Post-ASMS Go Local Tübingen, July 23, 2024, University Hospital Tübingen, The M3 Research Center, Otfried-Müller-Straße 37, 72076 Tübingen 09:00 - 09:15 Registration and Coffee 09:15 - 09:30 Welcome and Introduction Dr. Jörg Sauer, Sales Representatives, Bruker Daltonics, Germany 09:30 - 10:00多模式代谢组学阐明了人类生物流体中的抗病毒核苷,并识别SARS-COV-2中的NAD+途径和SIRT1激活改变了NAD+途径和SIRT1激活,核心设施代谢组学负责 heterogeneity in human breast cancer Dr. Laimdota Zizmare, PostDoc at Core Facility Metabolomics, University Hospital Tübingen 10:30 - 11:00 Redefining Spatial Biology with MALDI Imaging Dr. Andras Kiss, Field Application Support Engineer, Bruker Austria 11:00 - 11:30 Coffee Break 11:30 - 12:00 4D-Proteomics TM Innovation: Meeting Research Challenges Head-on Dr. Torsten蛋白质组学业务开发经理Müller - Dach,Bruker Daltonics 12:00-12:30基于质谱的Timstof基于质谱法的免疫肽组学鉴定精炼肿瘤抗原识别
摘要:非结核分枝杆菌(NTM)识别对于建立分离株的相关性和适当的抗菌治疗至关重要。传统上,NTM识别是通过使用线探针测定(LPA)进行的,这是一种昂贵且耗时的技术,需要训练有素的人员。maldi-tof MS是NTM识别的有前途的工具,其使用正在迅速增长。我们使用LPA结果评估了NTM MALDI-TOF MS鉴定,评估了新引入的MBT MYCOBACTERIA试剂盒(MBT)和Mycoex Prepaparation方案(Bruker Daltonics,Germany,德国),以参考为参考。在7H11琼脂上生长的五十个NTM和MGIT肉汤使用Bruker Micro-flip®LtMaldi-Tof MS(Bruker Daltonics)仪器分析了两种方案。MBT和Mycoex分别提供了97.0%和95.0%的病例识别结果。使用这两个协议,提供的结果的100%与LPA一致,没有注册不匹配。与Mycoex相比,MBT的高度可能识别率(88.0%比83.0%)和更高的可重复性率(86.6%对75.8%)相比,MBT的数量升高。本研究提供了有关液体和固体培养基的MBT性能的结果,从而强调了不同条件下的优势和劣势。我们的结果表明,MALDI-TOF MS可以为及时和节省成本的NTM识别提供巨大的优势,并可能对患者结局产生影响。
作为一项旨在隔离人类肠道的所有细菌物种的培养物研究的一部分[1],我们在纯细菌菌株中分离了一种细菌菌株,矩阵辅助的激光脱骨/电离时间 - 质量光谱质量识别失败了http://www.mediterranee-infection.com/article.php?laref = 256&titre = urms-database)在微杆光谱仪上(Bruker Daltonics,莱比锡,德国)[2]。通过一个63岁的法国男子,患有严重的贫血的男子,与Melaena一起通过右结肠灌洗的样本来征服这种菌株,Melaena通过结肠镜检查进行了探测。患者的临床病史对于在此住院前4年进行了4年的袖子胃切除术而出色。患者提供了书面知情同意; IFR48国家伦理委员会(法国马赛)就这项研究达成了同意。在3天在37°C下在5%绵羊's
