摘要................................................................................................................................. 8
背景:DNA甲基化模式的变化与肿瘤的发生发展密切相关,其中DNA甲基转移酶3α(DNMT3a)起着重要作用。但DNMT3a在肺腺癌(LUAD)中的作用和机制尚不清楚。本研究旨在探讨DNMT3a对LUAD细胞增殖和转移的潜在影响并探索其潜在的分子机制。方法:采用免疫组化和Kaplan-Meier生存分析方法探讨DNMT3a和组蛋白去乙酰化酶7(HDAC7)的表达与患者生存、预后及临床病理特征的关系。在体内和体外研究DNMT3a对LUAD细胞增殖和转移的影响。本研究采用重组慢病毒介导的体外基因过表达或敲减、蛋白质印迹法、定量实时聚合酶链式反应(qRT-PCR)等方法,阐明DNMT3a促进LUAD细胞增殖和转移的潜在分子机制。结果:DNMT3a或HDAC7高表达与LUAD患者预后不良、AJCC第8版分期高、肿瘤分化差呈正相关,DNMT3a/HDAC7共同低表达的LUAD患者预后最差。DNMT3a上调可以通过上调HDAC7,进一步激活下游介质ZEB1和c-Myc的表达,促进LUAD细胞增殖和转移。相反,HDAC7 的过表达逆转了由 DNMT3a 下调介导的肿瘤生长和转移的减弱以及 c-Myc 和 ZEB1 表达的抑制,进一步表明 LUAD 中 DNMT3a 和 HDAC7 之间存在正反馈调节。结论:我们的研究结果首次证实,DNMT3a 通过上调 HDAC7 并进一步诱导 ZEB1 和 c-Myc 上调,充当诱导 LUAD 恶性进展的肿瘤启动子。靶向 DNMT3a 和 HDAC7 可能是 LUAD 的一种有前途的治疗策略。
在复制过程中以细胞谱系依赖性方式(图1a)。在哺乳动物中,在配子发生中发生了第二次甲基化重编程。在生殖细胞发育的早期阶段,全局DNA甲基化模式被去除,并在雄性的促细胞和女性中生长的卵母细胞的细胞增多症之前重新建立(Bird 2002)。以性别依赖性的方式调节了一百多个基因在常染色体上的表达,这些基因被称为烙印基因。这些基因的特征是差异甲基化区域(DMR),在雄性和女性基因组中经历了不同的DNA甲基化。通常,在与全球DNA甲基化相同的阶段,在生殖细胞中建立了DMR甲基化模式(Kaneda等人。2004)。 在哺乳动物中,已经鉴定出了三个DNA甲基转移酶,DNMT1,DNMT3A和DNMT3B(Bestor等,1988; Okano等人。 1998)。 dnmt3a和dnmt3b负责在植入阶段胚胎和生殖细胞分化过程中通过其从头型DNA甲基化活性产生的DNA甲基化模式(Okano等人1999)。 据报道, dnmt3样(DNMT3L)是DNMT3家族的成员,但不具有DNA甲基化活性,据报道对于生殖细胞中的全球甲基化是必不可少的(Bourc'his等人。 2001; Hata等。 2002)。 建立了DNA甲基化模式后,维持型DNA甲基转移酶DNMT1忠实地将它们传播到DNA复制后的下一代。2004)。在哺乳动物中,已经鉴定出了三个DNA甲基转移酶,DNMT1,DNMT3A和DNMT3B(Bestor等,1988; Okano等人。1998)。 dnmt3a和dnmt3b负责在植入阶段胚胎和生殖细胞分化过程中通过其从头型DNA甲基化活性产生的DNA甲基化模式(Okano等人1999)。 据报道, dnmt3样(DNMT3L)是DNMT3家族的成员,但不具有DNA甲基化活性,据报道对于生殖细胞中的全球甲基化是必不可少的(Bourc'his等人。 2001; Hata等。 2002)。 建立了DNA甲基化模式后,维持型DNA甲基转移酶DNMT1忠实地将它们传播到DNA复制后的下一代。1998)。dnmt3a和dnmt3b负责在植入阶段胚胎和生殖细胞分化过程中通过其从头型DNA甲基化活性产生的DNA甲基化模式(Okano等人1999)。dnmt3样(DNMT3L)是DNMT3家族的成员,但不具有DNA甲基化活性,据报道对于生殖细胞中的全球甲基化是必不可少的(Bourc'his等人。2001; Hata等。 2002)。 建立了DNA甲基化模式后,维持型DNA甲基转移酶DNMT1忠实地将它们传播到DNA复制后的下一代。2001; Hata等。2002)。 建立了DNA甲基化模式后,维持型DNA甲基转移酶DNMT1忠实地将它们传播到DNA复制后的下一代。2002)。建立了DNA甲基化模式后,维持型DNA甲基转移酶DNMT1忠实地将它们传播到DNA复制后的下一代。dnmt1优先甲基化半甲基化的CpG位点,这些位点出现在DNA复制和修复后。
