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使用多种方法识别抗寄生虫药物靶点...
摘要背景：随着动物生产的扩大，寄生蠕虫的经济重要性日益增加。然而，由于几种已建立的驱虫剂的特异性较低，它们的应用可能会损害受治疗的宿主和环境。此外，表现出抗性的寄生虫菌株数量正在增加，而几乎没有开发出新的驱虫药。在这里，我们提出了一种生物信息学工作流程，旨在减少开发新的抗寄生虫策略的时间和成本。该工作流程包括定量转录组学和蛋白质组学、3D 结构建模、结合位点预测和虚拟配体筛选。它被证明可用于鱼类养殖中一种新兴害虫——棘头虫 (Acanthocephala)。我们从四种鱼类 (普通鲃鱼、欧洲鳗鱼、薄唇鲻鱼、大头鲻鱼) 中选取了三种棘头虫 (Pomphorhynchus laevis、Neoechinorhynchus agilis、Neoechinorhynchus buttnerae)。结果：该工作流程在棘头鱼中产生了 11 个高度特异性的候选靶标。候选靶标在确定宿主和偶然宿主中表现出恒定且升高的转录丰度，表明其具有组成性表达和功能重要性。因此，相应蛋白质的损伤应该能够特异性和有效地杀死棘头鱼。候选靶标在棘头鱼体壁中也非常丰富，这些无肠寄生虫通过体壁吸收营养。因此，这些候选靶标很可能与口服给鱼的化合物接触。虚拟配体筛选产生了十种化合物，其中五种根据 ADMET、GHS 和 RO5 标准似乎特别有希望：他达拉非、普拉那匹特、吡酮洛芬、海利霉素和杀线虫剂德奎特尔。结论：基因组学、转录组学和蛋白质组学的结合产生了一种广泛适用的程序，可以节省成本和时间地识别寄生虫中的候选靶蛋白。现在可以进一步评估预测结合的配体是否适合控制棘头虫。工作流程已存放在 Galaxy 工作流程服务器中，URL 为 tinyurl.com/yx72rda7 。关键词：寄生虫、驱虫药、靶分子、虚拟配体筛选、活性成分、医学基因组学
多源遥感数据的潜力......
感谢我的两位论文导师 Pascal Allemand 和 Christophe Delacourt。感谢您信任我，为我投入时间，并为我提供完成这个项目的方法。感谢 Christophe 的热情、活力和自发性。感谢帕斯卡的冷静、专注、严谨和积极进取（“摇滚之心”）。我要热烈感谢帕特里克·莱德鲁。在这三年里，我受益于你们的动力、你们的能量、你们的支持和你们的地质知识。感谢 Herv´e Le Borgne，没有他我就会淹没在资料来源的独立性中。感谢您对我们的所有讨论、鼓励以及对本研究的参与。感谢奥利维尔·布尔乔亚在纳米比亚战场上陪伴我们。与您分享这次旅行，无论是为了深夜谈话还是为了我作为一名野外地质学家的学徒，我真的很高兴。感谢 Ondrej Sramek，他为约束下光谱混合物分析的编程做出了贡献。感谢您投入的时间、动力和兴趣。感谢托马斯·贝克对我们的研究和结果如此热情（感谢您通过烧烤向我们介绍了纳米比亚生活的一部分）。还要感谢 Serge Elmi 让我参与他在摩洛哥的测绘项目。
生态风险筛选 - 苏格里亚.pdf
美国的地位。（2020年）：“在美国已引入了几个水体，但没有证据表明它们在野外建立或繁殖（Nico等人。2019）。我们在这里描述了在美国路易斯安那州东南部的一条城市水道上发现了库奇亚的既定人口。” “在亚洲，沼泽鳗鱼通常是为了人类的消费而收获的，包括cuchia在内的几个亚洲类群被活着出口并在美国，加拿大和其他地方的民族食品市场中作为食品出售（Nico等人，2019年）”。（2022）：“奥菲奇·库奇亚（Ophichthys Cuchia）也在美国（路易斯安那州，马里兰州，密歇根州，新泽西州，纽约和宾夕法尼亚州）的六个州内收集，并在新奥尔良（路易斯安那州）中存在既定的入侵人群。我们提供了来自德克萨斯州的O. cuchia的第一张记录，并根据26个博物馆的保证标本从休斯顿都会区（Fort Bend Co.）收集的第二个博物馆保证标本。 “这些大型Cuchia的大人物可能是在当地市场上购买的，然后在此地点发布，但就像Jordan等人一样。（2020），我们坚信该物种是基于收集多个较小标本的布法罗奔跑公园内繁殖的。”