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南美八个国家对 SARS-CoV-2 疫苗接种的看法、态度和相关因素
1 委内瑞拉伊萨鲁德大学传染病预防与控制研究中心，931，阿根廷布宜诺斯艾利斯自治市 C1095AAS 2 阿根廷疫苗学和流行病学学会（SAVE），阿根廷布宜诺斯艾利斯自治市 3 巴西免疫学会（Sbim），R. Luís Coelho，308-Consolação，圣保罗 01309-000，SP，巴西； isabellaballalai@gmail.com (IB) 4 乌拉圭儿科学会，传染病和疫苗委员会，Lord Ponsonby 2410，蒙得维的亚 11600，乌拉圭 5 传染病服务，CEMIC 大学医院，Dr. Ricardo Balbín 4459，布宜诺斯艾利斯自治市 C1430ABC，阿根廷 6 智利南方大学医学院医学研究所，Coronel Santiago Bueras 1003，瓦尔迪维亚 5110566，智利； macalvo@uach.cl 7 国际老年学和老年医学协会，拉丁美洲和加勒比委员会，Carrera 7C Bis 139-17，波哥大 110121，哥伦比亚； rcuadros@cafam.com.co 8 厄瓜多尔儿科学会（SEP），Naciones Unidas Av. E2-17 e，基多 170135，厄瓜多尔 9 中央医院，社会保障研究所，PCH9+4RX，Santísimo Sacramento，Asunción 1519，巴拉圭 10 委内瑞拉中央大学热带医学研究所传染病科，加拉加斯 1040，委内瑞拉 * 通讯地址：uruenaanalia@gmail.com
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在自然界中越来越多的抗生素抗性菌株选择，寻找替代性抗菌策略的搜索变得越来越重要。肠球菌CUS粪cv167是本公告中突出的菌株，已经证明了对各种病原体的体外活性，包括金黄色葡萄球菌，表皮球菌，apisterpococcus agalactiae，链球菌，链球菌Uberis uberis uberis，coliica coli coli coli coli coli，使用斑点测定法（1）的抑制活性结果如图1。该细菌是从2022年2月在巴西米纳斯Gerais的Coronel Xavier Chaves的牛奶罐中存储在散装牛奶箱中的原始牛奶样品中分离出来的。用于细菌分离，将1 ml等分试样的牛奶样品串联在磷酸盐缓冲溶液（pH 6.2; Merck，德国）中串联稀释（10°至10°），并将100 µL铺在M17琼脂（美国Sigma-Aldrich，USA）上。在35°C下孵育48小时后，将分离的细菌菌落条纹划分到新鲜的M17琼脂上以进行纯化。分离株指定的CV167被识别为无氧化氢酶活性的革兰氏阳性球菌。然后使用苯酚 - 氯仿法提取细菌的DNA（2）。使用Nanodrop 1000 UV/VIS（Thermo Scientific，Massachusetts，EUA）评估了DNA数量和质量，并使用Illumina DNA Prep套件制备了测序文库。使用Illumina NextSeq 2000平台上的300 bp配对末端测序对DNA进行了测序，从而产生了1,169倍的序列深度。修剪过程导致仅删除1.37％的读数。确认fastQC 0.12.1（3）最初用于评估测序数据的质量，该质量总共产生了11,863,824读。这些读取使用三型0.39（4）进行修剪，并具有以下参数：尾随：10;领导：10;滑动窗口：4:20;最小长度为50 bp。使用黑桃3.15.4（5）进行简短读数的从头组装，将覆盖范围参数设置为“自动”，而K-Mers则将21、33、55、77、99和127。较短的重叠群从最终组装中排除了500 bp。使用Quast 5.2.0（6）评估组装质量。总共产生了61个重叠群，合并长度为2,736,418 bp，鸟嘌呤 - 环氨酸（GC）含量为37.93％，N50的N50为156,530。基因组完整性，揭示了杆菌类的完整性99.3％。
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