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全球DNA甲基化水平的性别特异性变化...
神经退行性疾病等（Pagiatakis等，2021）。由于医疗和公共卫生资源的显着发展，在过去的几十年中，人类预期寿命迅速增强。然而，增强的预期寿命已导致发病率更高，并且在残疾中生活了多年（Pagiatakis等，2021）。因此，有必要了解衰老过程，以便将与之相关的不良健康结果最小化。研究确定了衰老，基因组不稳定性，端粒短路，蛋白质静脉曲张等的某些标志，表观遗传改变是这些标志之一（López-Otín等人，2013年）。至少在理论上是可逆的，与衰老相关的表观遗传变化正在广泛研究以探索健康衰老的可能性（Jones等，2015）。DNA甲基化是研究最广泛的表观遗传过程（Pal＆Tyler，2016年）。DNA甲基化是指在CPG二核苷酸（近鸟嘌呤近端）的胞嘧啶残基（5 MC）的第三碳上添加甲基（Martin＆Fry，2018年）。通常，DNA甲基化发生在那些具有高胞嘧啶和鸟嘌呤（CG）含量的基因组区域内，即所谓的CPG岛（Martin＆Fry，2018）；但是，CPH（H = A，T或C）位点也可以甲基化（Lister等，2013）。DNA甲基化模式由DNA甲基转移酶（DNMT），主要是DNMT3A，DNMT3B和DNMT1（Unnikrishnan等，2018）建立。（Gopalan等，2017； Martin＆Fry，2018）。在另一项研究中，Wilson等。在另一项研究中，Wilson等。虽然DNMT3A和DNMT3B是可以识别和甲基化的半甲基化和甲基化的甲基化和未甲基化的DNA的甲基甲基转移酶，但DNMT1是一种能够在半甲基化DNA上起作用的维持甲基转移酶（Okano等人，1999; un.nikrishnan and and，2018）。DNA甲基化水平可以受到内在（遗传背景）和外在因素（例如吸烟，饮食，暴露于空气污染，某些化学物质等）的影响。除了这些因素外，还报道了衰老影响DNA甲基化水平（Gopalan等，2017）。衰老和寿命直接与人类和其他几种生物体的DNA甲基化和表观遗传改变有关，总体趋势会增加全球低甲基化和随着年龄的高甲基化的区域（Johnson等，2012）。根据基因组低甲基化假设，全局DNA甲基化随着年龄的增长而降低，从而导致基因组稳定性降低和基因表达异常（Unnikrishnan等，2018）。尽管随着年龄的基因组低甲基化理论仍然很流行，但采用现代定量技术的最新研究对其进行了挑战（Lister等，2013； Unnikrishnan等，2018）。在探索全球DNA甲基化与衰老之间关系的最早尝试之一中，Vanyushin等人。（1973）研究了从1到28个月之间从雄性白化大鼠的不同组织中提取的5 mc含量的变化。在具有里程碑意义的论文中，威尔逊和琼斯（Wilson and Jones，1983）报告说，从小鼠，仓鼠和人类的皮肤细胞中提取的DNA中，人口倍增（复制衰老）的含量降低，人口加倍（复制衰老）的增加。他们报告说，随着年龄的增长，从大脑，心脏和脾脏组织中提取的DNA的5 mC含量降低。然而，从肝脏，肺和肾脏组织提取的DNA的5个MC含量没有变化（Vanyushin等，1973）。（1987）报道了DNA
羔羊 - 助人综合症：20种西班牙患者和文献综述扩大了由Sox5单倍弥补引起的神经发育障碍的看法
1。Lamb AN，Rosenfeld JA，Neill NJ等。 在12p12.1时Sox5的单倍不足与具有明显的行为延迟，行为问题和轻度畸形特征的发育延迟有关。 嗡嗡声突变。 2012; 33：728-740。 2。 Aza-Carmona M，Shears DJ，Yuste-Checa P等。 shox与软骨的转录因子Sox5和Sox6相互作用，以使Aggrecan增强剂作用。 hum mol Genet。 2011; 20：1547-1559。 3。 Harley VR，Clarkson MJ，Argentaro A. 睾丸确定因子的分子作用和调节，SRY（Y染色体上的性别确定区域）和Sox9 [与SRY相关的高弹性组（HMG）Box 9]。 Endocr Rev。 