来自Nico等。（2019年）：“自2001年以来，美国市场中库奇亚的流行率表明该物种是进口的主要沼泽鳗鱼，在很大程度上取代了亚洲复杂的单胞菌Albus/Javanensis的成员。LEMIS数据显示，大多数进口源于孟加拉国，越南和中国。LEMIS Records（1996年7月至2017年1月1日）972货物，其中包含估计有832,897个活沼泽鳗鱼进入美国的货物，尽管由于未宣布和虚假的报告，这些数据低估了实际数字。然而，柠檬错误地将许多进口的沼泽鳗鱼视为“单翅目”。尽管孟加拉国和印度的标本几乎可以肯定是该物种，但没有一个被确定为A. cuchia。一些进口的A. cuchia被错误地宣布为Anguilla Bengalensis。”如上所述，该物种是作为食品进口的，并在美国境内出售。没有发现该物种在美国水族馆贸易中存在的证据。拥有所有Synbranchidae物种的法规受到路易斯安那州（路易斯安那州修订的2022年修订法规），田纳西州（TWRA 2022），德克萨斯州（TPW 2022）和犹他州（犹他州DWR 2020年）。单胎属在内华达州（内华达州野生动物专员委员会2022;
使用压缩感应
Alex Robinson 1，Jack Wells 1,2，Daniel Nicholls 1，Giuseppe Nicotra 3，Nigel Browning，Nigel Browning 1,4 1 Senseai Innovations Ltd.，英国利物浦，2分布式算法算法，博士培训中心，英国利物浦，英国3 Cnr-immmmmmmmmm，liver-immmmm，liver-imm，liver-imm，liver-imm，italy italy，4扫描透射电子显微镜（Stem）可以捕获与材料的结构和化学性质相对应的多种信号。这些方法的示例包括明亮/暗场成像，能量分散X射线光谱（EDS）或电子能量损失光谱（EELS）[1]。由于其对低质量元素的敏感性以及确定其氧化态，化学键合和空间分布的能力，因此特别感兴趣。由于信号较低，梁的能量扩散以及检测器的灵敏度，鳗鱼光谱挑战很大。此外，由于采集速度，样本的稳定性被妥协，这是信号限制和相机读出速度的组合。克服这些局限性的一种解决方案是使用探针子采样，仅获取相对于典型扫描网格的探针位置的子集。这已显示出适用于各种茎技术，例如2-D成像，EDX和4-D茎[2,3]。我们的目标是将这些相同的策略应用于鳗鱼的获取，以提高速度，同时维持材料的结构和化学分析。将聚焦的电子探针对齐，并将扫描线圈连接到扫描发生器，以允许定制的扫描模式。此过程如图然后将电子探针定位在子采样的探针位置，并获得了鳗鱼光谱。对于实时成像，可以使用Beta过程因子分析（BPFA）算法[4]的GPU实现来覆盖能量损失的子集[4]，以使探针更加比对。对于离线分析，数据被重塑以形成一个3-D数据集，其中第一个两个维度对应于探针位置，最终维度是特定的能量损失。然后，使用3D补丁的BPFA对此数据进行覆盖。1。为了测试这种方法，我们使用碳脸上生长的石墨烯的硅卡宾枪样品模拟了一个亚采样的鳗鱼实验[5]。数据集包含17x104探针位置，扫描步骤为0.13nm，相机上的能量宽度为0.25EV（2048通道）。仅使用原始数据的25％测试数据集。结果（图1中给出）表明，可以恢复数据，以实现与原始，全采样数据集的功能相同的结果。这项工作表明，通过对采样网格的测量，可以实现原子分辨率鳗鱼。通过采用这些方法，干eels可以更快，较低的剂量，并且重要的是
十英里溪河岸修复项目
