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解旋酶辅助连续编辑用于内源基因组的可编程诱变
人类基因组学面临的一个主要挑战是破译序列与功能之间的特定关系。然而，现有的用于在原生基因组背景下进行位点特异性超突变和进化的工具有限。在这里，我们提出了一种用于长距离、位点特异性超突变的新型可编程平台，称为解旋酶辅助连续编辑 (HACE)。HACE 利用 CRISPR-Cas9 来靶向进行性解旋酶-脱氨酶融合，该融合会在较大的 (>1000 bp) 基因组间隔内引起突变。我们应用 HACE 来识别 MEK1 中导致激酶抑制剂抗性的突变，剖析 SF3B1 依赖性错误剪接中各个变体的影响，并评估 CD69 刺激依赖性免疫增强剂中的非编码变体。HACE 提供了一种强大的工具，可用于研究编码和非编码变体、揭示组合序列与功能的关系以及发展新的生物功能。
在能量系统优化中应用内源性学习模型
摘要：基于化石燃料的常规能源生产会导致造成全球变暖的排放。对于零排放能源系统的成本优势过渡需要准确的能源系统模型，这是一项努力，需要通过技术学习效应进行有条理地建模成本降低。在这篇综述中，我们总结了通过学习曲线对技术学习建模和相关成本降低的共同方法。接下来是一项文献调查，以发现对未来能源系统建模所需的相关低碳技术的学习率。重点是（i）在氢生产技术中学习效应以及（ii）内源性学习在能量系统模型中的应用。最后，我们讨论了典型学习曲线和可能的补救措施的方法论缺陷。我们的主要结果之一是可以在能源系统模型中应用的学习率的最新概述。
内源性阿片受体和不良适应性喂养的盛宴或饥荒
在过去的几十年中，研究已经揭示了内源性阿片受体（EOR）在神经回路和喂养中的作用，包括在食物过度或不足食物的州中如何出现此类电路。食物过量或不足食物，虽然并非总是表明不良适应性喂养状态，但在极端时，可以分别导致饮食诱发的肥胖症或神经性厌食症（AN）。肥胖增强了基底神经节中的兴奋性传播，反映了暴露于滥用药物的影响，并被认为最终可以重塑食物的感知价值1-3。食物的价值也偏向4 - 8，基于活性的厌食症（ABA）的小鼠模型揭示了整个大脑的结构和功能适应性9 - 13。这意味着涉及喂养不良适应性喂养状态的脑电路的持续功能障碍，尽管这些电路是如何异常限制的，并且在肥胖和正在进行中正在进行的研究中，这种偏见的相反条件与近距离相反的条件之间的这种变化在多大程度上重叠。我们在这篇综述中的目标是概述围绕健康条件下喂养的EOR调节的经过充分研究的现象，并强调与肥胖症中的EOR功能障碍有关的正在进行的研究领域。我们将探索动物模型和人类研究，并形成关于eors在肥胖症和肥胖症中的作用的假设，强调需要在何处进行其他研究以及领域的潜在未来方向。在这篇叙述性评论中，我们假设eors在与肥胖症和AN有关的大脑区域中高度表达，人类神经影像学研究表明，在肥胖或14-19的个体中，Eors差异表达和/或证明了变化的转移。
西班牙缅甸猫因 Prototheca 微藻引起的内源性眼内炎
靶标 引物/探针 序列 5′ → 3′ 参考 18S rDNA SSUF1 AACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTC ( 1 ) SSUR1 TGATCCTTCTGCAGGTTCACCTACG 28S rDNA 28SF1 AAGCATATCAATAAGCGGAGG ( 2 ) 635 GGTCCGTGTTTCAAGACGG 细胞色素 B cytB_F1 GYGTWGAACAYATTATGAGAG ( 3 ) cytB_R2 WACCCATAARAARTACCATTCWGG 附表 2. 18S rDNA 核糖体亚基、28S rDNA 核糖体亚基 D1/D2 区和部分细胞色素 B 基因的序列分析。使用基本局部比对搜索工具 (BLAST) 查询 NCBI 数据库（访问于 2024 年 7 月）
内源性自身肽保护中枢神经系统的免疫特权
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在表达 SOX2 的细胞中检测到古代人类内源性逆转录病毒的运动
