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CRISPR/CAS9系统介导的基因编辑在富士牡蛎（Crassostrea Angulate）中通过电穿孔
福建牡蛎（Crassostrea Angulate）是具有较高经济价值的重要海洋双壳类软体动物。基因功能研究和基因编辑技术在牡蛎中具有广泛的应用前景。群集的定期间隔短的短质体重复（CRISPR）/CRISPR相关蛋白9（CAS9）系统已广泛用于许多物种的基因组工程。CRISPR介导的基因编辑也通过微注射直接递送CRISPR/CAS9成分将CRISPR/CAS9成分直接递送到牡蛎胚胎中成功地用于了Paciifif的牡蛎。但是，与显微注射相关的低吞吐量和操作困难是限制CRISPR/CAS9在牡蛎中广泛应用的因素之一。在这项研究中，我们试图将CRISPR/CAS9系统传递到C.通过电穿孔的角度。在本研究中，将一个多合一的CRISPR/CAS9载体质粒用作CRISPR/CAS9系统。使用鸡蛋和胚芽幼虫进行电穿孔。电穿孔后大量幼虫变形或死亡。在电穿孔卵中发育的D-larvae中检测到单个碱基取代突变。我们的结果表明，CRISPR/CAS9系统可以传递到C的胚胎中，用于通过电穿孔进行基因编辑，该系统提供了参考，并将进一步有助于Mollusks中电穿孔的未来应用。
牡蛎疱疹病毒 1 感染期间的 ADAR 编辑：事实与局限性
摘要 在感染巨牡蛎 (Crassostrea gigas) 的过程中，牡蛎疱疹病毒 1 (OsHV-1) RNA 会通过 A 到 I 的转化进行酶促修饰。与 OsHV-1 RNA 平行的 ADAR1 表达和超编辑活性的增加表明 dsRNA 编辑与抗病毒反应之间存在功能性联系。我们分析了 87 个 RNA 测序数据集，这些数据集来自暴露于 OsHV-1 的免疫致敏、抗性和易感牡蛎，以比较宿主和病毒转录本上的 ADAR 超编辑水平并追踪牡蛎基因上的超编辑。尽管在感染后期病毒 RNA 的编辑有所增加，但宿主 RNA 比病毒 RNA 更容易发生超编辑。一组占牡蛎转录组 0.5% 的基因（包括几个含三部分基序的序列）不断被超编辑。相反，我们鉴定出参与抗病毒反应、miRNA 成熟和表观遗传调控的基因，这些基因仅在特定条件下被过度编辑。尽管技术和生物学瓶颈阻碍了对双壳类“RNA 编辑组”的理解，但现有的工具和技术可以适用于双壳类软体动物。
牡蛎疱疹病毒 1 感染期间的 ADAR 编辑：事实与局限性
摘要 在感染巨牡蛎 (Crassostrea gigas) 的过程中，牡蛎疱疹病毒 1 (OsHV-1) RNA 会通过 A 到 I 的转化进行酶促修饰。与 OsHV-1 RNA 平行的 ADAR1 表达和超编辑活性的增加表明 dsRNA 编辑与抗病毒反应之间存在功能性联系。我们分析了 87 个 RNA 测序数据集，这些数据集来自暴露于 OsHV-1 的免疫致敏、抗性和易感牡蛎，以比较宿主和病毒转录本上的 ADAR 超编辑水平并追踪牡蛎基因上的超编辑。尽管在感染后期病毒 RNA 的编辑有所增加，但宿主 RNA 比病毒 RNA 更容易发生超编辑。一组占牡蛎转录组 0.5% 的基因（包括几个含三部分基序的序列）不断被超编辑。相反，我们鉴定出参与抗病毒反应、miRNA 成熟和表观遗传调控的基因，这些基因仅在特定条件下被过度编辑。尽管技术和生物学瓶颈阻碍了对双壳类“RNA 编辑组”的理解，但现有的工具和技术可以适用于双壳类软体动物。
免疫基因的差异基础表达使牡蛎对太平洋牡蛎死亡综合症具有抗性
