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CRISPR-CAS9方法确认钙调神经蛋白响应锌指1（CRZ1）转录因子是抗棘candin的candida candida glabrata
热解转化是通往碳基纳米构造的最有希望的可持续途径之一，包括碳点（CDS）。然而，功能化碳点的分子组成仅限于杂原掺杂，并掺入了几个单一金属前体。此外，大多数这些修改都是通过剧烈的后移植程序进行的，需要有机溶剂来用于碳扩散，并且由于不兼容的实验条件而占据了大型潜在反应物的库。在与知名文献的显着差异中，我们在这里披露了一种创新且高度用途的方法，以丰富碳点功能。这种简单的方法将壳聚糖作为碳前体和金属烷氧化物融合为陶瓷前体，并通过碳水化合物溶液的热液转化来探索两个不同的“金属氧化物@碳点”相的双胞胎生长。由于壳聚糖朝金属烷氧化物前体的结构导向效应，一组晶体金属氧化物，包括二氧化钛，氧化钛和氧化铁簇，在原位形成的氮含量碳框架中直接融合。独特的方法，以下方法将水作为溶剂和可再生生物量作为碳源，并有望阐明废弃的生物废物在工程功能性纳米材料方面的隐藏才能。
抗生素对东非社区中铜绿假单胞菌基因组表达的影响：系统评价
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证。是根据作者/资助者提供的预印本（未经同行评审认证）提供的，他已授予Biorxiv的许可证，以在2024年12月26日发布的此版本中显示此版本的版权持有人。 https://doi.org/10.1101/2024.12.25.630341 doi：Biorxiv Preprint
有针对性地去除巨噬细胞分泌的白介素-1受体拮抗剂可预防致命的白色念珠菌败血症
Hang Thi Thuy Gander-Bui, 1 , 2 Jo € elle Schl € afli, 1 Johanna Baumgartner, 1 , 2 Sabrina Walthert, 1 Vera Genitsch, 3 Geert van Geest, 4 Jose´ A. Galva´ n, 3 Carmen Cardozo, 3 Cristina Graham Martinez, 3 Mona Grans, 5 Sabine Muth, 5 Re´ my Bruggmann，4 Hans Christian Probst，5 Cem Gabay，6和Stefan Freigang 1，7， * 1， * 1伯恩伯恩伯恩伯恩大学组织医学与病理学研究所实验病理学，瑞士大学2研究生院2伯尔尼大学伯尔尼，伯尔尼，瑞士3012伯尔尼，3012瑞士4 Interfulty BioInformatics和瑞士生物信息学研究所，伯恩大学，3012，瑞士伯恩，瑞士5. 55131 MAINZ大学医学中心，德国55131 Mainz 6 6 6瑞士大学医院，瑞士大学医院，瑞士大学医院7号风湿病学司。 stefan.freigang@unibe.ch https://doi.org/10.1016/j.immuni.2023.06.023
男性和女性尿液检查白色念珠菌检出率
电子邮件：jfechavecs@gmail.com 摘要 白色念珠菌已成为主要的公共卫生问题，引起住院患者从阴道到深部等多种感染，发病率和死亡率很高。虽然它是胃肠道和生殖道的常见共生菌，但在某些条件下，受环境因素和免疫系统相互作用的影响，它会变得致病。艾滋病和癌症患者特别容易受到白色念珠菌感染。这种酵母的主要毒力因素之一是生物膜的形成，这使其对抗真菌治疗产生抵抗力。标准治疗方法是两性霉素B，但其副作用和高成本限制了它的使用。唑类抗真菌药物是毒性较小的选择，但耐药性有所增加，使感染的治疗变得复杂。关键词：念珠菌、问题、死亡率。