XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search SystemCTNNB1
认可参数列表 Oncoscreen Jena v5.xlsx
Oncomine Comprehensive Assay v3 DNA 组：AKT1、AKT2、AKT3、ALK、AR、ARAF、ARID1A、ATM、ATR、ATRX、AXL、BAP1、BRAF、BRCA1、BRCA2、BTK、CBL、CCND1、CCND2、CCND3、CCNE1、CDK12、CDK2、CDK4、CDK6、CDKN1B、CDKN2A、CDKN2B、CHEK1、CHEK2、CREBBP、CSF1R、CTNNB1、DDR2、EGFR、ERBB2、ERBB3、ERBB4、ERCC2、ESR1、EZH2、FANCA、FANCD2、FANCI、FBXW7、FGF19、FGF3、FGFR1、FGFR2、FGFR3、FGFR4、FLT3、 FOXL2、GATA2、GNA11、GNAQ、GNAS、H3-3A、HIST1H1E、HNF1A、HRAS、IDH1、IDH2、IGF1R、JAK1、JAK2、JAK3、KDR、KIT、KNSTRN、KRAS、MAGOH、MAP2K1、MAP2K2、MAP2K4、MAPK1、MAX、MDM2、 MDM4、MED12、MET、MLH1、MRE11A、MSH2、MSH6、MTOR、MYC、MYCL、MYCN、MYD88、NBN、NF1、NF2、NFE2L2、NOTCH1、NOTCH2、NOTCH3、NRAS、NTRK1、NTRK2、NTRK3、PALB2、PDGFRA、PDGFRB、PIK3CA、 PIK3CB, PIK3R1、PMS2、POLE、PPARG、PPP2R1A、PTCH1、PTEN、PTPN11、RAC1、RAD50、RAD51、RAD51B、RAD51C、RAD51D、RAF1、RB1、RET、RHEB、RHOA、RICTOR、RNF43、ROS1、SETD2、SF3B1、SLX4、SMAD4、SMARCA4、SMARCB1、SMO、SPOP、SRC、STAT3、STK11、TERT、TOP1、TP53、TSC1、TSC2、U2AF1、XPO1
髓母细胞瘤的分子分层
摘要。髓母细胞瘤 (MB) 是最常见的儿童恶性后颅窝肿瘤。最近的遗传、表观遗传和转录组分析将 MB 分为三个亚组，即无翅型 (WNT)、Sonic Hedgehog (SHH) 和非 WNT/非 SHH（最初称为第 3 组和第 4 组），具有不同的患者特征和预后。WNT 是最不常见但预后最好的亚组，其特征是核 β-catenin 表达、Catenin beta-1 (CTNNB1) 突变和 6 号染色体单体性。SHH 肿瘤含有 GLI1、GLI2、SUFU 和 PTCH1 基因的突变和改变，这些基因组成性激活 SHH 通路。最初，TP53 基因改变和/或 MYC 扩增的存在被认为是最可靠的预后因素。然而，最近的分子分析将 SHH MB 细分为几种亚型，这些亚型具有不同的特征，例如年龄、TP53 突变、MYC 扩增、转移的存在、TERT 启动子改变、PTEN 丢失和其他染色体改变以及 SHH 通路相关基因突变。第三个非 WNT/非 SHH MB（组 3/4）亚组在遗传上高度异质性，并显示出几种分子模式，包括 MYC 和 OTX2 扩增、GFI1B 激活、KBTBD4 突变、GFI1 重排、PRDM6 增强子劫持、KDM6A 突变、LCA 组织学、10 号染色体丢失、17q 等染色体、SNCAIP 重复和 CDK6 扩增。然而，基于
回顾现代颅咽管瘤的靶向治疗
