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机器学习在区分胶质瘤与脑转移瘤中的应用——系统综述
1 耶鲁大学医学院放射学和生物医学成像系，333 Cedar Street，PO Box 208042，纽黑文，CT 06510，美国；leon.jekel@yale.edu（LJ）；waverly.brim@yale.edu（WRB）；marc.vonreppert@yale.edu（MvR）；lawrence.staib@yale.edu（LS）；gabriel.cassinellipetersen@yale.edu（GCP）；sara.merkaj@yale.edu（SM）；harry.subramanian@yale.edu（HS）；tal.zeevi@yale.edu（TZ）；sam.payabvash@yale.edu（SP）；mingde.lin@yale.edu（ML）；jcui527@gmail.com（JC）；amit.mahajan@yale.edu（AM）； michele.h.johnson@yale.edu (MHJ)；ajay.malhotra@yale.edu (AM) 2 DKFZ 德国癌症联盟 WTZ 转化神经肿瘤学部，DKTK 合作站点，埃森大学医院，45147 埃森，德国；b.scheffr@dkfz-heidelberg.de 3 德国癌症研究中心，69120 海德堡，德国 4 约翰霍普金斯大学惠廷工程学院计算机科学系，3400 North Charles Street，巴尔的摩，马里兰州 21218，美国 5 Visage Imaging GmbH，Lepsiusstraße 70，12163 柏林，德国； kbousabarah@visageimaging.com 6 Visage Imaging Inc.，12625 High Bluff Dr，San Diego，CA 92130，美国 7 耶鲁大学医学院 Harvey Cushing/John Hay Whitney 医学图书馆，333 Cedar Street，New Haven，CT 06510，美国；alexandria.brackett@yale.edu 8 耶鲁大学医学院神经内科，15 York St Ste LCI702，New Haven，CT 06510，美国；antonio.omuro@yale.edu 9 耶鲁大学医学院神经外科系，New Haven，CT 06510，美国；veronica.chiang@yale.edu 10 耶鲁大学医学院治疗放射学系，New Haven，CT 06510，美国 * 通信地址：mariam.aboian@yale.edu
安全有效的肝脏定向 AAV 介导的同源性...
Federica Esposito，1 Fabio Dell'aquila，1,2 Manuel Rhiel，3,4 Stefano Auricchio，1 Kay Ole Chmielewski，3,4,5 Geoffroy Andrieux，6,7 Rita ferla，1 paula sureda horrach，1 paula sureda horrach，1 arjun padmanabhan，1 rlar llar llard llard llard llard llard llard llard llard llAld llAld llAde llAld llard ，1 Melanie Boerries，6,7,8 Margherita Dell'anno，1 Edoardo Nusco，1 Agnese Padula，1 Sofia Nutarelli，9 Tatjana I. Cornu，3,4,7 Nicolina Cristina Sorrentino 12， * 1 Telethon遗传与医学研究所（Tigem），意大利波佐利 2 意大利那不勒斯费德里科二世大学高级生物医学科学系医学遗传学 3 德国弗莱堡大学医学中心输血医学和基因治疗研究所 4 德国弗莱堡大学医学中心慢性免疫功能中心 (CCI) 5 