摘要白色念珠菌已成为一个重大的公共卫生问题，导致一系列感染，从阴道念珠菌病到住院患者的深层感染，导致高发病率和死亡率。尽管白色念珠菌主要是一种胃肠道和生殖道中的共生生物，但在某些受环境因素和宿主免疫相互作用影响的条件下，它可以转变为致病状态。艾滋病和癌症患者特别容易感染白色念珠菌。这种酵母的一个关键毒力因素是其形成生物膜的能力，从而产生对抗真菌疗法的抵抗力。标准治疗方法历来采用两性霉素 B；但其肾毒性和高成本限制了它的使用。唑类抗真菌药物是毒性较小的替代药物，但耐药性的不断增加使得念珠菌病的有效治疗变得复杂。本文回顾了白色念珠菌的致病潜力、毒力机制以及抗真菌耐药性在临床环境中带来的挑战。关键词：念珠菌、问题、死亡率。摘要 白色念珠菌已成为重大公共卫生问题，引起从阴道感染到住院患者深部感染的多种感染，发病率和死亡率很高。虽然它是胃肠道和生殖道的常见共生菌，但在某些条件下，受环境因素和免疫系统相互作用的影响，它会变得致病。艾滋病和癌症患者特别容易受到白色念珠菌感染。这种酵母的主要毒力因素之一是形成
分裂标记介导的基因组编辑提高了 CTG 分支酵母中间假丝酵母中的同源重组频率
基因组编辑工具箱对于探索和利用非常规酵母物种作为细胞工厂至关重要，因为它们促进了基因组研究和代谢工程。非常规酵母中间假丝酵母 (Candida intermedia) 是一种在生物技术上很有趣的物种，因为它能够将多种碳源（包括林业和奶制品行业废弃物和侧流中的木糖和乳糖）转化为增值产品。然而，由于缺乏针对该物种的分子工具，迄今为止，进行基因操作的可能性有限。我们在此描述了一种针对中间假丝酵母 (C. intermedia) 的基因组编辑方法的开发，该方法基于电穿孔和基因删除盒，其中包含白色假丝酵母 NAT1 显性选择标记，两侧是与目标基因座同源的 1000 个碱基对序列。针对 ADE2 基因的线性删除盒最初导致的靶向效率 < 1%，这表明中间假丝酵母 (C. intermedia) 主要使用非同源末端连接来整合外来 DNA 片段。通过开发一种基于分裂标记的 C. intermedia 缺失技术，我们成功提高了同源重组率，实现了高达 70% 的靶向效率。对于无标记缺失，我们还将分裂标记盒与重组酶系统结合使用，从而能够通过标记回收构建双缺失突变体。总体而言，分裂标记技术被证明是一种快速可靠的 C. intermedia 基因缺失方法，这为揭示和增强其细胞工厂潜力提供了可能性。
鼠李糖乳杆菌无细胞提取物靶向白色念珠菌的毒力和抗真菌药物耐药性
完整作者名单： Dube, Yvonne；威特沃特斯兰德健康科学 Khan, Amber；威特沃特斯兰德健康科学，内科 Marimani, Musa；威特沃特斯兰德健康科学 Ahmad, Aijaz；威特沃特斯兰德大学，临床微生物学和传染病；国家卫生实验室服务，感染控制部门
用于耳念珠菌基因组编辑的无标记 CRISPR 介导系统揭示了 Cas5 在卡泊芬净反应中的保守作用
摘要 耳念珠菌是一种近期在世界范围内出现的耐多药人类真菌病原体。它可导致人类危及生命的播散性感染，死亡率高达 50%。其耐多药性和致病特性背后的分子机制尚不清楚。目前用于耳念珠菌基因组编辑的方法很少，所有这些方法都依赖于限制可进行的修改数量的选择标记。在这里，我们介绍了一种无标记的 CRISPR/Cas9 介导的耳念珠菌基因组编辑系统。利用该系统，我们成功删除了感兴趣的基因，然后在所有五个耳念珠菌进化枝的分离株中的天然位置重建它们。该系统还使我们能够引入精确的基因组编辑来创建翻译融合和单点突变。使用 Cas5 作为此系统的测试案例，我们发现 Cas5 在白色念珠菌和耳念珠菌之间的卡泊芬净反应中起着保守作用。总体而言，开发一种可在耳念珠菌中精确且简便地进行基因组编辑的系统，该系统可以以高通量的方式进行编辑，这是提高我们对这种重要的人类真菌病原体的了解的重要一步。
