数百万微生物构成了人类肠道中发现的复杂微生物生态系统。免疫系统与肠道微生物群的相互作用对于防止炎症和维持肠内稳态至关重要。可以通过肠道微生物群代谢免疫细胞和肠道上皮之间的众多代谢产物。创伤性损伤在初次犯罪后的几分钟内引起了出色而多方面的免疫反应,其中含有同时的促和抗炎性反应。改善患者结局的创新疗法的发展取决于肠道菌群和对创伤的免疫学反应。肠道微生物或肠道营养不良的构成改变也会导致免疫学反应失调,从而导致炎症。主要的人类疾病可能由于慢性营养不良以及细菌的易位和
尽管影响人胰腺的绝大多数癌症是胰腺导管腺癌(PDAC),但还有其他几种源自该器官的非分泌细胞的癌症类型,即,胰腺神经内分泌肿瘤(Pannet)。PDAC和PANNET的基因组分析表明,某些信号传导途径,例如通过转化生长因子B(TGF-B)触发的信号传导途径经常改变,突出了它们在胰腺肿瘤发展中的关键作用。在PDAC中,TGF- B起双重作用,在健康组织和肿瘤发育的早期阶段充当肿瘤抑制剂,但在后期肿瘤进展的启动子。该肽生长因子充当上皮到间质转变(EMT)的有效诱导剂,这是一种发展程序,将其他固定的上皮细胞转化为具有增强转移潜力的侵入性间质细胞。tgf- b通过涉及受体调节的SMAD蛋白,SMAD2和SMAD3的规范SMAD途径以及常见者SMAD,SMAD4以及SMAD独立的途径,即,ERK1/2,PI3K/AKT和Somatotatin(SST)。积累证据表明TGF-B和SST信号之间的串扰不仅在PDAC中,而且最近在Pannet中也是如此。在这项工作中,我们回顾了两种途径之间有关信号相互作用的可用证据,我们认为这具有潜在的潜力,但尚未完全理解对胰腺癌发展和/或进展以及新型治疗方法的重要性。
背景:观察到异常的DNA甲基化是乳腺癌发生的早期事件。但是,这种变化是如何出现的。microRNA(miRNA)在转录后水平调节基因表达,并在各种生物过程中起关键作用。在这里,我们整合了miRNA表达和CpGS的DNA甲基化,以研究miRNA如何影响乳腺癌甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基,以及DNA甲基化如何调节miRNA表达。方法:来自两个乳腺癌队列的miRNA表达和DNA甲基化数据(n = 297)和癌症基因组地图集(n = 439),通过一种相关方法整合,我们将miRNA-甲基化定量定量性状特征基因座(MIMQTL)分析。层次聚类用于鉴定miRNA和CPG的簇,这些聚类通过分析mRNA/蛋白质表达,临床病理学特征,在硅氧化液反应,染色质状态和可及性,转录因子结合和长期相互作用数据中进一步表征。
摘要:小儿高级神经胶质瘤(PHGGS)是神经胶质瘤的致命和异源亚组,为此,创新治疗的发展是紧迫的。高通量分子技术的进步已经揭示了这些疾病的关键表观遗传成分,例如组蛋白3的K27M和G34R/V突变。然而,DNA压实的修改本身并不足以驱动这些肿瘤。在这里,我们回顾了由H3突变引起的表观基因组重新布线的PHGGS子类别的分子特异性,以及随后与转录信号传导途径的肿瘤相互作用,从最终导致Gliomageneses的发展程序中相互采用的转录信号通路。了解在这些肿瘤中每个细胞环境中的转录和表观遗传变化如何协同化可以允许识别新的致命弱点的高跟鞋,从而突出新的杠杆来改善其治疗管理。
摘要 糖尿病肾病是三分之一糖尿病患者的并发症。糖尿病中异常的葡萄糖代谢会导致肾小球组织的结构和功能损伤以及全身炎症免疫反应。复杂的细胞信号传导是代谢和功能紊乱的核心。不幸的是,炎症在糖尿病肾病期间肾小球内皮细胞功能障碍中的作用机制尚未完全了解。系统生物学中的数学模型允许整合实验证据和细胞信号网络来了解疾病进展所涉及的机制。本研究开发了一个基于逻辑的普通微分方程模型,使用葡萄糖和脂多糖刺激的蛋白质信号网络来研究糖尿病肾病进展过程中巨噬细胞和肾小球内皮细胞之间的炎症串扰。这种建模方法减少了研究信号网络所需的生物参数。该模型已根据体外实验中可用的生化数据进行拟合和验证。该模型确定了糖尿病肾病期间巨噬细胞和肾小球内皮细胞中信号失调的机制。此外,还研究了通过选择性敲低和下调信号相互作用对肾小球内皮细胞形态的影响。模拟结果表明,VEGF受体1、PLC-γ、黏附连接蛋白和钙的部分敲低可部分恢复肾小球内皮细胞之间的细胞间隙宽度。这些发现有助于理解影响糖尿病肾病早期肾小球内皮细胞的信号和分子扰动。
