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将策略与工程的“骨化中心”器官分开
Xianzhu Zhang 1, 2, 3 # , Wei Jiang 3, 4 # , Xinyu Wu 1, 2, 3 # , Chang Xie 1, 2, 3 , Yi Zhang 1, 3 , Yuqing Gu 1, 2, 3 , Zihao Hu 1, 3 , Liying Li 1, 2, 3 , Renjie Liang 1, 2, 3 , Tao Zhang 2, 3 , Wei Sun 1, 2, 3 , Jingchun Ye 2, 3 , Wei Wei 3, 5 , Xiaozhao Wang 1, 2, 3 , Yi Hong 1, 2, 3 , Shufang Zhang 2, 3 , Youzhi Cai 1, 3 , Xiaohui Zou 1, 3 , Yihe Hu 1 , Hongwei Ouyang 1, 2, 3,
工程细菌启动并控制溶瘤病毒
Zakary S. S. Singer 1,2，＆，JonathanPabón1，＆，Hsinyen Huang 1，William Sun 1，William Sun 1，Hongsheng Luo 1，Kailyn Rhyah 2 Grant 1，Ijeoma Obi 1，Ijeoma obi 1，Courtney Coker 1，Courtney Coker 1，Charles M Rice 2，Charles M Rice 2，Tal Danino 1,3,4，Tal Danino 1,3,4，* 3 4 4 1 1002 York new York new York new Yar. new Year new Year new Year new Year new Year new Year new Yar.5 2病毒学和传染病实验室，洛克菲勒大学，纽约，纽约，纽约，10065，美国。6 3美国纽约哥伦比亚大学赫伯特·欧文综合癌症中心，美国纽约，10032，美国。7 4数据科学研究所，哥伦比亚大学，纽约，纽约，10027，美国。8 9＆这些作者同样贡献了10 *通讯作者，tal.danino@columbia.edu 11 12摘要。细菌和病毒在肿瘤中有选择性复制的能力已导致合成工程13
基因设计的土壤微生物：风险和关注
ge土壤微生物已经用于数百万英亩的美国农田，而没有足够的安全评估或法规。健康的土壤中充满了数十亿个微生物，包括细菌，真菌和原生动物。这些生物会调节全球碳和氮气周期，建立土壤结构，为害虫和疾病提供免疫力，并在土壤中解锁养分，因此农作物可以繁衍生息。在构成活土壤的数十亿种微生物中，土壤微生物组在农业E和气候中起着至关重要的作用。健康的土壤中挤满了小小的活微生物的bil狮，包括bacte ria，真菌和原生动物。这些有机体调节全球碳和氮气周期，Bui LD土壤结构，可为害虫和疾病提供免疫力，并在土壤中解锁养分，因此C rops可以繁衍生息。
工程干细胞抗体配对逃避1（...
我们的主要抗 CD117 mAb mAb-7 与未编辑的 HSPC 具有高亲和力，但与 CD117 编辑的细胞不结合（图 4）。mAb-7 与 CD117 结合可阻断 SCF-CD117 相互作用（图 4），从而选择性抑制未编辑 HSPC 的存活（图 5、6）。体外用 mAb-7 处理 HSPC 导致未编辑 HSPC 活力降低 85% 以上，而 CD117 编辑的细胞不受影响（图 5、6）。由于 CD117 信号传导与肥大细胞脱颗粒有关，我们评估了天然和 Fc 工程化版本的 mAb-7 对体外培养分化的肥大细胞的影响。Fc 工程化版本的 mAb-7 在体外不会导致任何程度的肥大细胞脱颗粒（图 6）。我们在体外比较了我们修饰的 CD117 与野生型 CD117 的磷酸化（图 7）。我们的 CD117 变体蛋白正常与 SCF 结合，在 SCF 结合后经历了相似水平的磷酸化（与 WT 蛋白相比）。我们在 HSPC 中实现了约 80% 的双等位基因 CD117 编辑和近乎完全的 HBG1/2 基因座编辑（图 8）。在异种移植研究中，我们观察到 CD117 编辑的 HSPC 能够在免疫功能低下的小鼠中进行长期多谱系造血植入（图 9）。重要的是，mAb-7 治疗导致仅使用未编辑的人类 CD34+ 细胞人源化的小鼠的人类嵌合体以及骨髓 CD34+ 细胞频率显着降低。有趣的是，在接受编辑：未编辑混合物的小鼠中，mAb-7 导致 CD117 编辑细胞在整个骨髓和 CD34+ 细胞区室中富集，这由这些区室中的高编辑水平表明（图 10）。
工程二氧化碳去除：可扩展性和耐用性
实现净零排放需要经济各个部门进行大规模变革，推动这一转变的努力正在加大。过去几年中，通过“气候创新 2050”计划，气候与能源解决方案中心 (C2ES) 与不同部门的领先公司密切合作，研究到 2050 年实现美国经济脱碳的挑战和解决方案。正如我们在《迈向零排放：美国气候议程》中所述，实现净零排放需要大规模变革，但也需要我们解决一些独立且紧迫的挑战。为了让政策制定者了解这些近期和长期问题，C2ES 发布了一系列“近距离观察”简报，以探讨脱碳挑战的重要方面，重点关注关键技术、关键政策工具和跨部门挑战。这些简报将探讨政策影响并概述到本世纪中叶实现净零排放所需的关键步骤。
涉及基因工程玉米（MX-USA ...