2003; 24：466-487。 4。 Truebestein L，Leonard TA。 盘绕螺旋：长而短。 生物评估。 2016; 38：903-916。 5。 Ikeda T，Zhang J，Chano T等。 识别和表征人类长的SOX5（L-SOX5）基因。 基因。 2002; 298：59-68。 6。 Wu L，Yang Z，Dai G等。 SOX5通过调节膀胱癌的DNMT1/P21途径来促进细胞的生长和迁移。 Acta Biochim Biophys罪。 2022; 54：987-998。 7。 Kwan KY，Lam MM，Krsnik Z等。 SOX5在森林中进行了森林，迁移，迁移后分化以及子板和深层新皮质神经元的投影。 Proc Natl Acad Sci u s a。 2008; 105：16021-16026。 8。 神经元。Lamb AN，Rosenfeld JA，Neill NJ等。在12p12.1时Sox5的单倍不足与具有明显的行为延迟，行为问题和轻度畸形特征的发育延迟有关。嗡嗡声突变。2012; 33：728-740。2。Aza-Carmona M，Shears DJ，Yuste-Checa P等。shox与软骨的转录因子Sox5和Sox6相互作用，以使Aggrecan增强剂作用。hum mol Genet。2011; 20：1547-1559。3。Harley VR，Clarkson MJ，Argentaro A. 睾丸确定因子的分子作用和调节，SRY（Y染色体上的性别确定区域）和Sox9 [与SRY相关的高弹性组（HMG）Box 9]。 Endocr Rev。 2003; 24：466-487。 4。 Truebestein L，Leonard TA。 盘绕螺旋：长而短。 生物评估。 2016; 38：903-916。 5。 Ikeda T，Zhang J，Chano T等。 识别和表征人类长的SOX5（L-SOX5）基因。 基因。 2002; 298：59-68。 6。 Wu L，Yang Z，Dai G等。 SOX5通过调节膀胱癌的DNMT1/P21途径来促进细胞的生长和迁移。 Acta Biochim Biophys罪。 2022; 54：987-998。 7。 Kwan KY，Lam MM，Krsnik Z等。 SOX5在森林中进行了森林，迁移，迁移后分化以及子板和深层新皮质神经元的投影。 Proc Natl Acad Sci u s a。 2008; 105：16021-16026。 8。 神经元。Harley VR，Clarkson MJ，Argentaro A.睾丸确定因子的分子作用和调节，SRY（Y染色体上的性别确定区域）和Sox9 [与SRY相关的高弹性组（HMG）Box 9]。Endocr Rev。2003; 24：466-487。 4。 Truebestein L，Leonard TA。 盘绕螺旋：长而短。 生物评估。 2016; 38：903-916。 5。 Ikeda T，Zhang J，Chano T等。 识别和表征人类长的SOX5（L-SOX5）基因。 基因。 2002; 298：59-68。 6。 Wu L，Yang Z，Dai G等。 SOX5通过调节膀胱癌的DNMT1/P21途径来促进细胞的生长和迁移。 Acta Biochim Biophys罪。 2022; 54：987-998。 7。 Kwan KY，Lam MM，Krsnik Z等。 SOX5在森林中进行了森林，迁移，迁移后分化以及子板和深层新皮质神经元的投影。 Proc Natl Acad Sci u s a。 2008; 105：16021-16026。 8。 神经元。2003; 24：466-487。4。Truebestein L，Leonard TA。盘绕螺旋：长而短。生物评估。2016; 38：903-916。 5。 Ikeda T，Zhang J，Chano T等。 识别和表征人类长的SOX5（L-SOX5）基因。 基因。 2002; 298：59-68。 6。 Wu L，Yang Z，Dai G等。 SOX5通过调节膀胱癌的DNMT1/P21途径来促进细胞的生长和迁移。 