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测试使用EDNA从沉积物核心碳起源分析的有效性
蓝色碳是由海洋生态系统中的活生物体捕获的碳，并存储在生物质和沉积物中。对识别和表征蓝色碳栖息地的兴趣越来越大，因为它们对于理解未来如何为净零目标做出贡献至关重要。目前，英国温室气体IINVENTORY（GHGI）中不包括蓝碳栖息地，但是，政府间气候变化（IPCC）湿地补充剂（IPCC，2014年）包括量化和委托GHG排放和撤离的准则，包括与湿地类型的管理，包括SALTM和SALTM的管理，以及与SALT的管理相关联。其他蓝色碳栖息地，例如降潮和潮间带海洋沉积物，目前尚无将其纳入英国GHGI的机制。
核心可及性，增加能力并促进国际埃德娜标准的创新
环境DNA（EDNA）包括一组快速新兴的技术，这些技术有可能通过新颖，非侵入性，成本效益和民主的方法和工具来支持环境监测和生物多样性保护。同时，EDNA研究人员正在为EDNA技术，方法和数据输出制定国际标准。为了使Edna技术可访问，有用和适当，我们必须确保制定的任何标准都包括来自世界各地的用户的广泛概念，各种各样的生态环境和位置，最重要的是，对研究能力和基础架构的真实前景。在本文中，我们从非洲，南美和太平洋岛屿的各种和全球用户和专家组成的埃德娜的国际标准化汇总了埃德娜的国际标准化。本文的作者通过回答和讨论一系列旨在引起有关EDNA标准的希望，关注和经验的开放式问题来合作。结果是一组新兴的主题和生成共识，以强调建立适应性标准的需求，区域能力的发展，对数据主权的敏感性增加，并将标准化视为全球能力建设活动。
鱼环境DNA（EDNA）
Q11：国家可以申请实施赠款，以涉及在没有开发PCAP的州进行的活动，并且需要将部分资金纳入不参加CPRG计划赠款计划的州？例如，状态A正在参加CPRG计划赠款计划并开发了州PCAP。状态A提交了实施赠款应用程序，其中包括一个措施，该措施将其属于没有其PCAP的相邻状态B。该子宣告将支付在州B中发生的活动。这样的安排可以允许吗？添加了2024年2月16日。........................................................................................................................................
比较Edna Metabarcoding和标准化的电击评估德克萨斯河和溪流中的鱼类组合
您可以将本文档中包含的信息和图像用于非商业，个人或教育目的，前提是您（1）不修改此类信息，并且（2）包括适当的引用。如果将材料用于其他目的，则必须在作者使用之前获得作者使用受版权保护的材料的书面许可。
使用Edna metabarcoding建立河流恢复后淡水鱼组成的靶标
需要为鱼类社区组成建立现实的目标来评估河流修复项目的有效性。，我们使用了与米里什底漆的环境DNA（EDNA）元法编码，以获取估计位于日本Ehime ehime Prefecture的Shigenobu River System的上游，下游和恢复缓解项目区域（Kaihotsu - Kasumi）的17个地点（Kaihotsu - Kasumi）的估计。我们评估了使用Edna快速，敏感和广泛收集数据的好处，以在恢复区建立现有的鱼类群落组成，以及物种组合的潜在的短期，中期和长期目标，这些物种组合可能在分散到来自上游和下游群体的项目区域后现实地出现。我们将Edna Metabarcodod的结果与从同时捕获调查和历史信息获得的物种列表进行了比较。从埃德纳（Edna Surveys）获得的社区组成的非衡量多维标度图显示，Kaihotsu - Kasumi恢复区和周围的河流及其河流分为三个簇：上游，中层和下游及河口和河口。Kaihotsu - Kasumi恢复区位点包含在恢复区附近的流入和流出河流的中间和下到达的组中。我们在这一组中检测到了总共26种，二十一种本地物种和五个非本地物种。因此，这些本地物种被认为是短期目标物种，其散布到Kaihotsu - Kasumi恢复区域。相比之下，基于捕获调查和历史文献，只有14种被选为目标物种。增加了我们埃德纳调查的分辨率的一个因素是我们确定存在a anguillicaudatus（进化枝A和B）的种内谱系的能力，这些谱系被捕获调查遗漏了。这些结果表明，与捕获调查相比，EDNA Metabarcoding方法可以提供更全面和现实的短期目标物种估计，并通过种内谱系检测提供更高的分辨率监测。
使用环境 DNA（eDNA）来评估存在...