17。此外，在USMCA中阐述的临时措施仅在没有足够的科学证据进行风险评估的情况下才允许。这里并非如此。对GE植物和动物衍生食品商品的风险评估通常由国家监管机构（包括墨西哥）经常监督。墨西哥自己的监管机构 - 反对卫生风险保护的联邦委员会（“ Cofepris”）授权大约100种玉米玉米品种用于食品和饲料中，并在其中评估了过敏性，毒性和营养问题的潜力。这些是墨西哥现在在多年后声称，由于科学证据不足，它必须制定临时措施。墨西哥立刻认为，新发表的研究使过去的评估过时了，但也声称可用的证据不足。6墨西哥尚未阐明为什么可用的科学证据不足以审查已经评估的这些产品，而现实是这种证据不存在。7
利用 CRISPR/Cas9 改造的麦胶蛋白基因家族
摘要：小麦的 α -麦胶蛋白与其他面筋成分一起决定了面包的粘弹性。然而，它们也与人类病理有关，如乳糜泻或非乳糜泻小麦敏感性。CRISPR/Cas 已成功用于敲除面包小麦和硬粒小麦中的 α -麦胶蛋白基因，从而获得低筋小麦品系。尽管如此，这些基因的突变分析很复杂，因为它们在 A、B 和 D 亚基因组中呈现多个高度同源的拷贝串联排列。在这项工作中，我们提出了一种基于 NGS 扩增子测序的生物信息学流程，用于分析两个单向导 RNA (sgRNA) 靶向的 α -麦胶蛋白基因中的插入和缺失 (InDels)。通过与最相似的野生型亲本序列进行比较，该方法可以识别突变的扩增子并分析 InDels。对样本间比较进行了 TMM 标准化；能够研究各代中每个 InDel 的丰度，并观察 Cas9 编码序列在不同细胞系中分离的影响。该工作流程的实用性与识别可能的基因组重排（例如由于 Cas9 切割活性而导致的大量缺失）有关。该流程能够快速表征多拷贝基因家族中多个样本的突变。
固氮根瘤共生工程路线图
19 世纪末，人们发现豆科植物可与具有固氮作用的根瘤菌建立根瘤内共生关系。此后不久，人们提出了是否有可能将这种特性转移到非豆科作物的问题。在过去的一个世纪里，越来越多的知识为控制这种内共生的细胞、分子和遗传过程提供了独特的见解。此外，最近的系统基因组学研究发现了几种进化后具有专门控制根瘤形成和细菌感染功能的基因。然而，尽管拥有大量知识，但改造非豆科作物固氮结瘤特性的长期目标尚未实现。本综述讨论并强调了非豆科植物固氮结瘤的未解决问题和改造策略。
通过 D- 设计的细胞内张力松弛...
摘要：微环境力学在损伤后的形态发生和免疫反应中起着至关重要的作用，但由于脊髓损伤 (SCI) 中脆弱的机械强度和氧化性生理环境阻碍了对微环境力学的探索。在这里，我们设计了具有与神经组织匹配的机械性能的对映体肽自组装水凝胶，以通过立体构象识别和随之而来的蛋白质亲和力差异持续操纵细胞膜张力和机械转导。D-对映体水凝胶诱导的细胞内张力松弛激活星形胶质细胞中的神经发生和 ECM 重塑，抑制促炎并促进小胶质细胞中的促再生，这显著促进了大鼠严重 SCI 模型中的神经保护和功能恢复。与非神经细胞相反，细胞内张力松弛诱导的形态发生可能是神经特性，因为下游的机械信号是由由此产生的神经源性形态变化激活的。总体而言，诱导细胞内张力松弛是促进神经再生的潜在有效策略。
适用于建筑环境的工程生物材料 (ELM)
本研究的作者是美国国家科学基金会 (NSF) 资助项目的一部分，该项目将 ELM 定义为封装在聚合物基质内的工程活细胞的复合材料。我们的跨学科研究团队由化学家、生物化学家、生物工程师、机械工程师和建筑师组成，他们为建筑环境开发 ELM，其中包括具有不同功能的工程活细胞的 3D 可打印树脂。我们实验室研究的重点是围绕创新 ELM 的三个主要问题：(1) 在不断变化的水合水平（室外环境）中茁壮成长的能力以及在低水合水平期间生存的能力，(2) 将具有光合作用活性、生产性的细胞整合到高科技建筑膜中，以及 (3) 创建 ELM 簇作为生物生产的弹性生物反应器。