德国弗莱堡大学生物学院博士课程 6 德国弗莱堡大学医学中心医学生物信息学和系统医学研究所 7 德国弗莱堡大学医学院 8 德国癌症联盟 (DKTK)，弗莱堡合作伙伴站点，DKFZ 与德国弗莱堡大学医学中心合作成立 9 意大利罗马圣心天主教大学生命科学与公共卫生系 10 意大利那不勒斯费德里科二世大学临床医学与外科系 11 基因治疗联合实验室意大利那不勒斯费德里科二世大学高级生物医学科学系和转化医学系 12 主要联系人 *通信地址：auricchio@tigem.it https://doi.org/10.1016/j.xcrm.2024.101619
项目摘要
项目建议结直肠癌（CRC）是世界上最普遍的癌症实体之一，在该疾病后期出现的患者的预后却令人沮丧。这主要是由于癌细胞在整个人体中的全身分布，转移细胞对护理标准疗法具有抗性。但是，如果我们了解如何转化为高级阶段，我们将克服全身治疗的需求。为驱动恶性转化的破译细胞和分子事件，我们启动了e Arly c Ororectal Cancer和T Herapy Protect Project项目的侵害和t的反应。该项目的总体目标是解码患者结肠中从良性病变到恶性病变的时空过渡，重点是早期发作结直肠癌（EOCRC）。与UKHD胃肠病学系合作，您的角色将是在保护项目的伞下在各个时间点采样的临床标本的深入表征。您将利用各种多组分分析（大量，单细胞或空间转录组学）来解密恶性转化的机制，以及哪些释放因子因素有助于进展。此外，您将生成各种患者的体内培养物，以识别和研究机制。总体而言，这个具有最高临床相关性的多学科项目旨在破译机制，以增强未来的试验设计，以提高早期癌症检测或预防恶性转化。我们正在寻找一个积极进取的候选人，他们的目标是在一流的互动中工作（项目中涉及许多合作）和国际研究团队。在DKFZ/HI-STEM/UKHD上，我们通过出色的技术和智力支持进行最先进的研究。
癌症治疗评论
a 瑞士苏黎世苏黎世大学医院神经内科 b 法国维尔瑞夫巴黎萨克雷大学古斯塔夫鲁西癌症医学系 c 德国哥廷根大学医院 (UMG) 放射肿瘤学系 d 德国哥廷根大学医院 (UMG) 下萨克森州综合癌症中心 (CCC-N) e 德国波恩大学医院神经放射学诊所计算放射学和临床 AI 分部 f 德国海德堡德国癌症研究中心 (DKFZ) 医学图像计算分部 g 韩国首尔成均馆大学医学院三星医疗中心血液肿瘤学分部 h 意大利罗马罗马大学放射科学、肿瘤学和解剖病理学系 i 意大利波齐利 IRCCS Neuromed j 大学神经外科和神经内科瑞士苏黎世苏黎世医院和大学 k 德国汉堡汉堡-埃彭多夫大学医院神经外科系和肿瘤生物学研究所 l 美国马萨诸塞州波士顿哈佛医学院麻省总医院癌症中心 m 新加坡国立大学医院血液肿瘤科 n 美国北卡罗来纳州达勒姆杜克大学放射肿瘤科和神经外科系 o 美国康涅狄格州纽黑文耶鲁癌症中心耶鲁医学院医学系（肿瘤内科） p 瑞士罗特克鲁兹安进（欧洲）有限公司 q 澳大利亚墨尔本墨尔本大学 Peter MacCallum 癌症中心放射肿瘤科 r 澳大利亚墨尔本墨尔本大学 Sir Peter MacCallum 临床肿瘤科 s 荷兰马斯特里赫特马斯特里赫特大学医学中心呼吸医学系、GROW 肿瘤和生殖学院
具有高时间分辨率的年轻女性生殖器人乳头瘤病毒感染的病毒和免疫动态
1 CIRB、CNRS、INSERM、法国学院、PSL 大学，法国巴黎，2 MIVEGEC、CNRS、IRD、法国蒙彼利埃大学，3 瑞士热带与公共卫生研究所，瑞士巴塞尔，4 CNRS UMR 5203，功能基因组学研究所，法国蒙彼利埃，5 PCCEI，大学。