Acta Biochim Biophys罪。 2022; 54：987-998。 7。 Kwan KY，Lam MM，Krsnik Z等。 SOX5在森林中进行了森林，迁移，迁移后分化以及子板和深层新皮质神经元的投影。 Proc Natl Acad Sci u s a。 2008; 105：16021-16026。 8。 神经元。2016; 38：903-916。5。Ikeda T，Zhang J，Chano T等。 识别和表征人类长的SOX5（L-SOX5）基因。 基因。 2002; 298：59-68。 6。 Wu L，Yang Z，Dai G等。 SOX5通过调节膀胱癌的DNMT1/P21途径来促进细胞的生长和迁移。 Acta Biochim Biophys罪。 2022; 54：987-998。 7。 Kwan KY，Lam MM，Krsnik Z等。 SOX5在森林中进行了森林，迁移，迁移后分化以及子板和深层新皮质神经元的投影。 Proc Natl Acad Sci u s a。 2008; 105：16021-16026。 8。 神经元。Ikeda T，Zhang J，Chano T等。识别和表征人类长的SOX5（L-SOX5）基因。基因。2002; 298：59-68。 6。 Wu L，Yang Z，Dai G等。 SOX5通过调节膀胱癌的DNMT1/P21途径来促进细胞的生长和迁移。 Acta Biochim Biophys罪。 2022; 54：987-998。 7。 Kwan KY，Lam MM，Krsnik Z等。 SOX5在森林中进行了森林，迁移，迁移后分化以及子板和深层新皮质神经元的投影。 Proc Natl Acad Sci u s a。 2008; 105：16021-16026。 8。 神经元。2002; 298：59-68。6。Wu L，Yang Z，Dai G等。SOX5通过调节膀胱癌的DNMT1/P21途径来促进细胞的生长和迁移。Acta Biochim Biophys罪。2022; 54：987-998。7。Kwan KY，Lam MM，Krsnik Z等。 SOX5在森林中进行了森林，迁移，迁移后分化以及子板和深层新皮质神经元的投影。 Proc Natl Acad Sci u s a。 2008; 105：16021-16026。 8。 神经元。Kwan KY，Lam MM，Krsnik Z等。SOX5在森林中进行了森林，迁移，迁移后分化以及子板和深层新皮质神经元的投影。Proc Natl Acad Sci u s a。2008; 105：16021-16026。 8。 神经元。2008; 105：16021-16026。8。神经元。Lai T，Jabaudon，BJ和Al。 SOX5皮质果神经元神经元的依次属。 2008; 57：232-247。 9。 Martin-Mors PL，AC女王，倒钩，道德AV。 sox5按照wnt-beta诱导的途径符合这种新进展的这种进展。 REP。 2010; 11：466-4 10。 问题交流，Stolt CC，Coral R和Al。 neu-robiol必须 2015; 75：522-538。 11。 li，menine menendize c，garci-corse l和al。 我们需要新的成年干细胞操作。 rep眼。 2022; 38：1 12。 Edgerley K，Bryson L，Hanington L和Al。 SOX5：综合征Shaffer进一步消耗了进一步的扩展现象。 am j with genet a 2023; 191：1447-1458。 13。 扬声器M，Na和Al。 变体解释使用人群数据：第一GMMAD。 Mutat的Hum 2022; 43：1012-1 14。 Rentzsch P，Schubma M，Shendure J，Kirker M. Cadd-Splicity-Splicity-Splicity-Splicity-Splicity-Splicity-Splicity the Genome vide变体变体预测，使用传递深度分数。 基因组医学。 2021; 13：31。 15。 ioannidis NM，Rothstein JH，Pejaver V和Al。 