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CRISPR-Cas系统在ESKAPE感染诊断和治疗中的应用
抗生素耐药性ESKAPE（屎肠球菌、金黄色葡萄球菌、肺炎克雷伯菌、鲍曼不动杆菌、铜绿假单胞菌和肠杆菌属）病原菌是对人类健康的全球威胁。ESKAPE病原菌是院内感染中最常见的机会性致病菌，相当一部分临床分离株对常规抗菌治疗不敏感。因此，能够有效对抗ESKAPE病原菌的创新治疗策略将带来巨大的社会效益和经济效益，并减轻成千上万患者的痛苦。在这些策略中，CRISPR（成簇的规律间隔的短回文重复序列）系统由于其高特异性而受到了格外的关注。遗憾的是，目前还没有基于CRISPR系统的直接抗感染治疗方法。本文就CRISPR-Cas系统在ESKAPE病原体研究中的应用进行综述，旨在为理想的新型药物研究提供方向，为解决后抗生素时代多重耐药菌（MDR）引起的一系列问题提供参考，但多数研究距离临床应用还有一定的距离。
CRISPR-Cas，ESKAPE 感染治疗和研究的一场革命：临床前研究
1 微生物科——科鲁尼亚大学医院（CHUAC），15006 拉科鲁尼亚，西班牙； manugo04@gmail.com (MGdA); monica.gonzalez.bardanca@sergas.es (MG-B.)； Melisa.Fernandez-Quejo.Mateos@sergas.es (MF-Q.); german.bou.arevalo@sergas.es (GB) 2 拉科鲁尼亚生物医学研究所 (INIBIC)，拉科鲁尼亚大学 (UDC)，15006 A Coruña，西班牙； luciablasco@gmail.com（LB）； olgapacios776@gmail.com（OP）； bleriot.ines@gmail.com (IB); laugemis@gmail.com (LF-G.)； maria.lopez.diaz@sergas.es (ML) 3 代表西班牙传染病和临床微生物学会（SEIMC）的抗菌药物作用机制和耐药性研究组（GEMARA），28003 马德里，西班牙 4 西班牙传染病研究网络（REIPI），41071 塞维利亚，西班牙 * 通信地址：ma.del.mar.tomas.carmona@sergas.es；电话：+34-9811-763-99 † 同等贡献。
纳米生物学：控制抗生素抗生素埃斯卡普病原体生物膜的先进方法
摘要在肠球菌，金黄色葡萄球菌，肺炎葡萄球菌，肺炎，baumannii，pseudomonas aeruginosa和肠oeruginosa和肠道（Eskape）Microororganisms中伴有重要的World Well Wellign Wellige Well Well Well Well Well Well Well Wellbe， 生物膜的发展，这是一个关键成分，增加了许多微生物的严重程度，会恶化治疗感染的麻烦。 常见的抗生素一次又一次地表现出由于其自然的阻塞成分而消除生物膜的不足。 纳米生物学提供了一种自信的方法来处理在这种特定情况下与生物膜有关的感染。 纳米元素使用纳米技术来制造可以成功打击生物膜耐药机制的创新抗菌物质。 纳米生物可以进入生物膜晶格，破坏细菌交流，并改善抗菌药物向细菌细胞的运输。 这导致了对生物膜改善的可行预期，并消除了先前现有的生物膜。 本章含有纳米素的最新改善，用于控制埃斯卡普感染带来的生物膜的发展，这些感染对抗微生物剂具有抗性。 它还讨论了不同的纳米益生元方法。 此外，审查可以理解纳米生物与常规抗生素或其他治疗剂的组合如何有助于抗菌效率并降低耐药性的风险。生物膜的发展，这是一个关键成分，增加了许多微生物的严重程度，会恶化治疗感染的麻烦。 常见的抗生素一次又一次地表现出由于其自然的阻塞成分而消除生物膜的不足。 