XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search SystemCave
使用 CaverDock 和机器学习筛选全球批准的针对 SARS-CoV-2 高动态刺突糖蛋白的药物
新型严重急性呼吸综合征冠状病毒 2 (SARS-CoV-2) 会引起病理性肺部症状。针对这种病毒的疫苗和药物的大多数开发工作都针对刺突糖蛋白，特别是其 S1 亚基，该亚基被血管紧张素转换酶 2 识别。在这里，我们使用内部开发的工具 CaverDock 使用低温电子显微镜结构 (PDB-ID: 6VXX) 和来自先前发布的分子动力学模拟的五个最密集簇的代表性结构对刺突糖蛋白进行虚拟筛选。配体数据集来自 ZINC 数据库，包括全球批准用于临床的药物。针对完整数据集计算了单个药物通过刺突糖蛋白同源三聚体通道的轨迹、它们在通道内的结合能以及它们与三聚体三个亚基的接触持续时间。然后使用多元统计方法建立结构-活性关系并选择运动抑制的最佳候选药物。这种用于快速筛选多状态蛋白质结构（6 种状态）中全球批准药物（4359 种配体）的新协议在完成计算的速度方面表现出很高的稳健性。该协议是通用的，可以应用于任何具有包含蛋白质隧道或通道的实验性三级结构的目标蛋白质。该协议将在 CaverWeb 的下一个版本中实现（https://loschmidt.chemi.- muni.cz/caverweb/），以便更广泛的科学界可以访问它。2021 作者。由 Elsevier BV 代表计算和结构生物技术研究网络出版。这是一篇根据 CC BY 许可开放获取的文章（http://creativecommons. org/licenses/by/4.0/）。
搬迁沙田污水处理厂往岩洞的实时大数据人工智能环境影响评估 (AIEIA) 执行摘要 搬迁沙田污水处理厂往岩洞（本项目）的环境影响评估中，位于沙田马场和周边河道的彭福公园鹭鸟林被列为环境指标之一。目前，香港对鸟类生态栖息地的监测主要以人为观察为主，而人为观察的时间间隔有限。由于繁殖季节环境变化微妙，人为不易分辨鸟类行为的细微变化。渠务署藉此机会与香港科技大学合作，通过在项目下对彭福公园鹭鸟林进行先导观察，探索将最先进的绿色人工智能 (AI) 技术融入环境监测。观察是明智行动的第一步。完整的阵列数据收集系统 (ADCS) 和实时数据提取管道架构经过全面设计，可实现模块化，并可成功部署在各种结构中，确保在所有环境中可靠运行。ADCS 具有多种优势，可满足户外环境长期监测的需求：(i) 自动连续录制；(ii) 高分辨率视频；(iii) 高帧率视频；(iv) 巨大的本地数据存储；(v) 保护恶劣环境（例如极端天气条件）。采用一种新的视频压缩标准高效视频编码 (H.265) 来处理、存储和传输高分辨率视频，同时保持视频质量。在户外环境中实现数据采集自动化之后，实施了 AI 算法，以从长达数月的数据中检测鸟类。本研究重点是检测大白鹭和小白鹭，即研究地点的主要鸟类。AI 算法开发的主要挑战是缺乏香港鸟类的标记数据集。为了解决这个问题，我们利用 3D 建模制作了大白鹭和小白鹭的合成鸟类数据集。在虚拟图像的开发过程中，我们应用了姿势和身体大小等显著特征的大量变化，这反过来又迫使模型专注于专家用来区分鸟类物种的细粒度鸟类特征，例如颈部和头部。经过训练的 AI 模型能够在不同背景下以高预测分数区分和定位鸟类物种，平均准确率达到 87.65%。我们的人工智能 ADCS 解决方案比传统的人工观察具有多种潜在优势，能够在不同的天气条件下为不同物种的鸟类计数、行为研究、空间偏好以及种间和种内相互作用提供密集的表面。这项研究的结果和发现有利于未来规划环境监测工作以及项目下的工作阶段，以尽量减少对彭福公园鹭鸟林的潜在环境影响。
搬迁沙田污水处理厂往岩洞的实时大数据人工智能环境影响评估 (AIEIA) 执行摘要 搬迁沙田污水处理厂往岩洞（本项目）的环境影响评估中，位于沙田马场和周边河道的彭福公园鹭鸟林被列为环境指标之一。目前，香港对鸟类生态栖息地的监测主要以人为观察为主，而人为观察的时间间隔有限。由于繁殖季节环境变化微妙，人为不易分辨鸟类行为的细微变化。渠务署藉此机会与香港科技大学合作，通过在项目下对彭福公园鹭鸟林进行先导观察，探索将最先进的绿色人工智能 (AI) 技术融入环境监测。观察是明智行动的第一步。完整的阵列数据收集系统 (ADCS) 和实时数据提取管道架构经过全面设计，可实现模块化，并可成功部署在各种结构中，确保在所有环境中可靠运行。ADCS 具有多种优势，可满足户外环境长期监测的需求：(i) 自动连续录制；(ii) 高分辨率视频；(iii) 高帧率视频；(iv) 巨大的本地数据存储；(v) 保护恶劣环境（例如极端天气条件）。采用一种新的视频压缩标准高效视频编码 (H.265) 来处理、存储和传输高分辨率视频，同时保持视频质量。