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儿童神经系统肿瘤和横纹肌肉瘤中 ErbB 受体家族的综合分析
图 1 对所研究的七种肿瘤类型的 ErbB 家族成员基因扩增和蛋白质表达进行研究。（A）HER2 /CEP17 比率的分布。使用 DDISH 确定儿童肿瘤样本 (n = 297) 中的 HER2 扩增。如果 HER2 /CEP17 比率 ≥ 2，则 HER2 DDISH 状态定义为阳性。（B）H 分值分布，代表 EGFR、HER2、HER3 和 HER4 的表达。通过 IHC 确定 EGFR、HER2、HER3 和 HER4 的表达。七种肿瘤类型的表达均以 H 分值表示。CEP17，17 号染色体的着丝粒探针；DDISH，双半抗原原位杂交；DIPG，弥漫性内在性脑桥神经胶质瘤；EGFR，表皮生长因子受体；EP，室管膜瘤；HGG，高级别神经胶质瘤； H 评分、Hirsch 评分；HER、人类表皮生长因子；HER2、HER 受体 2；HER3、HER 受体 3；HER4、HER 受体 4；IHC、免疫组织化学；MB/PNET、髓母细胞瘤/原始神经外胚层肿瘤；NB、神经母细胞瘤；RLGA、复发性低级别星形细胞瘤；RMS、横纹肌肉瘤
LYLA NSOULI 儿童大脑基金会......
受托人提交了其年度报告以及莱拉恩苏利儿童脑癌基金会（慈善机构）截至 2021 年 12 月 31 日的审计财务报表。受托人在编制慈善机构的年度报告和财务报表时采用了《慈善机构会计和报告建议做法声明》（SORP）（FRS 102）的规定。财务报表是根据账目附注中列出的会计政策编制的，并符合慈善机构的管理文件《2011 年慈善法》和《慈善机构会计和报告：适用于按照英国和爱尔兰共和国适用的财务报告准则编制账目的慈善机构的建议做法声明》。慈善机构的受托人根据公司法，慈善公司的受托人是其董事。本年度及年末以来任职的受托人列在第 1 页。 结构、治理和管理 章程 该慈善机构是一家担保有限公司，根据备忘录和公司章程于 2011 年 10 月 7 日成立。该慈善机构的主要目标是寻找治疗儿童脑癌尤其是弥漫性内生性脑桥神经胶质瘤 (DIPG) 的方法。所有董事均无该慈善机构的受益权。该慈善机构的董事保证在慈善机构清盘时向其资产捐赠不超过 10 英镑的金额。该慈善机构受担保限制，因此没有董事的利益需要披露。 董事的任命或选举方式 慈善机构的治理由根据公司章程条款选举和增选的董事负责。受托人入职和培训的政策 受托人由董事会任命，以满足领导慈善机构工作所需的经验、知识、技能和能力。如果任命了新的受托人，入职培训首先是与 Nadim 讨论角色和职责，并指导慈善委员会的指导方针。必要时，董事会会议将讨论持续的培训需求。 组织结构和决策 董事会管理慈善机构。科学顾问委员会在必要时审查拨款申请，并根据他们的集体观点决定哪些拨款可获得资助以及如何审查和管理这些拨款。有时，基金会将根据拨款的优点以及与基金会和以前的受助人有长期合作关系来批准拨款。SAC 与董事会合作，只批准其认为在对抗儿童脑癌和弥漫性内生性脑桥胶质瘤 (DIPG) 方面最有可能取得进展的资助。
儿童癌症治疗的异种移植模型
简介在过去的 50 年里，儿童癌症的预后有了很大的改善。儿童的 5 年总生存率 (OS) 从 1975-1977 年的 58% 增加到 2009-2015 年的 84%；成人的 5 年总生存率从 49% 增加到 69%1。大多数（但并非所有）类型的儿童癌症的生存率都有所改善。例如，儿童急性淋巴细胞白血病 (ALL) 的 5 年 OS 从 27% 增加到 91%，视网膜母细胞瘤、软组织肉瘤、肝脏和生殖细胞肿瘤、威尔姆斯肿瘤 (WT) 和神经母细胞瘤 1、2 也有显著改善。这些进步可以归因于整合化疗、放疗和手术的精心设计的临床试验，以及包括支持性治疗在内的改进的治疗标准。不幸的是，对于大多数儿童癌症，复发儿童的预后仍然很差。对于其他肿瘤，包括弥漫性内在性脑桥神经胶质瘤 (DIPG) 和转移性实体瘤，即使是新诊断的患者，生存率仍然很低。此外，生存率的提高伴随着后期影响；大约 67% 的儿童癌症幸存者会患上至少一种慢性健康疾病 3 。
物体检测可改善罕见脑肿瘤 MR 图像中的肿瘤分割
摘要：肿瘤病变分割是从 MR 神经放射图像中研究和描述癌症的关键步骤。目前，许多深度学习分割架构已被证明在它们所训练的特定肿瘤类型上表现良好（例如，大脑半球的胶质母细胞瘤）。然而，在给定肿瘤类型上进行大量训练的高性能网络可能在没有标记病例允许训练或迁移学习的罕见肿瘤类型上表现不佳。然而，由于常见肿瘤和罕见肿瘤在病变内和周围存在一些视觉相似性，因此可以将问题分为两个步骤：物体检测和分割。对于每个步骤，在常见病变上训练过的网络可以按照域自适应方案用于罕见病变，而无需额外的微调。这项工作提出了一种弹性肿瘤病变描绘策略，该策略基于实现检测和分割的已建立的基本网络的组合。我们的策略使我们能够在训练期间对位于未见肿瘤背景区域中的罕见肿瘤实现稳健的分割推断。以弥漫性内生性脑桥胶质瘤 (DIPG) 为例，我们无需进一步训练或网络架构调整即可实现 0.62 的平均骰子分数。
Kazia与Dana进入临床合作...