本报告介绍了由州水资源控制委员会 (SWRCB) 使用 319h 资金 (SWRCB #D2013114) 资助的四个 Tenmile Creek 生物工程项目的设计基础，并且正在寻求加州鱼类和野生动物部 (CDFW) 的资助。Tenmile Creek 保护和恢复行动计划 (Higgins 2020) 确定了河岸恢复的优先事项，前四项被列入 2019 年 12 月成功的鳗鱼河恢复项目 (ERRP) 拨款提案中。项目选择标准是可以预防的沉积物污染量以及发生河岸溃坝的河段对《濒危物种法》列出的太平洋鲑鱼物种的重要性。由于新冠疫情，该项目直到 2021 年 4 月才开放。BioEngineering Associates 制定了 Mill Creek、Streeter Creek 和 Cahto Creek 两个地点的修复项目计划，并于 2022 年 3 月完成。水文评估报告 - Tenmile Creek 河岸侵蚀防治和河岸修复项目由 Thomas Gast Associates 环境顾问于 2022 年 4 月完成。该项目于 2022 年 8 月获得了北海岸区域水质控制委员会小型栖息地修复项目的资格，以代替 401 许可证，但 CDFW 不允许根据《栖息地修复增强法》第 1653 条颁发许可证，因为他们认为这些项目有太多岩石，而且更多的是护岸工程而不是鱼类栖息地项目。国家海洋渔业局 (NMFS) 还表示，使用的岩石量超过了他们对区域修复计划生物意见 (PBO) 覆盖的标准。 2023 年 7 月 26 日，在与 CDFW 进行实地会议后，根据 CDFW 的意见制定了该项目的新概念设计，ERRP 寻找一家合格的公司来制作 100% 工程设计。Stillwater Sciences (Stillwater) 被选中开展这项工作。CDFW 还要求对项目失败时大木材 (LW) 可能造成的损害进行风险分析，并创建了 Tenmile Creek 生物工程项目 (319h #D2013114) 大木材风险评估 (Higgins 2023)。生物工程协会负责人 Evan Engber 于 2023 年退休，SWRCB 允许 ERRP 聘请 Native Ecosystems, Inc. 和 Edwards Engineering 进行施工。2023 年水年 12 月和 1 月的洪水导致 Tenmile Creek 河道发生重大变化，包括扩大目标侵蚀河岸地点。项目规模的扩大导致需要增加预算，这将超过 319 小时项目 80 万美元的上限。ERRP 已要求 SWRCB 增加资金，以完成两个 Cahto Creek 站点和 Streeter Creek 站点的规划和建设，同时正在向 CDFW 寻求资金，以支付 Mill Creek 上第四个站点的建设费用。该项目原计划于 2022 年旱季开工，但由于多次延误，目前计划于 2024 年 7 月 15 日至 10 月 15 日开工。
普渡大学停车场地图
ABRV 名称索引 ABRV 名称索引 ABRV 名称索引 ABRV 名称索引 ABRV 名称索引 844S 844 South River Road G12 EHSB 马健康科学大楼 G10 LYLE Lyle-Porter 大厅 F9 RAWL Jerry S. Rawls 大厅 H7 停车场目录 AACC 亚裔美国人资源和文化中心 F5 ELLT Edward C. Elliott 音乐厅 G6 LYNN Charles J. Lynn 兽医学大厅 G9 REC 朗诵大楼 G7 PGG Grant Street 停车场 H7 ABE 农业和生物工程 F8 FLEX Flex 实验室 D8 MACK Guy J. Mackey 竞技场 G4 RHPH Robert E. Heine 药房大楼 G5 PGGH 研究生院停车场 H8 ADDL 动物疾病诊断实验室 F10 FORD Fred And Mary Ford 餐厅 E4 MANN Gerald D. and Edna E. Mann 大厅 E8 SC斯坦利库尔特大厅 G6 PGH 哈里森街停车场 F9 ADPA 探索公园 A 栋 Aspire D7 FORS 林业大楼 G8 MATH 数学科学大楼 G6 SCHL 海伦 B. 施勒曼学生服务大厅 G5 PGMD 麦克库琴大道停车场 C6 ADPB 探索公园 B 栋 Aspire D8 FPRD 林产品大楼 G8 ME 机械工程大楼 G6 SCHO 舒韦大厦 F1 PGNW 西北大道停车场 H5 ADM 农业创新中心 E11 FRNY Forney 化学工程大厅 G5 MJIS 马丁 C. 