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World File Search SystemCXCR4
引用Zhang H，Zhou Y，Yan H，Huang C，Yang L和Liu Y（2025）利用生物信息学和机器学习来识别CXCR4基因相关的Therape
糖尿病足溃疡（DFUS）是糖尿病最常见且高度残疾的并发症之一，其特征是持续的脚步溃疡具有高感染率和截肢的风险，对患者生活质量和公共卫生系统构成了重大挑战（1）。根据数据预测，到2030年，全球糖尿病人口估计约为4.39亿（2）。在糖尿病患者中，大约30％的人会在其一生中出现足球溃疡（3），其中一部分患者因溃疡恶化而受到截肢的风险。研究表明，到2050年，三分之一的美国人将患有糖尿病，多达34％的糖尿病患者将在其一生中发展糖尿病足溃疡（DFU）（4）。DFU是成年糖尿病患者的严重并发症（5），一生中约有19％-34％的人足性溃疡，随着患者的年龄和医疗保健的复杂性，这种风险会增加（6）。DFU可以导致严重的结果，例如感染，截肢和死亡，在3 - 5年内复发率为65％（7），截肢率为20％，5年死亡率高达50％-70％（8）。尽管在多学科预防和早期筛查方面取得了进步，但在某些地区，截肢率却有所提高，尤其是影响年轻个人和少数群体，突出了DFU管理中的差异和不平等现象（9）。此外，糖尿病患者的免疫功能降低并降低了感染性（10），进一步增加了与DFU相关感染的风险（11）。在这些机制中，持续的炎症反应和组织受损（12）被认为是DFU的进展中的关键驱动因素。最近的研究表明，CXCR4基因在诸如细胞迁移，炎症调节和组织修复等过程中起重要作用（13），并且CXCR4的异常表达被认为是多种慢性条件下疾病进展的驱动力（14，15）。cxcr4在各种细胞类型（16）中表达，并通过其配体CXCL12调节细胞迁移，增殖和炎症反应（17）。研究表明，CXCR4在诸如DFU之类的慢性伤口中异常表达，可能导致
肿瘤负荷对接受 CXCR4 靶向成像的患者正常器官分布的影响 [
摘要背景：CXCR4 导向的正电子发射断层扫描/计算机断层扫描 (PET/CT) 已被用作实体瘤患者的诊断工具。我们的目的是确定肿瘤负荷和正常器官中放射性示踪剂积累之间的潜在相关性。方法：90 例经组织学证实的实体癌患者接受了 CXCR4 靶向的 [ 68 Ga] Ga-PentixaFor PET/CT 检查。感兴趣的体积 (VOI) 被放置在正常器官（心脏、肝脏、脾脏、骨髓和肾脏）和肿瘤病变中。确定正常器官的平均标准化摄取值 (SUV 平均值)。对于 CXCR4 阳性肿瘤负荷，计算最大 SUV (SUV 最大值)、肿瘤体积 (TV) 和肿瘤活动分数 (FTA，定义为 SUV 平均值 x TV)。我们使用 Spearman 等级相关系数 (ρ) 来推导正常器官摄取和肿瘤负荷之间的相关指数。结果：未受累器官的中位SUV平均值为脾脏5.2（范围，2.44 – 10.55），肾脏3.27（范围，1.52 – 17.4），其次是骨髓（1.76，范围，0.84 – 3.98），心脏（1.66，范围，0.88 – 2.89）和肝脏（1.28，范围，0.73 – 2.45）。未发现肿瘤病灶（ρ≤0.189，P≥0.07）、TV（ρ≥-0.204，P≥0.06）或FTA（ρ≥-0.142，P≥0.18）的SUV最大值与所研究的器官之间有显著相关性。结论：在接受 [ 68 Ga]Ga-PentixaFor PET/CT 成像的实体肿瘤患者中，未观察到相关的肿瘤下沉效应。这一观察结果可能与放射性和非放射性 CXCR4 靶向药物的治疗有关，因为随着肿瘤负担的增加，正常器官的剂量可能保持不变。
健康科学和生物医学研讨会
趋化因子受体是细胞表面受体，在不同的生理过程中发挥着重要作用：胚胎发生、炎症反应、发育、白细胞归巢等。这些受体嵌入细胞膜，可形成同型二聚体、异型二聚体和寡聚体1，均为功能性构象。趋化因子受体在细胞膜上的组织和动力学影响其行为以及细胞对趋化因子梯度的反应2,3。肌动蛋白细胞骨架重塑、细胞膜脂质组成或寡聚化的改变会损害正常细胞反应。一些证据表明异二聚体具有功能性，因此有必要分析它们在细胞表面的动态，以及配体如何对其进行修饰。4,5 CXCR4（一种常规趋化因子受体）和非典型趋化因子受体 ACKR3 形成异二聚体。ACKR3 识别两种配体，CXCL11 和 CXCL12，而 CXCR4 仅识别 CXCL12。因此，这是一个非常好的系统，可以分析这两种受体在细胞表面的动态，以及配体如何对其进行修饰。