关于合作者科学系列：合作者科学系列丛书于2013年启动。其目的是促进研究项目报告的归档和检索，主要是由美国支持的调查鱼类和野生动物服务（FWS），尤其是野生动植物和运动鱼修复计划。选择了在线格式，以立即访问FWS，州和部落管理机构，保护界以及整个公众的科学报告。本系列中的所有报告均经过与进行研究的机构和实体一致的同行审查过程。对于美国地质调查局作者，同行评审过程（http://www.usgs.gov/usgs-manual/500/502-3.html）还包括局在传播之前的批准官员的审查。提供这些报告的作者和/或机构/机构对其内容完全负责。FWS不提供这些报告的社论或技术审查。本系列报告中的评论和其他信件应针对报告作者或机构/机构。在大多数情况下，本系列发表的报告是以当前或修订的格式出版的，在同行评审的科学文献中。在科学文献发表之前进行进一步的同行审查或其他数据和/或分析后，可以修改报告中包含的数据的结果和解释。合作者科学系列得到了西弗吉尼亚州Shepherdstown国家保护培训中心FWS的支持和维护。101-2013。该系列依次编号为参考的出版年度，并从报告号FWS已将其他各种编号系统用于类似但现在停止的报告系列。从编号101对于当前系列而言，旨在避免与早期报告编号的混淆。使用合同的研究机构和机构，贸易，产品，行业或公司名称或产品或软件或模型（无论是否商业上）仅出于信息目的，并且不构成美国政府的认可。合同参考：本文件符合美国资助的研究报告要求鱼类和野生动物服务避难所（G15AC00021）。先前发布的文档，该文件在适用时会在其中一部分履行本合同的任何部分。（USGS IPDS＃：IP-106157）。推荐引用：Brewer，S。K.，J。B. Mouser和R. van den Bussche。2020。使用环境DNA（EDNA）评估Ozark高地洞穴中的洞穴鱼和小龙虾种群的存在。美国内政部，鱼类和野生动物服务部，合作社科学系列FWS/CSS-135-2020，华盛顿特区
环境DNA（EDNA）12S元编码PCR方案（使用铂Superfi II TAQ）
1。在密歇根州立大学的研究技术支持机构（RTSF）上进行了二级扩增和NGS。将每种纯化的原代PCR产物的20μL等分试样送到MSU的RTSF基因组核心，以用于临时PCR扩增，该引物针对主要PCR产物的CS1/CS2末端，并添加了双重索引，具有双重指标的，光明的，光明的兼容型适配器与酒吧尺度。
环境DNA（EDNA）检测地下和水生侵入性物种的应用：对Edna metabarcoding
世界正在努力解决毁灭性的生物多样性丧失，这不仅影响着珍贵的物种的灭绝和不可替代的遗传变异，而且危害了人们的粮食生产，健康和安全。所有旨在保护生物多样性的举措在很大程度上依赖于对物种和人群的监测，以获得准确的空间模式和整体人口评估。传统的监测技术，例如视觉调查和计数个体，由于识别隐性物种或不成熟的生命阶段的挑战，这是有问题的。环境DNA（EDNA）是一项相对较新的技术，具有更快，无创和具有成本效益的工具，以监视生物多样性，保护和管理实践。edna是从古老和现在的材料中提取的，其应用范围从单个物种到整个生态系统的研究。在过去的几年中，Edna在与生态保护和保护有关的研究中的使用情况大大增加。但是，仍然需要解决一些技术问题。为了减少当前Edna技术产生的假阳性和/或假阴性的数量，有必要在过程的每个阶段改进和优化校准和验证。非常需要更多关于EDNA使用的物理和生态限制及其合成，当前状态，预期寿命和潜在运动模式的信息。由于EDNA研究的广泛使用，评估这些研究的程度和广度也至关重要。在本文中，我们严格审查了埃德娜在地下和水生入侵物种中的主要应用。通过此评论，读者可以更好地了解Edna Metabarcoding的挑战和局限性。
调查迅速变化的欧洲北极地区的上层生物多样性和胶状浮游生物社区：EDNA METABARCODING调查
