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伊迪丝：河网络中环境DNA的模型运输
描述运行伊迪丝（Edith）（环境DNA整合传输和水文学）模型，该模型在河网尺度上实现了环境DNA（EDNA）运输的质量平衡，并与物种分布模型相结合以获得物种分布的地图。Edith可以与EDNA浓度（例如，通过定量聚合酶链反应获得）或元法编码（读取计数）数据一起使用。参数估计可以通过贝叶斯技术（通过'Bayesiantools'软件包）或优化算法执行。提供了“ DHARMA”软件包的接口，用于后验预测检查。参见Carraro和Altermatt（2024）有关包装简介； Carraro等。（2018）和Carraro等。（2020）用于方法论细节。
房间099，精确科学Exwi，Sidlersstrasse 5 ...
34 Rozanski Romane EthZürich苏黎世的季节性动态埃德纳（Edna）揭示的地中海鱼类社区：跨深度和海洋储备边界的对比鲜明的作品
DNA对粪便样品的DNA metabarcoding用于评估牧场土地中无脊椎动物群落
监测粪便社区的传统方法是劳动和专业知识密集的，并且通常效率低下。最近，非侵入性环境DNA（EDNA）元法编码已被试用，用于粪便相关无脊椎动物的生物监测（Sigsgaard等。，2021年）。结果是有希望的，有几个官能团，并且生态关联很明显。在这里，我们使用类似的EDNA技术进行了一个小型试点项目，以评估使用牲畜粪便样品监测英国牧场的粪甲虫和更广泛的无脊椎动物社区。该项目的成功可以证明粪便无脊椎动物DNA调查的倾向，以监测土壤管理实践和再生耕作的影响，从而导致土壤生物多样性增加。
将环境DNA用于种群遗传学的机会和固有的局限性
fi g u r e 2合成17项研究，报告组织样品与其他类型的样品（EDNA，散装，粪便或乙醇样品）之间的直接比较，用于研究种内多样性。（a）用组织样品鉴定的单倍型数量是用EDNA和其他类型的样品检测到的单倍型数量的函数。两个变量都是对数转换的。DOT表示在现场进行的比较，而三角形则用于在受控实验室环境中进行比较。虚线和虚线分别表示场（y = 1.247x -0.125）和实验室（y = 0.776 x + 0.836）研究的线性回归。灰线表示1：1相关性。（b）仅在其他类型的样品中仅在组织样品中鉴定出的单倍型的比例，或在目标研究中使用的两种样品类型中常见。
将环境DNA与遥感变量相结合，以绘制沿着大河的鱼类分布
河流生态系统中的生物多样性丧失速度要比限制系统更快，更严重，并且需要空间保护和恢复计划来停止这种侵蚀。关于生物多样性和物种分布的状态和变化的可靠且高度解决的数据对于有效措施至关重要。的高分辨率图仍然有限。与全球卫星传感器的耦合数据具有广泛的环境DNA（EDNA）和机器学习可以实现河流生物分布的快速而精确的映射。在这里，我们研究了使用沿瑞士和法国Rhone River的110个地点的埃德纳数据集组合这些方法的潜力。使用Sentinel 2和Landsat 8图像，我们产生了一组生态变量，描述了河走廊周围的水生栖息地和陆地栖息地。我们将这些变量与基于EDNA的存在和29种鱼类的不存在数据相结合，并使用了三种机器学习模型来评估这些物种的环境适用性。大多数模型表现出良好的性能，表明从遥感中得出的生态变量可以近似鱼类分布的生态决定因素，但是水衍生的变量比河流周围的陆地变量具有更强的关联。物种范围的映射表明该物种沿着瑞士的物种占用物的显着转移，从其瑞士阿尔卑斯山的来源到法国南部的地中海出口。我们的研究消除了将遥感和EDNA结合到大河中物种分布的可行性。该方法可以扩展到任何大河以支持保护方案。
MICHAEL J. WOLK，60 岁，医学博士，医学教育会议