背景：颅咽管瘤 (CP) 与关键神经血管结构的接近可导致一系列神经和内分泌并发症，从而给手术治疗带来困难。在本综述中，我们研究了与 CP 有关的分子和遗传标记、它们在致瘤途径中的参与以及它们对 CP 预后和治疗的影响。方法：我们对与 CP 有关的相关文章、临床试验和分子摘要进行了重点回顾。结果：遗传和免疫标记在不同类型的 CP 中表现出不同的表达。BRAF 与乳头状 CP (pCP) 的肿瘤发生有关，而 CTNNB1 和 EGFR 在釉质瘤性 CP (aCP) 中经常过度表达，VEGF 在 aCP 和复发性 CP 中过度表达。抑制这些途径的靶向治疗方式可以缩小或阻止 CP 的进展。此外，EGFR 抑制剂可能会使肿瘤对放射疗法敏感。这些药物在脑性瘫痪的医疗管理和新辅助治疗中显示出良好的前景。免疫疗法，包括抗白细胞介素 6 (IL-6) 药物和干扰素治疗，在控制肿瘤生长方面也非常有效。正在进行的脑性瘫痪临床试验有限，但正在测试 BRAF/MET 抑制剂和 IL-6 单克隆抗体。结论：遗传和免疫标记在脑性瘫痪的不同亚型中表现出不同的表达。目前几种分子疗法在治疗这种疾病方面取得了一些成功。额外的临床试验和靶向疗法对于改善脑性瘫痪患者的预后非常重要。
解释和整合临床癌症治疗中的基因组检测结果：概述和实用指南
图 1 按照癌症类型划分的晚期癌症患者比例，这些患者可能有资格接受生物标志物相关疗法或生物标志物指导的临床试验。根据 Normanno 等人，2022 年的资料改编和更新。9 生物标志物流行率数据基于对 AACR GENIE 真实世界基因组数据集第 8 版的内部分析（AACR Project GENIE Consortium，2017 10）。癌症发病率基于 2015-2017 年英国癌症研究中心的数据。晚期疾病患者比例来自英国癌症研究中心和国家癌症研究所监测、流行病学和最终结果 (SEER) 计划以及其他来源。获批疗法基于 FDA 批准。临床试验生物标志物（已获批准药物的癌症类型除外）：ERBB2 突变和扩增（乳腺癌、NSCLC 和胃癌除外）、KRAS G12C（NSCLC 除外）、CCNE1 扩增、STK11（仅限 NSCLC）、MET 扩增、PALB2（乳腺癌、胰腺癌、卵巢癌）、ARID1A、EGFR（NSCLC 除外）、IHD1/2（胆道癌除外）、PIK3CA（乳腺癌除外）、AKT1/2/3（乳腺癌除外）、CDK12、ERBB3/4 扩增和突变、FGFR1 融合和突变、ATM（前列腺癌除外）、BAP1、CTNNB1、NF1/2 和 PTCH1。AACR 表示美国癌症研究协会；CNS，中枢神经系统；FDA，美国食品药品监督管理局；GENIE，基因组学证据肿瘤信息交换；NSCLC，非小细胞肺癌；SCLC，小细胞肺癌。
对 1350 例神经内分泌肿瘤进行分析可识别出多种...
结果：总体而言，在 1350 例病例中，有 1295 例 (96%) 被确认存在药物治疗相关改变。在 149/243 例胰腺病例 (61%) 和 488/1015 (48%) 非胰腺 NET 中发现 MGMT 表达低或缺失 (IHC 为 0 或 1+)，MGMT 是烷化剂敏感性的生物标志物。在 927/1193 例 NET (78%) 中发现 RRM1 是吉西他滨敏感性的生物标志物，RRM1 表达低或缺失 (IHC 为 0 或 1+)，在 950/1187 例 NET (80%) 中发现胸苷合酶 TS 是氟嘧啶敏感性的生物标志物，TS 表达低或缺失。肿瘤测序表明，BRAF（6/446（3 例为 V600E、2 例为 G596R、1 例为 K601E）、CTNNB1（3/223）、KIT（4/357）、EGFR（1/245）、FGFR2（2/224）、GNAS（1/224）、HRAS（2/192）、PIK3CA（10/418）、RB1（4/222）VHL（2/203）、KRAS（23/472）、NRAS（2/349）和 APC（14/224）存在致癌突变，EGFR（46/688）和 MET（4/306）存在扩增。在有记录的病例中，以基于机制的生物标志物为指导的治疗产生了持久的反应：一例患有 KIT 突变的转移性 NET 患者对伊马替尼治疗后部分缓解（PR）>1 年，对于 MGMT 低 / TS 低的患者，则使用链脲佐菌素或替莫唑胺加氟嘧啶化疗进行治疗，从而支持 NET 靶标分析的临床相关性。结论：尽管单个生物标志物的频率较低，但对大量 NET（n=1350）进行全面的多平台分析，在 90% 以上的患者中确定了临床相关靶标。鉴于 NET 化疗的使用率越来越高，我们的研究结果为未来临床试验评估基于生物标志物的 NET 治疗的疗效提供了基础。