reve：变体的致病性。 am j hum genet 2016; 99：877-885。Lai T，Jabaudon，BJ和Al。SOX5皮质果神经元神经元的依次属。2008; 57：232-247。 9。 Martin-Mors PL，AC女王，倒钩，道德AV。 sox5按照wnt-beta诱导的途径符合这种新进展的这种进展。 REP。 2010; 11：466-4 10。 问题交流，Stolt CC，Coral R和Al。 neu-robiol必须 2015; 75：522-538。 11。 li，menine menendize c，garci-corse l和al。 我们需要新的成年干细胞操作。 rep眼。 2022; 38：1 12。 Edgerley K，Bryson L，Hanington L和Al。 SOX5：综合征Shaffer进一步消耗了进一步的扩展现象。 am j with genet a 2023; 191：1447-1458。 13。 扬声器M，Na和Al。 变体解释使用人群数据：第一GMMAD。 Mutat的Hum 2022; 43：1012-1 14。 Rentzsch P，Schubma M，Shendure J，Kirker M. 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UC Riverside 压力生物学_健康与疾病中的复杂性和多种多样性 Kaposi的肉瘤相关疱疹病毒（KSHV）LANA可防止KSHV inpoyomes DNMT1，DNMT3A和DNMT3B DNA DNA甲基转移酶的域结构多样化的青少年的超凡思想预测了年轻人...
质膜富含受体和信号蛋白，这些受体和信号蛋白可从细胞外空间进行药理学干预。在这里，我们在多个癌症模型中使用人细胞表面蛋白质组和整合素家族文库进行了一系列CRISPR筛选。我们的结果确定了ITGAV（整合素αV）及其异二聚体伴侣ITGB5（整合素β5）是癌细胞扩张的必需蛋白α/β对。高密度CRISPR基因瓷砖进一步指出了整联蛋白αVβ5二聚体ITGAV的β-螺旋桨域内的积分袋。与硅化合物对接结合使用，我们开发了一个用于药物发现的CRISPR ting式实施计算机辅助（CRISPR-TICA）管道，并将CPD_AV2确定为靶向ITGAV的β-促销中央袋的主要抑制剂。CPD_AV2处理导致整联蛋白αVβ5和细胞凋亡的快速解偶联，提供了一类独特的治疗作用，从而消除了通过异二聚体分离消除整联蛋白信号传导。我们还预计，CRISPR-TICA方法将成为未来药物发现研究的一种可用方法。
非洲木薯基因组的单倍型分辨DNA甲基
胞嘧啶DNA甲基化参与了转座元件（TE）沉默，烙印和X染色体灭活。植物DNA甲基化由Met1（Mammalian DNMT1），DRM2（哺乳动物DNMT3）和两个植物特异性DNA甲基转移酶，CMT2和CMT3介导（Law and Jacobsen，2010年）。DRM2通过植物特异性RNA指导的DNA甲基化（RDDM）途径建立了植物中的从头DNA甲基化，依赖于两个DNA依赖性RNA聚合酶，POL IV和POL V（Gallego-Bartolome et al。木薯的DNA甲基团先前已根据其单倍体倒塌的基因组进行了记录（Wang等，2015）。由于木薯基因组是高度杂合的，因此单倍型折叠基因组的DNA甲基团错过了甲基体的许多特征。With the development of long-read sequencing and chromosomal conformation capture techniques, haplotype-resolved genomes are available for highly heterozygous genomes (Mansfeld et al., 2021 ; Qi et al., 2022 ; Sun et al., 2022 ; Zhou et al., 2020 ), which provides high-quality reference genomes facilitating studies of haplotype-resolved DNA甲基组。为了剖析木薯的单倍型分辨DNA甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基（TME7和TME204）在两个单倍型基因组分辨率（TME7和TME204）中进行了研究。 Al。，2021;测序读数分别映射到不同的单倍型，允许零不匹配和一个最佳命中，这允许分离属于不同单倍型的读数。总体而言，我们发现尽管使用了WGB和EM-SEQ方法，但两种单倍型具有相似的整体
