摘要:为了研究SARS-COV-2感染的全身代谢效应,我们分析了人类血浆中的1 H NMR光谱数据,并与多个血浆细胞因子和趋化因子和趋化因子和趋化因子(并行测量)共同建模。因此,在从SARS-COV-2 RRT-PCR阳性患者(n = 15,具有多个样本时间点)和年龄相匹配的健康对照(N = 34的CORMED-CCR)中,在SARS-COV-2 RRT-PCR阳性患者(n = 15,n = 15,n = 15)中记录的血浆中收集了600 MHz 1 h溶剂抑制的单脉冲,自旋回波和2D J分解光谱。测试了SARS-COV-2阴性的Uenza样临床症状(n = 35)。我们将单脉冲NMR光谱数据与体外诊断研究(IVDR)的信息进行了比较,以了解从原始1D NMR数据中提取的定量脂蛋白促蛋白(112个参数)。所有NMR方法都对使用单个NMR方法的对照组和SARS-COV-2阴性患者对SARS-COV-2阳性患者进行了高度显着歧视,从而给出了有关疾病诱导的现场版本的不同诊断信息。选定患者的纵向轨迹分析表明,在恢复阶段没有可检测的病毒的个体中,代谢恢复是不完整的。我们观察到四个血浆细胞因子簇,它们表达了与多种脂蛋白和代谢产物的复杂统计关系。IL-18,IL-6和IFN-γ与IP-10一起,RANTES与LDL1-4亚构件表现出很强的正相关性,并且与多个HDL亚段的负相关性。包括以下内容:群集1,包括MIP-1β,SDF-1α,IL-22和IL-1α,与多个增加的LDL和VLDL亚隔离相关;群集2,包括IL-10和IL-17A,仅与脂蛋白蛋白相关。群集3,包括IL-8和MCP-1,与多种脂蛋白成反比。总体而言,这些数据表明了与SARS COV-2感染的多级细胞免疫反应与血浆脂蛋白相互作用的多级免疫反应,从而使疾病的强烈和特征性免疫代谢表型相互作用。我们观察到,呼吸道恢复阶段和无测试病毒的一些患者在代谢上仍然是高度异常的,这表明这些技术在评估全身恢复中的新作用。关键字:血浆,Covid-19,Sars-Cov-2,NMR光谱,单脉冲,自旋回波,IVDR,代谢表型,生物标志物,诊断模型,脂蛋白■简介
循环肿瘤DNA(CTDNA)分析对于中枢神经系统(CNS)和非CNS实体瘤的儿童进行实时“液体活检”的潜力仍有旨在完全阐明。我们进行了一项研究,以研究CTDNA测序在参加机构临床基因组学试验的儿科患者中的可行性和潜在临床实用性。在研究期间,共有240名患者进行了肿瘤DNA分析。血浆样品,然后从一部分患者的纵向收集。成功的无细胞DNA提取和定量发生在这些初始样品中的217个(99.5%)中的216个。鉴定出二十四名患者,其肿瘤具有30种独特的变体,这些变体可能在商业上可用的CTDNA面板上可检测到。在这30个突变中,有20个突变(67%)通过至少一个血浆样品中的ctDNA中的下一代测序成功地检测到。与患有CNS肿瘤的患者相比,非CNS实体瘤患者(7/9,78%)的CTDNA突变检测率更高(9/15,60%)。与非转移性疾病相比,在转移性疾病(9/10,90%)的患者中,在转移性疾病患者中也观察到更高的CTDNA突变检测率(7/14,50%),尽管在没有放射线遗迹证据的情况下,在少数患者中检测到肿瘤特异性变异。这项研究说明了将纵向CTDNA分析纳入儿童中枢神经系统或非CNS实体瘤的复发或难治性患者的管理的可行性。
Camille Houdelet、Eva Blondeau-Bidet、Mathilde Estevez-Villar、Xavier Mialhe、Sophie Hermet 等人。指示欧洲海鲈 (Dicentrarchus labrax) 性别和压力的循环微小 RNA:寻找新的生物标志物。海洋生物技术,2023 年,25 (5),第 749-762 页。�10.1007/s10126-023-10237-0�。�hal-04204152�
