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World File Search SystemCXCL13
免疫疗法反应的单细胞空间景观揭示了CXCL13增强的抗肿瘤免疫的机制
抽象背景免疫疗法已彻底改变了患有肺癌患者的临床结果，但相对较少的患者维持长期耐用反应。最近的研究表明，肿瘤免疫微环境促进了肿瘤异质性，并介导了疾病的进展和对免疫检查点抑制剂（ICI）的反应。因此，尚无满足的需要阐明肺癌微环境的空间定义的单细胞景观，以了解疾病进展的机制并确定对ICI的反应的生物标志物。在这里，在本研究中，我们通过描述活化的细胞态，细胞相互作用以及与提高功效相关的邻居来应用成像质量细胞仪来表征免疫疗法反应的肿瘤和免疫学局势。我们使用用反编程细胞死亡蛋白-1（PD-1）免疫检查点阻滞处理的临床前小鼠模型在功能上验证了我们的发现。结果，我们在27例接受ICI治疗的患者中解析了114,524个单细胞，从而实现了具有不同临床结果的免疫谱系和激活状态的空间分辨率。我们证明了CXCL13表达与患者的ICI疗效有关，并且重组CXCL13与体内的抗PD-1反应增强了抗原抗原经历的T细胞亚群，并降低了CCR2+单核细胞。讨论我们的结果提供了高分辨率的分子资源，并说明了主要免疫谱系的重要性及其功能取代在理解肿瘤免疫微环境对ICIS的作用方面的作用。
控制中枢神经系统发育和疾病的大脑免疫系统
图2：B-1A细胞在发育过程中B-1A细胞的少突胶质细胞的发育控制机理，B细胞被CXCL13从血液中吸引，CXCL13是由脉络膜丛产生的，并被定位于边界区域，例如脉络膜丛和脑膜。这些B细胞将其性质变成B-1A细胞，产生天然抗体，促进OPC的生长并控制少突胶质细胞的成熟。
2。多素（蛋白质和RNA）的空间表型在苯酚融合2.0
5.2使用ViewRNA测定2.0上的ViewRNA分析，对肿瘤3和肿瘤4区域的靶向空间RNA分析。与HNSCC样品的肿瘤3相比，淋巴细胞激活和募集面板的标记在肿瘤4中高度表达[图A和B]。肿瘤4中CXCL9和CXCL13的局部模式表明，细胞因子通过募集CD8 T+细胞促进了抗肿瘤活性。同样，来自免疫激活和反应签名面板的RNA靶标位于肿瘤4中，包括干扰素[图C和D]。STAT1和CD3的定位表明激活了各种细胞过程，例如免疫反应和对靶向癌细胞靶向癌细胞的凋亡4。在肿瘤4中发现的成熟TLS中也发现了这些标记的较高定位[图E和F]。
高质量亮度分析用于蛋白质和基因表达多重分析
图3。用PHA，CONA或LPS刺激后，基因（RNA）与蛋白质表达的相关性与蛋白质表达的相关性。在刺激后12、24和48小时，ENA（CXCL5），GRO-ALPHA（CXCL1），MCP-3（CCL7）和BLC（CXCL13）的相对RNA和蛋白质表达。将Quantigene plex人免疫反应面板80-plex数据（线图）标准化为管家PPIB。使用Procartaplex人免疫反应面板80-plex获取蛋白质数据。数据（条形图）显示为log2折叠在未刺激的控制样本上的变化。
匹配的唾液器官和粘附培养物的细胞组成分析：选择您的Sjögren疾病研究工具仔细
sjögren疾病（SJD）通过在唾液腺（SGS）中存在B细胞的淋巴细胞浸润广泛认可。与最初假定的相反，SJD中的SG功能不全与SGS中SG淋巴细胞浸润程度不密切相关。在SJD的SG发病机理中，导管性表现与表达toll-tliel-e自身抗体SSA/RO60，SSA/RO52的互动的导管细胞的能力表达了TOLL样受体和受体的受体样受体和受体，并以表达SJD相关的自身抗体，并以下是SSSA/RO52的互动，并以下是SSSA/RO52，并以下是SSSA/RO52，并以下是SSSA/RO52，并以下是SSSA/RO52，并以下是SSSA/sss，并以下是SSSA/sss，以及Leukin（IL）-1，IL-6，IL-7，IL-18，肿瘤坏死因子（TNF），B细胞激活因子（BAFF），CXC基序趋化因子10（CXCL10），CXCL112，CXCL12和CXCL13（在Verstappen等人1中进行了综述）。这些关键工作中的许多探索SG上皮涉及SJD病理学的涉及SG上皮细胞（SGEC）培养物。sgec培养物是使用epplant培养技术得出的，从而将一小部分SG组织铺在烧瓶中，并假定将生长的细胞推定为代表上皮细胞。2