吉施克生物医学工程大厅 E8 SCPA 斯莱特表演艺术中心 E4 PGU 大学街停车场 F6 AERO 航空科学实验室（机库 3 号） C10 FWLR 哈里特 O. 和詹姆斯 M. 福勒 Jr. 纪念馆 E7 MMDC 材料管理与配送中心 F11 SIML Holleman-Niswonger 模拟器中心 A10 PGW 伍德街停车场 H8 AGAD 农业管理大楼 G8 GMF 场地维护设施 F11 MOLL Mollenkopf 运动中心 F3 SMLY John C. Smalley 住房和食品服务管理中心。 E6 住房目录 AHF 动物饲养设施 G10 GRIS Grissom Hall H6 MRGN Burton D. Morgan 创业中心 E8 SMTH Smith Hall F8 CARY Franklin Levering Cary Quadrangle F4 AQUA Boilermaker 水上运动中心 E6 GRS 场地服务大楼 E8 MRRT Marriott Hall F7 SOIL 土壤侵蚀实验室 E8 DUHM Ophelia Duhme 宿舍楼 E6/7 AR Armory F6 HAAS Felix Haas Hall F6 MSEE 材料与电气工程 G5 SPUR Tom Spurgeon 高尔夫训练中心 C1 ERHT Amelia Earhart 宿舍楼 D7 ARMS Neil Armstrong 工程学大楼 G4 HAMP Delon 和 Elizabeth Hampton 土木工程学大楼 G5 MTHW Matthews Hall F7 STDM Ross-Ade 体育场 F3 FSTC 中央第一街塔 D7 ASB 机场服务大楼 B11 HANS Arthur G. Hansen 生命科学研究大楼 F8 NACC 美洲原住民教育和文化中心 F5 STEW 斯图尔特中心 G7 FSTE 第一街塔，东部 D7 ASTL 动物科学教学实验室 E8 HEAV Heavilon 大厅 G6 NISW Niswonger 航空技术大楼 C10 TEL 电信大楼 F7 FSTW 第一街塔，西部 D7 BALY 拉尔夫和贝蒂贝利大厅 H6 HERL 赫里克声学 E8 NLSN Philip E.纳尔逊食品科学大厅 G8 TERM 航站楼（2 号机库） B11 GRFN 格里芬宿舍北楼 E6 BCC 黑人文化中心 F6 HGRH 园艺温室 G9 NUCL 核工程大楼 H6 TERY 奥利弗·珀金斯·特里之家 E8 GRFS 格里芬宿舍南楼 E6 BCHM 生物化学大楼 F8 HIKS 约翰·W·希克斯本科图书馆 G7 PAO 包玉刚视觉与表演艺术大厅 G8 TREC 草坪娱乐中心 D5 HLTP 山顶公寓 E2/3 BELL 钟楼 G6 HLAB 赫里克实验室 E8 PEST 农药施用者培训设施 C1 UNIV 大学大厅 G7 HARR 本杰明·哈里森宿舍 D7 BIND 宾德利生物科学中心 D8 HNLY 比尔和莎莉·汉利人类发展研究所 E7 PFEN 大卫·C·芬德勒农业大厅 G7 VA1 兽医动物隔离大楼 1 F9 HAWK George A. Hawkins 大厅 G8 BRES Drew & Brittany Bress 学生运动中心 F3 HOCK Hockmeyer 结构生物学大厅 E9 PFSB 物理设施服务大楼 F11 VA2 兽医动物隔离楼 2 F9 HCRN 荣誉学院宿舍楼北 E6 BRK Birck 纳米技术中心 D8 HORT 园艺楼 G8 PHYS 物理楼 G5 VLAB 兽医实验室动物楼 G10 HCRS 荣誉学院宿舍楼南 E6 BRNG Steven C. Beering 人文教育大厅 F7 HOVD Frederick L. Hovde 行政大厅 G5 PJIS Patty Jischke 早期护理和教育中心 C8 VMIF 兽医隔离设施 G10 HILL Hillenbrand 宿舍楼 D6 BRWN Herbert C. Brown 化学实验室 G6 HRTP 园艺公园谷仓 A6 PMU 普渡大学纪念联盟 H7 VOIN Samuel Voinoff高尔夫馆 D1 