Julien de Lorgeril、Bruno Petton、Aude Lucasson、Valérie Perez、Pierre-Louis Stenger 等人。免疫基因的差异性基础表达使 Crassostrea gigas 具有对太平洋牡蛎死亡综合症的抵抗力。 BMC Genomics，2020，21（1），第63页。 “10.1186/s12864-020-6471-x”。 �第 02432454 页�
细胞周期蛋白A/B RXL大环抑制剂以高E2F活性治疗癌症
海洋酸化会显着影响牡蛎等海洋钙化剂，保证研究分子机制（如DNA甲基化），这些机制响应环境变化而导致自适应可塑性。然而，在海洋无脊椎动物中，甲基化模块基因表达和可塑性的程度尚未达成共识。在这项研究中，我们研究了PCO 2对基因表达和DNA甲基化的影响，在牡蛎crassostrea virginica中。暴露于30天的对照（572 ppm）或升高的PCO 2（2,827 ppm）后，由成年雌性性腺组织和雄性精子样本产生了整个基因组Bisulfite测序（WGB）和RNA-SEQ数据。尽管在女性（89）和雄性（2,916）中鉴定出差异化甲基化的基因座（DML），但没有差异表达的基因，并且在女性中只有一个差异表达的转录本。然而，基因体甲基化影响了精子中其他形式的基因活性，例如每个基因表达的最大转录本数以及表达的主要转录本的变化。升高的PCO 2暴露增加了男性基因表达变异性（转录噪声），但女性的噪声降低，表明甲基化在基因表达调节中的性别特异性作用。对转录级表达变化或含有DML的基因的功能注释显示，有几个富集的生物学过程可能参与了升高的PCO 2响应，包括凋亡途径和信号转导，以及生殖功能。综上所述，这些结果表明，DNA甲基化可能调节基因表达变异性，以维持升高的PCO 2条件下的稳态，并且可能在海洋无脊椎动物的环境弹性中发挥关键作用。
“在向加性经济的途中重组经济体系”
摘要：Paciifinfund牡蛎（Crassostrea gigas）在具有较高经济价值的中国海洋牧场中广泛文化。然而，由于疾病和环境障碍（例如，高温），近年来养殖牡蛎的大规模死亡经常发生。为了分析微生物与牡蛎死亡之间的潜在关系，我们使用高通量测序比较了不同生长阶段的牡蛎中细菌和原生物群落的动力学。结果表明，养殖牡蛎中的微生物群落发生了显着变化，与天然牡蛎和周围环境中的微生物有明显不同。随着牡蛎的生长，养殖牡蛎及其周围环境中生物标志物分类群的数量逐渐减少。在耕种牡蛎大量死亡期间，微生物群落的丰富生态功能基因发生了变化，微生物之间的相关性消失了。这些结果丰富了我们对不同生长阶段耕种牡蛎中微生物群落动态的理解，这说明了在养殖牡蛎大量死亡期间，微生物之间相互作用的特征。我们的研究对促进牡蛎的健康水产养殖是有益的。
oxoguanine-DNA糖基酶AGOG用于DNA损伤
本综述使用海洋双壳类crassostrea gigas来突出生活在动态潮间环境中的物种中的氧化还原反应和控制系统。潮间带每天面临和季节性环境变异性，包括温度，氧气，盐度和营养变化。增加人为压力可以将污染物和病原体作为其他应激源带来。令人惊讶的是，C。Gigas对大多数此类挑战表现出令人印象深刻的适应性。我们探讨了ROS的产生，抗氧化剂保护，氧化还原信号传导和代谢调整如何阐明氧化还原生物学在恶劣条件下如何支持牡蛎生存。评论提供了（i）Metazoan共享的氧化还原传感过程的简要摘要； （ii）概述C. gigas潮间带栖息地的独特特征以及该物种作为模型有机体的适用性； （iii）对C. gigas的氧化还原生物学的见解，包括ROS源，信号通路，ROS扫除系统和含硫醇的蛋白质；以及（IV）在双壳类研究中不发达的热门主题的示例，将氧化还原生物学与免疫代谢，生理和发育联系起来。鉴于其对环境变化的可塑性，C。Gigas是研究氧化还原生物学在适应恶劣栖息地的作用的宝贵模型，有可能为海洋和比较生物化学和生理学的基础研究提供新颖的见解。
