淋巴结周围T细胞淋巴瘤,没有其他指定(PTCL,NOS)具有细胞毒性表型,总体上很少见,大多数报告来自亚洲。鉴于其难以捉摸的病理生物学,我们对淋巴结中的54例诊断为PTCL,NOS表达细胞毒性分子的西方患者进行了一项临床病理和分子研究。更常见的男性(M/F-2,6/1)受影响60岁的男性。除了淋巴结肿大外,有87%的患者≥1例涉及外道结束。高阶段疾病(III-IV),国际预后指数> 2,B症状,LDH水平和细胞质症(S)。十名患者有B细胞恶性肿瘤的病史,每种骨髓肿瘤,乳腺癌或前列腺癌,另外4例患有潜在的免疫疾病。大多数患者(70%)死亡,主要是疾病,中位总生存期为12.7个月。免疫表型,肿瘤淋巴细胞为T细胞受体(TCR)αβ +(47%),TCR-硅质(44%)或TCRγδ +(10%),通常是CD8 +(45%)或CD4-CD8-(32%)。除了一个以外,所有除了一个活化的细胞毒性方面,并基于CXCR3,TBX21和GATA3表达模式将95%的分类属于PTCL-TBX21亚型。7例(13%)揭示了Eber +肿瘤细胞。靶向的DNA深层(33例)和多重连接依赖性转录 - 转录酶链反应分析(43例)(43例)在表观遗传修饰器中识别出频繁的突变(73%)(73%)(73%)(包括TET2(61%)和DNMT3A(39%),统计局(39%),统计局(39%),并影响了tetcr(36%)(36%)(36%)(36%)(36%)(36%)(36%)(36%)(36%)(36%)和TP53突变(18%)。在6/43例患者中鉴定出涉及VAV1的融合转录本(14%)。患有淋巴结细胞毒性PTCL的患者,NOS具有侵略性行为,并且经常出现在免疫力受损的背景下,尽管与爱泼斯坦 - 巴尔病毒的关联很少见。与细胞因子或TCR信号相关的基因涉及的基因的复发改变表明,表观遗传调节与细胞信号途径的合作在这些淋巴瘤的病原体中起着关键作用。
成熟和新兴的基因编辑器 CRISPR–Cas 系统是一种广泛存在的原核生物防御系统,用于防御入侵的噬菌体和外来遗传物质。在自然界中,它们由 (1) 效应模块(在第 1 类 CRISPR 系统中是蛋白质复合物,在第 2 类 CRISPR 系统中是单个效应子)和 (2) 适应模块(将外来序列整合到 CRISPR 阵列中,crRNA 从中表达)组成。由于这些系统是 RNA 引导的,因此可以通过改变 crRNA 的序列重新定位它们,这为可编程基因组编辑工具提供了一个起点,有关此类工具的开发已在其他地方进行了综述 5 – 13 。第一个被设计用于人类细胞的系统是 2 类 CRISPR–Cas9 系统 14、15,其中化脓性链球菌 CRISPR–Cas9 系统 (SpCas9;也简称为 Cas9) 是目前使用最广泛的系统。Cas9 在与向导 RNA(对于 Cas9 来说称为单向导 RNA (sgRNA))互补的靶位点处产生双链断裂 (DSB);在人类细胞中,这些 DSB 可以通过非同源末端连接 (NHEJ) 修复,这一过程通常会导致基因功能丧失。早期临床数据 16 表明,NHEJ 介导的基因敲除会降低致病蛋白的表达(见相关链接)。靶向的 DSB 也可以通过宿主细胞的内源性同源修复机制进行修复,从而整合由 Cas9 和 gRNA 随附的外源提供的模板 DNA。 Cas9 已被改造以实现其他基因组结果。通过突变 SpCas9 的催化残基(参考文献 17),Cas9 可以转化为可编程的 DNA 结合蛋白,通常称为死 Cas9 (dCas9)。尽管单独使用 dCas9 可以通过阻止 RNA 聚合酶的通过来减少靶基因转录,但 dCas9 与转录抑制因子(例如 Krüppel 相关框结构域 18)或表观基因组修饰因子(例如 DNA 甲基化酶 DNMT3A 19、20)的融合已促成 CRISPR 干扰系统的产生。类似地,dCas9 可通过融合转录激活因子(如 VP64(参考文献 21))或表观基因组修饰因子(如人类乙酰转移酶 p300(参考文献 22)或 TET1 脱甲基酶 19、23)用于靶向转录激活。
急性髓样白血病(AML)是一种克隆疾病,是由造血祖细胞中获得的体细胞突变引起的,导致分化失调和造血细胞的增殖[1,2]。积累的证据表明,许多基因组改变,例如染色体重排。基因扩增,缺失和突变对于AML分类至关重要[1-6]。此外,遗传病变的鉴定在AML患者的预后和治疗中起着越来越多的作用[1-4]。下一代测序(NGS)以及全基因组示例(WGS)最近已纳入临床实践,从而使AML患者的风险分层更好。实际上,NGS方法的常规使用已使超过90%的AML患者中一个或多个体细胞突变的鉴定[1-9]。最常见的突变基因包括NPM1,FLT3,DNMT3A,IDH1,IDH2,TET2,RUNX1,TP53,WT1,NRAS,NRAS和CEBPα。然而,在正常的核型AML中,遗传突变的预后预测性显性更为重要[4,10,11]。这些畸变可能有助于确定克隆优势的AML途径和可以帮助血液学家靶向精确医学疗法的转变[7-9]。在过去的几年中,人们对触发AML发展的分子像差以及新型分子生物学技术的使用增加了越来越多的了解,从而促进了针对驱动器基因突变的研究药物的发展[7-9]。基于这种考虑,可以考虑到识别“可药物”突变为使用新型靶向疗法铺平了道路[12]。本期癌症的特刊侧重于用于管理AML的新型诊断和治疗工具,其主要目的是提高我们在AML [10-17]领域的知识。二十年前,发现伊马替尼用于治疗慢性髓样白血病及其出色的活性,这对AML的有针对性疗法产生了类似的好处。在过去的几年中,已经提出了一些血液学恶性肿瘤在内的精确药物,包括急性白血病,在AML中已经确定了100多种不同的靶标,使其成为实验性临床研究的最佳候选者[18-22]。靶向FMS,例如酪氨酸激酶-3(FLT-3),已成为临床可作用突变的第一个例子,使其成为血液学家以及制药和生物技术公司开发新型药物的吸引力[23]。在过去的几年中,在临床试验中已经开发并测试了大量FLT-3靶向药物[24,25]。使用FLT-3靶向化合物的主要考虑因素与以下观点有关,即FLT3基因的内部串联复制(FLT3- ITD-MUT)表征了AML案例的显着数量(25-30%),并且代表了较差的预测因子,而较差的预测因素与增加的风险相关。在批准试验中,将中端龙添加到daunorubucine-和Celtarabine-基于基于daunorubucine的诱导疗法(所谓的“ 3 + 7”方案),从而显着改善了