纳米生物学提供了一种自信的方法来处理在这种特定情况下与生物膜有关的感染。 纳米元素使用纳米技术来制造可以成功打击生物膜耐药机制的创新抗菌物质。 纳米生物可以进入生物膜晶格，破坏细菌交流，并改善抗菌药物向细菌细胞的运输。 这导致了对生物膜改善的可行预期，并消除了先前现有的生物膜。 本章含有纳米素的最新改善，用于控制埃斯卡普感染带来的生物膜的发展，这些感染对抗微生物剂具有抗性。 它还讨论了不同的纳米益生元方法。 此外，审查可以理解纳米生物与常规抗生素或其他治疗剂的组合如何有助于抗菌效率并降低耐药性的风险。生物膜的发展，这是一个关键成分，增加了许多微生物的严重程度，会恶化治疗感染的麻烦。常见的抗生素一次又一次地表现出由于其自然的阻塞成分而消除生物膜的不足。纳米生物学提供了一种自信的方法来处理在这种特定情况下与生物膜有关的感染。纳米元素使用纳米技术来制造可以成功打击生物膜耐药机制的创新抗菌物质。纳米生物可以进入生物膜晶格，破坏细菌交流，并改善抗菌药物向细菌细胞的运输。这导致了对生物膜改善的可行预期，并消除了先前现有的生物膜。本章含有纳米素的最新改善，用于控制埃斯卡普感染带来的生物膜的发展，这些感染对抗微生物剂具有抗性。它还讨论了不同的纳米益生元方法。此外，审查可以理解纳米生物与常规抗生素或其他治疗剂的组合如何有助于抗菌效率并降低耐药性的风险。此外，本章还讨论了纳米生物学来治疗与生物膜相关的疾病的进步和使用中可能存在的困难和未来途径。
埃斯卡普群体微生物的抗生素耐药性，来自Hermosillo和CiudadObregón，Sonora，México
抗生素耐药性已成为一个公共卫生问题，高发病率和死亡率很高，主要影响新兴经济体的国家（Zhen等，2019）。世界卫生组织（WHO）认为，在2050年，与抗菌抗药性相关的感染（AMR）将导致每年1000万人死亡（Giono-Cerezo等人，2020年）。疾病控制与预防中心（CDC）估计，在美利坚合众国（美国），与抗生素耐药性微生物有关的感染每年至少造成23,000人死亡（Yu-Xuan等人，2020年）。由于AMR细菌引起的感染，健康个人需要使用高毒性抗生素，例如Colistin或上一代抗菌剂的有限列表（Benkő等，2020年）。在2017年2月，该人出版了一份抗生素耐药的微生物清单，为新的抗菌治疗的发展被认为是紧急的。此列表包括来自Eskape组的微生物：粪肠球菌，金黄色葡萄球菌，克雷伯氏菌肺炎，baumannii acinetobacter baumannii，pseudomonas aeruginosa和aeruginosa和intobacter sppter spp（de oliveirira spp（de oliveira et e et an de oliveira et et and.2020）。由于它们的内在和广泛的抗生素耐药性，并且能够获取多种基因赋予它们多药耐药性（Ayobami et al。，2022）。此外，它们也被认为是大多数医疗相关感染（HAI）的原因，特别是对于严重患病和免疫功能低下的患者（Yu-Xuan等，2020; Ayobami et al。，2022）。几项研究表明，患有AMR感染的患者更难以接受适当的治疗方法，使他们能够解决感染，从而使他们能够传播抗菌抗性，但这种情况也必须使这些患者更有可能在ICU中接受，并接受更多的抗生素治疗（Zhen等人，2019年； 2019年； santos-Zont Al。在当地，没有研究或报告评估Eskape组抗菌剂的抗性。在2014年至2015年期间，在Me ́ Xico市的六个卫生机构中对细菌抗性进行了监测研究，其中评估了抗生素耐药性。结果强调了氨苄青霉素/磺胺硫酸氨基氨木的耐药性高分，以及对肺炎链球菌分离株的抗tigecycline的抗性。