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最受欢迎的传统临床生物标志物评估肾脏功能和糖尿病肾脏疾病(DKD)的鉴定,包括血清肌酐(SCR),肾小球滤过率(EGFR),尿白蛋白肌酐比率(UACR)和白蛋白尿尿症检测[7,8]。即使存在这些传统标记,及时,精确的DN诊断也存在重大障碍。最近的研究表明,大约30%的DN患者没有蛋白尿[9]。此外,在DN患者中,特别是在T2D中,在没有蛋白尿的情况下,GFR的降低。相反,这些患者以严重降低的GFR降低了慢性肾脏疾病(CKD),而没有从微藻尿症过渡到明显的蛋白尿[10]。并非特定于DKD的存在,也可能发生在其他疾病中[11]。由于DN的早期诊断对于防止该疾病的发展至关重要,因此近年来已经努力引入新的DN诊断标记。最近的研究表明,非编码RNA(NCRNA),尤其是microRNA(miRNA)和长期编码RNA(LNCRNA)参与DN的发作和进展[12-14]。LNCRNA和miRNA之间的相互作用,称为miRNA海绵或竞争性内源性RNA(CERNA),可以减少miRNA对mRNA的抑制作用,从而防止靶基因抑制[15]。此外,NCRNA可以作为一种新型敏感和无创的诊断生物标志物来预测DN进展,因为它们在体液,组织和组织和细胞特异性表达曲线上的稳定性很高[16,17]。
用于指导复发和难治性套细胞淋巴瘤 (R/R MCL) 治疗决策的临床工具有限,而循环肿瘤 DNA (ctDNA) 的转化潜力在很大程度上仍未得到证实。我们设计并应用了基于面板的双重测序,以揭示接受维奈克拉、来那度胺和利妥昔单抗 (Ven-R2) 治疗的 R/R MCL 患者 ctDNA 中反应和结果的分子决定因素。基因分析揭示了反应和结果的分子预测因子,这些预测因子与临床预后因素无关,SMARCA4 突变的 R/R MCL 对治疗有反应,而 TP53 突变则产生耐药性。治疗前 ctDNA 捕获了空间异质性,其浓度与临床病理疾病特征和生存期相关,与分子预测因子无关。根据当代实时定量 PCR 检测,对微小残留病的动态 ctDNA 评估补充了临床反应评估,并揭示了部分分子缓解患者的难治性。基线时克隆性造血 (CH) 的特征与治疗期间的血液学毒性和不良结果相关。治疗期间对 TP53 相关 CH 的阳性选择不会损害 ctDNA 反应分析的特异性,并且碎片特征可以区分 MCL ctDNA 和 CH。总之,我们报告了 MCL ctDNA 中的新特征,这些特征解锁了新的微创工具,有可能改变 R/R MCL 的临床决策。
smerage(2014)报道了转移性乳腺癌患者的一项随机对照试验的结果,并持续提高了CTC水平,以测试一线治疗周期后的化学疗法是否可以改善整体生存期(OS;主要的研究结果)。[21]在基线时没有CTC水平升高的患者一直保持初始治疗,直到进展(ARM A),最初患有CTC水平的患者在治疗21天后降低了初始治疗(ARM B),并且在治疗21天后持续增加了CTC水平的患者继续治疗以继续进行初始治疗(ARM C1)或替代治疗(ARM C1)或替代CANT(ARM C2)。有595名合格且可评估的患者,其中276名(46%)没有增加CTC水平(ARM A)。最初升高CTC水平,31例(10%)的患者未重新测试,将165例分配给B手臂,而123例被随机分配给ARMS C1或C2。手臂C1(10.7个月)和C2(12.5个月,p = 0.98)之间的OS中位OS没有差异。CTC水平具有强烈的预后,其中臂A,B和C(C1和C2组合)的中位OS为35
缩写:CA19-9,碳水化合物抗原19-9; ctDNA,循环肿瘤DNA; F,女; Folfirinox,叶酸,5-氟尿嘧啶,伊立曲霉和奥沙利铂的组合; M,男性; Mfolfirinox,改良的folfirinox; PFS,无进展的生存; OS,整体生存
背景:血浆中的循环肿瘤 DNA (ctDNA) 检测为在完成确定性治疗但仍有分子残留疾病 (MRD) 的患者中识别早期乳腺癌 (BC) 复发提供了机会。ZEST 是一项随机、3 期、双盲试验,旨在评估尼拉帕尼是否可以提高完成治愈性治疗后无放射学复发证据的 BC 和 ctDNA 检测 (ctDNA+) 患者的无病生存率。方法:I-III 期三阴性乳腺癌 (TNBC) 或 BRCA 突变的 HER2- BC 患者符合条件。根据肿瘤组织和匹配的正常血液的全外显子组测序设计了个性化的肿瘤信息 ctDNA 检测 (Signatera)。基于 ctDNA 的 MRD 检测在确定性治疗 (EODT) 结束后的任何时间开始;HR+ 疾病患者可以同时进行内分泌治疗(稳定方案)。根据 ctDNA+ 进行放射学分期。无转移性疾病证据的患者被随机分配(1:1)接受尼拉帕尼(200 或 300 毫克/天,取决于体重和血小板计数)或安慰剂(PBO)。每 12 周进行一次影像学检查。主要终点是尼拉帕尼的安全性;还评估了无病生存期(衡量标准是从随机分组到复发或因任何原因死亡的时间)。
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