Edna K. Akoto '05，医学博士，FAAP Edna Akoto 博士出生并成长于加纳库马西，11 岁时移民美国。她的其余童年时光是在纽约市布朗克斯度过的。在高露洁完成大学学业后，Akoto 在纽约市立大学城市学院完成了学士后课程。她于 2011 年毕业于阿尔伯特爱因斯坦医学院，随后在纽约长老会哥伦比亚大学接受了儿科住院医师培训。在住院医师培训后的几年里，Akoto 最初在纽约市上西区的一家社区卫生中心工作，后来在布朗克斯金斯布里奇社区的一家小型私人诊所工作。Akoto 目前为蒙蒂菲奥里医疗中心的学校健康项目工作，为不同学校环境中的学生提供紧急和儿童保健服务。她热衷于与少数民族、无保险和服务不足社区的家庭一起工作并照顾他们。
沉积物中环境DNA的生存：DNA Taphonomy的矿物学控制
从沉积物中提取环境DNA（EDNA）正在提供过去的生态系统和生物多样性的开创性观点。尽管有丰富的信息来源，但仍不清楚哪种沉积物有利于保存以及原因。在这里，我们使用原子力显微镜和分子动力学模拟来探索DNA-矿物质相互作用，以评估矿物学和界面地球化学如何在矿物底物上保护环境DNA中发挥作用。我们证明矿物组成，表面形貌和表面电荷会影响DNA吸附行为以及保存。建模和实验数据表明，如果存在强大的吸附驱动力，则可以通过矿物结合诱导DNA损伤。研究表明，对沉积物的矿物质组成的了解和环境条件对于评估沉积物是否能够存储细胞外DNA以及在多大程度上保留DNA。我们的数据增加了对Edna Taphonomy的理解，并强调了，对于某些矿物系统而言，碎片的DNA可能不代表旧的DNA。
Farnesyl转移酶KO-2806将复发性肿瘤重新敏感为RAS抑制
这项研究采用纳米颗粒亲和力珠技术来分离石油的DNA。研究确定了来自石油提取物（PDNA）的3,159,020个DNA序列，主要来自环境DNA（EDNA）。这项研究表明，石油如何通过与周围环境的分子交流捕获大量的埃德纳，包括古代（paedna）和更近代的碎片（predna）。建立了一种学术上严格的“大型筛查方法”来识别这些碎片，揭示了最原始的原位DNA（Oridna）的显着损失。有趣的是，Paedna的持久性提供了超过传统化石的宝贵生态和进化见解。石油被认为是新发现的化石，它通过发现海洋物种，祖先鸟类和未分类的古代人类种类的古老存在，揭示了地球的隐藏历史。此外，该研究还阐明了当地灭绝的动物的轨道，包括牛，火鸡和猕猴桃鸟。值得注意的是，这些古老的DNA（ADNA）片段不显示
使用环境DNA估计急性除草剂污染过程中的快速多样性变化
摘要全球淡水生态系统的生物多样性由于各种人为压力源（例如栖息地降解，入侵物种的引入和污染）而面临严重威胁。评估人类引起的环境压力源对人群和社区持久性的影响需要准确的生物多样性估计。虽然环境DNA（EDNA）的质量编码已成为一种有前途的工具，但其在捕获生物组织（社区，人口和特异性水平）跨生物多样性响应中的有效性仍有待研究。在这项研究中，我们通过对基于草甘膦除草剂除草剂除草剂除草剂脉冲进行对比的养分水平（孕育和雌激素）进行了两个月的中核实验，测试了EDNA Metabarcoding在评估水生浮游动物和昆虫群落快速变化方面的疗效。我们检查了治疗对社区组合，家庭丰富性和种内多样性的影响，并将我们的发现与通过显微镜方法获得的结果进行了比较。元编码揭示了与显微镜的部分一致的生态发现，表明其在评估社区快速变化方面的潜力。除草剂引起的社区组成的转变以及差异影响的浮游动物和昆虫家族的丰富度（昆虫的增加，以及甲壳动物和旋转器的减少），这表明对类群中除草剂的宽容梯度以及昆虫幼虫的潜在自上而下的调节，这可能抵消了昆虫的优势。最后，我们表明养分富集加剧了除草剂对种内多样性的负面影响，从而突出了人们对遗传培养的关注。我们的发现强调了淡水生态系统中对除草剂和营养富集的反应的复杂性。我们得出的结论是，Edna Metabarcoding不仅可以用来估计无脊椎动物群落的快速变化，而且还可以通过对生物组织不同规模的多样性动态和潜在的级联效应提供更广泛的观点来获得额外的价值。
研究设施2024/25
专门研究长阅读的测序和表观遗传分析，我们使用牛津纳米孔技术，从多功能小兵到高通量的Promethion 24，在基因组组装中提供高分辨率，EDNA以及DNA甲基化研究。我们的设施也使用Bionano的Saphyr平台在结构变化检测中表现出色，从而发现全基因组的洞察力对复杂的遗传结构。