fi g u r e 2上升后生阿尔法和β多样性模式。（a）在每个深度区域和采样位置，海洋后生动物门的相对读取丰度。（b）香农多样性指数（H'）和（c）在所有四个深站组合的每个深度区域的SRS的物种丰富度标准化的Motus数据。Tukey的HSD成对比较与Tukey调整后的P值进行了比较。*表示<0.05的显着差异，****表示显着差异<0.001。（d）基于jaccard距离的Motus社区结构（K = 2）的非线性多维标度。颜色表示海洋区，点形表示站点，地块上显示的应力值。深度区域被定义为上皮（0-99 m），下层（100-200 m），中质质量（201-1000 m）和浴类质（> 1000 m）。
优化大湖支流的幼虫海七lamp鼠环境DNA（EDNA）
和尺寸分布（Slade等人2003）。 这些数据，当输入经验流治疗排名系统时（Christie等人 2003; Hansen and Jones，2008年），指导选择TFM治疗成本与杀伤率最高的支流。 在历史记录中，在5,311（9.4％）的大湖支流中有500多个面临着海lamp虫的侵扰（Barber and Steeves 2020）。 然而，大湖渔业委员会（GLFC）Sea Lamprey Control计划的预算和人员配备的限制允许每年仅处理四分之一的溪流（Jubar等人 2021）。 此外，电钓鱼调查也有局限性。 Steeves等。 （2003）证明，即使在中等到高幼虫海七lamp亵的密度下，通过电钓检测的可能性也仅为0.48。在幼虫七lamp窃密度较低的情况下，电钓效果的效果较差。 此外，通常无法从10月下旬到5月或在水太深的地区进行电钓鱼，无法进行背包电钓鱼或无法通行的船基电钓鱼。 鉴于大湖区盆地支流的数量和程度，对补充电钓鱼的替代方法的探索可以极大地增强海lamp架监视。2003）。这些数据，当输入经验流治疗排名系统时（Christie等人2003; Hansen and Jones，2008年），指导选择TFM治疗成本与杀伤率最高的支流。 在历史记录中，在5,311（9.4％）的大湖支流中有500多个面临着海lamp虫的侵扰（Barber and Steeves 2020）。 然而，大湖渔业委员会（GLFC）Sea Lamprey Control计划的预算和人员配备的限制允许每年仅处理四分之一的溪流（Jubar等人 2021）。 此外，电钓鱼调查也有局限性。 Steeves等。 （2003）证明，即使在中等到高幼虫海七lamp亵的密度下，通过电钓检测的可能性也仅为0.48。在幼虫七lamp窃密度较低的情况下，电钓效果的效果较差。 此外，通常无法从10月下旬到5月或在水太深的地区进行电钓鱼，无法进行背包电钓鱼或无法通行的船基电钓鱼。 鉴于大湖区盆地支流的数量和程度，对补充电钓鱼的替代方法的探索可以极大地增强海lamp架监视。2003; Hansen and Jones，2008年），指导选择TFM治疗成本与杀伤率最高的支流。在历史记录中，在5,311（9.4％）的大湖支流中有500多个面临着海lamp虫的侵扰（Barber and Steeves 2020）。然而，大湖渔业委员会（GLFC）Sea Lamprey Control计划的预算和人员配备的限制允许每年仅处理四分之一的溪流（Jubar等人2021）。此外，电钓鱼调查也有局限性。Steeves等。（2003）证明，即使在中等到高幼虫海七lamp亵的密度下，通过电钓检测的可能性也仅为0.48。在幼虫七lamp窃密度较低的情况下，电钓效果的效果较差。此外，通常无法从10月下旬到5月或在水太深的地区进行电钓鱼，无法进行背包电钓鱼或无法通行的船基电钓鱼。鉴于大湖区盆地支流的数量和程度，对补充电钓鱼的替代方法的探索可以极大地增强海lamp架监视。