精准癌症医学在转移性胆道癌中的应用
摘要 简介 晚期治疗难治性胆道癌 (BTC) 预后不良，对适当的治疗策略构成了重大挑战。通过绘制晚期 BTC 患者的分子图谱，精准癌症医学可以为这些患者提供有针对性的治疗。目的 在本分析中，我们旨在展示 PCM 在转移性 BTC 中的潜力。方法 在我们的 PCM 平台的单中心、真实世界回顾性分析中，我们描述了 30 名被诊断为不同类型转移性 BTC 的患者的分子图谱。使用 161 基因下一代测序面板、免疫组织化学 (IHC) 和荧光原位杂交检查患者的肿瘤样本以检测染色体易位。结果 我们总共在 30 名患者中发现了 35 种分子畸变。主要突变为 KRAS ( n = 8)、TP53 ( n = 7)、IDH2 ( n = 4) 和 IDH1 ( n = 3)，这些突变占所有分子改变的大部分 (62.86%)。在两例患者中观察到 BRAF 突变。在 ARID1A 、 CTNNB1 、ESR1 、FBXW7 、FGFR2 、MET 、NOTCH2 、PIK3CA 、PTCH1 、SMAD4 和 SRC1 中观察到较少见的改变，各见一例。在一名患者中检测到 FGFR 融合基因。在八名患者中未检测到突变。IHC 显示 28 名患者有 EGFR 和 p-mTOR 表达。将这些结果应用于我们的患者，建议对 60% 的患者 ( n = 18 ) 进行靶向治疗。一名患者的病情稳定。结论 PCM 是一种可行的治疗方法，可以为转移性 BTC 提供分子引导治疗建议。
肝细胞癌的治疗进展
肝细胞癌（HCC）仍然是全球与癌症相关死亡的主要原因。免疫疗法，靶向疗法和联合治疗的最新进展已显着改善许多HCC患者的结局。本评论总结了2024年ASCO年度会议的关键发现，重点是新兴疗法，包括免疫检查点抑制剂（ICIS），CAR-T细胞疗法，溶瘤病毒以及局部区域疗法，例如跨性别化学栓塞（TACE）和肝脏肠胃不接受化学疗法（Hapticalial Infife Infife Chemothy）。ICI，尤其是与其他药物结合在一起时，已经显示出有希望的效率，尽管仍然存在诸如免疫相关的不良事件和抵抗机制之类的挑战。CAR-T细胞疗法和溶瘤病毒为晚期HCC提供了新型的治疗途径，但是它们在实体瘤中的长期效率仍在研究中。局部疗法，尤其是与全身治疗的结合，在管理不可切除的HCC和提高外科切除率的转化率方面继续发挥关键作用。此外，正在探索生物标志物（例如缺氧评分和CTNNB1突变）的潜力，以更好地个性化治疗并预测患者反应。这些生物标志物可以为更有针对性和有效的治疗策略铺平道路。总体而言，最近在ASCO遇到的最新研究重点介绍了HCC治疗的进展，强调了持续创新的重要性。未来的研究应集中于克服抗药性机制，优化组合疗法以及整合生物标志物驱动的方法，以改善患者的结果并增强个性化治疗策略。
鉴定基于免疫基因组学的肾上腺皮质癌的免疫特异性亚型
摘要：背景：肾上腺皮质癌（ACC）的肿瘤免疫微环境（时间）是异质的。但是，基于时间的ACC分类仍未探索。方法：我们基于二十三个免疫特征的富集水平分层群集ACC，以识别其免疫特异性亚型。此外，我们全面比较了亚型之间的临床和分子纤维。结果：我们分别识别出分别具有高和低免疫特征分数的ACC：ACC的两个免疫特异性亚型。我们证明了通过分析五个不同的ACC队列，这种亚型方法是稳定且可重复的。与免疫H相比，免疫力L的免疫细胞水平较低，整体和无疾病的生存预后较差，肿瘤干性较高，基因组不稳定性，增殖潜力和肿瘤内异质性。