摘要 人类内源性逆转录病毒 (HERV) 约占人类基因组的 8%。HERV 在早期胚胎中转录，在体细胞中表观遗传沉默，病理条件下除外。HERV-K 被认为可以保护胚胎免受外源性病毒感染。然而，体细胞中不受控制的 HERV-K 表达与多种疾病有关。在这里，我们表明 SOX2 对 HERV-K LTR5H 至关重要，它在维持干细胞多能性方面起着关键作用。在没有 Env 表达的情况下，HERV-K 在生产细胞内进行逆转录转座。此外，我们在表达 SOX2 的诱导多能干细胞的长期培养中发现了新的 HERV-K 整合位点。这些结果表明，HERV-K 对 SOX2 的严格依赖使得 HERV-K 能够在进化过程中保护早期胚胎，同时限制 HERV-K 逆转座对这些早期胚胎中宿主基因组完整性的潜在有害影响。
调节血管发育和二次生长的内源性和环境信号
弹性植物的生长取决于分生组织的功能，包括芽顶分生组织（SAM），根尖分生组织（RAM）和侧向分生组织。血管形成是侧向分生组织，负责径向轴处的二次生长和茎膨胀。血管形成库的干细胞增殖，而后代分化为木质部和韧皮部细胞。每个径向细胞文件都有一个双种族干细胞，该干细胞同时产生木质部和韧皮部细胞谱系（Shi等，2019； Smetana等，2019）。确实成菌的干细胞和未分化的木质部和韧皮部祖细胞形成一个形糖化区域，通常用作形糖化活性的指标（图1A）。顶端分生组织和血管分生组织在空间上分离。这些分生组织之间的协调生长是通过移动信号（例如激素，肽和机械提示）介导的（Fischer等，2019）。环境因素在调整二次增长方面也起着重要作用。二级增长是一种进化创新，可为更大，更复杂的植物体提供足够的机械支持和有效的长距离流体传输（Tonn and Greb，2017）。此外，二级生长还会产生大量的木质生物量，顽固形式的碳形式，可以通过将大气碳固定在存储中，从而有可能减轻全球变暖。主要的血管发育是在胚胎发生期间早期建立的（Miyashima等，2013）。前尾首字母开始在全球阶段分裂，形成类似于胚胎后根血管的径向模式（Rodriguez-Villalon等，2014）。在最近的几篇优秀评论论文中讨论了调节原发血管发育的信号传导途径（Fischer和Teichmann，2017年； Tonn和Greb，2017; Wang，2020; Turley and Etchells，2022; Wang等，2023）。本文主要关注调节植物血管确实活性和继发生长的进步。
毕利酶介导的生物发生，富含丝氨酸的内源性肽的膨胀家族
hal是一个多学科的开放访问档案，用于存款和传播科学研究文件，无论它们是否已发表。这些文件可能来自法国或国外的教学和研究机构，也可能来自公共或私人研究中心。
招募内源性和外源性ADAR酶进行位点特异性RNA编辑的方法
作用于 RNA 的腺苷脱氨酶 (ADAR) 可以重新用于实现位点特异性的 A-to-I RNA 编辑，方法是通过 ADAR 招募向导 RNA (adRNA) 将它们招募到感兴趣的靶标上。在本章中，我们详细介绍了通过两种正交策略实现此目的的实验方法：一是通过招募内源性 ADAR（即已经在细胞中天然表达的 ADAR）；二是通过招募外源性 ADAR（即将 ADAR 递送到细胞中）。对于前者，我们描述了使用环状 adRNA 将内源性 ADAR 招募到所需的 mRNA 靶标上。这可在体外和体内实现稳健、持久且高度转录特异性的编辑。对于后者，我们描述了使用 split-ADAR2 系统，该系统允许过度表达 ADAR2 变体，可用于以高特异性编辑腺苷，包括难以编辑非优选基序中的腺苷，例如 5′ 鸟苷两侧的腺苷。我们预计所述方法应促进研究和生物技术环境中的 RNA 编辑应用。
DIETERpy：内生可再生能源调度与投资评估工具的 Python 框架
DIETER 是一个开源电力部门模型，旨在分析未来可再生能源占比非常高的情况。它最大限度地降低了总体系统成本，包括各种发电的固定成本和可变成本、灵活性和部门耦合选项。在这里，我们介绍了 DIETERpy，它基于现有的模型版本，用通用代数建模系统 (GAMS) 编写，并使用 Python 框架对其进行了增强。这将 Python 在数据预处理和后处理方面的灵活性与 GAMS 中简单的代数公式和高效求解器的使用相结合。DIETERpy 还提供了基于浏览器的图形用户界面。新框架旨在易于访问，因为它使用户能够运行模型、更改其配置并定义许多场景，而无需深入了解 GAMS。代码、数据和手册在公共存储库中提供，并根据许可提供透明度和可重复性。© 2021 作者。由 Elsevier BV 出版 这是一篇根据 CC BY 许可 ( http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ ) 开放获取的文章。