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基因编辑针对DUX4聚腺苷酸化信号
摘要：Facioscapulohumeral营养不良（FSHD，OMIM：158900，158901）是成年人中最常见的Dys-Tropherphy，到目前为止，还没有治疗。已经表征了疾病的不同基因座，它们都导致Dux4蛋白的异常表达，这会损害肌肉的功能，最终导致细胞死亡。在这里，我们使用基因编辑来试图通过靶向其poly（a）序列永久关闭Dux4表达。我们在FSHD成肌细胞上使用了类似转录激活剂样效应子核酸酶（TALEN）和CRISPR-CAS9核酸酶。测序了150多个Topo克隆，仅观察到4％的indels。重要的是，在其中2个中，Dux4 poly（a）信号在基因组水平上被消除，但由于使用了非典型上游poly（a）信号序列，仍会产生DUX4 mRNA。这些实验表明，在基因组水平上靶向DUX4 PA可能不是FSHD治疗的适当基因编辑策略。
losmapimod，一种p38小分子抑制剂，有选择地抑制dux4程序，而没有负面影响FSHD
•FSHD是由D4Z4基因座失去抑制作用引起的，导致骨骼肌中异常DUX4表达，基因表达编程改变和肌肉纤维死亡。•使用优化的MyoTube培养条件，我们将p38 MAPK确定为DUX4表达的关键调节剂。•我们观察到，用p38α/β抑制剂losmapimod治疗导致FSHD患者衍生的肌管中DUX4表达，活性和细胞死亡的降低，对肌发生的影响很小。•RNA-seq研究表明，用Losmapimod处理后，只有少数基因被差异表达，其中约有90％是DUX4的靶标，对肌原编程的主要驱动因素没有负面影响。•体外发现突出了洛斯马皮莫德对FSHD治疗的潜力，这种疾病今天没有批准的疗法。
引用 Bouwman、LF、Maarel、Van Der、SM 和 Greef、JC de。 （2020 年）。针对 DUX4 治疗面肩肱型肌营养不良症的前景。
双同源框 4 (DUX4) 是一种转录因子，与人类胚胎四细胞阶段的合子基因组激活 (ZGA) 有关，在该阶段，它充当重复元件和分裂特异性基因的激活剂 [1,2]。人们认为 DUX4 在大多数躯体组织中受到表观遗传抑制，包括骨骼肌。面肩肱型肌营养不良症 (FSHD；MIM 158900) 是一种进行性神经肌肉疾病，其特征是面部、肩胛骨和肱骨肌肉不对称无力和萎缩 [3]，D4Z4 大卫星重复序列的表观遗传抑制丧失。这导致 DUX4 基因座的转录活性，该基因座在每个 D4Z4 重复单元内编码 [4,5]。 DUX4 激活未受影响的骨骼肌中通常不表达的基因，包括在 ZGA 期间激活的基因和免疫系统基因 [6,7]。成肌细胞中 DUX4 过表达会诱导不同的毒性级联反应，包括氧化应激增加、无义介导的衰变抑制和肌肉生成抑制。这些变化最终
开发小分子 Losmapimod 来调节基因表达，治疗 FSHD 的根本原因
• 使用专有探针库确定目标 • Fulcrum 产品引擎将 p38α (MAPK) 确定为 DUX4 表达的关键调节器 • 使用基因组学和化学基因组学工具在多个细胞中验证 p38α (MAPK) • 确定可降低 DUX4 表达的化合物 • 使用患者来源的肌管建模疾病 • 第 1 阶段：临床安全性、耐受性、剂量 (PK) • 第 2 阶段：临床概念验证 • 第 3 阶段：临床益处确认
Epi-321-A-Novel-epbepenetic-Gene-gene-for-fshd- ...
