XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search SystemEditing
基因组编辑 - isdRA2TNPB -Kamaraj IAS Academy
增加农作物对环境压力的韧性：ISDRA2TNPB可能有助于创建更短的稻作作物，而稻草在旋风中较不容易受到损害，这是易受旋风分离的地区的常见问题。基因组是生物体中的完整遗传信息集，它存储在称为染色体的DNA分子中。它包括将RNA和蛋白质编码的基因，其真核生物在核中包含其基因组和原核生物中的基因。
通过潮汐和TIDE对CRISPR基因组编辑的快速定量评估
当前的基因组编辑工具使许多物种中选定的DNA序列的靶向诱变。但是，通过基因组编辑方法引入突变的效率和类型在很大程度上取决于目标位点。因此，很难预测编辑操作的结果。因此，量化突变频率的快速测定对于正确评估基因组编辑作用至关重要。我们开发了两种快速，具有成本效益且容易适用的方法：（1）潮汐，可以准确识别和量化插入和删除（indels），这些插入和删除（indels）在引入双链断裂后出现的（dsbs）； （2）Tider，适用于模板介导的编辑事件，包括点突变。这两种方法仅需要一组PCR反应和标准的Sanger测序运行。通过潮汐或TIDE算法分析序列轨迹（可在https://tide.nki.nl或https://deskgen.com上获得）。例程很容易，快速，并且提供了比当前基于酶的测定更详细的信息。潮汐和TIDE加速基于DSB的基因组编辑策略的测试和设计。
患者IPSC中的基因组编辑纠正了最普遍的USH2A突变，并揭示了有趣的突变mRNA表达曲线
遗传性视网膜营养不良（IRD）的特征是进行性光感受器变性和视力丧失。Usher综合征（USH）是一种综合征IRD，其特征是色素性视网膜炎（RP）和听力损失。USH在临床和基因上是异质的，最普遍的病因基因是USH2A。USH2A突变还解释了大量孤立的常染色体隐性RP（ARRP）病例。这种高预期是由于两个经常性的USH2A突变引起的，C.2276G> T和C.2299delg。由于USH2A cDNA的大尺寸，基因增强疗法是无法访问的。但是，CRISPR/CAS9介导的基因组编辑是可行的替代方法。我们使用了增强的链球菌链球菌（ESPCAS9）的特异性CAS9来成功实现诱导多能干细胞（IPSC）患者的两个最普遍的USH2A突变的无缝校正。我们的结果强调了促进ESPCAS9的高目标效率和特种型的功能。一致地，我们没有在校正后的IPSC中识别出任何非靶诱变，这些诱变也保留了多能性和遗传稳定性。此外，对USH2A表达的分析出乎意料地识别了与C.2276G> T和C.229999delg突变相关的异常mRNA水平，这些突变在校正后恢复。综上所述，我们有效的CRISPR/CAS9介导的USH2A突变校正策略为USH和ARRP患者提供了潜在治疗的希望。
crispr/cas9介导的基因编辑
简介评论：引言有效地介绍了CRISPR/CAS9系统的历史背景，从而将其从Escherichia Coli的发现成为其作为基因编辑工具的发展。Jennifer Doudna和Emmanuelle Charpentier的贡献得到了充分的详细说明，强调了他们独立的研究工作和最终的合作。CRISPR机制的解释是彻底的，涵盖了关键组成部分，例如Cas9蛋白，引导RNA，tracrrna和crrna。基因编辑过程的分步分解，包括DNA裂解，序列靶向和基因剪接，为理解系统的功能提供了强大的基础。提及PAM序列及其在特异性中的作用可确保在解释目标位点选择方面的清晰度。
主要编辑现成（OT）产品
Prime Editing（PE）系统最少由两个组件组成：可编程DNA Nickase融合到工程逆转录酶和PEGRNA。Genscript核酸部门提供合成的Pegrna服务；以下是阳性对照pegrna（Kiok16＆kiok17）和其他附件（OTS）产品：
通过模型植物Physcomitrium（Physcomitrella）Patens
crispr-cas9对于包括模型植物Phantcomitrium patens在内的植物中的基因组编辑非常有价值。然而，使用天然Cas9核酸酶进行的大多数编辑事件对应于小插入和缺失，这一事实是一个限制。CRISPR-CAS9碱基编辑器使真核基因组中的单核苷酸的靶向突变，因此克服了这一限制。在这里，我们报告了两个可编程基础编辑系统，以在p中诱导精确的胞嘧啶或腺嘌呤转化。patens。使用胞嘧啶或腺嘌呤碱基编辑器，可以使用高达55％的效率来实现位点特异性的单基碱基突变，而无需脱离靶向突变。使用APT基因作为编辑的记者，我们可以证明两个基本编辑器都可以在单纯形或多重编辑中使用，从而可以生产具有多种氨基酸变化的蛋白质变体。最后，我们设置了一个共同编辑的选择系统，命名为APRT的修改以报告基因靶向（SMART），最多可在p中进行效率高达90％的效率位点基础编辑。patens。这两个基本编辑者将促进p中的基因功能分析。patens，可以通过单个SGRNA碱基编辑或使用多个SGRNA碱基编辑来生产随机诱变的变体来通过单个SGRNA碱基编辑或用于给定基因的植物学演化进行定位编辑。
ICAR-IVRI启动基因组编辑技术培训计划
IVRI主任Triveni Dutt博士对该研究所对兽医研究的重要贡献提供了见解。 主任IVRI强调了IVRI在兽医研究中的遗产，并强调了其在疫苗和诊断的开发中的贡献。 他讨论了基因组编辑在推进牲畜特征和疫苗开发中的重要性，并强调了这些技术在兽医领域的变革潜力。 他祝贺整个NP Get团队为年轻的大脑组织培训研讨会。IVRI主任Triveni Dutt博士对该研究所对兽医研究的重要贡献提供了见解。主任IVRI强调了IVRI在兽医研究中的遗产，并强调了其在疫苗和诊断的开发中的贡献。他讨论了基因组编辑在推进牲畜特征和疫苗开发中的重要性，并强调了这些技术在兽医领域的变革潜力。他祝贺整个NP Get团队为年轻的大脑组织培训研讨会。
可变剪接、RNA 编辑和下一代测序的当前限制
摘要：下一代测序 (NGS) 的出现促进了不同病理学中基因表达分析的基本分析策略的转变，这些分析可用于研究、药理学和个性化医疗。从基因表达阵列时代开始，曾经高度集中于单个信号通路或通路成员的研究已经变成了对基因表达的全局分析，有助于识别新的通路相互作用、发现新的治疗靶点以及建立疾病相关性图谱以评估进展、分层或治疗反应。但是，这种分析存在一些重大缺陷，无法构建完整的图景。由于缺乏对公共数据库的及时更新以及科学数据“随意”地存放到这些数据库中，大量可能重要的数据被归为“垃圾”，这不禁让人想问：“我们到底错过了多少？”这个简短的观点旨在强调 RNA 结合/修饰蛋白和 RNA 处理对我们当前使用 NGS 技术治疗癌症所带来的一些限制，以及不充分认识到当前 NGS 技术的局限性可能会对长期治疗策略产生负面影响。