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标题 1 罕见癌症靶点发现框架 2 ...
虽然大规模功能性基因筛选已经发现了许多癌症依赖性，但罕见癌症在这些努力中表现不佳，而且许多罕见癌症的依赖性状况仍然不清楚。我们对一种典型的罕见癌症——TFE3- 易位肾细胞癌 (tRCC) 进行了基因组规模的 CRISPR 敲除筛选，揭示了与线粒体生物合成、氧化代谢和肾脏谱系特化相关的途径中以前未知的 tRCC 选择性依赖性。为了推广到其他可能不易获得实验模型的罕见癌症，我们采用机器学习根据肿瘤或细胞系的转录谱推断其基因依赖性。通过将依赖性预测应用于肺泡软组织肉瘤 (ASPS)，一种也是由 TFE3 易位驱动的独特罕见癌症，我们发现并验证了 MCL1 代表 ASPS 中的依赖性，但不代表 tRCC。 24 最后，我们应用我们的模型预测了 TCGA 中的肿瘤（11,373 个肿瘤；28 25 个谱系）和多种其他罕见癌症（16 种类型的 958 个肿瘤，包括 26 种肾癌的 13 种不同亚型）中的基因依赖性，从而确定了几种特征不明显的癌症类型中可能存在的潜在可操作漏洞。27 我们的研究结果将无偏功能性基因筛查与预测模型结合起来，建立了 28 种癌症候选漏洞的概况，包括几种目前缺乏潜在靶点的罕见癌症。29
癌症及其治疗意义中的基因表达谱
公共领域中可用的大量肿瘤和细胞系的大量基因表达数据代表了巨大的资源。对于任何主要的癌症类型，表达数据都可以识别分子亚型，预测患者的结果，确定治疗反应的标志物，确定体细胞突变的功能后果，并阐明转移性和晚期癌症的生物学。本综述提供了癌症中基因表达分析的广泛概述（可能包括转录组和蛋白质组水平）以及使用这些数据做出的发现的类型。本综述还提供了访问公共癌基因表达数据集并产生独特的数据观点和产生的感兴趣基因的特定示例。这些例子涉及泛癌分子亚型，代谢相关的表达相关性的患者存活涉及多种癌症类型，以及乳腺肿瘤中化学疗法反应的基因表达相关。
免疫原性肺癌中介导的抗肿瘤免疫
。CC-BY 4.0 国际许可，根据 （未经同行评审认证）提供，是作者/资助者，他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是此预印本的版权持有者，此版本于 2022 年 6 月 8 日发布。；https://doi.org/10.1101/2021.10.18.464819 doi：bioRxiv 预印本
药物重新发现方案中的罕见癌症患者（......
摘要 ◥ 目的：罕见癌症患者（每年每 100,000 人中发病率低于 6 例）通常治疗机会较少，而且在基因组靶点水平的研究不足。我们假设罕见癌症患者与常见癌症患者一样，可从获批的抗癌药物中获益。实验设计：在药物再发现方案 (DRUP) 中，具有可操作分子特征的治疗难治性转移性癌症患者将与 FDA/欧洲药品管理局批准的靶向治疗或免疫治疗相匹配。根据组织学肿瘤类型、分子特征和研究药物，将患者纳入平行队列。主要终点是临床获益（完全缓解、部分缓解、病情稳定 ≥ 16 周）。结果：在 1,145 例提交的病例中，500 名患者（包括 164 名患有罕见癌症的患者）开始使用 25 种可用药物中的一种，并且
整合素在癌症中的生物学功能及其临床应用
整合素是细胞外基质 (ECM) 的粘附分子和受体。它们介导细胞与细胞、细胞与 ECM 之间的相互作用。癌细胞与其微环境之间的串扰触发了多种关键信号线索并促进了癌症的恶性表型。作为一种跨膜蛋白，整合素介导的细胞粘附在调节癌细胞的各种生物学功能中至关重要。最近的证据表明，肿瘤细胞或肿瘤相关基质细胞上的整合素参与 ECM 重塑，并作为机械传感器感应 ECM 生物物理特性的变化，这有助于癌症转移、干细胞性和耐药性。在本综述中，我们概述了整合素介导对癌症生物学变化的影响的机制，并强调了针对整合素的临床治疗的现状。
甲状腺癌中的激酶抑制剂 - 内分泌肿瘤学
目的：随着针对 VEGFR、BRAF、MEK、NTRK 和 RET 的激酶抑制剂的出现，甲状腺癌的治疗前景迅速发生了变化。我们提供了激酶抑制剂在甲状腺癌中的作用的最新综述，并讨论了即将进行的试验。设计和方法：对描述激酶抑制剂在甲状腺癌中的作用的现有文献进行了全面回顾。结果和结论：激酶抑制剂已成为转移性放射性碘难治性甲状腺癌患者的标准治疗方法。短期治疗可以重新使分化型甲状腺癌对放射性碘敏感，从而可能改善结果并避免长期使用激酶抑制剂带来的毒性。卡博替尼获批用于索拉非尼或仑伐替尼治疗失败后进展性放射性碘难治性分化型甲状腺癌的挽救治疗，这增加了可用的活性药物库。无论 RET 突变状态如何，凡德他尼和卡博替尼已成为转移性髓样甲状腺癌的主要治疗方法。赛帕替尼和普拉替尼是具有抗 RET 活性的强效选择性受体激酶抑制剂，彻底改变了髓样甲状腺癌和其他具有 RET 驱动突变的癌症的治疗模式。达拉非尼加曲美替尼用于治疗 BRAF 突变的间变性甲状腺癌为这种预后不佳的恶性癌症提供了有效的治疗选择。为了设计下一代甲状腺癌药物，未来的努力将需要集中在更好地了解激酶抑制的耐药机制，包括旁路信号和逃逸突变。
MYC致癌基因：治疗癌症的可用药物靶点...
