对于鉴定生物化学过程和活细胞中生物学规范至关重要的主要营养素是蛋白质。蛋白质通常围绕由其家庭类型定义的一个或几个功能。因此,需要识别和分类来根据其结构和家庭分离蛋白质。在这项工作中,我们建立了一个模型来对蛋白质序列的家庭进行分类。我们使用的蛋白质序列数据集由各种生物学意义的大分子组成。分类器是使用BI-LSTM深入学习的。我们通过从结构生物信息学研究合作社的蛋白质数据库中收集数据集,使用令牌化对数据进行预处理,并基于BI-LSTM的深度学习网络对分类器进行建模。由于我们获得了受过训练的模型的最佳准确率,因此我们使用学习曲线,准确率和损失的评估指标来找出模型性能。结果表明,Deep Bi-LSTM具有拟合学习曲线,99%的精度率和0.042损失的出色性能。
本文经过外部同行评审。提交于 2022 年 5 月 6 日;修订于 2022 年 10 月 14 日;接受于 2022 年 12 月 5 日。来自上游实验室、MAP/城市健康解决方案中心、李嘉诚知识研究所、Unity Health Toronto、加拿大安大略省多伦多 (TLU、CAN、JM、ADP);卡尔加里大学卡明医学院,加拿大艾伯塔省卡尔加里 (TLU);多伦多大学医学院本科医学教育,加拿大安大略省多伦多 (TLU、JM);Bridgepoint 研究与创新合作实验室,Lunenfeld-Tanenbaum 研究所,西奈健康系统,加拿大安大略省多伦多 (CSG);多伦多大学达拉拉纳公共卫生学院卫生政策、管理和评估研究所,加拿大安大略省多伦多 (CSG、ADP);多伦多大学应用科学与工程学院机械与工业工程系,多伦多,
SREC 成立于 2002 年,提供各种工程和管理本科和研究生课程,其核心价值是创新、创造力和创业思维。为了在校园内建立创业产品开发文化,该学院将其他核心价值确定为跨学科学习、行业相关性和信息技术。它一直走在前列,每年为 3000 多名学生提供优质教育。该学院被 UGC 授予自治权,经 NAAC 认证,所有课程均经 NBA 认证。该学院已与多所国内外大学/学院合作,以提高教育标准并开展应用研究。为了在其核心价值观的基础上培育创新教育生态系统,该学院成立了创造性认知中心、科学技术创业巢、设计中心和社会创新合作实验室。该学院通过基础研究到技术演示等各个领域的大量项目获得了大量研究资金,这些项目由 DST、AICTE、UGC 和其他组织赞助,其中 20 个项目已完成,13 个项目正在进行中。该校拥有教育思想领袖、工程和管理学生、执业设计师和企业家,推动了创新生态系统。
1 上游实验室,MAP 城市健康解决方案中心,Unity Health Toronto,加拿大安大略省多伦多,2 本科医学教育,多伦多大学 Temerty 医学院,加拿大安大略省多伦多,3 卡尔加里大学 Cumming 医学院,加拿大阿尔伯塔省卡尔加里,4 多伦多大学生物伦理学联合中心,加拿大安大略省多伦多,5 多伦多大学 Dalla Lana 公共卫生学院,加拿大安大略省多伦多,6 Bridgepoint 研究与创新合作实验室,Lunenfeld-Tanenbaum 研究所,Sinai 卫生系统,加拿大安大略省多伦多,7 多伦多大学 Dalla Lana 公共卫生学院卫生政策、管理和评估研究所,加拿大安大略省多伦多,8 多伦多大学应用科学与工程学院机械与工业工程系,加拿大安大略省多伦多,9 圣迈克尔医院家庭与社区医学系,加拿大安大略省多伦多,10 大学医学院家庭与社区医学系加拿大安大略省多伦多市
对跨物种的因素的研究,使某些人比其他人更成功地老化对个人健康以及健康教育,政策和干预具有重要意义。div范围的研究和该领域研究人员的交流受到多种术语的影响。关于认知衰老和痴呆症的储备和韧性的研究定义合作,由美国国家衰老研究所资助,并于2019年成立,是制定共识定义和研究指南的三年过程。拟议的框架基于一个局限性流程,其中包括3个年度研讨会,专注的工作组和来自众多国际调查人员的投入。它提出了总体术语:弹性,并为3个征服者提供了操作定义:认知储备,脑部维护和大脑储备。提出了整合这些定义的十二个试点研究。使用通用词汇和操作定义将有助于理解与成功衰老相关的因素方面更大的进步。©2022 Elsevier Inc.保留所有权利。
•该项目是否与PHSA之外的合作伙伴一起进行?如果是这样,请量减去与这些合作伙伴共享的数据或产品,如果已通知TDO有关协议的潜在需求。•请清楚地说明谁将管理算法中使用的数据以及是否预计数据的任何所有权索赔。•谁将拥有与算法有关的知识产权。•这项研究是否会在预审进的PHSA环境中进行内部进行?请描述如何访问数据,描述环境和平台。请注意,尚未审查的新平台,环境或活动以安全和隐私合规性和/或旨在与卫生当局系统建立联系将需要隐私影响评估(PIA)和安全审查。•使用算法时将如何保留隐私。请注意,Google协作不适用于敏感数据。•每个研究站点都有为特定目标人群实施此算法所需的资源/设备,还是在将不同的机构在实施和使用该算法的情况下引起了任何潜在问题。
