Le Cong, 1,2 * F. Ann Ran, 1,4 * David Cox, 1,3 Shuailiang Lin, 1,5 Robert Barretto, 6 Naomi Habib, 1 Patrick D. Hsu, 1,4 Xuebing Wu, 7 Wenyan Jiang, 8 Luciano Marraffini, 8 Feng Zhang 1 †
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生物技术、合成生物学和基础研究对多种染色体修饰的需求要求开发新技术。利用 CRISPR SWAPnDROP,我们将基因组编辑的极限扩展到细菌物种之间大规模体内 DNA 转移。其模块化平台方法有助于物种特异性适应,从而在各种物种中实现基因组编辑。在这项研究中,我们展示了 CRISPR SWAPnDROP 概念在模型生物大肠杆菌和目前增长最快、与生物技术相关的生物弧菌中的实现。我们展示了 151kb 染色体 DNA 在大肠杆菌菌株之间以及从大肠杆菌到弧菌的切除、转移和整合,而无需大小限制的中间 DNA 提取。随着大肠杆菌 MG1655 野生型乳糖操纵子的转移,我们在弧菌中建立了功能性的乳糖和半乳糖降解途径,以扩展其生物技术谱。我们还转移了大肠杆菌 DH5 α lac 操纵子,使 V. natriegens 能够进行 α 互补 - 这是朝着超快速克隆菌株迈出的一步。此外,CRISPR SWAPnDROP 旨在成为基因组工程的瑞士军刀。其应用范围包括无疤痕、无标记、迭代和并行插入和删除、基因组重排以及菌株间和物种间的基因转移。模块化特性有利于 DNA 库应用和标准化部件的回收利用。其新颖的多色无疤痕共选择系统显著提高了单次编辑的编辑效率,四次编辑的编辑效率提高到 83%,并在整个组装和编辑过程中提供视觉质量控制。
封面图片来源:https://www.drugtargetreview.com/news/74139/nobel- priper--in-hamistry-award-to-scientists-scientists-iho-iho-difcovered-rispr-cas9/
到目前为止,七个冠状病毒已引起人类疾病(4、5)。两种含有人畜共患起源的菌株,其中包含严重的急性呼吸综合症冠状病毒(SARS-COV)和中东呼吸道综合征冠状病毒(MERS-COV)与2003年和2012年人类的严重呼吸疾病的出现有关人类大流行。Like SARS and MERS, the symptoms of COVID-19 are commonly recognized from mild to critical as dry cough, sore throat, nasal congestion, malaise, headache, muscle pain, fever, shortness of breath, dyspnea, respiratory distress, tachypnea less than 30 breaths per minute, hypoxia less than 90% of SpO2 on room air, conjunctivitis, diarrhea, confusion, chest疼痛,恶心,呕吐,厌食和消化不良(6-10)。与其他冠状病毒一样,SARS-COV-2是一种阳性的RNA病毒,它会感染上呼吸道和下呼吸道(11)。此外,其生命周期可能与SAR有关。严重传染性,其发病率和死亡率迅速发展。此外,还没有特定的疫苗和治疗。因此,在
• EBV 是一种多拷贝的附加体,在潜在感染的细胞中通常保留 5-100 个 cccDNA 拷贝(Adams 和 Lindahl 1975)。
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Cas 酶是细菌免疫系统的一部分,可将短的病毒 DNA 序列整合到细菌基因组中。这是一个复杂的过程,尚未完全了解 [ 3 ]。人们所熟知的是,这些病毒序列在细菌基因组中以规则的间隔排列,彼此相距很短。这些序列之间的细菌 DNA 具有回文重复模式,因此得名,即成簇的规则间隔的短回文重复序列。整合的病毒 DNA 序列可以在需要时翻译成向导 RNA (gRNA)——也就是说,如果同一种病毒试图再次感染细菌,CRISPR 系统可以通过使用 gRNA 和 Cas 酶切割入侵的病毒 DNA。细菌免疫过程的最后一步是将 gRNA 与 Cas 结合并切割目标 DNA,这是实验室中用于基因组编辑的方法。随着 CRISPR 技术触手可及,我们进入了基因组工程的黄金时代。