废水包含许多不同的ARG与来自人类,病毒和细菌在内的各种来源的遗传物质混合在一起。因为ARG仅占总DNA含量的很小比例,因此在废水样品中发现它们需要敏感的检测方法。最常见的技术是定量聚合酶链反应(QPCR)。此方法使用称为引物的RNA指南来识别已知ARG的特定DNA序列,然后将其放大以进行检测。
亚培养从粘附细胞中去除旧培养基,并用无钙和镁的PBS洗涤它们。使用3-5 mL PBS进行T25烧瓶,T75烧瓶使用5-10 mL。然后用ACCUTASE完全疲倦,T25 Colber用1-2 mL和T75烧瓶的2.5 mL静止。让细胞在室温下孵育8-10分钟以松开它们。孵育后,将细胞与10 ml培养基轻轻混合以使其恢复它们,然后以300xg离心3分钟。丢弃上清液,将细胞重悬于新培养基中,然后将其转移到已经包含新培养基的新瓶中。
亚培养消除了粘附细胞的古老介质,并用缺乏钙和镁的PBS洗涤它们。 div>对于T25烧瓶,使用3-5毫升PBS,对于T75烧瓶,使用5-10毫升。 div>然后用1-2 mL对T25和2.5 mL烧瓶进行T75烧瓶的作用覆盖细胞。 div>让细胞在室温下孵育8-10分钟以释放它们。 div>孵化后,将细胞与10 ml培养基轻轻混合,以重悬于它们,然后离心至300xg 300倍。 div>丢弃上清液,将细胞重悬于凉爽的介质中,然后将其转移到已经包含新鲜手段的新瓶中。 div>
亚培养物从粘附细胞中去除旧培养基,并用不含钙和镁的PBS洗涤它们。将T25活塞3-5毫升PBS和T75活塞使用5-10毫升。然后将细胞完全用ACCUTASE覆盖,其中T25活塞的1-2 mL和T75活塞的2.5 mL。让细胞在室温下孵育8-10分钟以更换它们。孵育后,将细胞与10 ml培养基仔细混合以使它们共振,然后以300xg离心3分钟。丢弃上清液,在新鲜培养基中产生共鸣,并将其转换为已经包含新鲜培养基的新活塞。
I.简介香蕉(Musa spp。)是全球消耗量最多的水果之一,对数百万人的饮食产生了重大贡献,尤其是在热带和亚热带地区。在生产和消费方面,他们在全球五大主食中都排名榜首。根据粮食和农业组织(FAO),全球香蕉的产量在2022年达到了约1.53亿吨,其中包括印度,中国,菲律宾和厄瓜多尔在内的主要生产商。香蕉营养丰富,甚至可以携带美国医学协会在20世纪初期认可的第一个“超级食品”的头衔,作为儿童的健康食品和腹腔疾病的治疗方法。一份或一种中等成熟的香蕉,可提供约110卡路里的卡路里,0-克脂肪,1克蛋白,28克碳水化合物,15克糖(天然发生),3克纤维和450 mg钾。除了饮食重要性外,香蕉还为许多国家(尤其是拉丁美洲,非洲和亚洲的经济体)做出了重大贡献。例如,在厄瓜多尔,香蕉是主要出口商品之一,约占该国农业出口收入的30%(粮农组织,2022年)。同样,印度是最大的香蕉生产国,依靠农作物来用于国内消费,也是小农户的生计来源。香蕉的社会和经济相关性强调了改善香蕉生产和收获后管理以最大程度地减少损失的必要性。
许多炎症关节疾病与CD10蛋白的表达相关,CD10蛋白在炎症和疼痛传播信号中起很大作用。这种促炎性机制是人类肌肉骨骼组织中各种关节的关节软骨降解的主要指标。CD10在间充质干细胞(MSC)中的表达与其免疫调节和软骨保护作用直接相关。因此,该项目着重于开发基于适应性的生物传感器,该生物传感器将检测CD10表达而不会扰动样品。适体是一个小的单链核酸分子,可以折叠成独特的结构,从而使它们能够高特异性与各种分子蛋白靶标结合。这使他们能够检测出大量的高和低丰度分子。该项目的第一步是使用称为SELEX(指数富集对配体的系统演变)的过程为CD10开发高亲和力适体。我们从一个初始的单链RNA库开始,该库包含大约10 14个不同的序列。将RNA文库与溶液中的CD10蛋白一起孵育。然后使用硝酸纤维素滤光片将蛋白-RNA复合物与未经膜的RNA分离。然后,在对RNA进行逆转录和PCR之前,我们将蛋白质与RNA分开。第一轮之后的最终产物包含与CD10蛋白结合的ssRNA分子。我已经完成了2轮SELEX,并有令人鼓舞的结果。此过程将重复大约10次,使我们能够识别与CD10高亲和力结合的RNA适体。这是开发适体CRISPR传感器的关键步骤,因为某些样品的CD10表达较低。