使用 CRISPR-Cas9 系统评估与耳念珠菌卡泊芬净耐药性相关的新型 FKS1 R1354H 突变
1 长崎大学生物医学科学研究生院呼吸医学系，日本长崎 852-8501； crystalblood2009@gmail.com (MK); tatsuro_h_20@nagasaki-u.ac.jp（泰国）； n-nakada@nagasaki-u.ac.jp (NN)； y-ito@nagasaki-u.ac.jp (YI)； n-ashizawa@nagasaki-u.ac.jp (NA)； k-takeda@nagasaki-u.ac.jp (KT)； niwanaga@nagasaki-u.ac.jp (NI)； takahiro-takazono@nagasaki-u.ac.jp (TT)； s-kohno@nagasaki-u.ac.jp（SK）； hmukae@nagasaki-u.ac.jp（HM） 2 宫崎大学医学院内科学系呼吸病学、风湿病学、感染性疾病和神经病学系，宫崎 889-1692，日本；makoto_sumiyoshi@med.miyazaki-u.ac.jp 3 千叶大学医学真菌学研究中心，千叶 260-8673，日本；m-sato_okamoto@chiba-u.jp（MO）；chibana@faculty.chiba-u.jp（HC） 4 长崎大学生物医学科学研究生院药物治疗学系，长崎 852-8501，日本 5 帝京大学医学真菌学研究所，东京 192-0395，日本； makimura@med.teikyo-u.ac.jp 6 长崎大学生物医学研究生院传染病系，长崎 852-8501，日本；koizumik@nagasaki-u.ac.jp 7 长崎大学医院实验室医学系，长崎 852-8501，日本；k-yanagi@nagasaki-u.ac.jp * 通信地址：taiga_miyazaki@med.miyazaki-u.ac.jp
卫生保健环境中成年患者中念珠菌非殖民化的氯己定沐浴：系统审查和荟萃分析的方案
方法和分析：遵守系统审查和荟萃分析协议（PRISMA-P）指南的首选报告项目，该协议概述了我们的系统评价和荟萃分析的方法。这项研究开始于2023年6月至2023年8月在PubMed进行的广泛搜索，随后在其他三个关键数据库中进行了搜索：Embase，Web of Science和Scopus，2023年9月。系统搜索将涵盖所有可用的出版物，而无需应用任何出版日期过滤器。文献搜索中的记录将上传到系统的审查软件的共同版本，以促进重复数据删除，盲目筛选和选择合格的研究。两名独立的审稿人将严格筛选记录，提取数据并执行偏见评估的风险，并通过第三个研究人员解决冲突。结果将在摘要表中进行叙述，并具有荟萃分析取决于发现的可能性，重点是医疗环境中成年患者的每日氯氏菌沐浴的有效性和不良事件。此外，我们将通过量化其效应大小来研究某些风险因素是否会影响结果。
肺癌患者肠道中的念珠菌扩张与生态特征相关，该症状支持不良生物条件下的生长
人类肠道中的念珠菌物种过度生长被认为是侵入性念珠菌病的先决条件，但是我们对促进或限制这种过度生长的肠道细菌的理解仍然受到限制。通过从75名男性和女性癌症患者的粪便中整合横截面的真菌病和shot弹枪元基因组学数据，但没有全身性念珠菌病，高念珠菌样品中的细菌群落显示出比低念珠菌样本中的较高的代谢功能，但具有更高的贡献多样性。我们开发的机器学习模型仅使用细菌分类单元或功能相对丰度来预测外部验证队列中的念珠菌属和物种水平，而AUC为78.6 - 81.1％。我们提出了一种基于产生乳酸细菌的增加的肠道念珠菌过度生长的机制，该机制与调节短链脂肪酸和氧气水平的细菌的降低相吻合。在这些条件下，念珠菌将乳酸作为营养源的能力可能使念珠菌能够在肠道中占据其他真菌。