Director of TIME (Translational Institute of Medicine) & QCPU (Queen's Cardiopulmonary Unit) Department of Medicine, Queen's University Elizabeth Smith, Distinguished University Professor C. Franklin and Helene K. Bracken Chair Biosciences Complex Room 1520 116 Barrie Street Kingston, Ontario, Canada, K7L 3N6 Preferred E-mail : stephen.archer@queensu.ca Telephone: 613-533-2817传真:613-533-2061
目标。本研究的目的是比较多发性骨髓瘤(MM)不同阶段的患者中选定的DNA甲基转移酶和全球DNA甲基化状态的表达谱。进行分析,使用了不同的细胞群,包括未分离的骨髓瘤细胞和一组用相关抗体纯化的浆细胞。因此,将实验室数据与患者的临床数据进行了比较。患者和方法。进行分析,使用了44例44例患者(30例新诊断,9例复发和5例缓解患者)的未排序骨髓细胞群,并使用了8例患者的样本样本。我们使用了从3个健康个体的BM中分离出的COM可用RNA作为对照样品。通过定量RT-PCR进行了三种DNA甲基转移酶 - DNMT1,DNMT3A和DNMT3B的表达分析,并通过比色测定法检测到患者全局DNA甲基化谱。结果。未改变的DNMT1表达。归一化的DNMT3A基因表达在全球范围内更高。低(0.08–1.81%)的全球DNA甲基化状态在多发性骨髓瘤患者的无分类样品中与受监测的DNA甲基转移酶的SION谱或基于Durie-Salmon和International分期系统的MM阶段相关。结论。这是多发性骨髓瘤患者的不同阶段中DNA甲基转移酶表达谱和全局DNA甲基化状态之间的首次比较研究。注册了多发性骨髓瘤患者的未分布细胞群之间的全球甲基化水平与临床阶段之间没有显着相关性。DNMT3A基因的过表达发生在多发性骨髓瘤的患者的分类细胞和未分布的细胞群中。这一事实强调了DNMT3A是多发性骨髓瘤肿瘤前体的潜在标记。此外,我们在分类细胞群体和未分类的细胞群体中表达了DNA甲基转移酶表达的可比结果。这是从有条理的角度来看的一个有希望的结果,因为与未分类的多个骨髓瘤细胞样品相比,分类细胞的样品会减少所执行的可能分析的数量。
在哺乳动物卵母细胞中建立适当的DNA甲基化景观对于母体的印记和胚胎发育很重要。de de dNA甲基化,该DNA甲基转移酶DNMT3A具有ATRX-DNMT3-DNMT3L(ADD)结构域,该域与组蛋白H3尾巴相互作用,在赖氨酸-4处未甲基化的组蛋白H3尾部(H3K4ME0)。该结构域通常通过分子内相互作用阻止甲基转移酶结构域,并与组蛋白H3K4me0结合释放自身抑制。然而,H3K4ME0在染色质中广泛存在,并且添加 - 固定相互作用的作用尚未在体内研究。我们在此表明,小鼠DNMT3A的添加域中的氨基酸取代会导致矮人。卵母细胞显示CG甲基化的镶嵌性丧失和几乎完全的非CG甲基化丧失。源自此类卵母细胞的胚胎在中胎妊娠中死亡,并在印记控制区域内具有随机,通常是全或无人类型的CG-甲基化损失,并且链接基因的misexpression。随机损失是一个两步的过程,在裂解阶段胚胎中发生损失,并在植入后重新恢复。这些结果突出了添加域在有效且可能是过程中,从头甲基化和构成一种模型,是生殖细胞中表观遗传扰动对下一代的随机遗传的模型。