开发表观遗传学的博士职位
开发表观遗传学的博士职位开始日期：2024年9月2X精通帖子，在博士学位上加速通道的掌握帖子可在Chu Sainte-Justine Research Center（蒙特利尔，加拿大魁北克）的Serge McGraw博士实验室中获得。McGraw实验室的工作着重于在胚胎发育开始时发生的表观遗传重编程事件以及其放松管制导致发育和神经发育障碍的方式。候选人将利用他的专业知识来发现表观遗传模型失调（DNA甲基化，组蛋白的变化）所涉及的分子机制，这是由于不利的环境暴露而导致的（例如，母亲中的产前酒精暴露）或表观遗传学变化的不良（例如，DNMT3A，DNMT3A，DNMT1），以及在表观遗传学变化的情况下，以及在脑图中的脑海中及其影响。候选人将有机会使用神经发育性疾病和3D皮质器官开发各种鼠模型和干细胞以及多能诱导的多能干细胞（IPSC），并使用新一代生物学测序和生物信息学，成像，分子生物学以及由CRISPR引用。拟议的项目旨在允许候选人在与其项目方向有关的决策中发挥领导作用。资格。我们正在寻找对表观遗传学，发育生物学，干细胞和/或生物信息学领域研究的才华横溢的候选人。所选候选人将必须在项目，生成和分析数据，帮助受训者和编写手稿上独立工作。将在以下领域具有经验和技能的候选者进行优先级： - 神经科学（神经科学（Neuroépigenetics，图像和行为分析）） - 染色质生物学 - 转录组学，包括单细胞方法，包括单细胞的方法 - 甲基化的特征 - 甲基化的甲基化概况 - 甲基化的DNA和基于CRISPR的细胞的修饰 - 基于CRISPR -ristor -swiment -ristim -andim -swertim -abtrys stratim-构成的茎 - 构成了茎 - 构成的茎 - 构图
利用 CRISPR/Cas9 介导的靶向整合生成 Y 染色体中含有 EGFP 基因的转基因克隆水牛胚胎
性别控制技术在家畜生产中具有重要意义，尤其对于快速繁殖的水牛（bubalus bubalis）具有重要意义，本研究以水牛为研究模型。我们已证实整合到小鼠Y染色体上的荧光蛋白可用于小鼠植入前胚胎的性别鉴定。首先，我们优化了增强型绿色荧光蛋白（eGFP）和mCherry外源基因在Neuro-2a细胞、小鼠胚胎干细胞、小鼠胚胎细胞（NIH3T3）、水牛胎儿成纤维细胞（BFF）中的靶向整合效率。结果表明，靶标两侧同源臂长度为800 bp比300 bp或300 bp/800 bp更有效。当细胞补充了 pifithrin-µ（一种抑制 p53 与线粒体结合的小分子）时，BFF 细胞中同源定向修复 (HDR) 介导的敲入也得到了显著改善。250 V 的三个脉冲在 BFF 细胞中产生最有效的电穿孔，并且发现 1.5 µ g/mL 嘌呤霉素是筛选的最佳浓度。此外，利用 CRISPR/Cas9 介导的基因编辑结合体细胞核移植 (SCNT) 技术成功生成了 Y-Chr-eGFP 转基因 BFF 细胞和克隆水牛胚胎。在第 6-8 代时，Y-Chr-eGFP 转基因 BFF 细胞的生长率和细胞增殖率明显低于非转基因 BFF 细胞；甲基化相关基因 DNMT1 和 DNMT3a 的表达水平相似；然而，与非转基因细胞相比，Y-Chr-eGFP 转基因 BFF 细胞中乙酰化相关基因 HDAC1 、 HDAC2 和 HDAC3 的表达水平显著较高（p < 0.05）。Y-Chr-eGFP 转基因 BFF 被用作 SCNT 的供体，结果表明 eGFP 报告基因适用于胚胎性别的可视化。克隆水牛胚胎的囊胚率相似；然而，与对照相比，转基因克隆胚胎的卵裂率明显较低。总之，我们优化了产生转基因 BFF 细胞的方案，并使用这些细胞作为供体成功产生了 Y-Chr-eGFP 转基因胚胎。