Jane Lowe Ir部门Jane.lowe@irdepartment.com.au电话：+61 411 117 774关于Kazia Therapeutics Limited Kazia Therapeutics Limited（NASDAQ：KZIA； ASX：KZA； KZA）是一家以肿瘤学为中心的药物开发公司，位于澳大利亚悉尼，澳大利亚。 我们的铅计划是Paxalisib，Paxalisib是PI3K / AKT / MTOR途径的脑渗透抑制剂，该途径正在开发以治疗成年人中最常见和最具侵略性的原发性脑癌形式。 Paxalisib于2016年底从Genentech获得许可，开始招募GBM Agile，这是2021年1月在胶质母细胞瘤的一项关键研究。。Jane Lowe Ir部门Jane.lowe@irdepartment.com.au电话：+61 411 117 774关于Kazia Therapeutics Limited Kazia Therapeutics Limited（NASDAQ：KZIA； ASX：KZA； KZA）是一家以肿瘤学为中心的药物开发公司，位于澳大利亚悉尼，澳大利亚。我们的铅计划是Paxalisib，Paxalisib是PI3K / AKT / MTOR途径的脑渗透抑制剂，该途径正在开发以治疗成年人中最常见和最具侵略性的原发性脑癌形式。Paxalisib于2016年底从Genentech获得许可，开始招募GBM Agile，这是2021年1月在胶质母细胞瘤的一项关键研究。另外八项研究在各种形式的脑癌中都活跃。paxalisib于2018年2月被美国FDA授予孤儿药物名称，并于2020年8月被美国FDA授予胶质母细胞瘤的快速轨道名称。此外，Paxalisib于2020年8月被美国FDA授予罕见的小儿疾病名称和孤儿指定。Kazia也正在开发VEGFR3的小分子抑制剂EVT801，该抑制剂于2021年4月从Evotec SE获得许可。临床前数据表明，EVT801对广泛的肿瘤类型具有活性，并为免疫肿瘤剂提供了令人信服的协同作用。I期研究于2021年11月开始招募。
膜流动性的高通量分析揭示了免疫细胞状态中隐藏的维度
该项目由Hyundai Hope On Wheels Hope Scholar Award（PI：R.D.G，Grant＃716838）资助，并在美国游泳，包括R.D.G和H.E.M.的工资支持。O.P. 获得了NCI刺激获得居住研究（Starr）奖项的支持，该奖项是哥伦比亚癌症研究者研究计划的补充（R38CA231577）。 C-C.W获得了Gary and Yael Fegel Family Foundation（CU21-1080），St.Baldrick's Foundation（SBF CU21-0529），Star and Storm Foundation，Sebastian Strong Foundation和Matheson Foundation（UR010590）。 Flash Iradiator的开发得到了NIAID Grant U19-AI067773的部分支持，以及哥伦比亚大学欧文医学中心和Weill Cornell Medical Center的辐射肿瘤学系，以及Barry Neustein的无限制研究礼物。 ZZ实验室的研究得到NIND的支持（NS 132344）。 这项研究使用了由中心赠款P30CA013696资助的Herbert Irving综合癌症中心（HICCC）的共享资源，特别是分子病理学，流式细胞仪，肿瘤学精确治疗学和成像（Optic），以及基因组学和基因组学和高吞吐量筛选共享资源。 特别感谢流式细胞仪核心的帮助。 内容仅是作者的责任，并不一定代表NIH的官方观点。 致谢我们要感谢Oren J. Becher博士提供的Murine DIPG 4423 Cell系列，以及Jim Sharkey，Ron Drake和James Viera在包括Clinac设置和维护在内的Flash Iradiator上提供了帮助。O.P.获得了NCI刺激获得居住研究（Starr）奖项的支持，该奖项是哥伦比亚癌症研究者研究计划的补充（R38CA231577）。C-C.W获得了Gary and Yael Fegel Family Foundation（CU21-1080），St.Baldrick's Foundation（SBF CU21-0529），Star and Storm Foundation，Sebastian Strong Foundation和Matheson Foundation（UR010590）。