在户外环境中实现数据采集自动化之后，实施了 AI 算法，以从长达数月的数据中检测鸟类。本研究重点是检测大白鹭和小白鹭，即研究地点的主要鸟类。AI 算法开发的主要挑战是缺乏香港鸟类的标记数据集。为了解决这个问题，我们利用 3D 建模制作了大白鹭和小白鹭的合成鸟类数据集。在虚拟图像的开发过程中，我们应用了姿势和身体大小等显著特征的大量变化，这反过来又迫使模型专注于专家用来区分鸟类物种的细粒度鸟类特征，例如颈部和头部。经过训练的 AI 模型能够在不同背景下以高预测分数区分和定位鸟类物种，平均准确率达到 87.65%。我们的人工智能 ADCS 解决方案比传统的人工观察具有多种潜在优势，能够在不同的天气条件下为不同物种的鸟类计数、行为研究、空间偏好以及种间和种内相互作用提供密集的表面。这项研究的结果和发现有利于未来规划环境监测工作以及项目下的工作阶段，以尽量减少对彭福公园鹭鸟林的潜在环境影响。
洞穴运输的能量和动态
洞穴小窝是直径为 70-100 纳米的质膜内陷，在脂肪细胞、内皮细胞、肌细胞和成纤维细胞中大量存在。它们的球状膜域具有特征，由特定的脂质结合蛋白形成，包括 Caveolins、Cavins、Pacsin2 和 EHD2。同样，胆固醇和其他脂质的富集使洞穴小窝成为一种独特的膜环境，支持参与细胞类型特异性信号通路的蛋白质。它们脱离质膜并穿过细胞溶胶的能力已被证明对脂质运输和代谢很重要。在这里，我们回顾了洞穴小窝运输和动力学的最新概念。其次，我们讨论了 ATP 和 GTP 调节蛋白（包括动力蛋白和 EHD2）如何控制洞穴小窝行为。在整个过程中，我们总结了洞穴小窝内化和运输的潜在生理和细胞生物学作用，并强调了该领域的未决问题和未来的研究方向。
通过染料追踪研究对附近喀斯特次盆地进行划分...
图1：肯塔基地质调查局建立的排水子碱边界。浅蓝色显示的大盆地是沙洞盆地。这是这项研究的主要主题。以前的染料跟踪结果显示为红线。请注意，砂洞盆地内的染料迹线是从另一个大盆地的高流量溢流途径，并且不能定义盆地的范围。
机器人探索火星洞穴寻找生命
[1] Fan，Thakker，Bartlett，Miled，Kim，Theodorou，Agha-Mohammadi，“自动杂种地面/未知环境中的空中移动性”，IROS 2019。[2] Lew，Emmei，Fan，Bartlett，Santamaria-Navarro，Thakker，Agha-Mohammadi，“接触惯性探测：碰撞是您的朋友，” ISRR2019。[3] Santamaria-Navarro，Thakker，Fan，Morrell，Agha-Mohammadi，“迈向无人机的弹性自动导航”，ISRR2019。[4] Terry，Lei，Morrell，Daftry，Agha-Mohammadi，“感知衰落的地下环境中的伪影检测和定位”，ICRA 2020（提交）。[5] Ebadi，Change，Palieri，Stephens，Hatteland，Heiden，Thakur，Morrell，Carlone，Carlone，Agha-Mohammadi。“灯：大规模的自主映射和定位，用于探索感知衰落的地下环境，” ICRA，2020年（提交）。[6] Jung，Lee，Shim，Agha-Mohammadi，“ DARPA地下挑战的自动空中勘探无人机”，ICRA 2020年（提交）。[7] Kanellakis，Karvelis，Mansouri，Agha-Mohammadi，Nikolakopoulos，“在地下隧道导航中使用多旋转器使用多旋翼的自主空中搜寻”，ICRA 2020（提交）。[8] Kramer，Stahoviak，Santamaria-Navarro，Agha-Mohammadi，Heckman，“视觉上降解环境的雷达惯性自我效率估计”，ICRA 2020（提交）。[9] Sasaki，Otsu，Thakker，Haesaert，Agha-Mohammadi，“在哪里映射？迭代的漫游者 - 弯曲器路径计划火星探索，” ICRA 2020（提交）。[10] Fan，Nguyen，Thakker，Alatur，Agha-Mohammadi，Theodorou。“基于贝叶斯学习的自适应控制对安全关键系统的自适应控制”，ICRA 2020（提交）。[11] Kanellakis，Karvelis，Mansouri，Agha-Mohammadi，Nikolakopoulos，“在地下环境中进行自主空中航行的视觉驱动的NMPC，IFAC（提交），[12]，[12] [12]长期耐药性活动的概念混合空中/地面车辆。