翻译系统的成分是常见的，除了核糖体以外，b骨出现了更大的抑制作用。枯草核糖体暗示核糖体是diaphorin的潜在靶标之一。另一方面，结果也暗示diaphorin对E的积极影响。大肠杆菌是由于转录和翻译的核心机制以外的目标。这项研究首次进行了pederin同类体影响细菌基因表达的情况。
大肠杆菌中鞭毛蛋白表达和运动的启动子驱动的调节
合成生物学为工程生物系统提供了强大的工具，用于不同的应用。然而，在实现现实世界应用（例如环境生物修复或用于靶向药物的治疗微型机器人）之类的实际应用之前，主要的挑战一直存在。这项研究旨在通过在大肠杆菌中使用工程启动子调节基因表达来精确控制细菌运动。我们专注于模型生物的大肠杆菌，并通过工程化鞭毛蛋白的表达来操纵其运动，这是一种至关重要的细菌运动蛋白。为了实现这一目标，采用了特定的遗传启动子来调节鞭毛蛋白的产生，从而决定了这些细菌的运动能力。启动子启用了针对鞭毛蛋白表达的有针对性的调整，这反过来允许增强或抑制细菌运动。有趣的是，启动子设计参数与基因表达水平之间的关系是非线性的，突出了复杂的基础动力学。最佳细菌运动发生在30°C，说明了环境因素的影响。我们的发现证明了使用基因工程策略有效调节运动型等复杂微生物表型的能力。结果不仅扩展了我们对细菌基因调节的理解，而且还强调了合成生物学在创建各种生物技术应用中创建功能和适应性的微生物表型方面的变革潜力。
衰老对尿路上皮稳态和免疫的影响
从相同起源发起的抽象双向DNA复制复制络合物在零件或其所有生命的一部分中都以工厂配置进行了共同体系。但是，几乎没有证据表明姐妹的重生在功能上是相互依存的，而工厂复制的结果尚不清楚。在这里，我们研究了大肠杆菌中姐妹重新组合之间的功能关系，该复制自然在同一复制周期中表现出工厂和孤立构型。使用诱导的转录因子障碍系统，我们发现阻止一个重建体导致姊妹重壳体的总体进展和速度显着降低。非常明显的是，只有在姐妹重生仍处于工厂配置时发生块时，进展才受到损害 - 当姐妹补充物在物理上分开时，阻止一个叉子对另一个叉子没有显着影响。工厂复制的破坏还导致叉车停滞和叉子重新启动机制的需求增加。这些结果表明，姐妹复制体之间的物理关联对于建立有效且不间断的复制程序很重要。我们讨论了我们的发现对复制机制的结构和功能机制的含义，以及复制有问题的DNA（例如高转录段）的细胞策略。