耳念珠菌是一种新出现的耐多药真菌,可引起高死亡率的侵袭性感染。尽管人们付出了巨大的努力来了解这种病原体如何迅速出现并在全球传播,但人们对其环境宿主知之甚少。在这里,我们介绍了美国疾病控制和预防中心、美国国家生物技术信息中心和 GridRepublic(一个志愿者计算平台)之间的合作,以识别公开可用的宏基因组数据集中的耳念珠菌序列。我们开发了 MetaNISH 流程,该流程使用 SRPRISM 将序列与一组参考基因组比对,并计算每个参考基因组的分数。我们使用 MetaNISH 扫描了自 2010 年以来约 300,000 个 SRA 宏基因组运行,并确定了五个包含耳念珠菌读数的数据集。最后,GridRepublic 使用 MetaNISH 和志愿者计算实施了一个前瞻性的耳念珠菌分子监测系统。
RNA 干扰 (RNAi) 是一种基本调控途径,具有广泛的功能,包括调节基因表达和维持基因组稳定性。尽管 RNAi 在真菌界广泛存在,但众所周知的物种,如模型酵母酿酒酵母,已经失去了 RNAi 途径。到目前为止,还没有证据表明白色念珠菌中存在完全功能的 RNAi 途径,白色念珠菌是一种被世界卫生组织认为至关重要的人类真菌病原体。在这里,我们证明了广泛使用的白色念珠菌参考菌株 (SC5314) 在编码中心 RNAi 成分 Argonaute 的基因中含有失活错义突变。相比之下,大多数其他白色念珠菌分离株含有典型的 Argonaute 蛋白,预计该蛋白具有功能性和 RNAi 活性。事实上,使用高通量小RNA和长RNA测序结合无缝CRISPR/Cas9基因编辑,我们证明了活性白色念珠菌RNAi机制抑制了亚端粒基因家族的表达。因此,白色念珠菌中存在完整且功能性的RNAi通路,这凸显了在研究这种危险病原体时使用多种参考菌株的重要性。
白色念珠菌是一种真菌或酵母,通常生长在口腔和消化道中,可引起念珠菌病。白色念珠菌可从良性共生菌转变为致病病原体,导致口腔、胃肠道和生殖道感染。复发性阴道鹅口疮是由对念珠菌病的局部免疫缺陷引起的,这可能是由于前列腺素 E2 (PGE2) 合成过多引起的。白色念珠菌菌株的致病性存在差异,这表明菌株特有的毒力因子可能在疾病严重程度中发挥作用。对宿主智人和病原体白色念珠菌的代谢途径进行了计算机比较分析。blastp e 值阈值截止值设置为 0.005。 281 种酶中,共有 118 种酶序列与人类蛋白质序列非同源,其中 24 种酶根据 DEG 数据库被发现对白色念珠菌的生存至关重要。CELLO v.2.5:subCELlulor 定位预测器结果显示,约 57% 的酶位于细胞质中,15% 的酶位于线粒体中,12% 的酶为质膜蛋白,6% 的酶位于细胞核中,5% 的酶位于叶绿体和过氧化物酶体中。确定的潜在药物靶点为进一步研究发现新型治疗化合物奠定了基础。
PGA31和UTR2-特定的噬菌体粘合剂是从噬菌体显示的AN4体库中分离出来的,并将其改革为人IgG1 AN4-PGA31和AN4-utr2单核An4bodies(mabs)。所有mAb的目标都有很强的能力,其EC50值达到300 pmol。当将细胞与An4fungal剂,caspofungin和氟康唑胁迫时,mAb在所有主要的念珠菌病原体中都与真菌细胞交叉-REAC4VE,并具有增强的结合。不同的结合式全景,即使未经AN4FUNCAL治疗,均与侵入性菌丝形态具有偏好的结合。在Addi4On中,AN4-PGA31 AN4体与菌丝4PS AAER AN4FUNGAL挑战的局部结合。检测到了增强的An4体介导的Opsonisa4ON,与对照组相比,鼠J774.1巨噬细胞的An4bodies的结合显着诱导了白色念珠菌的吞噬作用。重要的是,MAB在鼠类入侵性念珠菌病模型中证明了体内效应,这些模型代表了Pa4ents的免疫能力和免疫抑制状态。具有巨大的POTEN4AL,可用于具有新颖的AC4ON作为单一疗法或与Exis4NG AN4FUNCLALS的新型AC4ON机制或共同治疗,以改善复杂的PA4ENTS的临床结果并打击AMR危机。