[13] Otsu，Tepsuporn，Thakker，Vaquero，Edlund，Walsh，Walf，Wolf，Agha-Mohammadi，“与机器人团队对贫困环境的自动探索和映射”[14] Tagliabue, Schneider, Pavone, Agha-mohammadi, “ The Shapeshifter: a Multi-Agent, Multi-Modal Robotic Platform for the Exploration of Titan, " IEEE Aerospace Conf., 2020 [15] Agha-mohammadi, Hofgartner, Vyshnav, Mendez, Tikhomirov, Chavez, Lunine, Nesnas, “探索冰冷的世界：通过自动协作混合机器人访问泰坦的地下空隙，” IPPW，2018。[16] Heiden，牧师，Vyshnav，Agha-Mohammadi，“通过置信度丰富的3D网格映射：应用于物理机器人的异质传感器融合：Iser，2018年。[17] SABET，AGHA-MOHAMMADI，TAGLIABUE，ELLIOTT，NIKRAVESH，“滚筒式：能源吸引能量的混合杂种空中地形迁移率对极端地形”，IEEE Aerospace Conf。，2019年。[18] Agha-Mohammadi，Heiden，Hausman，Sukhatme，“信心丰富的3D网格映射” IJRR，2019年。[19] Kim，Thakker，Agha-Mohammadi，“不确定性下的风险感知计划的双向价值学习”，IEEE机器人和自动化信，2019年。[21] Parcheta，Nash，Parness，Mitchell，Pavlov，“狭窄的垂直洞穴：映射火山裂缝几何形状”，IPCC，2015年。pp。[20] Agha-Mohammadi，Agarwal，Kim，Chakravorty和Amato，“ Slap：通过在信仰空间中启用动态重建的物理移动机器人的同时本地化和计划，”机器人技术的IEEE Transactions，2018。[22]波士顿，“洞穴和喀斯特科学的百科全书”。Fitzroy-Dearborn Publishers，Ltd。，英国伦敦。355-358，2004。
白鼻综合症表演洞穴指南
引言白鼻子综合征是一种由非本地真菌引起的冬眠蝙蝠疾病，称为pseudogymnoascus destructans或PD简称。Cave Explorers在2006年在纽约奥尔巴尼附近的一个洞穴中首先看到了蝙蝠，伴有白鼻子综合症的迹象。从那以后，该疾病遍布北美，造成数百万蝙蝠。这种疾病不会影响人们，但是真菌的孢子可以长时间持续在衣服，鞋子，背包，摄像头和其他物品上。结果，真菌生活的洞穴游客可以在不知不觉中将其传播到其他地区。展示洞穴，也称为旅游洞穴或商业洞穴，为将公众介绍给自然地下环境的奇观提供了重要的机会。作为表演洞穴的所有者和经理，您可以进一步帮助保护本地洞穴环境和使用它们的蝙蝠，从而减少在洞穴中花费时间的游客，人员或研究人员可能会干扰蝙蝠并可能将真菌从一个地方移至另一个地方。本指南提供了一种风险评估工具，建议和示例，以支持您努力降低访客的风险，从而传播导致这种毁灭性疾病的真菌。背景洞穴包含丰富的自然，文化和古生物学资源，并为娱乐，探索，教育和研究提供了宝贵的机会。许多室外教育团体和社区组织依靠洞穴来提高对蝙蝠和其他洞穴居住生物的认识，展示独特的地质特征，并促进对自然的欣赏。表演洞穴还通过旅游业增加了经济并丰富我们的社区。以前，白鼻综合症反应团队开发了WNS净化协议1和设备限制的建议，并管理访问Subterranean Bat Roosts 2。这些建议基于通用预防措施3的应用和最佳的科学信息，这表明参观洞穴的人们有可能传播白鼻综合症，并可能干扰冬眠的蝙蝠2。目的本文档提供了参考资料，以帮助显示洞穴操作员考虑降低人们将PD散布到洞穴中或从洞穴中传播的风险，并减少白鼻综合症对蝙蝠的影响。提供信息和工具以帮助执行其他国家指导（例如“ Cave Access Advisory 2”和全国WNS净化协议3）专门用于探访，研究或旅游业的洞穴。这些建议专门针对人们传播PD的风险，但也可能会降低
SARA 建议通知 – 4-14 Cavey Court, Queenton
o 根据对弗林德斯高速公路/戈尔德塔街交叉口的调查，确定了现有土地用途的交通生成率。该方法假设没有交通通道 Cavey Court 可以使用东边的 Ben Lane 通道或停放在从西边的弗林德斯高速公路直接进入的停车场。这种方法通常被认为是不可接受的，因为其他可行的进出场地的路线会稀释正在记录的交通生成量。但是，注意到 RMS 大件商品商店的交通生成率为高峰时段的 1.5 到 3 次/小时，SARA 通常接受仅适用于大件商品零售的调查交通生成率。
海绵状腔内三氯乙烯蒸气的长距离输送...
