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MUSICiAn：通过无控制突变谱分析对参与 DNA 修复的基因进行全基因组识别
动机：了解 DNA 双链断裂 (DSB) 修复所涉及的因素对于开发靶向抗癌疗法至关重要，但许多基因的作用仍不清楚。最近的研究表明，某些基因的扰动可以改变 DSB 修复后留下的序列特异性突变的分布。这表明全基因组筛选可以通过识别基因来揭示新的 DSB 修复因子，这些基因的扰动会导致在给定 DSB 位点观察到的突变分布谱与野生型有显著偏差。然而，为全基因组扰动筛选设计适当的对照可能具有挑战性。我们探索了这样一种想法，即全基因组筛选可能允许我们放弃使用传统的非靶向对照，方法是将分析重新定义为异常值检测问题，假设大多数基因对 DSB 修复的影响最小。结果：我们提出了 MUSICiAn（突变特征目录分析），这是一种组合数据分析方法，通过测量所有光谱分布与集中趋势的偏差，对没有对照的基因扰动特定突变谱进行排序。我们表明 MUSICiAn 可以有效估计现有 Repair-seq 数据集的伪对照，筛选 476 个基因和 60 个非靶向对照。我们进一步将 MUSICiAn 应用于全基因组数据集，该数据集分析了 CRISPR-Cas9 在三个靶位点诱导的突变结果，这些突变发生在细胞中，每个细胞的个体扰动为 18,406 个基因。MUSICiAn 成功恢复了已知基因，突出了剪接体在 DSB 修复中不太受重视的作用，并揭示了进一步研究的候选基因。可用：github.com/joanagoncalveslab/MUSICiAn。
将人工智能融入……的火炬手
通过使用人工智能，苏丹国能够提高其在数字领域的能力。在当今数字化快速发展的时代，根据牛津洞察指数，苏丹国在 2020 年政府实施人工智能的准备情况指数中上升了 11 位，而其在全球排名第 48 位，在中东排名第六。随着苏丹国越来越依赖复杂的 IT 基础设施来支持其产业，明智的做法是预见未来人工智能将成为重要信息、数据收集和分析的关键，这些信息、数据可作为决策和高效执行的输入，而这在竞争激烈的世界中原本会耗费大量时间和成本。毋庸置疑，数据中心和云服务已被确定为数字化重点关注领域之一，其中有巨大的机会可供探索和利用。 Nebula AI 的推出为政府加速采用云服务提供了机会，也使阿曼成为该地区提供 AI 云服务门户的领跑者。苏丹国拥有大量海底电缆，使其有资格托管数据中心、高速计算机和用于处理人工智能算法的云服务。此外，大量 IT 毕业生可以获得人工智能和先进技术领域的资格和培训，这也是阿曼的优势。阿曼数据园区作为阿曼 AI 革命的火炬手，正在通过在渔业、农业、交通运输、物流等领域综合应用智能技术，在促进经济增长和社会影响的行业采用人工智能，帮助提高经济多元化目标行业的生产力。