这项研究还显示出对头孢菌素，酸磷脂，cipro氟沙霉素，阿米卡辛，庆大霉素和毒素分离株中对头孢菌素的敏感性低（Bolado-Martı́nez Nez等，2018）。由于这些先前的结果，重要的是实施包括主动流行病学监测的措施，以获取有关索诺拉卫生机构中埃斯卡普集团微生物的患病率和抵抗力的更多信息。这将允许及时检测Eskape组的微生物，以鉴定其抗生素耐药性纤维，并在每个患者需要的抗生素上使用抗生素抗性。这项研究的目的是分析Eskape群微生物的抗生素耐药性，这些抗生素耐药性是从Hermosillo的11个卫生机构和Ciudad Obrego的11个卫生机构中回收的，在2019 - 2020年期间，我是Me ́ Xico。
Diana Taft -UF/IFAS-佛罗里达大学
抗生素耐药性是一项重大的公共卫生挑战。特别关注的是埃斯卡普病原体，这是6种可以“逃脱”抗生素的生物，一旦抗菌耐药性发展，就缺乏有效的治疗方法。婴儿比成年人可以携带更高水平的抗菌素抗性基因，这使得在婴儿肠道微生物组中鉴定出存在Eskape病原体的存在。新的计算工具（例如MGS2AMR）已使使用元基因组测序方法研究抗性生物的能力。这些计算工具已使婴儿进食实践与肠道微生物组中抗性Eskape病原体的运输之间的关联识别。
项目详细信息项目代码MRCIIAR25EX Harmer头衔开发针对最危险的抗生素抗生素细菌研究主题
项目详细信息项目代码MRCIIAR25EX HARMER头衔开发针对最危险的抗生素抗生素细菌研究主题感染，免疫，抗菌抗性和维修摘要抗菌抗菌耐药性是一个日益严重的社会问题，在2019年造成了约5,000,000,000件死亡，2019年。最高优先细菌是埃斯卡普病原体，其死亡率和发病率占一半以上。该项目将通过在蜡蛾梅洛内拉（Galleria Mellonella）中开发新的体内Eskape病原体感染模型来有助于抵抗抗菌耐药性。这些将用于测试我们的新型化合物，使细菌更容易受到常规抗生素的影响并促进化合物的进一步发展。该项目将加速我们的化合物的开发，并为抗菌发现提供新的体内模型。描述所谓的“ Eskape病原体”（肠杆菌，金黄色葡萄球菌，肺炎克雷伯氏菌，baumannii acinetobacter baumannii，Pseudomonas铜绿假单胞菌，铜绿和粪肠球菌）是最严重的严重的抗抗菌抗菌抗抗抗菌剂。在2019年，据估计，全世界有超过3,000,000人死亡与这些细菌的抗菌素抗性菌株有关。如果没有新的治疗选择，可能会继续增加死亡人数，并可能使某些现有的医疗程序不可行。提出的一种方法是开发增强的药物，以削弱特定细菌的辅助功能，使它们更容易受到常规抗生素的影响。这些在药物发现的铅开发/铅优化阶段，需要在整个生物体中证明这种方法的有效性。对于学术项目而言，情况尤其如此，因为如果没有这些概念证明数据，这种药物开发将无法提供资金。模型有机体Galleria Mellonella已被用作感染的模型。Galleria幼虫很便宜，容易饲养，并在鼠标中复制结果。急性感染和慢性感染都可以建模，并且可以通过预防和感染后进行治疗。埃克塞特大学的Galleria Mellonella研究中心已经开创了Galleria的基因工程。重要的是，这提供了对荧光标记的幼虫的访问。将它们与细菌的标记结合在一起，可以通过成像流式细胞仪的幼虫血液抑制仪高效地检测感染进展。但是，这仅证明了少数细菌的感染。我们开发了抑制巨噬细胞感染增强剂（MIP）蛋白的化合物，几乎所有感染细菌都发现。我们的化合物显着增强了针对肺炎克雷伯氏菌的小鼠的护理抗生素标准。他们对许多细菌表现出强大的有效性（例如baumannii a acinetobacter，Neisseria Gonorrhoeae，Burkholderia pseudomallei）在基于细胞的模型中。我们希望这些化合物将对所有Eskape病原体显示出与护理标准的共同治疗的有效性。
研究产生抗菌素的微生物。......
