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amp_dpyd_final.pdf
罗克维尔，马里兰州- 2024年7月22日 - 全球全球分子诊断专业社会的分子病理学协会（AMP）今天发表了共识建议，以帮助设计和验证临床DPYD基因分型测定，促进对不同实验室的测试标准化，并改善患者护理。手稿，“ DPYD基因分型建议：美国医学遗传学与基因组学院（ACMG），美国病理学家（CPIC）的临床药物遗传学实施联盟（CPIC）的联合共识建议（ESPT），药物基因组学知识库（PharmGKB®）和药物变异财团（PharmVar），”在《分子诊断杂志》发表之前在线发布。建立了AMP临床实践委员会的药物基因组学（PGX）工作组，以定义推荐用于临床测试的药物遗传学等位基因的关键属性，以及应包含在临床PGX基因分型测定中的最低变体。新的DPYD报告是AMP PGX工作组开发的一系列建议中的最新报告，旨在帮助标准化常用基因分型测定法的临床测试。它基于对CYP3A4 / CYP3A5，TPMT / NUDT15，CYP2D6的早期临床基因分型建议，对于华法林测试，CYP2C9和CYP2C19重要的基因。可选变体的第2层列表符合至少一个但不是全部标准的列表。对于医疗保健提供者而言，重要的是要实施这些建议以及其他相关的临床准则，例如CPIC和DPWG发布的建议，这两者主要着重于解释PGX测试结果并为特定药物对的治疗建议提供治疗建议。“Testing for variants in the DPYD gene can help identify individuals who may be at increased risk for severe fluoropyrimidine-related toxicity,” said Victoria M. Pratt, PhD, Co-Chair of the AMP PGx Working Group, Director of the Scientific Affairs for Pharmacogenetics at Agena Bioscience, and Adjunct Professor of Clinical Pharmacology at Indiana University School of Medicine.“这份新报告旨在改善临床实验室的临床实践，并促进临床实验室的标准化，并确保将适当的变体包括在临床PGX DPYD分析中。”与以前的临床PGX基因分型测定建议一样，AMP PGX工作组使用了建议包含的变体的两层分类。之所以选择，是因为它们对蛋白质和/或基因表达的功能活性具有良好的特征性作用，在人群/祖先组中具有明显的次要等位基因频率，具有可用的参考材料，可用于测定验证，并且对于使用标准分子测试方法进行疑问的临床实验室在技术上是可行的。 这些有关临床基因分型测定的建议不包括对蛋白质功能或基因表达不明的变体。 它们是作为参考指南而不是限制性列表。，是因为它们对蛋白质和/或基因表达的功能活性具有良好的特征性作用，在人群/祖先组中具有明显的次要等位基因频率，具有可用的参考材料，可用于测定验证，并且对于使用标准分子测试方法进行疑问的临床实验室在技术上是可行的。这些有关临床基因分型测定的建议不包括对蛋白质功能或基因表达不明的变体。它们是作为参考指南而不是限制性列表。
稀有和新型DPYD变体的临床实施...
氟吡啶胺（FLS）[5-氟尿嘧啶，卡皮替滨]用于治疗几种实体瘤。二氢吡啶定脱氢酶（DPD）是限制率的FL催化酶，其缺乏可能会导致FL给药后严重，威胁生命或致命的毒性。在二氢吡啶二酰胺脱氢酶基因（dpyd）（dpyd*2a，dpyd*13，c.2846a> t，c.1129-5923c> g）治疗之前，使用二氢嘧啶脱氢酶基因（dpyd*2a，dpyd*2a，dpyd*2a，dpyd*2a，dpyd*2a，dpyd*2a，dpyd*2a，dpyd*2a，dpyd*2a，dpyd*2a）进行测试。 （例如，EMA）。但是，该小组识别出<20％的患有严重FL相关毒性的患者。累积近期证据强调了稀有（次要等位基因频率<1％）和新型DPYD遗传变异的潜在临床价值，以识别额外的DPD缺陷患者的额外部分，具有严重的FL相关毒性风险增加。在这篇综述中，我们旨在全面地描述有关FLEAD患者中新型和稀有DPYD变体作为毒性标记的潜在临床预测作用的可用证据，并讨论基于此类标记的临床应用来调整FL治疗的挑战和机会。尽管我们必须克服临床实施的现有障碍，但与当前的目标方法相比，对DPYD序列的全面评估（包括稀有和新颖的遗传变异）的全面评估（包括稀有和新颖的遗传变异）的可用数据支持可能会显着增强对处于危险的患者的预先识别。
种系顺式变体确定表观遗传学1抗癌药物代谢基因2二氢吡啶脱氢酶（DPYD）3 4 TING Z
种系CIS变体确定表观遗传1抗癌药物代谢基因2二氢吡啶脱氢酶（DPYD）3 4 Ting Zhang 1，Alisa Ambrodji 2,3 2,3，Huanging Huang 1，Huang Huang 1，Kelly J. Bouchonville 1，Amy S. 5 Etheride E. SCHMING sCHMING，1 ETRING 4 Bembenek 1，Zoey B. Temesgen 1，6 Zhiquan Wang 5，Federico Innocenti 4，Deborah Stroka 6，Robert B. Diasio 1，Carlo R. 7Largiadèr2和Steven M.提供1,7,8,9,9，* 8 9 9 1 Molecuarl Pharmarogology and Lassifore therapiential Therapiential Therapicologic and Mayo clins 5.9 1 ROCH clin，Mayo 5 Roch Selter，Mayo 5。11 12 2伯尔尼大学医院Inselspital临床化学系，瑞士CH-3010伯尔尼大学，伯恩大学。14 15 3伯尔尼大学蜂窝和生物医学科学研究生院，瑞士CH-3010 16 Freiestrasse 16。17 18 4美国北卡罗来纳州教堂山，北卡罗来纳大学，北卡罗来纳大学27599年，北卡罗来纳大学药物治疗和实验学院埃塞尔曼药学院。20 21 5血液学系，医学系，梅奥诊所，罗切斯特，明尼苏达州55905 22美国。23 24 6瑞士伯尔尼大学伯尔尼大学医院Inselspital内脏和医学系。26 27 7爱荷华大学卡弗大学医学院病理学系，爱荷华州爱荷华州28号，爱荷华州，美国爱荷华州52242，美国。29 30 8爱荷华大学爱荷华大学医学院，爱荷华大学，爱荷华大学，爱荷华州，霍尔顿综合癌症中心，美国爱荷华州52242，美国。32 33 9铅接触。34 35 *通信：soffer@uiowa.edu; upfor.steven1@mayo.edu 36
DPY30 缺失导致胰腺导管腺癌中的 DNA 重新复制和免疫编辑
本研究由 AIRC 和欧盟“地平线 2020”研究与创新计划资助，资助协议编号为居里夫人 800924，并由 2020 年 AACR-阿斯利康 START 资助，资助编号为 20-40-12-CITR