Edman降解是通过从肽链的氨基端依次去除一个残基来纯化蛋白质的过程。为解决通过水解条件损害蛋白质的问题,Pehr Edman创造了一种新的标记和切割肽的方法。埃德曼(Edman)想到了一次仅删除一个残留物的方法,这并没有损害整体测序。这是通过添加异硫氰酸苯基苯基苯基苯基苯基苯基苯甲酸苯基苯基苯甲酸苯甲酸苯甲酸苯甲酰胺的衍生物来完成的。然后在不太苛刻的酸性条件下裂解N末端,从而产生苯基噻吩家(PTH) - 氨基酸的环状化合物。可以重复其余残基的方法,一次将一个残基分开。Edman降解非常有用,因为它不会损害蛋白质并允许在更少的时间内对蛋白质进行测序。
1°Aastrand实验室,生理学,营养和生物力学系,瑞典体育与健康科学学院,斯德哥尔摩114 33,瑞典,瑞典2,2妇女和儿童健康部,卡罗林斯卡研究所,斯德哥尔摩,斯德哥尔摩171 77,瑞典,瑞典,瑞典3号,运动和体育运动部,吉特大学,吉特大学4000,吉特大学,吉特大学。生理学,哥本哈根大学营养,运动和运动系,哥本哈根大学1172年,丹麦5号,瑞典体育与健康科学学院体育锻炼和健康部5斯德哥尔摩171 77,瑞典和8号生理学和药理学系,卡罗林斯卡研究所,斯德哥尔摩171 77,瑞典
上午 10:00 – 首席执行官 Tom Edman:战略更新、愿景、当日概述 上午 10:15 – 商业部门和网络/数据中心计算部门 Doug Soder 和汽车、医疗、工业仪器仪表部门 Anthony Sandeen
摘要:可以在单氨基酸分辨率下准确测序肽的可扩展方法可以显着提高蛋白质组学研究。我们提出了一种基于肽序列信息的“反翻译”到DNA条形码中的蛋白质测序方法,该方法记录了每个氨基酸的身份,位置和起源肽。我们采用了修改后的EDMAN降解过程,该过程将肽转化为DNA-Barcoded氨基酸,随后通过接近扩展测定法检测到,产生了可以放大和测序的多键型DNA输出。使用我们的方法,我们测序了模型肽中多个连续的氨基酸。此方法还可以使单个氨基酸取代的区分,并同时鉴定翻译后修饰及其在多种肽中的位置。随着进一步的发展,我们预计该方法将使从单分子灵敏度具有高度平行的从头蛋白测序。
包括天然产物,肽和合成小型化合物在内的各种分子通过与靶向生物大分子的特定相互作用表现出其生物学活性。蛋白质在内,包括酶,受体和离子通道代表这些靶标的主要群体。鉴定与生物活性配体相互作用的未知蛋白靶标在化学生物学和药物发育领域已经是必不可少的。但是,这种研究方法是耗时且费力的。靶标识别包括一系列过程:(1)使用具有生物活性配体作为诱饵的靶标的靶; (2)钩靶的富集; (3)通过Edman退化或质谱法(MS)对目标进行序列分析。1对于第一步,照片 - 亲和力标记允许在光辐射时将诱饵共价为相应的目标,因为可能适用于低亲和力配体靶向对。1a,b,2然后将钩状靶标与生物素链接蛋白珠相互纯化的生物素化接头分子使用生物素 - 链霉亲蛋白相互作用链接。1,3