EADCA

朝着RNA家族的副生成建模

摘要生成概率模型作为数据 - 滴滴en，e v iNolution-Inf Ormed设计的新范式出现。本文介绍了一种无VEL方法，称为边缘直接耦合分析SIS（EADCA），该方法是根据RNA序列的特征量身定制的，并强调了简单性，效率和可解释性。EADCA明确构建了RNA家族的稀疏协同进化模型，在利用明显的参数数量的同时，获得了与更多Comple X方法相当的效果。我们的方法表明，在统计分析和形状映射实验中以及预测MUT效应的统计分析和形状映射实验中，它们在产生人工RNA序列方面的效率。不当，EADCA提供了一个独特的功能：估计给定RNA家族中潜在功能序列的数量。例如，在环状DI-AMP核糖开关（RF00379）的情况下，我们的分析表明，占用的10 39个功能性核苷酸序列。虽然与已知的<40 0 0自然序列相比，但该数字仅代表近10个可能长度（136个核苷酸）的近10 82个可能的核苷酸序列的巨大池的一小部分。这些结果强调了稀疏且可解释的生成模型（例如EADCA）的希望增强了我们对E Xpansiv e RNA序列空间的理解。