一个用于体外心脏电生理学的可访问平台
图1。点击编辑的概述和开发。a，单击编辑器的示意图（CE），它是由RNA程序编程的DNA nickase，DNA依赖性DNA聚合酶和ssDNA绑扎域组成的融合蛋白（例如，嗯，核酸内切酶； Huhe）与导向RNA（GRNA）配对。Click-DNA（clkDNA）模板是一种单链DNA寡核苷酸，它编码底漆结合位点（PBS），聚合酶模板（PT）和Huhe识别位点B，从709序列产生的系统生成树47序列47，描绘了Huains多样性的小型元素，该序列是47个序列。量表表示序列之间的分数相关性。c，与ssDNA分子共价磷酸酪氨酸加合物形成共价磷酸酪氨酸加合物的示意图，其中huhe结合了识别顺序以引发单点样共轭反应。d，逐步点击编辑机制，涉及：（1）DNA目标位点释放非目标链（NTS）3'基因组瓣，（2）NTS laps plap杂交与clkDNA PBS，（3）NTS-NTS-NTS-NTS-PBS连接与DNA依赖性DNA Polimentsion（4）nts-pbs intthers（3） clkDNA的编码PT，（5）新合成的3'和天然基因组5'襟翼之间的平衡，以及（6）5'-flap裂解，导致编辑结合。e，在HEK 293T细胞中的点击编辑转染的示意图，涉及CE质粒的共转染（Porcine Circovirus 2（PCV2）Huhe Huhe与NSPCAS9（H840A）融合，并从e.coli dna Polymerase I（DNA Polymerase I（DNA Polymerase I（DNA Polymerase I（DNA Polymerase I（DNA））中， clkDNA和一个（或两个）GRNA质粒（S）。ngrna）针对非编辑链的目标编辑效率。f，g，使用DNMT1 GRNA和带有PBS13-PT12的clkDNA插入或读取突变（Indels）的 f，g， f，g， f，g， f，g， f，g， f，g，使用PBS13-PT12编码A +3- 5 cag deletion（使用A +49 nick; Panel f）或rnf2 grna a +rnf2 grna a +rnf2 grna a +rnf2 gkdna A +3-5 clkDNA A +49-PT12替换（带有+5“ 2b”刻度；面板G）。 CE1，CE（PCV2-NSPCAS9（H840A）-ECKLENOW），带有一个GRNA，以指导非目标链刻度； CE1.N2，CE1带有额外的grna来指导刻痕（即f，g， f，g， f，g， f，g， f，g， f，g，使用PBS13-PT12编码A +3- 5 cag deletion（使用A +49 nick; Panel f）或rnf2 grna a +rnf2 grna a +rnf2 grna a +rnf2 gkdna A +3-5 clkDNA A +49-PT12替换（带有+5“ 2b”刻度；面板G）。 CE1，CE（PCV2-NSPCAS9（H840A）-ECKLENOW），带有一个GRNA，以指导非目标链刻度； CE1.N2，CE1带有额外的grna来指导刻痕（即f，g， f，g， f，g， f，g， f，g，使用PBS13-PT12编码A +3- 5 cag deletion（使用A +49 nick; Panel f）或rnf2 grna a +rnf2 grna a +rnf2 grna a +rnf2 gkdna A +3-5 clkDNA A +49-PT12替换（带有+5“ 2b”刻度；面板G）。 CE1，CE（PCV2-NSPCAS9（H840A）-ECKLENOW），带有一个GRNA，以指导非目标链刻度； CE1.N2，CE1带有额外的grna来指导刻痕（即f，g， f，g， f，g， f，g，使用PBS13-PT12编码A +3- 5 cag deletion（使用A +49 nick; Panel f）或rnf2 grna a +rnf2 grna a +rnf2 grna a +rnf2 gkdna A +3-5 clkDNA A +49-PT12替换（带有+5“ 2b”刻度；面板G）。 