此外，ACC驱动基因CTNNB1在免疫中比免疫H中更频繁地突变。与免疫H相比，几种蛋白质，例如MTOR，ERCC1，AKT，ACC1，Cyclin_E1，β-Catenin，Fasn和GAPDH，在免疫H中更高地表达在免疫中。相反，在免疫H中更高度表达了P53，SYK，LCK，PERX1和MAPK。途径和基因本体分析表明，免疫，基质和凋亡途径在免疫H中高度富集，而细胞周期，类固醇生物合成和DNA损伤修复途径在免疫中高度富集。结论：ACC可以分为两种稳定的免疫相关亚型，它们具有明显不同的抗肿瘤反应，分子特征和临床结果。这种亚型可能会为ACC的预后和免疫治疗层分层提供临床意义。
细胞外囊泡是否具有特定的靶细胞？
细胞外囊泡（EV）是细胞间通信的使者，但是受体细胞解释EV消息的确切机制仍未完全理解。在这项研究中，我们探讨了电动汽车的起源，它们的蛋白质货物的起源以及受体细胞类型如何影响胚胎植入模型中对EV的细胞反应。我们使用定量聚合酶链（QPCR）对受体细胞中锌纤维蛋白81（ZNF81）基因表达的两种类型的EV进行了处理。还分析了EV货物的蛋白质组学含量。结果表明，Znf81基因的下调是接受性子宫内膜上皮细胞对滋养细胞衍生的EV的特定细胞反应。蛋白质货物分析表明，电动汽车的蛋白质组学因素取决于其原产细胞，因此可能会影响受体细胞对EV的反应。Furthermore, trophoblastic EVs were found to be speci fi cally enriched with transcription factors such as CTNNB1 (catenin beta- 1), HDAC2 (histone deacetylase 2), and NOTCH1 (neurogenic locus notch homolog protein 1), which are known regulators of ZNF81 gene expression.当前的研究提供了支持EV特异性存在的令人信服的证据，在这种情况下，电动汽车和受体细胞类型的特征共同有助于调节EV目标特定。此外，EV蛋白货物分析表明，转录因子与滋养细胞EV的特定功能之间存在潜在的关联。这种体外胚胎植入模型和ZNF81读出提供了一个独特的平台来研究自然细胞 - 细胞通信中的EV特定功能。
解密荜茇的抗癌武器库
简介：肺癌的特征是肺组织内细胞增殖不受控制，是全球癌症相关死亡的主要原因。传统药草荜茇因其有据可查的抗癌特性而成为肿瘤学研究的重要竞争者，表明其具有开发新疗法的潜力。方法：本研究采用网络药理学和组学方法，通过识别荜茇的生物活性成分及其相应的分子靶点，阐明荜茇的抗肺癌潜力。结果：通过全面的文献综述和综合药用植物化学和治疗学数据库 (IMPPAT)，我们从荜茇中鉴定出 33 种生物活性分子。随后，使用 SwissTargetPrediction、SuperPred 和 DIGEP-Pred 等工具进行的分析有助于分离出 676 个潜在靶点，其中 72 个与通过治疗靶点数据库 (TTD)、人类在线孟德尔遗传 (OMIM) 和 GeneCards 等数据库确定的 666 个肺癌相关遗传标记相交。通过蛋白质-蛋白质相互作用 (PPI) 网络、基因本体论、通路分析、箱线图和总体生存指标的进一步验证强调了 7-表-eudesm-4(15)-ene-1 β、去甲氧基哌拉汀、3,4,5-三甲氧基肉桂酸甲酯、6-α-二醇和马兜铃二酮等化合物的治疗潜力。值得注意的是，我们的研究结果再次证实了肺癌基因（如 CTNNB1、STAT3、HIF1A、HSP90AA1 和 ERBB2）的重要性，这些基因对各种细胞过程至关重要，在癌症发生和发展中起着关键作用。分子对接评估显示 6-α-二醇与 HIF1A 之间存在明显的亲和力，强调了它们作为肺癌治疗剂的潜力。结论：这项研究不仅突出了 P. longum 的生物活性化合物，还加强了其抗癌机制的分子基础，为未来的肺癌治疗铺平了道路。