4,5由于 CXCR4 和 ACKR3 共享一个配体，并通过不同的途径发出信号，该模型可以解释趋化因子受体异二聚体是否具有与单个受体形成的二聚体相似的动力学，或者相反遵循不同的特征，当与配体一起激活时，它如何影响复合物，以及产生的功能后果是什么。全内反射显微镜 (TIRF-M) 是一种新的先进荧光技术，在研究膜过程方面具有巨大潜力。2,3 当显微镜的入射光完全反射时，在盖玻片和细胞培养基之间的界面上会产生衰减波。这种物理现象允许与盖玻片接触的细胞荧光染料被激发，因此非常适合研究细胞膜相关现象。此外，TIRF-M 允许单粒子跟踪 (SPT)。在我们的案例中，对瞬时转染了与单体绿色荧光蛋白 (Ac-GFP) 偶联的趋化因子受体的细胞进行分类，以获得模拟生理条件的低受体表达细胞群。以人类 T 淋巴细胞为模型，我们研究了当人类 T 细胞表达两种受体 (CXCR4 和 ACKR3) 和仅表达 ACKR3 时 CXCR4 和 ACKR3 的动态。当人类 T 细胞不表达 CXCR4 时，ACKR3 寡聚化对共享配体 CXCL12 的响应要低得多。这些差异可能会影响信号传导特性和功能响应。
miRNA/CXCR4信号轴损害糖尿病关键肢体缺血中的单伏和血管生成
引言人类巨细胞病毒（HCMV）是全球最常见的垂直传播感染，与死产，神经发育障碍，感觉性听力损失和儿童白血病有关（1，2）。全世界有超过80％的生殖年龄妇女是HCMV血清阳性的，先天性传播可能会在原发性或非主要HCMV感染后发生，其中可能包括重新感染因病毒潜伏期的新菌株或重新激活（3）。尽管存在这些疾病风险和先天性HCMV（CCMV）感染的普遍性，但我们缺乏有效的治疗剂和疫苗来防止HCMV转移。中和针对HCMV进入包膜糖蛋白（例如，糖蛋白B [GB]和五聚糖复合物）的抗体和T细胞反应一直是迄今为止疫苗发育中的主要靶标，但是这些疫苗只能限制为适度的效率（4）。此外，一些研究发现，母体中和抗体滴度与CCMV感染的风险降低无关（5，6）。我们最近还报道说，针对多种HCMV菌株的中和抗体滴度在HCMV传输妊娠中较高，并且与保护无关（7）。Mater-NAL用HCMV高免疫球蛋白（HCMV-HIG），这是HCMV - 异位阳性供体的IgG的合并多克隆制备，怀孕期间初次感染后也无法防止2个随机临床试验中的结合（8，9）。因此，迫切需要对预防CCMV传播的母体抗体反应的改进理解，以指导疫苗和免疫疗法的发展（10，11）。
海马齿状回发育所需的早期SOX2依赖性基因表达程序
海马是认知的大脑区域。人类SOX2转录因子中的突变会导致神经发育缺陷，导致智障和癫痫发作，以及海马发育不良。我们在小鼠中产生了一系列等位基因SOX2条件突变，在不同的发育阶段删除SOX2。SOX2晚期缺失（来自E11.5，通过Nestin-Cre）仅影响产后海马发育；早期的缺失（来自E10.5，EMX1-CRE）显着降低了齿状回（DG），最早的缺失（来自E9.5，FOXG1-CRE）会导致剧烈的异常，几乎完全没有DG。我们识别一组功能相互连接的基因（Gli3，Wnt3a，cxcr4，p73和tbr2），已知在海马胚胎发生中起着重要作用，在SOX2早期突变体中被下调，以及（Gli3和cxcr4）直接通过SOX2键入SOX2；它们的下调提供了导致缺陷的合理分子机制。对EMX1-CRE小鼠模型的电生理研究显示CA1和CA3区域的兴奋性传播改变了。对EMX1-CRE小鼠模型的电生理研究显示CA1和CA3区域的兴奋性传播改变了。
文章 嵌合化可实现基因合成和可定制 TALE 效应的慢病毒递送
摘要：基于黄单胞菌转录激活因子样效应 (TALE) 的 DNA 结合结构域 (DBD) 的设计效应是强大的序列特异性工具，因其在编辑基因组、转录组以及最近的表观基因组方面的特异性而享有盛誉。然而，组成 DBD 的 TALE 阵列的重复结构阻碍了它们作为基因合成产物的生成，并阻止了使用慢病毒载体 (LV)（一种广泛用于人类基因治疗的系统）递送基于 TALE 的基因。为了克服这些限制，我们旨在通过引入足够的多样性来嵌合编码 TALE-DBD 的 DNA 序列，以促进它们的基因合成和实现慢病毒递送。为此，我们用来自细菌伯克霍尔德菌的 TALE 样单元替换了 17 个黄单胞菌 TALE 重复序列中的 3 个。这与整个 DBD 中的广泛密码子变异和特定氨基酸替换相结合，以最大限度地提高重复序列内和重复序列间的变异性。我们证明，使用传统的 Golden Gate 克隆策略或基因合成可以轻松生成嵌合 TALE。此外，嵌合化使得使用慢病毒载体递送基于 TALE 的设计核酸酶、转录组和表观基因组编辑器成为可能。当以质粒 DNA 递送时，靶向 CCR5 和 CXCR4 基因座的嵌合 TALE 在人体细胞中显示出类似的活性。然而，基于 TALE 的转录激活因子的慢病毒递送仅在嵌合形式下才成功。同样，递送嵌合的 CXCR4 特异性表观基因组编辑器会导致内源性 CXCR4 表达快速沉默。总之，基于 TALE 的 DBD 的广泛密码子变异和嵌合使得设计 TALE 的生成和慢病毒递送变得简单，因此有利于这些工具的临床应用，以精确编辑基因组、转录组和表观基因组。