直接从痰液中直接从痰液中检测到结核病检测的流线型护理点测试。 5,6,Padmapriya Banada 2,#,Yingda L. Xie 2,#,Cameron Myhrvold 1,7,8,9,#,#,†1普林斯顿大学分子生物学系,普林斯顿新泽西州,新泽西州普林斯顿大学,08544,美国08544,美国,美国2公共卫生研究所,新吉尔特吉尔特尔医学院,新吉尔斯医学院,新泽西州,新泽西州,新泽西州。 Epidemiology of Microbial Diseases, Yale School of Public Health, New Haven, Connecticut, United States of America 4 Pulmonary, Critical Care, and Sleep Medicine Section, Yale School of Medicine, New Haven, Connecticut, United States of America 5 Centro Internacional de Entrenamiento e Investigaciones Médicas (CIDEIM), Cali, Colombia 6 Universidad Icesi, Cali, Colombia 7 Department of Chemical and Biological工程,普林斯顿大学,新泽西州普林斯顿大学,美国08544,美国8 Omenn-Darling Bio Giogineering Institute,普林斯顿大学,新泽西州普林斯顿大学,新泽西州,08544,美国9美国,普林斯顿大学,普林斯顿大学,普林斯顿大学,新泽西州,新泽西作者同样贡献#这些作者同样贡献†相应的作者:cmyhrvol@princeton.edu摘要结核分枝杆菌(MTB)是对全球健康的主要威胁,每年造成超过100万人死亡。我们试图开发一种基于CRISPR的等温测定法,再加上兼容,直接的样品处理技术,用于护理点。为了阻止病例的潮流并最大程度地提高了早期干预措施的机会,迫切需要在资源不足的地区负担得起,简单的结核病诊断手段。在这里,我们将重组酶聚合酶扩增(RPA)与CAS13A和CAS12A相结合,以创建两个并行的单锅测定,它们检测MTB的两个保守元素(IS6110和IS1081)和一个内部对照人类DNA。这些测定显示与横向流相兼容,并且很容易冻干。我们的最终测定在痰液中的各种细菌载荷(10 5至10 2 CFU/mL)上表现出敏感性。对于M. Bcg的M. Bovis bcg的M. BCG,测定法检测限为69.0(51.0 - 86.9)CFU/ML的MTB菌株H37RV为MTB菌株H37RV和80.5(59.4 - 101.6)CFU/ML。我们的测定法没有针对广泛的细菌/真菌分离株的交叉反应性。对13个盲痰样品的临床测试显示,与培养物相比,100%(6/6)的灵敏度和100%(7/7)的特异性。我们的测定法在临床样品中表现出与微生物黄金标准,结核病培养以及对核酸最先进的GenExpert MTB/RIF Ultra的敏感性。这项技术以快速且强大的格式简化了从样品提取到测定读数的诊断,这使其成为结合放大和检测的第一个测试,同时与横向流动和冻干兼容。
。cc-by-nc 4.0国际许可(未获得同行评审证明),他授予Biorxiv授予Biorxiv的许可,以永久显示预印本。这是该版本的版权持有人,该版本发布于2025年3月7日。 https://doi.org/10.1101/2025.03.03.03.03.641322 doi:Biorxiv Preprint
噬菌体(噬菌体)构成了地球上最丰富和遗传多样的实体。细菌与估计全球总数10³为病毒体的相互作用显着塑造了人类健康和环境生态系统(1)。噬菌体与其细菌宿主之间的生态相互作用的规模驱动了一种遗传武器种族,从而不断改变分子水平的微生物寿命(2)。在大型时间尺度上快速发展而产生的多样性为人类健康创新(例如噬菌体疗法)提供了基础,以及生物技术创新的基础,例如群集定期散布的短期短滴定重复序列(CRISPR)和CRISPR与CRISPPR相关(CAS)蛋白质系统(3-5)。然而,具有巨大的遗传多样性是伟大的未知数 - 对绝大多数噬菌体中的基因含量已知。与细菌对应物相比,噬菌体基因组编码具有已知或预测功能的基因的小部分,这构成了生物圈中最大的遗传暗物质(未知功能基因)之一(6)。尽管有可能使用经典的遗传技术将一些暗物质带到光线下,但仍需要更高的实验方法来简化和加快噬菌体基因组的遗传遗传含量的表征和加快表征。