1 126 USC § 48, https://www.govinfo.gov/content/pkg/USCODE-2011-title26/pdf/ USCODE-2011-title26-subtitleA-chap1-subchapA-partIV-subpartE-sec48.pdf。 2 2017 年减税与就业法案 3 美国国税局规定,在美国领土拥有太阳能的美国公司、公民或合伙企业可以申请投资税收抵免 (ITC);但是,如果公司和个人不缴纳联邦所得税,他们就没有资格获得税收优惠,这意味着大多数波多黎各人和波多黎各公司没有资格。因此,美国领土内的太阳能资产很可能需要由美国外部投资者拥有才能享受投资税收抵免(Farrell、Mac、Lindsay Cherry、Jeffrey Lepley、Astha Ummat 和 Giovanni Pagan。2018 年。《重新构想电网解决方案:波多黎各更好的前进之路》。为全球合作小组准备。https://sipa.columbia.edu/sites/default/files/embedded-media/Reimagining%20Grid%20Solutions_Final%20SIPA%20REPORT_0.pdf)。4 不超过 20% 的光伏系统合格价值可归类为二手设备。5 2017 年减税与就业法案 6 “根据第 48 条开始投资税收抵免的建设。”美国国税局。2018-59 号通知。 https://www.irs.gov/pub/irs-drop/n-18-59.pdf 。 7 当储能设备还用于存储太阳能光伏系统以外的其他来源产生的能量时,还需要考虑其他因素。有关更多信息,请参阅: • IRS。2013 年 2 月 22 日。IRS 私人信函裁定 121432-12。http://www.irs.gov/pub/irs-wd/1308005.pdf 。 • Elgqvist,Emma,Kate Anderson 和 Edward Settle。2018 年。联邦税收激励措施
研究教育补助金2023-至今,改善家庭护理人员和家庭护理助手之间关心ADRD的人的信息共享。pi:Fabius,Chanee。角色:导师。K01AG080079国家老化研究所,善良的努力为5%,$ 616,385 2022至关重要的视频干预,以提高痴呆症素养和对黑人美国人的护理对话的目标。pi:斯隆,丹妮塔。角色:导师。K01AG077222 National Institute on Aging, 5% in kind effort, $638,965 2021-present Health Care Systems Scholar Award (IMPACT Collaboratory), PI: Samus, Quincy, U54AG063546 National Institute on Aging, 50% effort, $128,160 PI: Samus, Quincy 2020-present Improving Post-Diagnosis Dementia Care in Primary Care,PI:Amjad,Halima,角色导师,K23AG064036,美国国家老化研究所,实物努力3%,$ 893,205 2020年至今的健康服务和老龄化人口研究结果,PI:PI:Wolff:Wolff,Jennifer,Jennifer;博伊德,辛西娅,角色:T32AG066576国家老化研究所的教职员工和讲师,1%的努力,$ 2,373,700 2017-20222 2017-2022心理健康服务和系统培训计划,PI:Barry,Colleen,Colleen; Stuart, Elizabeth, Role: Faculty and Lecturer, T32MH109436 National Institute of Mental Health, 2% effort in- kind, $1,058,010 2009-2014 Quality of Mental Health Care in Assisted Living, PI: Samus, Quincy, K01MH85142 NIMH, 82% effort $738,575.pi:Lyketsos,君士坦丁,角色:中心教职员工,里奇曼家庭基金会,1%的努力,1,000,000美元2021-2023 Covid-19对痴呆症患者的护理人员的影响。pi:罗森伯格,保罗;林斯特,布伦特。角色:角色:共同投资者。