蒙彼利埃，INSERM，EFS，法国蒙彼利埃，6 妇产科系，蒙彼利埃大学中心医院，法国蒙彼利埃，7 细胞和分子免疫学实验室，GIGA 研究所，列日大学，列日，比利时，8 IAME，INSERM，巴黎大学，法国巴黎，9 医学微生物学系，曼尼托巴大学，温尼伯，加拿大，10 弗朗什孔泰大学，CNRS，Chrono-environnement，法国贝桑松，11 法国国家乳头瘤病毒研究中心，贝桑松 CHRU，法国，12 UMR996，炎症、趋化因子和免疫病理学，INSERM，巴黎萨克雷大学，法国奥赛，13 CHU de Nîmes，法国尼姆、14 法国索邦大学、15 英国牛津大学纳菲尔德医学系李嘉诚健康信息与发现中心大数据研究所、16 法国蒙彼利埃大学 INM RMB-PPC、法国蒙彼利埃大学 CHU 蒙彼利埃国家健康与医学研究院、17 法国蒙彼利埃大学中心医院医学信息系 (DIM)、18 法国蒙彼利埃大学中心医院传染病和热带病系、19 法国蒙彼利埃大学中心医院免费信息筛查与诊断中心 (CeGIDD)、20 德国海德堡感染与癌症流行病学德国癌症研究中心 (DKFZ)、21 加拿大公共卫生署 (PHAC) 国家微生物实验室 (NML)、加拿大
感染和免疫中的性别和性别
UCLA脑肿瘤成像实验室，计算机视觉和成像生物标志物中心，美国加利福尼亚州洛杉矶（B.M.E.）;美国加利福尼亚州洛杉矶的UCLA神经肿瘤学计划（B.M.E.，T.F.C。）;美国加利福尼亚州洛杉矶放射科学系（B.M.E.）;美国加利福尼亚州洛杉矶的精神病学和生物行为科学系（B.M.E.）;加利福尼亚大学洛杉矶分校戴维·格芬医学院神经外科系，美国加利福尼亚州洛杉矶（B.M.E.）;美国马萨诸塞州波士顿的哈佛医学院Dana-Farber/Brigham和妇女癌症中心神经肿瘤学中心（P.Y.W.，G.Y。）;加利福尼亚大学旧金山分校，美国加利福尼亚州旧金山的神经肿瘤学系（S.M.C.，J.F.D.G.）;美国佛罗里达州坦帕市莫菲特癌症中心神经机学系（M.A.V.）;荷兰鹿特丹大学医学中心Erasmus MC癌症研究所的脑肿瘤中心（M.V.D.B.）;海德堡大学和临床合作单元神经诊所，德国癌症联盟（DKTK），德国癌症研究中心（DKFZ），德国海德堡（W.W.）；哥伦比亚大学Vagelos医师与外科医生学院神经学系神经肿瘤科，赫伯特·欧文（Herbert Irving）;美国马里兰州贝塞斯达国家癌症研究所的Neuro-Concologoly分公司（M.R.G.）;瑞士苏黎世大学医院和苏黎世大学神经病学系（M.W.）;美国明尼苏达州罗切斯特市梅奥诊所肿瘤学系医学肿瘤学系（例如）;加利福尼亚大学洛杉矶分校戴维·格芬医学院神经病学系，美国加利福尼亚州洛杉矶（T.F.C.）;加利福尼亚大学洛杉矶分校戴维·格芬医学院生物统计学系，美国加利福尼亚州洛杉矶（G.L.，S.L.，J.K。）
项目摘要
项目建议表观遗传异质性是一种新型治疗抗性急性髓样白血病（AML）的新型驱动力，是一种侵略性的血液癌，总体生存率较低，复发率很高。表观遗传失调在疾病进展中起着重要作用，因为表观遗传调节剂经常因缺失而丢失并进入单倍性调节剂。此外，现已将表观遗传药物用作标准治疗[1]。最近的一项研究表明，诊断时白血病细胞池的表观遗传异质性可归因于大约40％的复发。虽然可以使用大量方法来量化表观基因组异质性，但了解特定表观遗传构型和复发之间的关系需要单细胞方法。了解表观基因组异质性以及诸如MNX1等癌基因的激活如何导致加速肿瘤发生或耐药性对于改善AML治疗至关重要。我们推测，表观遗传调节剂的单倍不足会导致表观基因组异质性的水平升高，从而导致肿瘤发生和耐药性加速。在此项目中，临床医生将在诊断和复发中介绍来自AML患者的样本，以了解导致复发的特定表观遗传构型。我们将使用各种表观遗传构型的读数，包括单细胞ATAC-SEQ，用于分析染色质的可及性和SCTAM-SEQ，用于分析DNA甲基化[4]。该项目将需要对现有的批量数据进行分析，以查明该部门已经生成的较大人群中的变量区域，然后可以在单细胞级别上以更多详细信息进行介绍。除了在DKFZ的单细胞开放式实验室中执行单细胞测定外，该项目还将有一个大的计算部分，分析生成的数据也与批量数据有关。最终，我们将探索表观遗传调节，这是AML以外的癌症抗药性的主要标志（例如肺癌，前列腺癌），为精密医学铺平了道路。
MET 外显子 14 跳跃型肺癌的一线免疫治疗及 TP53 突变的相关性