2型糖尿病(T2D)是一种具有实质性遗传风险的多因素疾病,对此尚不完全了解潜在的生物学机制。我们通过分析37个发表的T2D基因组 - 广泛关联研究(GWAS)的遗传数据(GWAS),鉴定了多种概念T2D遗传簇,代表> 140万个个体。我们通过650个T2D相关的遗传变异和110 T2D相关的性状实施了软聚类,捕获了已知和新颖的T2D群集,具有不同的心脏代谢性状关联,跨两个独立的生物库,代表多样化的遗传种群,非洲人,非洲人,N = 21,906; n = 21,906; Admixed Assixed Assix; n = East; n = East; n = East; n = East; n = East; n = 142; n = 90,093;十二个遗传簇富含特定的单细胞调节区域。来自祖先组之间的分布分布的几个多基因评分,包括东亚血统中与脂肪营养不良相关的多基因风险的比例明显更高。T2D风险在欧洲亚群中的BMI为30 kg/m 2的BMI,东亚亚洲亚洲人口中的24.2(22.9–25.5)kg/m 2;调整了集群特异性遗传风险后,东亚组的等效BMI阈值增加到28.5(27.1–30.0)kg/m 2。因此,这些多种能式T2D遗传簇涵盖了更广泛的生物学机制,并提供了初步见解,以解释T2D风险概况中与祖先相关的差异。
图 2 A:蛋白质 5YX2(A) 的氨基酸序列的二级结构(由 PDBsum 生成);B:DNMT3A(链 A)蛋白质的 3D 结构;C:蛋白质的 Ramachandran 图。红色表示低能量区域,黄色 - 允许区域,淡黄色 - 允许范围大的区域,白色 - 不允许区域。
forn yuen stessman ruzo 41%50%37%41%44%adcy3 adcy3 adcy5 adnp adnp adnp adnp adnp adnp agap2 agap2 agap2 akap9 ank2 ank2 ank2 ank2 ank2 ank2 ank2 ank2 ank2 ank2 ank2 ank2 ankrd11 ankrd11 ankrd11 ankrd11 ankrd11 ankrd11 ap2s1 ariD1b ARID1B ARID1B ARID1B ARID1B Ash1l Ash1l Ash1l Ash1l Asxl3 ASXL3 ASXL3 Babrb3 Bcl11a Bcl11a Bcl11a BRIN2B BTRC CACNA1E C16ORF13 CELF4 CACNA2D3 CACNA2D3 CACNA2D3 CASK CAPN12 CDC42BPB CCSER1 CHD2 CHD2 CHD2 CHD2 CHD2 CHD8 CHD8 CHD8 CHD8 CHD8 CHD8 CHD8 CIC CIC CIC CMPK2 CLASP1 CLASP1 COL4A3BP CNABP CNABP CTNNNB1 CTNNB1 CTNNB1 CTNNB1 CTNB1 CTNBP2 CUL3 CUL3 CUL3 DEAF1 DDX3X DIP2C DDX3X DDX3X DDX3X DNMT3A DNMT3A DNMT3A DNMT3A DIP2A DNMT3A DPYSL2 DPYSL2 DLGP4 DLGAP4 DLGAP1 DSCAM DSCAM DSCAM DSCAM DSCAM DSCAM DSCAM DSCAM DSCAM DSCAM DOCK8 DSCAM DYSCAM DYSC1H1 DSCAM DSCAM DSCAM DRKAM DYRK1A DYRK1A DYRK1A dyrk1a dyrk1a dyrk1a EIF3G FMR1 FAM47A ERBIN ETFB FAM98C FOXP1 FOXP1 FOXP1 FOXP1 FOXP1 FOXP1 FOXP1 FOXP2 GABRB3 GFAP GFAP GIGYF1 GIGYF1 GIGYF1 GIGYF1 GIGYF2 GIGYF1 GNAI1 GNAI1 GNAI1 GRIN2B Grin2B Gria1 Irf2BPL KDM6A HIVEP3 GRIN2B KCNQ3 ILF2 ILF2 KDM5B ITPR1 INTS6 KDM6B Kdm6B Kdm6B Kiaa0232 Kiaa2022 Katnal2 Katnal2 KMT2A KMT2A KDM5B KMT2C KMT2C KMT2C KMT2C KMT2E KMT2E KMT2E KMT5B KMT5B KMT5B KMT5B KMT5B KMT5B LDB1 LAMC3 MFRP MAP1A MECP2 MECP2 MECP2 MECP2 MECP2 MLANA MBD5 MED13L MED13L MED13 MED13 MED13L div>