Flash Iradiator的开发得到了NIAID Grant U19-AI067773的部分支持，以及哥伦比亚大学欧文医学中心和Weill Cornell Medical Center的辐射肿瘤学系，以及Barry Neustein的无限制研究礼物。ZZ实验室的研究得到NIND的支持（NS 132344）。这项研究使用了由中心赠款P30CA013696资助的Herbert Irving综合癌症中心（HICCC）的共享资源，特别是分子病理学，流式细胞仪，肿瘤学精确治疗学和成像（Optic），以及基因组学和基因组学和高吞吐量筛选共享资源。特别感谢流式细胞仪核心的帮助。内容仅是作者的责任，并不一定代表NIH的官方观点。致谢我们要感谢Oren J. Becher博士提供的Murine DIPG 4423 Cell系列，以及Jim Sharkey，Ron Drake和James Viera在包括Clinac设置和维护在内的Flash Iradiator上提供了帮助。此外，我们要感谢哥伦比亚大学的放射学研究加速器设施（RARAF）设施在闪光照射实验方面的帮助。
H3K4-H3K9组蛋白甲基化模式和肿瘤发育网络作为小儿高级神经胶质瘤中细胞命运决定的驱动因素
3 Oxford Immune Algorithmics, Reading, UK ABSTRACT This study employs systems medicine approaches, including complex networks and machine learning- driven discovery, to identify key biomarkers governing phenotypic plasticity in pediatric high-grade gliomas (pHGGs), namely, IDHWT glioblastoma and H3K27M diffuse intrinsic pontine glioma (DIPG).通过整合单细胞转录组学和组蛋白质量细胞术数据，我们将这些侵略性肿瘤概念化为复杂的自适应生态系统，该系统由被劫持的oncofetal发育程序和病理吸引力动力学驱动。Our analysis predicts lineage-plasticity markers, including KDM5B (JARID1B), ARID5B, GATA2/6, WNT, TGFβ, NOTCH, CAMK2D, ATF3, DOCK7, FOXO1/3, FOXA2, ASCL4, PRDM9, METTL5/8, RAP1B, CD99, RLIM, TERF1, and LAPTM5, as drivers of细胞命运控制论。此外，我们确定了内源性生物电特征，包括Grik3，Grin3，Slc5a9，Nkain4和KCNJ4/6，是潜在的重编程靶标。此外，我们验证了先前发现的可塑性基因，例如PDGFRA，EGFR靶标，OLIG1/2，FXYD5/6，MTSSS1，SEZ6L，MTRN2L1和SOX11，证实了我们复杂系统方法的鲁棒性。此系统肿瘤学框架为精确医学提供了有前途的途径，通过指导由单细胞多摩学告知的组合疗法来优化患者的结果，并以PHGG表型可塑性为治疗性脆弱性。此外，我们的发现表明肿瘤表型可塑性（即过渡疗法）和PHGG生态系统中疾病的表观遗传重编程性能朝向稳定的，转分化的状态。因此，了解关键字：小儿神经胶质瘤；表型可塑性；癌症多组学；数据科学；系统医学；精度肿瘤学。引言小儿高级神经胶质瘤（PHGGS）代表致命疾病，没有任何精确诊断，有效的治疗或预防（Swanton等，2024）。这些侵略性肿瘤破坏了发育过程和组织稳态，导致形态发生，对治疗的抵抗力和免疫逃避（Senft等，2017; Jessa等，2019）。对其病理学的中心是表型可塑性 - 细胞在谱系身份之间适应响应微环境压力的能力。This plasticity arises from epigenetic dysregulation, such as oncohistone mutations like H3K27M (H3F3A) and driver mutations like TP53, ACVR1, etc., which destabilize chromatin structure, trapping cells in metastable, multipotent states and impairing their differentiation hierarchy (Shpargel et al., 2014; Paugh et al., 2011; Jessa et al., 2019）。实际上，这些塑料状态促进了肿瘤的进展和耐药性作为新兴行为，从而创造了不稳定的生态系统。