a 海德堡大学医院胸腔肿瘤科、国家肿瘤疾病中心 (NCT)、海德堡国家肿瘤中心 (NCT Heidelberg)，由 DKFZ 和德国海德堡大学医院合作成立 b 海德堡转化肺研究中心 (TLRC)，德国肺研究中心 (DZL) 成员，德国海德堡 c 洛文斯坦肺科诊所、德国洛文斯坦胸部肿瘤科 d 德国柏林福音肺科诊所呼吸医学科 e 德国柏林埃米尔冯贝林赫利奥斯医院肺病学科 f 德国慕尼黑大学医院第五医学科 g 柏林夏洛特医学大学传染病和呼吸医学科，柏林自由大学和洪堡大学的企业成员h 德国海德堡大学医院病理研究所，海德堡，德国 i 德国斯图加特罗伯特博世肿瘤诊断中心 (RBCT) j 德国奥格斯堡大学医学中心血液学/肿瘤学系，作为 BZKF（巴伐利亚癌症研究中心）的一部分，以及德国弗莱堡大学医学中心医学 I 系，弗莱堡大学医学院 k 德国奥格斯堡大学医学院病理学系，奥格斯堡，德国，巴伐利亚癌症研究中心 (BZKF) 的一部分 l 德国埃斯林根医院心脏、血管和肺病学诊所 m 德国格罗 ß 汉斯多夫肺根诊所肺病学系，格罗 ß 汉斯多夫，德国（DZL），德国大汉斯多夫 o 慕尼黑综合肺病学中心（CPC-M），德国肺脏研究中心（DZL）成员，德国慕尼黑
经受住新冠肺炎疫情的考验
5 比利时布鲁塞尔天主教鲁汶大学鲁汶药物研究所代谢与营养研究组，6 以色列雷霍沃特魏斯曼科学研究所系统免疫学系，7 德国海德堡癌症研究中心 (DKFZ) 微生物组和癌症科，8 法国巴黎法兰西学院，9 法国巴黎内克尔儿童疾病大学医院儿科免疫血液学和风湿病科，10 法国巴黎巴黎西岱大学想象研究所，11 法国巴黎巴黎西岱大学 Inserm UMR 1163，12 法国巴黎高等科学研究院，13 约翰霍普金斯大学动物试验替代中心 (CAAT)、彭博公共卫生学院和巴尔的摩惠廷工程学院， MD，美国，14 康斯坦茨大学欧洲动物试验替代中心 (CAAT)，康斯坦茨，德国，15 欧洲健康数据创新研究所，根特，比利时，16 内科系和拉德堡德传染病中心，拉德堡德大学奈梅亨医学中心，奈梅亨，荷兰，17 波恩大学生命与医学科学研究所 (LIMES) 免疫学和代谢系，波恩，德国，18 病毒学和化学疗法实验室，微生物学和免疫学系，雷加医学研究所，天主教大学 (KU) 鲁汶，比利时，19 VirusBank 平台，鲁汶，比利时，20 全球病毒网络 (GVN)，巴尔的摩，马里兰州，美国，21 单克隆抗体发现 (MAD) 实验室，托斯卡纳生命科学基金会，锡耶纳，意大利， 22 意大利锡耶纳大学生物技术、化学和药学系，23 意大利锡耶纳生物技术基金会，
更正为：DNA 甲基化特征可预测脉络丛肿瘤的侵袭性
作者详细信息 1 加拿大安大略省多伦多市 PGCRL 儿童医院遗传学和基因组生物学项目，686 Bay Street，邮编 M5G 0A4。2 加拿大安大略省多伦多市 PGCRL 儿童医院计算医学中心，686 Bay Street，邮编 M5G 0A4。3 癌症研究之友，1800 M Street, NW, Suite 1050 South，邮编 20036，美国。4 多伦多大学计算机科学系，40 St. George Street，邮编 M5S 2E4，加拿大。5 加拿大安大略省多伦多市儿童医院临床和代谢遗传学科，邮编 M5G 1X8，大学大道 555 号。6 加拿大安大略省多伦多市儿童医院儿科实验室医学科，邮编 M5G 1X8，大学大道 555 号。 7 加拿大安大略省多伦多市大学大道 555 号儿童医院血液学/肿瘤学部，邮编 M5G 1X8。8 加拿大安大略省多伦多市大学大道 555 号儿童医院儿科，邮编 M5G 1X8。9 加拿大安大略省多伦多市大学玛格丽特公主癌症研究大楼 MaRS 中心医学生物物理学系，邮编 M5G 1 L7 大学街 101 号。10 英国剑桥癌症中心罗宾逊路剑桥 CB2 0RE 肿瘤学部。11 美国俄亥俄州哥伦布市全国儿童医院和俄亥俄州立大学神经肿瘤学项目，邮编 43205，儿童大道 700 号。 12 加拿大蒙特利尔麦吉尔大学健康中心儿童医院血液学/肿瘤学部（RI-MUHC），1001, Decarie Blvd, Montreal, Québec H4A 3 J1。13 德国明斯特大学医院神经病理学研究所，48149 Münster。14 海德堡国家癌症中心 Hopp 儿童癌症中心（KiTZ），Im Neuenheimer Feld 280, 69120 Heidelberg，德国。15 德国癌症研究中心（DKFZ）和德国癌症研究中心儿科神经肿瘤学部