与养牡蛎（Crassostrea gigas）及其周围环境相关的微生物群落的多样性和转移，中国
摘要：泵送热能存储（PTE）的研究引起了科学界的极大关注。它更好地适合特定应用程序，以及对创新储能技术开发的日益增长的需求，这是引起这种兴趣的主要原因。文献中使用了Carnot Battery的名称（CB）来参考PTES系统。目前的论文旨在开发包括高温两阶段热泵（2SHP），中间热储存（潜热）和有机兰金循环（ORC）的CB的能量分析。从广义的角度来看，考虑到HP的两种热量输入：地面中的冷储液（在全年的恒温为12℃）和80℃（热整合PTES-TI-PTES）中进行热量存储。第一部分定义了HP和ORC的简单模型，其中仅考虑周期的效率。在此基础上，识别存储温度和流体的种类。然后，考虑到更现实的模型，热交换器的恒定大小以及扩展器和压缩机的外部设计操作，计算了预期的功率（往返）效率。该模型是使用工程方程求解器（EES）软件（学术专业V10.998-3D）模拟的，用于几种工作流体和不同的温度水平，用于中级CB热量存储。此外，当HP工作流体（在同一情况下）更改为R1336MZZ（Z）时，往返全负载和零件载荷效率分别降至72.4％和46.2％。结果表明，基于TI-PTES操作模式（甲苯作为HP工作流体）的场景达到了全负载时达到80.2％的最高往返效率，而在零件负载（25％的负载的25％）中，往返额效率为50.6％。这项研究的发现提供了基于混合构成线性编程（MILP）算法的热性经济优化模型，可以在热经济优化模型中进行线性性和使用。
DNA甲基化与转录噪声相关，响应于东部牡蛎（Crassostrea virginica）的PCO2升高
抽象分子模拟扩展了我们学习生物分子相互作用的能力。由具有不同理化特性的不同脂质组成的生物膜是参与细胞功能的高度动态环境。蛋白质，核酸，聚糖和生物兼容的聚合物是细胞质和脂质膜界面中细胞过程的机械。脂质物种直接调节膜特性，并影响其他生物分子的相互作用和功能。天然分子扩散会导致局部脂质分布的变化，从而影响膜特性。将生物物理和结构膜和生物聚合物的特性投射到二维平面可能是有益的，可以在降低的尺寸空间中量化分子特征，以识别感兴趣界面的相关相互作用，即膜表面或生物聚合物表面接口。在这里，我们提出了一个工具箱，旨在将膜和生物聚合物特性投射到二维平面上，以表征脂质 - 脂质与脂质聚合物接口之间的相互作用模式和空间相关模式。该工具箱包含两个使用MDakits体系结构实施的枢纽，一个用于膜，一个用于生物聚合物，可以独立或一起使用。三个案例研究证明了工具箱在GitHub中具有详细教程的多功能性。该工具箱和教程将定期更新其他功能和决议，以扩展我们对生物分子在二维中的结构 - 功能关系的理解。
氧化还原控制抗氧化剂，代谢，免疫力和发育是牡蛎crassostrea gigas对动态潮间带环境的压力适应的核心
摘要：在整个生命周期中，马养殖动物都在水中耕种，其中包含与它们密切关联的各种微生物。动物与周围水之间的微生物交换。然而，关于虾幼虫与水之间的相互作用，尤其是关于跨个体发育的幼虫细菌选择和微生物群模构的相互作用。使用针对16S rRNA分子的V4区域的HISEQ测序来解决这一差距，我们研究了健康的Penaeus stylirostris幼虫和海水的活性实质性多样性和结构。在不同的幼虫阶段之间的比较揭示了特异性菌群和生物标志物的证据，这是所有阶段常见的核心微生物群，以及连续阶段之间的共享分类单元，表明细菌分类群的垂直传播。比较阶段的微生物群和核心菌群与水矿物的比较强调，许多与幼虫相关的分类单元最初都存在于天然海水中，强调了细菌从水到幼虫的水平传播。由于其中一些谱系在特定的幼虫阶段变得活跃，因此我们建议幼虫能够调节其微生物群。这项研究提供了对幼虫阶段尺度上幼虫 - 微生物群相互作用的见解。