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脑脊液靶向测序快速鉴定耐药结核性脑膜炎
摘要 结核性脑膜炎 (TBM) 的死亡率仍然保持在 30% 左右，大多数死亡发生在开始治疗后的 2 个月内。耐药菌株的死亡率更高，因此及早发现耐药性 (DR) 至关重要。靶向下一代测序 (tNGS) 产生高读取深度，可以检测低频率的 DR 相关等位基因。我们将 Deeplex Myc-TB（一种 tNGS 检测）应用于 72 名经微生物学确诊的 TBM 成人的脑脊液 (CSF) 样本，并将其基因组药物敏感性预测与表型敏感性测试 (pDST) 和全基因组测序的综合参考标准以及临床结果进行了比较。Deeplex 在 24/72 (33.3%) 个 CSF 样本中检测到结核分枝杆菌复合体 DNA，并为 22/24 (91.7%) 生成了完整的 DR 报告。 Deeplex 生成的读取深度与 MTB/RIF Xpert 的半定量结果相关。在与一线 DR 相关的典型基因座上可以看到频率 <20% 的等位基因。忽略这些低频等位基因，Deeplex 与除吡嗪酰胺和链霉素以外所有药物的综合参考标准 100% 一致。三名患者在治疗 30 天后脑脊液培养呈阳性；参考测试和 Deeplex 在其中两名患者中鉴定出异烟肼耐药性，而 Deeplex 单独在一名患者中鉴定出低频利福平耐药等位基因。五名患者死亡，其中一名患者通过 pDST 鉴定出吡嗪酰胺耐药性。脑脊液 tNGS 可以快速准确地检测出耐药 TBM，但其应用仅限于细菌负荷较高的患者。对于细菌负荷较低的患者，需要开发诊断和耐药性检测的替代方法。
正常的儿童大脑发育以及与脑脊液的普遍性别和拟人化关系
目的 脑大小和生长研究历史悠久，且充满争议，但正常的脑容量发育尚未得到充分描述。特别是，正常的脑生长和脑脊液 (CSF) 积聚关系至关重要，因为它会受到儿童早期多种疾病的影响，这些疾病会影响脑生长和液体积聚，例如感染、出血、脑积水和多种先天性疾病。本研究的作者旨在描述正常的脑容量增长，特别是在脑脊液积聚的情况下。 方法 作者分析了 505 名健康儿童受试者从出生到 18 岁的 1067 次磁共振成像扫描，以量化脑的组成部分和区域体积。使用平滑样条方差分析比较了不同性别和不同半球的体积轨迹。使用位置、规模和形状的广义加性模型开发了人口增长曲线。 结果 脑容量在 10-12 岁时达到峰值。男性的年龄调整后总脑容量大于女性，体型标准化程序并未消除这一差异。然而，脑体积与脑脊液体积的比率揭示了一种普遍的年龄相关关系，与性别或体型无关。结论这些发现使得规范生长曲线能够应用于管理各种儿童疾病，这些疾病与认知发展、脑部生长和体液积聚相互关联。
原创文章 儿科脑脊液分流术感染的危险因素：荟萃分析
作者审查了数据库中已发表的研究。我们排除了所有未发表的研究或未发表的文章，并使用了关键词 [表 1]。搜索的文章对出版年份没有任何限制。为了尽量减少偏见，我们手动搜索了相应文章中提到的参考文献，以查找进一步的原始研究。研究对象是接受原发性脑脊液分流术且年龄 < 16 岁的患者。排除标准是年龄 > 16 岁且分流术不是患者的第一次分流术。本研究可以接受印尼语或英语文章，且没有出版年份限制。研究的数据包括年龄、脑积水病因、胃造口术、种族和民族、合并症和偏见。检查并描述了所有人群和特征的统计平均值和百分比。
正常的儿童大脑生长以及与脑脊液的普遍性别和拟人化关系
保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。（未经同行评审证明）是作者/资助者，他已授予Medrxiv的许可证，以永久显示预印本。此预印版的版权持有人于2021年1月7日发布。 https://doi.org/10.1101/2020.05.19.20102319 doi：medrxiv Preprint
睡眠不足后注意力不集中代表脑脊液流动的时刻
。CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可证下可用（未经同行评审认证）是作者/资助者，他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是此预印本的版权持有者此版本于 2024 年 11 月 15 日发布。；https://doi.org/10.1101/2024.11.15.623271 doi：bioRxiv 预印本
Krabbe病的临床前研究