摘要：各种疾病，包括癌症、与年龄相关的疾病和急性肝功能衰竭，都与致癌基因 MYC 有关。动物试验和临床试验表明，当 MYC 失活时可以实现持续的肿瘤体积缩小，目前正在开发包括 MYC 抑制剂在内的不同治疗剂组合。在本综述中，我们首先总结了 MYC 癌蛋白在癌症治疗中的多种生物学功能，强调 MYC/MAX、MIZ1/MYC/MAX 和 MAD (MNT)/MAX 复合物的平衡点在癌症治疗中具有进一步的潜力，可用于抑制 MYC 致癌基因的表达及其在肿瘤发生中的作用。我们还讨论了 MYC 在各种细胞癌症过程中的多功能能力，包括其对免疫反应、代谢、细胞周期、细胞凋亡、自噬、细胞焦亡、转移、血管生成、多药耐药性和肠道菌群的影响。此外，我们总结了 MYC 治疗专利状况，并强调了 MYC 作为可用药靶点的潜力，使用草药调节剂。最后，我们描述了生物医学研究中的待决挑战和未来前景，涉及开发调节 MYC 或其靶基因的治疗方法。患有由 MYC 信号驱动的癌症的患者可能会受益于针对这些途径的治疗，这可以延缓癌细胞生长并恢复抗肿瘤免疫反应。关键词：MYC、癌症、免疫反应、多药耐药性、天然产物、草药 1.简介 MYC 是一种“全局”转录因子，可导致多种疾病，包括癌症、与年龄相关的疾病和急性肝功能衰竭等。由于其参与多种细胞过程，包括 DNA 修复、蛋白质翻译、细胞周期停滞、应激反应、细胞增殖和分化、程序性细胞死亡、免疫反应调节和
针对其他 HER2 阳性癌症的治疗作用
Ado-trastuzumab emtansine (T-DM1) 是一种抗体-药物偶联物，2013 年获 FDA 批准用于治疗晚期 HER2 阳性乳腺癌，表现出良好的临床疗效。然而，HER2 过表达和基因扩增也已在胃癌、非小细胞肺癌 (NSCLC) 和结直肠癌等其他癌症中报道。大量临床前研究也揭示了 T-DM1 对 HER2 阳性肿瘤的显著抗肿瘤作用。随着研究的进展，已经进行了多项临床试验来研究 T-DM1 的抗肿瘤作用。在这篇综述中，我们简要介绍了 T-DM1 的药理作用。我们回顾了它的临床前和临床研究，特别是对其他 HER2 阳性癌症的研究，确定了其临床前和临床研究之间遇到的情况。在临床研究中，我们发现T-DM1对其他癌症有治疗价值，但对胃癌和NSCLC无明显疗效，与临床前研究结果不一致。
甲状腺癌中的激酶抑制剂 - 内分泌肿瘤学甲状腺癌中的激酶抑制剂 - 内分泌肿瘤学
目的：甲状腺癌的治疗景观随着针对VEGFR，BRAF，MEK，NTRK和RET的激酶抑制剂的可用性而迅速变化。我们对激酶抑制剂在甲状腺癌中的作用进行了最新审查，并讨论即将进行的试验。设计与方法：对描述甲状腺癌激酶抑制剂的可用文献进行了全面综述。结果和结论：激酶抑制剂已成为转移性放射性碘 - 饮食性甲状腺癌患者的护理标准。短期治疗可以将分化的甲状腺癌重新敏感为放射性碘，从而有可能改善与长期使用激酶抑制剂相关的结果和保留毒性。Cabozantinib的批准为进行性放射性放射性碘 - 弗拉克疗法分化后，索拉非尼或Lenvatinib失败后，甲状腺癌增加了活性药物的可用武器群。vandetanib和cabozantinib已成为转移性甲状腺癌的主要治疗方法，而不管RET突变状态如何。selpercatinib和pralsetinib，有效和选择性受体激酶抑制剂具有针对RET的活性，彻底改变了甲状腺甲状腺癌和其他具有RET驱动突变的甲状腺癌的治疗范式。dabrafenib加上trametinib用于BRAF突变的甲状腺甲状腺癌为这种侵略性癌症提供了有效的治疗选择，并具有令人沮丧的预后。为了设计甲状腺癌的下一代药物，未来的努力将需要集中精力，以更好地理解对激酶抑制的抗性机制，包括旁路信号传导和逃生突变。