新型子宫内膜癌模型利用灵敏的转移追踪对晚期疾病进行 CXCR4 靶向治疗
1 圣保罗生物医学研究所（IIB-Sant Pau），08041 巴塞罗那，西班牙； emedina@santpau.cat （EM-G.）; mcespedes@santpau.cat （MVC）； erioja@santpau.cat (ER-B.)； lalba@santpau.cat（洛杉矶-C.） uunzueta@santpau.cat (UU) 2 西班牙巴塞罗那 Leuc è mia Recerca contra Josep Carreras 研究所，08025，西班牙 3 西班牙巴塞罗那圣克鲁伊圣保罗医院病理学系，08041； agallardoa@santpau.cat 4 Institut Catal à d'Oncologia (ICO), 08908 L'Hospitalet de Llobregat，西班牙； mpavon@iconcologia.net (M. À .P.)； lfarre@iconcologia.net (LF) 5 CIBER 公共卫生流行病学研究所 (CIBERESP)，28029 马德里，西班牙 6 贝尔维特奇生物医学研究所 (IDIBELL)，08908 L'Hospitalet de Llobregat，西班牙 7 加泰罗尼亚肿瘤研究所 (ICO)，Oncobell 项目，贝尔维特奇生物医学研究所 (IDIBELL)，08908 L'Hospitalet del Llobregat，西班牙； lasensio@idibell.cat 8 CIBER de Bioingenieri í a, Biomateriales y Nanomedicina (CIBER-BBN), 28029 马德里, 西班牙; antoni.villaverde@uab.cat 9 巴塞罗那自治大学遗传学和微生物学系，08193 Bellaterra，西班牙 10 巴塞罗那自治大学生物技术与生物医学研究所，08193 Bellaterrac，西班牙（Estherracquet：EV. icasanova@santpau.cat （IC）; rmangues@santpau.cat （RM）
通过 CRISPR/Cas9 基因组编辑使结肠癌干细胞中的白细胞介素-30 失活可抑制其致癌性并提高宿主生存率
摘要背景结直肠癌 (CRC) 是全球癌症相关死亡的主要原因，其进展是由结直肠癌干细胞 (CR-CSC) 驱动的，而结直肠癌干细胞受内源性和微环境信号的调控。白细胞介素 (IL)-30 已被证明对 CSC 活力和肿瘤进展至关重要。它是否参与 CRC 肿瘤发生并影响临床行为尚不清楚。方法通过蛋白质印迹、免疫电子显微镜、流式细胞术、细胞活力和球体形成试验确定 CRC 干细胞和非干细胞中 IL30 的产生和功能。CRISPR/Cas9 介导的 IL30 基因缺失、RNA-Seq 以及在 NSG 小鼠中植入转染或删除 IL30 基因的 CR-CSC 可以研究 IL30 在 CRC 致癌作用中的作用。CRC 样本的生物信息学和免疫病理学强调了临床意义。结果我们证明 CR-CSC 和 CRC 细胞均表达膜锚定 IL30，该 IL30 通过 WNT5A 和 RAB33A 调节其自我更新和/或增殖和迁移，主要通过上调 STAT3 上的 CXCR4 来调节，而 IL30 基因缺失会抑制 CXCR4 以及 WNT 和 RAS 通路。IL30 基因缺失会下调蛋白酶（如 MMP2 和 MMP13）、趋化因子受体（主要是 CCR7、CCR3 和 CXCR4）以及生长和炎症介质（包括 ANGPT2、CXCL10、EPO、IGF1 和 EGF）的表达。这些因素有助于 IL30 驱动的 CR-CSC 和 CRC 细胞扩增，而选择性阻断可消除这种扩增。 IL30 基因缺失的 CR-CSC 表现出降低的致瘤性，并在 80% 的小鼠中产生生长缓慢且转移性低的肿瘤，这些小鼠的存活时间比对照组长得多。对“结肠直肠腺癌 TCGA Nature 2012”集的生物信息学和 CIBERSORTx 以及对临床 CRC 样本中 IL30 表达的形态学评估表明，CRC 和浸润白细胞中缺乏 IL30 与总生存期延长相关。结论 IL30 是一种新的 CRC 驱动因素，因为其失活会禁用致癌途径和多个自分泌环路，从而抑制 CR-CSC 的致瘤性和转移能力。CRISPR/Cas9 介导的 IL30 靶向性的发展可以改善当前的 CRC 治疗前景。