CE1，CE（PCV2-NSPCAS9（H840A）-ECKLENOW），带有一个GRNA，以指导非目标链刻度； CE1.N2，CE1带有额外的grna来指导刻痕（即f，g， f，g， f，g，使用PBS13-PT12编码A +3- 5 cag deletion（使用A +49 nick; Panel f）或rnf2 grna a +rnf2 grna a +rnf2 grna a +rnf2 gkdna A +3-5 clkDNA A +49-PT12替换（带有+5“ 2b”刻度；面板G）。 CE1，CE（PCV2-NSPCAS9（H840A）-ECKLENOW），带有一个GRNA，以指导非目标链刻度； CE1.N2，CE1带有额外的grna来指导刻痕（即f，g， f，g，使用PBS13-PT12编码A +3- 5 cag deletion（使用A +49 nick; Panel f）或rnf2 grna a +rnf2 grna a +rnf2 grna a +rnf2 gkdna A +3-5 clkDNA A +49-PT12替换（带有+5“ 2b”刻度；面板G）。 CE1，CE（PCV2-NSPCAS9（H840A）-ECKLENOW），带有一个GRNA，以指导非目标链刻度； CE1.N2，CE1带有额外的grna来指导刻痕（即f，g，使用PBS13-PT12编码A +3- 5 cag deletion（使用A +49 nick; Panel f）或rnf2 grna a +rnf2 grna a +rnf2 grna a +rnf2 gkdna A +3-5 clkDNA A +49-PT12替换（带有+5“ 2b”刻度；面板G）。CE1，CE（PCV2-NSPCAS9（H840A）-ECKLENOW），带有一个GRNA，以指导非目标链刻度； CE1.N2，CE1带有额外的grna来指导刻痕（即
表观遗传分子因子的表达与癌细胞系中化学治疗剂的DNA甲基化和敏感性的表达相关性
抽象背景：改变的DNA甲基化模式在癌症的发展和进展中起着重要作用。我们检查了直接或间接参与DNA甲基化和脱甲基化的基因的表达水平是否与癌细胞系对用多种抗肿瘤药物进行化学疗法治疗的反应有关。结果：我们分析了直接或间接参与DNA甲基化和脱甲基化过程的72个基因。我们检查了它们的预处理表达水平与单个DNA甲基化探针的甲基化β值，基因区域内的DNA甲基化平均以及平均层状甲基化水平的关联。我们分析了癌细胞系百科全书中的645种癌细胞系和23种癌症类型的数据，以及癌症数据集中药物敏感性的基因组学。我们观察到编码表观遗传因子的基因表达与对化学治疗剂的反应之间的许多相关性。编码各种表观遗传因子的基因的表达，包括KDM2B，DNMT1，EHMT2，SETDB1，EZH2，APOBEC3G和其他基因，与多个药物的响应有关。DNA甲基化的众多靶探针和基因区域与编码表观遗传因子的多个基因的表达相关，强调通过多个相交的分子途径来强调表观遗传组甲基化的复杂调节。结论：编码表观遗传因子的多个基因的表达与药物反应以及可能影响对治疗剂反应的许多表观遗传组靶标的DNA甲基化有关。The genes whose expression was associated with methylation of multiple epigenome targets encode DNA methyltransferases , TET DNA methylcytosine dioxyge- nases , the methylated DNA-binding protein ZBTB38, KDM2B, SETDB1, and other molecular factors which are involved in diverse epigenetic processes affecting DNA methylation.虽然许多表观基因组靶标的基线DNA甲基化与细胞系对抗肿瘤药物的反应相关，但每个表观遗传因子对特定靶标的甲基化的重叠作用与肿瘤对单个药物反应中这种影响的重要性之间的复杂关系需要进一步研究。我们的发现表明了调节表观基因组中DNA甲基化的互连途径，这可能直接和间接影响对化学疗法的反应。