我们的临时性研究表明，Epi-321的给药可在十种不同的FSHD患者衍生的患者衍生的永生化和原发性成肌细胞中对Dux4和Dux4-Downstream基因表达的稳健和剂量抑制，无论D4Z4重复序列的数量如何，并且表现出抗iapoptication Asspase 3 Inge caspase 3 ige。从机械上讲，Epi-321显示了D4Z4靶基因座的重新甲基化，从而导致DUX4表达抑制。此外，在人源化FSHD小鼠模型中对Epi-321的体内评估显示，在mRNA和蛋白质水平上对Dux4-Pathway的剂量依赖性抑制作用，以及肌肉组织中的抗凋亡活性。此外，使用FSHD患者衍生的永生化的成肌细胞（Epi-321）进行了3D设计的人体肌肉组织（3D EMT），从而有效地抑制了DUX4和DUX4-PATHWAY基因长达46天，并显示出肌肉缩减性的剂量依赖性，表现出了肌肉缩减的显着改善，表现出受肌肉的增长和Teteratient poptertic posteatial posteat posteat teteat teteat awteat aTteat aTteat aTeat eateat aTeat酸味。
faciosculohumeral肌肉营养不良临床试验的结果度量
摘要：Facioscapulohumeral肌肉营养不良（FSHD）是一种令人衰弱的肌肉营养不良，具有变化，严重性和进展的变化。虽然仍然无法治愈这种疾病，但自从双鸡蛋ox 4（Dux4）基因的表观遗传压缩的潜在机制导致骨骼肌毒性以来，朝着FSHD疗法的进展加速了。这促进了新的疗法的快速发展，以靶向DUX4表达和下游失调，从而导致肌肉变性。这些发现和临床前翻译研究为等待临床试验评估的疗法开辟了新的途径。正如领域预期的FSHD试验一样，对于早期和II期和III期试验，需求已增长，对肌肉功能的更可靠和量化的结果度量的增长。促进纵向临床评估的高级工具将大大提高试验的潜力，以确定成功改善疾病进展或允许肌肉功能恢复的治疗剂。在这里，我们讨论了当前和新兴的FSHD结果指标以及研究人员可能在将此类措施应用于FSHD临床试验设计和实施中所面临的挑战。
8C 样细胞在体外捕获人类合子基因组激活程序
胚胎基因组的激活标志着发育生物体中第一次主要的转录浪潮。小鼠 2 细胞胚胎和人类 8 细胞胚胎中的合子基因组激活 (ZGA) 对发育至关重要。本文，我们报告在幼稚胚胎干细胞中发现了人类 8 细胞样细胞 (8CLC)，其转录类似于人类 8 细胞胚胎。它们表达 ZGA 标记，包括 ZSCAN4 和 LEUTX ，以及转座因子，例如 HERVL 和 MLT2A1 。8CLC 显示降低的 SOX2 水平，可在体外使用 TPRX1 和 H3.Y 标记蛋白进行识别。转录因子 DUX4 的过表达和剪接体抑制会增加人类 ZGA 样转录。令人兴奋的是，8CLC 标记物 TPRX1 和 H3.Y 也在 ZGA 阶段的 8 细胞人类胚胎中表达，因此可能与体内相关。 8CLCs 为表征人类 ZGA 样转录提供了独特的机会，并可能为人类胚胎发生早期事件提供重要见解。
急性淋巴细胞白血病的遗传星座
急性淋巴细胞白血病（ALL）是由多种复发遗传畸变的星座驱动的异质癌。样品骨髓的易感性可以轻松进入癌细胞，并可以深入探索所有驱动全部的遗传学。自然而然地使用了每个新的GE网络工具，所有人的遗传星座通常是第一个探索的边界。这些深度探索导致了所有遗传星座的详细图（图1），这是世界卫生组织造血和淋巴组织肿瘤分类的基础。从1960年代建立核分型和染色体带时，调查人员开始了这项60年的发现旅程。此发现始于异常的整个染色体拷贝数，称为非整倍性。多余的染色体> 50，也称为高二倍体，是最常见的驱动因素（图1）。易位，其中一块染色体被异常融合，导致发现费城（pH）染色体T（9; 22）/ bcr :: abl1 and t（1; 19）/ tcf3 :: pbx1。不会更改诸如t（12; 21）/ etv6 :: runx1之类的频带模式的易位花费更长的时间才能屈服。与此发现并行的是更好的治疗方法。通过更好的治疗方法，研究人员发现这些遗传驱动因素是预后的，即他们预测复发的风险。遗传亚型的这种预后价值产发了遗传风险分层，并最终以遗传驱动的治疗，例如添加伊马替尼和dasatinib对pH值的添加。2使用单然而，核型淋巴细胞的困难以及对许多不同诊断平台的需求，例如多种荧光原位杂交（FISH）探针，有限的广泛使用遗传分层。在2000年代，基因阵列诱人地承诺了一个平台来询问所有人的遗传驱动因素。基因ex Prassion微阵列同时测量了数以万计基因的表达lev els，它允许发现“新颖”亚型1（后来发现是DUX4亚型）和pH样亚型。