摘要:结核分枝杆菌是导致结核病的微生物,这种疾病影响着全世界数百万人。基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 (MALDI-TOF MS) 是一种快速、可靠且经济高效的微生物鉴定方法,已用于鉴定分枝杆菌分离株。然而,分枝杆菌细胞壁富含脂质,这使得获取蛋白质进行 MALDI-TOF MS 分析变得困难。在本研究中,比较了两种细胞制备方案:MALDI-TOF 仪器制造商 Bruker Daltonics 推荐的 MycoEx 和本文描述的 MycoLyser 方案,后者使用 MagNA Lyser 仪器通过乙醇增强细胞破碎。使用两种方案对结核分枝杆菌 H37Rv 菌株进行细胞破碎和蛋白质提取步骤,并比较 MALDI-TOF MS 结果。MycoLyser 方案可以提高结核分枝杆菌的 Biotyper 鉴定率,因为使用此方案获得的 log(score) 值大多≥1.800,并且明显高于经过 MycoEx 处理的 log(score) 值。考虑到布鲁克标准,鉴定可靠性也提高了。鉴于这些结果,可以得出结论,MycoLyser 分枝杆菌细胞破碎和蛋白质提取方案提高了 MALDI-TOF MS 方法鉴定结核分枝杆菌的效率。
2015年,从刚果人那里收集了粪便样本,作为该项目的一部分,旨在通过培养物来描述人类的肠道微生物组[1]。从数字09-022获得伦理委员会的批准是从Fédératifde Recherches IFR48(法国马赛)获得的。用1 ml磷酸盐缓冲盐水稀释后,将样品在血液培养基中接种。然后将5毫升绵羊的血和5毫升过滤的瘤胃加入培养瓶中,并在厌氧条件下在37°C下孵育。在第10天,在5%绵羊的血液中分离出马赛-P3295菌株 - 富集哥伦比亚琼脂(BioMérieux,Marcy L'Etoile,France)。菌落平滑,平均直径为0.4至0.8 mm。菌株Marseille-P3295细胞为革兰氏阳性杆菌,过氧化氢酶和氧化酶阴性,平均长度为1.58μm。我们的系统基质辅助解吸电离无法鉴定菌落 - 在微质量范围(Bruker Daltonics,Bremen,Bremen,Germany,Germany,Germany)上筛选的质量质量指标(MALDI-TOF MS)的时间[2]。因此,如前所述[3],使用3130-XL测序仪(Applied Biosciences,Applied Biosciences,Applied Biosciences,France,France)在3130-XL测序仪上使用FD1-RP2引物(Euro-Gentec,Seraing,Belgium)进行16S rRNA基因测序。
访问微生物学是一个开放的研究平台。可以通过本文的在线版本找到预印刷,同行评审报告和编辑决策。收到2024年1月5日; 2024年6月4日接受;于2024年6月27日出版了作者分支:1个细菌学实验室,马达加斯加antananarivo的Chu Joseph Raseta Befelatanana; 2马达加斯加antananarivo的马达加斯加的巴斯德学院实验细菌学单元; 3小儿服务,楚约瑟夫·拉塞塔·贝菲拉塔纳(Chu Joseph Raseta Befelatanana),马达加斯加的安塔纳里沃(Antananarivo); 4 Madagascar Antananarivo的中心医院的细菌实验室Mère -enfantTsaralàlana; 5巴斯德研究所,感染部门的生物学,巴黎大学,INSERM U1117,巴黎,75015,法国; 6巴斯德研究所,国家参考中心以及法国巴黎的李斯特菌中心合作; 7传染病和热带医学司,Institut Imagine,APHP,Necker-Enfants Malades Malades University Hospital,法国巴黎,法国。*信函:Mamitina Alain Noah Rabenandrasana,Rabalainnoah@gmail。com关键字:致命案例;基因组表征;李斯特氏病;马达加斯加;脑膜炎。缩写:Bdal,Bruker Daltonics图书馆; BigSDB,细菌分离株基因组序列数据库; CGMLST,核心基因组多分解序列分型; CSF,脑脊液; IVD,体外诊断; MALDI-TOF MS,基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱; MLST,多级别序列键入; MSP,主要光谱曲线; PCR,聚合酶链反应。在Bioproject PrjNA1032442下,组件和SRA数据存放在NCBI上。000764.v3©2024作者†这些作者对这项工作也同样贡献了本文的在线版本提供补充表。