MCUT John T. Mccutcheon 宿舍 C7 CHAS Chaney-Hale 科学馆 JNSN Helen R. Johnson 护理馆 G5 PMUC 普渡纪念联盟俱乐部 H7 VPRB 兽医病理学研究大楼 F9 MRDH Virginia C. Meredith 宿舍 D/E6 CL50 1950 级演讲厅 G6 KCTR Krannert 高管教育与研究中心 H8 POAN 家禽科学附楼 F8 VPTH 兽医病理学大楼 G9 OWEN Richard Owen 宿舍 E4 COMP 复合材料实验室 C11 KFPC Kozuch 足球表演中心 F2 POTR AA Potter 工程中心 G6 WADE Walter W. Wade 公用事业厂 G10 PVIL 普渡村 C/D8/10 CREC Cordova 休闲运动中心 E5/6 KNOY Maurice G. Knoy 技术馆 H6 POUL 家禽科学大楼 E8 WALC Thomas S. 和 Harvey D. Wilmeth 主动学习中心 G6 SHLY Frances M. Shealy 宿舍 E6/7 DAUC Dick & Sandy Dauch 校友中心 H8 KRAN Krannert 管理研究生院 H7 PRCE Peirce 大厅 G6 WANG Seng Liang Wang 大厅 G5 SHRV Eleanor B. Shreve 宿舍 D6 DLR 发现和学习研究大厅 E9 KRCH Krach 领导力中心 E6 PRSV 印刷服务设施 F11 WDC Windsor 餐饮广场 E6 TARK Newton Booth Tarkington 宿舍 E4/5 DMNT Clayton W. Dement 消防站 D6 LAMB Ward L.Lambert 体育馆和体育馆 F4 PSYC 心理科学大楼 G6 WDCT Wiley Dinning Court E5 VAWT Everett B. Vawter 宿舍 E6/7 DOYL Leo Philip Doyle 实验室 G9 LCCP 普渡大学拉丁裔文化中心 F5 PUSH 普渡大学学生健康中心 F5 WEST Westwood Manor B5 WARN Martha E. 和 Eugene K. Warren 宿舍 E6/7 DRUG 药物研发中心 F8 LILY Lilly 生命科学馆 F8 PVAB 普渡村行政大楼 D9 WSLR Roy L. Whistler 农业研究馆 G8 WILY Harvey W. Wiley 宿舍 E5 EE 电气工程大楼 G5 LSA 生命科学动物大楼 F8 PVCC 普渡村社区中心 C8 WTHR Richard Benbridge Wetherill 化学实验室 G6 WOOD Elizabeth G. 和 William R. Wood 宿舍 E6/7 EEL 昆虫学环境实验室 G8 LSPS生命科学植物与土壤实验室 F8 PVP 普渡村幼儿园 C8 YONG Ernest C. Young 大厅 H8 414R 414R 公寓 F5 EHSA 马健康科学附楼 G10 LSR 生命科学靶场 F8 RAIL 美国铁路大厦 G6 LWSN Richard & Patricia Lawson 计算机科学大厦 F6 RALR Ross-ade 体育场更衣室 F4
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使用上述协议。瑞典印度尼西亚村庄的肖像小企业和企业家，也称为晶体管 mos。随着用户输入的字符逐个字符地出现在所有用户屏幕上，brown 和 woolley 消息发布了基于网络的 talkomatic 版本，通过超链接和 URL 链接。最后，他们确定的所有标准成为了新协议开发的先驱，该协议现在被称为 tcpip 传输控制协议互联网协议，通过超链接和 url 连接。Knnen sich auch die gebhren ndern，dass 文章 vor ort abgeholt werden knnen。