白色念珠菌中抽象的抗真菌抗性是最有害的微生物之一,可能导致阴道和尿路炎症。为了解决这个问题,我们测试了一些天然产品对抗白色念珠菌的作用。这项研究的重点是隔离,识别,研究念珠菌对某些天然产物的流行和敏感性。在特定培养基上分离后,我们对回收的念珠菌株进行了形态学和生化鉴定。然后,我们估计了分离株对抗真菌性物质的抗真菌耐药性,以及它们对苹果醋,大蒜,薰衣草,椰子和茶树油的敏感性。我们仅获得了五十个尿液样品和阴道拭子中的十二个念珠菌。生化鉴定表明所有分离株都是念珠菌属。最抗真菌的分离株具有估计其基因。之后,六个分离物对苹果醋,茶树油,椰子油,大蒜油和薰衣草油的敏感性揭示了念珠菌对测试产品的敏感性。最后,ITS2基因测序结果证实了白色念珠菌MS24和C的鉴定。白色唱片MS44。我们的研究得出的结论是,白色念珠菌被认为是阴道和尿路炎症的最常见原因之一。此外,天然产品,尤其是茶树油和苹果醋,分别对白色念珠菌MS24和MS44具有出色的抗真菌活性。
摘要:世界卫生组织(WHO)确定了Auris的念珠菌是其最新的真菌清单中的关键优先病原体。C。在血液中报道了Auris感染,在脑脊液和腹部中较少报道,死亡率在30%至72%之间。但是,迄今为止尚未报告大规模流行病学研究。诊断为Auris感染可能具有挑战性,尤其是在采用常规技术时。这可能会阻碍爆发的早期发现和实施适当的控制措施。酵母可以通过受污染的环境或设备在患者和医疗机构之间轻松传播,在那里它可以长时间生存。因此,筛查患者的Auris定植是可取的。这将使设施能够识别患有该疾病的患者并采取适当的预防和控制措施。它通常不舒服,在进化枝和地理区域之间观察到抗药性的不同模式。本综述提供了有关Auris的更新,包括流行病学,临床特征,基因组分析,进化,定殖,感染,识别,抗药性谱,治疗选择,预防和控制。
au:PleaseconfirmthatalleheadinglevelsarerepressedCorrectly:Candida auris是一种新兴的真菌病原体,可能导致人类威胁生命的感染。与许多其他念珠菌的念珠菌不同,c。Auris最有效地将皮肤定居。 这种定殖污染了患者的环境,并可能导致快速的医院传播。 此外,这种传播可能导致死亡率在40%至60%之间的全身感染中断。 c。 已经鉴定出对所有已知类别的抗真菌抗体类别的抗auris iSo均具有抵抗力,因此,了解皮肤定殖启动和进步的潜在生化机制对于开发更好的治疗选择至关重要。 在此评论中,我们简要总结了有关水平传输和用于识别,理解和控制c的当前工具的了解。 Auris感染。Auris最有效地将皮肤定居。这种定殖污染了患者的环境,并可能导致快速的医院传播。此外,这种传播可能导致死亡率在40%至60%之间的全身感染中断。c。已经鉴定出对所有已知类别的抗真菌抗体类别的抗auris iSo均具有抵抗力,因此,了解皮肤定殖启动和进步的潜在生化机制对于开发更好的治疗选择至关重要。在此评论中,我们简要总结了有关水平传输和用于识别,理解和控制c的当前工具的了解。Auris感染。Auris感染。
着丝粒提出了一个进化悖论:功能高度保守,但序列和结构却迅速变化。然而,在没有损伤的情况下,着丝粒的位置通常在一个物种内是保守的。我们在此报告,致病酵母菌种近平滑假丝酵母的分离株在其八条染色体中的两条染色体上表现出着丝粒位置的种内多态性。它的旧着丝粒具有反向重复 (IR) 结构,而其新着丝粒没有明显的结构特征,但位于旧位置的 30 kb 以内。因此,着丝粒可以自然地从一个染色体位置移动到另一个染色体位置,似乎是自发的,并且在 DNA 序列没有任何显著变化的情况下。我们的观察结果与所有着丝粒都是由基因决定的模型相一致,例如由短或长 IR 的存在或形成十字形的能力决定。我们还发现着丝粒已成为 C. parapsilosis 进化枝中基因组重排的热点。
(未通过同行评审认证)是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。此预印本版的版权持有人于2024年1月5日发布。 https://doi.org/10.1101/2024.01.05.574287 doi:Biorxiv Preprint
7。Abiona Ja。等。 “对来自白化病和正常皮肤的非洲巨型蜗牛(Archachatina Marginata)对某些细菌分离株的抑制活性的比较评估”。 埃塞俄比亚环境研究与管理杂志6.2(2013):177-181。Abiona Ja。等。“对来自白化病和正常皮肤的非洲巨型蜗牛(Archachatina Marginata)对某些细菌分离株的抑制活性的比较评估”。埃塞俄比亚环境研究与管理杂志6.2(2013):177-181。