摘要：奇妙的洞穴（洞穴）是密苏里州斯普林菲尔德的全国著名旅游胜地。洞穴及其地下水充电区位于相对扁平的伯灵顿 - 基库克石灰岩和污水坑内，而山洞和失去的溪流在充值区域中很丰富。充值区域由厚而复杂的环保区延伸。密苏里州自然资源部（MDNR）在洞穴空气中检测到的TCE（三氯乙烯）浓度的初步监测要高于目标时间加权最大污染物水平（MCL），用于6 µg/m 3的工作场所。tce从未在洞穴财产上使用过； MDNR可信地将TCE归因于距洞穴5.2公里的印刷电路板制造商。工业场所已经关闭了十年，并且已经30年没有出现了可观的TCE出院。数据表明，TCE蒸气正在长时间穿过epikarstic区域，并且蒸气迁移方向季节性地改变了表面和地下温度之间的差异。天然电势和电阻率调查，以识别Epikarst中蒸气井的目标位点，以用于洞穴附近的升级土地。废物场所的常规TCE控制措施未能防止现场迁移，可能会影响很大的地区。简介
岩洞工程指南 - 香港 - 土木工程拓展署
C. Franks 博士（2014 年 11 月 13 日之前） 何耀强先生（自 2015 年 7 月 31 日起） 林志雄先生（2015 年 1 月 3 日至 2015 年 7 月 30 日期间） 梁佩桦先生（自 2014 年 11 月 13 日起） 吴克昌博士（2015 年 1 月 3 日之前） K. Roberts 先生 黄俊峰先生（自 2015 年 1 月 3 日起） F.W.Y. Ko (秘书) 香港铁路有限公司 (土力工程部) A. Yates 先生 香港岩土及土力环境专家协会 C. Chan 先生 伦敦地质学会 (香港区域小组) C. Jack 先生 (2013 年 8 月 13 日之前) R. Sung 先生 (自 2013 年 8 月 13 日起) 香港地质学会 R.S.M.陈先生 香港隧道学会 G. Page 博士 香港工程师学会 (土力分部) E. Chung 先生 香港工程师学会 (土力分部) – 岩洞及隧道工程工作小组 F. Desaintpaul 先生 (2014 年 3 月 25 日之前) D. Salisbury 先生 (自 2014 年 3 月 25 日起) 英国材料、矿物及采矿学会 (香港分会) G. Bridges 先生 英国采石学会 (香港分会) P. Fowler 先生
洞穴特征、季节性和地下分布……
季节性通过影响给定位置的个人存在的环境条件的变化影响物种分布。尽管洞穴小气候的动力学是众所周知的，但只有少数研究评估了这种动力学对非刻痕洞穴物种的影响。在这里，我们评估了利用地下环境的物种是否显示出与洞穴微气象季节性变化有关的栖息地占用变化。我们每个月在意大利中部进行了一年的16个洞穴。洞穴被细分为三米的纵向部门。在每个部门中，我们测量了洞穴形态和微气候特征，评估了八个非湿球体分类群（正翅目，蜘蛛，胃足类和两栖动物）的出现，以及相关物种分布到环境特征和抽样周期。大多数物种的发生都与洞穴形态和微气候特征有关。调查月是确定洞穴部门物种存在的主要因素，表明洞穴居民在活动和分布中表现出强烈的季节性。对于多种物种，我们检测到采样周期和微气候特征之间的相互作用，这表明物种可以全年与不同的微生境相关。最富有的社区是在特定微气候（即高湿度，温度温度和低光）的地点发现的，但是物种丰富度的季节性也很强，这强调了户外和地下环境之间相互作用的复杂性。