B 细胞与实体肿瘤患者免疫检查点抑制剂反应的协调
摘要 免疫疗法通过在部分患者中提供持久的反应，彻底改变了癌症治疗的格局，目前已成为几种实体瘤的标准治疗方法。然而，除传统免疫检查点抑制之外的免疫疗法活性正在趋于稳定，而且总体上缺乏指导治疗选择的生物标志物。大多数研究都集中在 T 细胞的参与和反应上，但越来越多的证据表明，B 细胞可能是建立有组织的免疫反应的关键参与者，尤其是通过三级淋巴结构。B 细胞反应的机制包括抗体依赖性细胞毒性和吞噬作用、促进 CD4+ 和 CD8+ T 细胞活化、维持抗肿瘤免疫记忆。在几种实体瘤中，较高水平的 B 细胞、特定的 B 细胞亚群或三级淋巴结构的存在与免疫检查点抑制剂的疗效改善有关。 B 细胞亚群的命运可能受到细胞因子环境的广泛影响，B 特异性细胞因子 B 细胞活化因子和 B 细胞吸引趋化因子-1/CXCL13 具有多种作用，而 IL-10 则具有主要调节作用。B 细胞特异性免疫检查点（如 TIM-1）的作用正在显现，可能代表潜在的治疗靶点。总体而言，实体瘤中 B 细胞领域的不断扩大有望改善当前的免疫治疗策略和患者选择。
精神分裂症配偶诊断的酒精使用障碍
目的：这项研究利用综合的生物信息学来研究差异表达的基因（DEG）和与溃疡性结肠炎（UC）有关的途径。材料和方法：使用GSE13367和GSE134025数据集从UC患者的结肠粘膜样品和对照组中鉴定出差异表达的基因。使用差异表达的基因选择使用了GEO2R和Venn图，然后使用功能性注释，途径分析，通过字符串数据库确定PPI以及使用Metascape的GO/KEGG富集分析。结果和讨论：分析揭示了197摄氏度，有76个上调和121个下调基因。上调的基因富含体液免疫反应，肽聚糖的结合和NADPH氧化酶复合物，而下调的基因与无机阴离子转运，递质门控离子通道活性和整体质量质膜成分相关。在PPI网络中，上调的DEG形成了密集的网络（75个节点，190个边缘），表明显着相互作用，而下调的DEG形成了一个较小的密度网络（114个节点，63个边缘）。在197摄氏度中鉴定出五个集线器基因（CXCR4，CXCL13，CXCL1，MMP3）。这些发现为UC的原因提供了新的见解，并为更有效的治疗方法提供了希望。关键词：生物信息学分析，基因表达，炎症性肠病，途径富集分析，蛋白质相互作用
韩国人口中的全基因组关联研究确定了六个新型的易感基因座，类风湿关节炎
类风湿关节炎（RA）中摘要全基因组关联研究（GWAS）发现了100多个RA基因座，解释了与患者相关的RA发病机理，但显示出很大一部分缺失的遗传力。作为一项持续的努力，我们在大型朝鲜RA病例对照人群中进行了GWAS。方法我们在两个独立的韩国人群中新生成的全基因组变异数据，其中包括4068 RA病例和36 487个对照，然后进行全基因组插补和对疾病关联的荟萃分析，导致了两个同类。通过将公开可用的OMIC数据与GWAS结果整合在一起，进行了一系列生物信息学分析，以优先考虑RA基因座中的RA风险基因，并剖析疾病关联的生物学机制。结果，我们确定了六个新的RA风险基因座（Slamf6，CXCL13，SWAP70，NFKBIA，ZFP36L1和LINC00158），其中P Meta <5×10 -8，并且在两个谱系中均一致的疾病效应大小。基于物理距离，调节性变体和染色质相互作用，从6个新颖和13个复制的RA基因座进行了总共122个基因的优先级。生物信息学分析具有与RA相关基因的组织特异性表达的潜在RA相关组织（包括免疫组织，肺和小肠），并提出了与免疫相关的基因组（例如CD40途径，IL-21途径，IL-21途径，IL-21-介导的途径和Citrullantination）以及与其他风险 - 甲壳虫相关。结论本研究确定了六个新的RA相关基因座，这有助于更好地理解RA的遗传病因和生物学。
