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分子对接研究 Hasan Cubuka 和 Mehme
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利用榄仁树的植物化合物对心血管疾病相关蛋白质进行对接研究
序号 化合物/药物 分子式 化合物 ID 1 阿朱尼汀 C 36 H 58 O 10 3052779 2 阿朱酸 C 30 H 48 O 5 15385516 3 阿朱醇酸 C 30 H 48 O 5 73641 4 阿朱酮 C 19 H 20 O 6 14034821 5 阿朱皂苷 C 30 H 48 O 6 12444386 6 β-谷甾醇 C 29 H 50 O, 222284 7 木麻黄苷 C 41 H 28 O 26, 13834145 8 鞣花酸 C 14 H 6 O 8 5281855 9 没食子酸乙酯 C 9 H 10 O 5 13250 10 没食子酸酸 C 7 H 6 O 5 370 11 木犀草素 C 15 H 10 O 6 5280445 12 槲皮素 C 15 H 10 O 7, 5280343 13 苦素酸 C 30 H 48 O 4 355369274 14 儿茶素 C 15 H 14 O 6, 73160 15 芦丁 C 27 H 30 O 16, 5280805 16 山奈酚 C 15 H 10 O 6, 5280863 17 白花青素 C 15 H 14 O 7, 71629 18 3-O-甲基鞣花酸 3'-鼠李糖苷
重新利用 COVID-19 疗法：通过机器学习和对接快速预测市售药物
保留所有权利。未经许可不得重复使用。 （未经同行评审认证）是作者/资助者，他已授予 medRxiv 永久展示预印本的许可。此预印本的版权所有者此版本于 2020 年 4 月 7 日发布。；https://doi.org/10.1101/2020.04.05.20054254 doi：medRxiv preprint
CoV-2：分子对接
发现针对 SARS- CoV-2 3CL pro 蛋白靶点的新型羟乙胺类似物：分子对接、分子动力学模拟和构效关系研究 Sumit Kumar 1,2、Prem Prakash Sharma 2、Uma Shankar 3、Dhruv Kumar 4、Sanjeev K Joshi 5、Lindomar Pena 6、Ravi Durvasula 7、Amit Kumar 3、Prakasha Kempaiah 7、Poonam 1、和 Brijesh Rathi 2,* 1 德里大学米兰达楼化学系，德里 - 110007。 2 德里大学汉斯拉吉学院转化化学与药物研发实验室，德里 - 110007 印度 3 印度理工学院生物科学与生物医学工程系，印多尔，西姆罗尔，印多尔 - 453552，印度 4 阿米蒂大学北方邦阿米蒂分子医学与干细胞研究所 (AIMMSCR)，Sec-125，诺伊达 - 201313，印度 5 国防研究与发展组织技术部，总部，Rajaji Marg，新德里 - 110011 6 奥斯瓦尔多·克鲁兹基金会 (Fiocruz) Aggeu Magalhaes 研究所 (IAM) 病毒学系，50670-420，累西腓，伯南布哥州，巴西。 7 洛约拉大学斯特里奇医学院医学系，2160 South First Avenue，芝加哥，伊利诺伊州 60153，美国
stafia-1：通过docking开发的STAT5A选择性抑制剂
摘要：我们提出了一种新的方法，用于鉴定磷酸化依赖性蛋白质 - 蛋白质相互作用结构域的抑制剂，其中酚片段在基于基于筛选的筛选之前通过硅o磷酸化进行了调整。从10369180库的数据库中，我们确定了85021天然产品衍生的nolic片段，这些片段实际上是O-磷酸化的，并在硅胶结合中筛选了STAT3 SH2域。九个筛选命中，其中八个显示了STAT3的体外抑制程度。在分析其选择性曲线后，将最有效的INBITOTIT开发到Stafia-1，这是第一个小摩尔分子，该小分子在近距离同源性STAT5B上优先抑制STAT家族成员Stat5a。基于Stafia-1的磷酸前药抑制了人类白血病细胞中STAT5B的STAT5A，这是通过小分子抑制作用的体外体外和网细胞抑制STAT5A的首次证明。