自噬是一种分解代谢过程,在整个进化过程中一直被保留,用于降解和回收细胞成分和受损细胞器。自噬在各种应激条件下被激活,例如营养缺乏、病毒感染和基因毒性应激,并与其他应激反应途径协同作用,以减轻氧化损伤并维持细胞稳态。其中一种途径是 Nrf2-Keap1-ARE 信号轴,它作为一种内在的抗氧化防御机制,与癌症化学预防、肿瘤进展和耐药性有关。最近的研究发现了自噬受损(由自噬受体蛋白 p62 介导)与 Nrf2 通路激活之间的联系。具体而言,p62 通过选择性自噬促进 Keap1 降解,导致 Nrf2 易位到细胞核中,在那里它转录激活下游抗氧化酶表达,从而保护细胞免受氧化应激。此外,Nrf2 还调控 p62 的转录,从而建立起 p62、Keap1 和 Nrf2 之间的正反馈回路,增强对细胞的保护作用。本文旨在全面综述 Nrf2 和自噬在癌症进展中的作用、Nrf2 通路与自噬之间的调控相互作用以及 Nrf2-自噬信号轴在癌症治疗中的潜在应用。
摘要:脂肪组织先前被视为脂质储存的休眠器官,直到1990年代初期鉴定脂联素和瘦素为止。这一启示揭示了脂肪组织的动态内分泌功能,这进一步扩展了。脂肪组织近几十年来一直是一种多功能器官,在能量代谢和稳态中起着重要作用。目前,很明显,脂肪组织主要通过分泌多种信号分子(称为脂肪因子)来执行其功能。除了它们在能量消耗和代谢调节中的关键功能外,这些脂肪因子对多种生物学过程产生了重大影响,包括但不限于炎症,温度调节,免疫反应,血管功能,血管功能和胰岛素敏感性。脂肪因子在调节脂肪组织中的众多生物过程方面至关重要,并促进脂肪组织与各种器官(包括大脑,肠道,胰腺,胰腺,内皮细胞,肝脏,肌肉等)之间的通信。失调的脂肪因子与肥胖和糖尿病等几种代谢疾病以及心血管疾病有关。在本文中,我们试图描述脂肪因子在发展代谢和心血管疾病中的重要性,并强调了它们在脂肪组织,其他组织以及其他组织和器官之间的串扰中的作用。
摘要:神经因浮肿,在阿尔茨海默氏病,多发性硬化症和肝性脑病等神经系统疾病中至关重要,涉及复杂的免疫反应。细胞外囊泡(EV)在细胞间和器官间通信中起关键作用,影响疾病的疾病。evs是免疫系统中的关键介质,其中包含能够激活分子途径的分子,这些途径加剧了神经系统疾病中神经素的炎症过程。,来自间充质干细胞的电动汽车在减少神经蛋白的流量和认知降低方面表现出了有望。evs可以越过中枢神经系统屏障,周围免疫信号可以通过EV介导的通信影响大脑功能,从而影响屏障功能和神经蛋白的流量响应。了解大脑和其他器官内的EV相互作用可以公布神经系统疾病的新型治疗靶标。
n 6-甲基腺苷(M 6 A)是真核信使RNA(mRNA)中最普遍的内部RNA修饰,在转录和转录后水平调节基因表达。M 6 A与其他良好研究的表观遗传修饰(包括组蛋白修饰和DNA修饰)之间的复杂相互作用已被广泛报道。RNA M 6之间的串扰修饰和组蛋白/DNA修饰在建立基因表达的精确和特定微调的染色质状态和无疑对生理和病理过程都产生深远影响。在这篇综述中,我们讨论了RNA M 6的修改与组蛋白/DNA修饰之间的串扰,强调了它们的复杂通信和基于的机制,以使M 6 A基于M 6的生物学相关性具有全面的看法。
摘要:Glypicans与肿瘤行为的各个方面有关,并且在不同的癌症中提出了它们的治疗价值。在这里,我们通过功能基因组学和转录组分析在广泛的癌症中系统地评估了GPC4对癌症进展的影响。使用TCGA癌症患者数据的生存分析揭示了GPC4表达在各种癌症类型中的不同作用,发现GPC4表达水平升高,与癌症依赖性的较差和有利的预后相关。通过遗传扰动研究对GPC4在胶质母细胞瘤和非小细胞肺腺癌中的作用的详细研究表现出对这些癌症的影响,其中GPC4与CRISPR/CAS9的敲除gpc4降低了胶质母细胞瘤的增殖,并增强了Lung adenaCarcarcarcarcarcarcarcarcarcarcincarincarcarcarcincarncarcarcarcarcarcinsy and and Crignct andc runge的效果。此外,在GPC4敲除胶质母细胞瘤细胞中GPC4的过度表面恢复了增殖,表明其在这种癌症类型中的有丝分裂作用。此外,对TCGA患者数据的生存分析证实了这些发现,揭示了GPC4水平升高与胶质母细胞瘤预后不良之间的关联,同时表明肺癌患者的结果有利。最后,通过转录组分析,我们试图将作用机理分配给GPC4,因为我们发现它与细胞周期控制和生存核心途径有关。分析表明,肿瘤基因的上调,包括FGF5,TGF-β超家族成员和ITGA-5在胶质母细胞瘤中的上调,它们在肺腺癌患者中被下调。我们的发现阐明了GPC4在癌症中的多效效应,强调了其作为推定的预后生物标志物的潜力,并以依赖癌症的方式表明其治疗意义。