R01AG050515-04S1国家老化研究所,3%的努力,$ 446,295 2021-20232007-present Research Training in Age-Related Cognitive Disorders, PI: Albert, Marilyn, Role: Faculty and Lecturer, T32AG027668 National Institute on Aging, 1% in kind, $1,729,020 2005-2022 Medical Student Training in Aging Research (MSTAR) Program, PI: Christmas, Colleen, Role: Faculty and Lecturer, T35AG026758国家老化研究所(National Institute on Native of Noding),努力为2%,1,531,836美元赞助项目2021-至今的阿尔茨海默氏病富豪家族精密医学中心。
AIM:小分子CSF1R抑制剂在临床开发中,针对癌症治疗剂的临床开发和潜在的铅优化在临床开发中对基于结构的抑制作用抑制菌落刺激因子-1受体(CSF1R),因为CSF1R是一种新型的预测性生物标记物,用于癌症的免疫疗法。方法:化合物是在分子工作环境中通过诱导的拟合对接方案建模的硅(Moe,Moe.V.2015)。CSF1R激酶(蛋白质数据库,ID 4R7H)的3维(3D)X射线结晶结构是从结构生物信息信息学(RSCB)蛋白数据库的研究合作中获得的。Edicotinib,DCC-3014,Arry-382,BLZ-945,Chiauranib,Dovitinib和Sorafenib的3D构象体是从PubChem数据库中获得的。这些结构在Amber10:EHT分子力场中进行了建模,并使用快速准备应用来纠正和优化缺失残基,H-Counts,Termini限额和交替的结构。在CSF1R激酶的共结晶配体附近定义了结合位点。这些化合物通过三角匹配器的放置方法对接,并通过伦敦DG评分函数进行排名。通过诱导的合适方法进一步完善了对接的姿势。使用最低结合评分(ΔG)的姿势用于模拟Discovery Studio Visualer V17.2中的配体相互作用曲线。共结晶的配体以其APO构象对接,并计算出根平方的偏差以验证对接协议。结果:除edicotinib以外,所有7个CSF1R抑制剂与残基MET637相互作用。抑制剂通过与ASP-Phe-Gly(DFG)基序的ASP797相互作用和/或阻碍GLU633和LYS616之间形成的保守盐桥,以自动抑制构象的构象保持CSF1R。DCC-3014,Arry-382,BLZ-945和Sorafenib与CSF1R激酶与最低的结合能结合。结论:嘧啶是与CSF1R残基相互作用的有效抑制剂。DCC-3014和Arry-382具有出色的药物潜力,具有巨大的结构稳定性和亲和力。
在国际同行评审期刊、会议论文集和书籍章节中发表了 65 多篇研究文章,其中包括 15 多篇 SCIE/Scopus 索引高影响力期刊论文。 成功指导了 8 名博士生,目前有 5 名全日制学生就读。 印度专利“基于移动生物特征签名的身份验证系统”于 2023 年 4 月 19 日授予(提交日期为 2017 年 2 月 23 日)。 2023 年和 2024 年出版了两本书,书名:机器学习 I (2023) 和机器学习 II (2024),Wiley India 出版商。 ACM 专业会员资格(2024 年 1 月-续),以感谢审阅 ACM 期刊的研究论文(会员编号:5167921)。 自 2024 年 11 月起担任知名期刊《计算机科学前沿》和《牙科医学前沿》的客座副主编 多个专业机构的成员,包括亚太生物信息学交互与网络协会(APbians)的终身会员,自 2018 年 7 月起为第 3 名成员,ACM-SIGCSE 一年期会员资格(2011 年 11 月至 2012 年 11 月)和印度技术教育协会 (ISTE) 的终身会员自 2005 年起,除了许多会议和期刊审查委员会外 教授研究生课程的理论论文:数字图像处理(DIP)、数据挖掘和仓储、机器学习和软计算、人工智能、深度学习、高级 DBMS、离散数学、编译器设计和系统编程等。 DIP 和 AI 实验室、使用 MATLAB 2023a 的机器学习、Prolog、Java、J2EE、C、C ++ 等编程。 2006、2007、2012 年 DBT-BIF 研讨会,ACBB 2015、NWTB-2017、NWTB-2018(6 次研讨会)。 活动负责人:组织部门年度校友聚会活动“里程碑”,2017、2018、2019、2021、2023 年;就业相关的网络谈话活动“HR Conclave 2020”(在线模式)等。 获得 IEC JMI 的伦理许可,可为两个正在进行的非资助合作项目收集涉及人类受试者的数据。 自 2024 年 11 月起担任知名期刊《计算机科学前沿》和《牙科医学前沿》的客座副主编。