随着越来越多的抗菌素耐药性被发现，全世界对新型抗菌素的需求正变得越来越迫切。为此，我们使用 Tiny Earth 模型从明尼苏达州湿地的土壤样本中识别、分离和鉴定潜在的新型抗菌素来源。Tiny Earth 项目是一个学生采购抗菌素发现社区，致力于发现潜在的新型抗菌素。该项目由明尼苏达州资源立法公民委员会 (LCCMR) 提供资金支持。当前的研究项目比较了三个连续学期的普通微生物学 (2021 年秋季、2022 年秋季和 2023 年秋季) 的结果。使用的培养基如下：营养物、10% 胰蛋白酶大豆、放线菌和甘油酵母提取物 (gyea)。以下被用作 ESKAPE 安全相关病原体：肠球菌、金黄色葡萄球菌、大肠杆菌、贝氏不动杆菌、恶臭假单胞菌和产气克雷伯氏菌。化学提取包括在琼脂平板上培养分离物，并使用乙酸乙酯提取要针对 ESKAPE 安全相关病原体进行测试的物质。该过程产生了从 2021 年秋季回收的 58 个分离物，其中 43 个分离物被发现是纯净的，其中 13 个对 ESKAPE 病原体表现出持续抑制作用。从 2022 年秋季样本中，有 34 个分离物表现出持续抑制作用，并且正在不断努力分离纯培养物。最后，在本秋季学期，我们初步回收了 75 种分离物，这些分离物显示出对安全相关病原体的抑制作用。我们将介绍正在进行的分离纯培养物和表征与观察到的抑制作用相关的化学物质的研究。我们还将介绍在该项目过程中获得的经验教训以及与湿地环境相关的未来药物发现机会。
铜绿假单胞菌型III分泌系统对免疫反应的调节
铜绿假单胞菌是一种革兰氏阴性细菌，引起免疫功能低下个体的感染。该病原体是Eskape病原体之一（包括粪肠球菌，金黄色葡萄球菌，克雷伯氏菌肺炎，baumanii，p.eruginosa，p.eruginosa，肠杆菌，肠杆菌，肠杆菌。），构成威胁生命的医院细菌（Hirsch和Tam，2010； Mulani等，2019）。铜绿假单胞菌还感染患有特定病理的患者，例如囊性纤维化（CF）。由于其形成生物膜的能力，铜绿假单胞菌通常会长期感染CF患者，并代表该疾病的负面结果（Malhotra等，2019）。为了成功地在宿主中建立自己，铜绿假单胞菌部署了一系列毒力因子，包括毒素，铁载体，粘附素和分泌系统（请参阅GONCgonçAlves-alves-de-albuquerque等人的评论，2016; Qin等，2022）。后者允许运输
药物微生物组和细菌活生物治疗联合体的生产
微生物组调节的方式 传统的药物开发通常首先将颠覆性技术（如干细胞）视为工具和目标 [4] ，随后仅在风险足够低的情况下将其用作治疗方法。这种模式正在微生物组中出现。药物可以影响胃肠道微生物组，反之亦然 [5–8] 。抗感染药物已用于治疗微生物疾病几代，然而，目前的知识认识到广谱抗生素可导致微生物组的改变，从而增加对病原体的易感性 [4,9] ，包括耐药性（屎肠球菌、金黄色葡萄球菌、肺炎克雷伯菌、鲍曼不动杆菌、铜绿假单胞菌和肠杆菌属）“ESKAPE”病原体的定植 [10] 或促进炎症性疾病 [11] 。窄谱抗生素可能会不影响微生物群，针对特定的病原体 [12]，但其可行性在开发和临床部署方面受到挑战。
Scientific Program.pdf
关于重症监护的研讨会III- MDR病原体和治疗措施中的创新 - 新方法椅子：Girish Agrawal，Avni Joshi，Avni Joshi（美国），SzymonSkoczyński（波兰），Mayank Saxena，Mayank Saxena，Mayank Saxena在ICU中了解MDR：ICU的MDR：ICU的机制：抵抗和创新的策略和创新策略和控制策略和控制策略和控制策略。（中校）Kunal Kumar（13+2分钟）解决了抗菌抗菌Eskape病原体的挑战：有效治疗的策略。Mansi Gupta（13+2分钟）Ceragenins（CSA）对MDR革兰氏阴性病原体的潜力。Pawan Kumar Singh（13+2分钟）对抗感染的创新治疗方法：抗生素组合，抗菌肽，纳米颗粒，噬菌体治疗和天然产物。vivek nangia（13+2分钟）新的治疗靶标：酪蛋白水解蛋白（CLP）和生物膜 - 新方法和策略。prejeesh balan（13+2分钟）重新利用抗抑郁药：抗菌特性和与抗抗性病原体抗生素的协同作用。（13+2分钟）