逆转癌症中的DNA高甲基化（综述）
cfh f gctgtatgcactgaatctgga 136 r actgggtacgtgtgatttcatctccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc 123 r acgtttttttttcgctgcctgagtc cd44 f acacgagaagaagaagagagagcaggac 135 ttatctgcagtggatcgagttc 150 r gtagcttttcctttcctatgccaaacc oct4 f gagaatttgtgttgtcctggagtgc150 r tcgttgtgtgtgcatagtgctgtcgctgtcgcgtcggctg sox2 TTCGGGTAGTGGAAAACCAG 108 R AGTAGAAATACGGCTGCACC Klf4 F ACCTACACAAAGAGTTCCCATC 136 R TGTGTTTACGGTAGTGCCTG EpCAM F CAGACAAGGACACTGAAATAACC 134 R TGTGATCTCCTTCTGAAGTGC ALDH1A3 F cttctgccttagagtctggaac 138 r tcacttctgtgtgtattcggcc abcg2 f aggtctgtgtgtggtggtcaatctcac 142 r tcctgttgcattgagtcctg nanog nanog nanog f gaaatacctcctcctcagcctcctcctccctccagc149 ggatcgggttaagggaaagag 139 r aggagacataggcgagaggggggggggggg epas1 f cccatgtctccaccttcaag 136 r aaggcttgcttcttcattccttcatctcccccccccccccccccccacacaagcaagactc146 r gggggggggtccgtccccccctccctcctcccctcct4 105 r tcttcacggaaacagggttc ptprj f caagcaggctcaggactatg 142 r ggaggtgaAatggaAtggaActgtct myo6 f acgtgctccaaagtctgtgttac12 atccatgagcttttttccccagβ-肌动蛋白f cccagcacaatgaagatcaag 136 r gactcgtcatcatactcctgcttg abcg2，atp biding cassette cassette subfimily g ement g ement 2; Aldh1a3，醛脱氢酶1家族成员A3； CFH，补体因子H； CXCR4，C-X-C基序趋化因子受体4; EPAS1，内皮PAS结构域蛋白1； Epcam，上皮细胞粘附分子； EPB41L3，红细胞膜蛋白带4.1样3; GJA1，间隙连接蛋白α1; KLF4，KLF转录因子4； Myo6，肌球蛋白VI； PTPRJ，蛋白酪氨酸磷酸酶受体类型J
大脑周细胞的发展需要在中间前体中表达转录因子NKX3.1
脑周细胞是调节内皮屏障功能和活性的关键细胞类型之一，从而确保足够的血液流向大脑。尚不清楚将未分化的细胞引导到成熟的周细胞中的遗传途径。我们在这里表明，斑马鱼的神经rest和中胚层的周细胞前体种群表示转录因子NKX3.1发展成脑周细胞。我们确定了这些前体的基因特征，并表明NKX3.1，FOXF2A和CXCL12B表达周围的周围前体群体存在于动脉形成和周细胞募集之前的基底动脉周围。前体随后散布在整个大脑中，并分化以表达规范的周细胞标记。cxcl12b- cxcr4信号传导是细节附着和分化所必需的。此外，随着损失的损失和增益增加，NKX3.1和CXCL12 B在调节周细胞数方面都是必需的，并且足够。通过遗传实验，我们为脑周细胞定义了前体群体，并确定了对其分化至关重要的基因。