GPR182是一种广泛清除的非典型趋化因子受体，影响T非依赖性免疫
免疫反应高度取决于免疫细胞对次生淋巴机器人器官（SLO）的有效传输。非典型趋化因子受体（ACKRS）清除趋化因子从细胞外空间中消除它们，从而产生引导白细胞的梯度。与规范趋化因子受体相反，ACKR不会诱导导致细胞迁移的经典细胞内信号传导。最近，ACKR3的最接近GPR182的亲戚已被部分脱字为潜在的新型ACKR。我们通过确定将GPR182分类为广泛清除趋化因子受体的进一步的配体来确认并扩展了先前的研究。我们验证了受体的“非典型”性质，其中规范性G蛋白依赖性细胞内信号在配体刺激后未激活。然而，B-甲蛋白是非配体独立的内在化和趋化因子清除所必需的，而C末端则部分可分配。在没有体内GPR182的情况下，我们观察到血清中的趋化因子水平升高，也观察到SLO间质中的趋化因子水平。我们还揭示了不结合任何其他ACKR的CXCL13和CCL28被GPR182绑定并有效地清除。此外，我们在调节血清CXCL12水平的GPR182和ACKR3之间以及在控制CCL20水平的GPR182和ACKR4之间存在合作关系。此外，我们在GPR182-KO小鼠中揭示了一种新的表型，在该小鼠中，我们观察到一个大小和细胞的边缘区（MZ），因此在T非依赖性抗体反应中。综上所述，我们和其他人揭示了一种新颖的，广泛的趋化因子受体，我们建议将其命名为ACKR5。
单细胞转录组分析揭示EGFR突变肺腺癌中的抑制性肿瘤免疫微环境
摘要 背景 免疫治疗对表皮生长因子受体 (EGFR) 突变型非小细胞肺癌 (NSCLC) 患者的疗效较差。据报道，程序性细胞死亡配体 1 (PD-L1) 表达和肿瘤突变负荷 (TMB) 较低是潜在机制。作为影响免疫治疗疗效的另一个重要因素，迄今为止尚未全面了解该 NSCLC 亚组的肿瘤微环境 (TME) 特征。因此，我们发起了这项研究，从细胞组成和功能角度描述 EGFR 突变型肺腺癌 (LUAD) 的具体 TME，以更好地了解这种最常见 NSCLC 亚型的免疫状况。方法我们使用单细胞转录组测序和多重免疫组织化学来研究 EGFR 突变型和 EGFR 野生型 LUAD 的免疫微环境并确定免疫治疗的疗效。我们分析了来自九个未接受治疗样本的单细胞，并使用生物信息学方法将它们与之前从单细胞角度报道的三个免疫治疗后样本进行了比较。结果我们发现 EGFR 突变的恶性上皮细胞具有与无反应者的上皮细胞相似的特征。EGFR 突变的 LUAD 缺乏 CD8 + 组织驻留记忆 (TRM) 细胞，该细胞可通过分泌 CXCL13 促进三级淋巴结构的生成。此外，能够在 TME 中募集、保留和扩增 CD8 + TRM 细胞的其他细胞类型，在 EGFR 突变的 LUAD 中也是缺乏的。此外，与 EGFR 野生型 LUAD 相比，EGFR 突变的 LUAD 通过程序性细胞死亡-1 (PD-1) 和 PD-L1 或其他免疫检查点的 T 细胞与其他细胞类型之间的串扰明显较少。结论：我们的研究结果在单细胞水平上全面揭示了EGFR突变型LUAD的免疫状况。基于研究结果，许多细胞成分可能通过影响CD8 + TRM对EGFR突变型LUAD的特定TME产生负面影响。CD8 + TRM的缺乏可能是导致EGFR突变型LUAD抑制性TME的关键因素。