阿尔茨海默氏病生物标志物对于了解疾病的病理生理学，有助于准确的诊断和识别靶向治疗至关重要。尽管生物标志物的数量继续增长，但每个人的相对效用和独特性被遗憾的理解很少，因为先前的工作通常一次仅在少数标记上计算出串行成对关系。本研究评估了27例阿尔茨海默氏病生物标志物之间的横断面关系，并确定了他们使用机器学习预测有意义的临床结果的能力。从527个社区居民志愿者那里获得了数据，该志愿者在圣路易斯华盛顿大学的Charles F.和Joanne Knight Alzheimer病研究中心招收。我们使用层次聚类进行了淀粉样蛋白β，tau [磷酸化的tau（p-tau），tau t-t-tau）的27组，CSF和血浆测量值，神经元损伤和从MRI，MRI，PET，PET，质量表光学测定法和炎症中得出的炎症。还包括神经心理学和遗传措施。基于森林的随机特征选择确定了整个队列中淀粉样蛋白宠物阳性的最强预测指标。模型还预测了整个队列和淀粉样蛋白宠物个体的认知障碍。出现了四个反映：阿尔茨海默氏病病理学（淀粉样蛋白和TAU），神经变性，AT8 AT8抗体相关的磷酸化TAU位点和神经元功能障碍。神经元功能障碍和炎症的非特异性CSF度量是淀粉样蛋白PET和认知状况的较差的预测指标。在整个队列中，CSF P-TAU181/Aβ40Lumi和Aβ42/Aβ40Lumi和CSF PT217/T217，PT111/T111，PT231/T231的CSF PT217/T217，PT111/T217的质谱测量值是强大的预测者。鉴于他们有能力在阿尔茨海默氏病的病理轨迹上表示个体，因此这些相同的标记（CSF PT217/T217，PT111/T111，P-TAU/Aβ40Lumi和T-Tau/Aβ40Lumi）在很大程度上是整个Coghort中较差的认知者的最佳预测指标。将分析限制为淀粉样蛋白阳性个体时，认知受损的最强预测指标是Tau PET，CSF T-TAU/Aβ40Lumi，P-TAU181/Aβ40Lumi，CSF PT217/217/217/217和PT205/T205。当前的工作利用机器学习来了解大量生物标志物的相互关系结构和实用性。结果表明，尽管生物标志物的数量已迅速扩大，但许多人是相互关联的，很少有强烈预测临床结果。同时研究可用生物标志物的整个语料库提供了一个有意义的框架，以了解阿尔茨海默氏病病理生物学变化，以及对哪些生物标志物在阿尔茨海默氏病临床实践和试验中最有用的见解。
评估 CHIT1 和 SERPINA3 作为多发性硬化症进展生物学候选脑脊液生物标志物
* P <0.05；** P <0.01；*** P <0.001，按 Spearman 等级相关系数计算，其中阴影代表相关系数 (r)。BMI，体重指数；CSF，脑脊液；CHIT1，壳三糖苷酶-1；EDSS，扩展残疾状况量表；Gd +，钆增强；GFAP，胶质纤维酸性蛋白；MS，多发性硬化症；NfL，神经丝轻链；SEL，缓慢扩展性病变；SERPINA3，丝氨酸蛋白酶抑制剂家族 A 成员 3；T2LV，T2 病变体积。a 包括所有基线 CSF 样本已检测 CHIT1 和 SERPINA3 水平的参与者（n=109）。10
特定区域脑脊液的变化调节经颅直流电刺激的焦点
1 印度班加罗尔国家心理健康和神经科学研究所 (NIMHANS) 神经影像学和介入放射学，2 新加坡南洋理工大学计算机科学与工程学院，3 印度班加罗尔国家心理健康和神经科学研究所神经生理学系，4 新加坡南洋理工大学社会科学学院 (SSS) 心理学，5 印度班加罗尔国家心理健康和神经科学研究所 (NIMHANS) 精神病学系精神分裂症诊所 InSTAR 计划，6 沙特阿拉伯达曼法赫德国王专科医院神经科学中心，7 美国马里兰州巴尔的摩约翰霍普金斯大学医学院，8 新加坡南洋理工大学学习研究与发展中心 (CRADLE)，9 新加坡南洋理工大学李光前医学院 (LKC Medicine)，10教育背景：新加坡南洋理工大学
DNA甲基化 - 环境相互作用在人类基因组中
背景：甲状腺激素（Th）是大脑发育和功能所必需的。浸泡9个大脑和脊髓的脑脊液（CSF）含有自由或经甲状腺素（TTR）结合。中枢神经10系统中的紧密甲状腺激素水平调节对于控制神经发生，髓鞘形成和突触发生的发育基因表达至关重要。这一综合的11个功能强调了开发精确和可靠的方法评估CSF中TH水平的重要性。方法：我们报告了12种基于LC-MS的方法，用于测量啮齿动物CSF和血清中的甲状腺激素，适用于新鲜和冷冻样品。13结果：我们发现怀孕大坝与非妊娠成年人以及胚胎与成人CSF的CSF甲状腺激素有着明显的差异。14此外，靶向的LC-MS代谢分析发现了这些人群中CSF中的不同中央碳代谢。结论：相关代谢途径的第15次检测和代谢物分析开放了对CSF甲状腺激素16的严格研究的新途径，并将为正常发育过程中CSF的代谢改变的未来研究提供信息。17 18
创伤性脑损伤患者脑脊液中的壳三糖苷酶活性：与神经炎症和结果的关系
Chit 的生物学作用尚未被充分认识，尽管已证实它能水解几丁质，而几丁质是许多昆虫和病原体的结构和功能成分 [2]。在正常个体和 CHIT1 基因外显子 10 突变的患者血浆中发现了 Chit 活性的变化，从而导致无症状的 Chit 活性缺乏 [3, 4]。这种酶缺乏的病理生理意义尚不十分清楚。在正常个体中，Chit 活性已被确定为巨噬细胞活化的标志。事实上，患有伴有显著吞噬细胞活性的慢性疾病的患者，如溶酶体戈谢病和尼曼匹克病 [5]、β-地中海贫血 [6] 或动脉粥样硬化 [7]，以及患有急性和慢性寄生虫感染的患者，如疟疾和利什曼病 [8]，其血浆中的 Chit 活性均升高。据报道，在戈谢病 [9] 中存在鞘内 Chit 活性的证据，并且初步研究也表明，在一些慢性炎症性神经系统疾病（如中风和多发性硬化症）中也存在这种活性 [10, 11]。在创伤性脑损伤 (TBI) 中，人类和动物研究均报告了鞘内胶质细胞活化、巨噬细胞浸润和细胞因子产生增加 [12, 13]。特别是慢性胶质细胞活化与神经退行性病变的进展有关 [14]。