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真菌酶的进化用于分解聚合物材料
为了实现对微生物如何分解材料的理解，我们建议开发一个合成的生物学平台，该平台自主会演变出降解聚合物材料的真菌生物。这项工作在用于军事应用的真菌工程领域中的最新技术可以推进现场，从而可以将用户定义的功能设计成真菌生物，而进化的生物可以以加速的速度或容量或能力来执行这些功能。我们提出了一种全面的，全面的方法，针对真菌生物的进化，以增强和利用聚合物材料来代谢。这项工作建立了基本的生物工程策略，以通过Transforme ERP（用于军事环境基本研究计划的转型合成生物学）在ARL开发的合成生物学工具的武器库。有了一套模块化工具，可以开始实现基于合成的能力的全部潜力。
Caspedia数据库：2类CRISPR-CAS酶Benjamin A. Adler 1,2†，Marena I. Trinidad 1,3†，Daniel Bellie
Caspedia数据库：2类CRISPR-CAS酶的功能分类系统Benjamin A. Adler 1,2†，Marena I. Trinidad 1,3†，Daniel Belieny-Relo 1,2，Elaine 1，Elaine 1，Elaine 1， 1,2，Brittney W. Thornton 1,5，Rachel F. Weissman 1,5，Peter H. Yoon 1,5，Lixing Chen 1,6，Tomas Hessler 1,6-8，Amy R.Eggers 1,5，Ron Boger Doherrty 1,2，Connor A. Tsuchida 1,9，Ryan V. Tran 4，Laura Hofman 1,2,10，Honglue Shi 1,3，Kevin M. Wasko 1,5，Zehan Zhou 1,5帕特尔1，维也纳C.J.X.Thomas 1,4，Rithu Pattali 1,5，Matthew J. Kan 1,11，Anna Vdapetyan 1，Pag Yang 1,5，Arushi Lahiri 5，Michael Maxwell 12，Andrew G. Murdock 12 Roland W. Calvert 13，Rebecca S. Bamert 13，Gavin J. Knott 13，Audrone Lapinatite 14-16，Pausch 17，Joshua C. Cofsky 18，Erik J 23-26，Stan J.J. Brouns 27-28，Dipali G. Sashhital 29，Brian C. Thomas 30，Christopher T. Brown 30，Daniela S. A. Goltsman 30，Rodolphe Barrangou F. Savage 1,3,5，Jennifer A. Doudna 1-5,34-35 * 1 Innovative gentites Institute，加利福尼亚大学，加利福尼亚州伯克利分校，加利福尼亚州94720，美国。2加州定量生物科学机构（QB3），加利福尼亚大学，加利福尼亚州伯克利分校，美国94720，美国。 3美国加利福尼亚州伯克利分校，加利福尼亚大学，美国94720，美国。 4，加利福尼亚大学，加利福尼亚大学，加利福尼亚大学，美国94720，美国化学系。2加州定量生物科学机构（QB3），加利福尼亚大学，加利福尼亚州伯克利分校，美国94720，美国。3美国加利福尼亚州伯克利分校，加利福尼亚大学，美国94720，美国。4，加利福尼亚大学，加利福尼亚大学，加利福尼亚大学，美国94720，美国化学系。4，加利福尼亚大学，加利福尼亚大学，加利福尼亚大学，美国94720，美国化学系。5分子与细胞生物学系，加利福尼亚大学，加利福尼亚大学，加利福尼亚大学，美国94720，美国。5分子与细胞生物学系，加利福尼亚大学，加利福尼亚大学，加利福尼亚大学，美国94720，美国。
微生物和酶在发酵中的作用
发酵是一个非凡的自然过程，几个世纪以来，人类已经利用了多种美味和营养的食物和饮料。这种迷人的转化的核心是微生物和酶，这使发酵成为可能。在本文中，我们将在发酵产品中深入研究微生物和酶的世界，探索其作用背后的角色，意义和迷人的科学。
生态酶在可持续发展中的作用
全球有机废物是由水果，蔬菜及其果皮产生的。它主要是在垃圾填埋场或堆肥方法中分解的。食品加工行业，蔬菜市场和餐馆每天生产大量有机废物，通常在环境或堆肥中处置。从有机厨房废物中生产出生态酶是用于家庭废物污染的创新解决方案。这是一种从含有有机酸，酶和矿物质盐的有机废物物质获得的酶溶液。它是通过进行简单的批处理发酵而产生的，该发酵涉及红糖，水果或蔬菜废物的混合物以及1：3：10的水。通过使用蔬菜和果皮发酵工艺产生两种类型的生态酶，约90天涉及酿酒酵母。获得的最终液体或酶为棕色。来自（Cucurbita Maxima）的生态酶1含有水解酶，例如淀粉酶和脂肪酶。观察到微生物的多样性，像耶尔森氏菌，芽孢杆菌和真菌一样的细菌（如trichoderma sp。和penicillium sp。在生态酶2（Citron）中观察到没有酶和微生物。Eco-enzyme 1具有50％稀释的生态酶1可有效降低各种参数，例如dra剂，COD，TDS，硝酸盐，硝酸盐，硝酸盐和铵。此外，与对照相比，它在10天内促进了植物的生长。因此，本研究概述了如何使用生态酶来治疗成本效益和环境友好的工业废水。
DNA 编辑酶作为碱基编辑器的设计和应用
DNA 编辑酶对 DNA 核碱基进行化学反应。这些反应可以改变修饰碱基的遗传特性或导致基因表达调节。近年来，由于 CRISPR-Cas 系统的出现，人们对 DNA 编辑酶的兴趣日益浓厚，该系统可用于将其 DNA 编辑活动引导至特定的目标基因组位点。在这篇综述中，我们展示了已被重新利用或重新设计并开发为可编程碱基编辑器的 DNA 编辑酶。这包括胞苷和腺苷脱氨酶、糖基化酶、甲基转移酶和脱甲基酶。我们强调了这些酶被重新设计、进化和改进的惊人程度，并将这些集体工程努力作为未来重新利用和设计其他酶家族的典范。总的来说，从这些 DNA 编辑酶衍生的碱基编辑器通过对核碱基的靶向化学修饰促进可编程点突变的引入和基因表达调节。
土壤嗜热及其细胞外酶
摘要：在本世纪，许多报告描述了在高温期间，嗜热剂在上层土壤层中的潜在作用。这项研究评估了这些微生物的能力，并提出了与土壤嗜热的活性相关的一些潜在后果和风险。它们活跃于有机物矿化中，释放了无机养分（C，S，N，P），否则仍将被困在土壤的有机复杂性中。要在土壤中处理复杂的有机化合物，这些嗜热剂需要细胞外酶将大型聚合物分解成简单的化合物，这些化合物可以掺入细胞中并加工。土壤嗜热剂能够使其细胞外酶活性适应环境条件。这些酶可以在高温下表现出最佳活性和降低的水含量。因此，这些微生物已被证明在土壤中（即干燥和热量）下积极处理并分解物质（包括污染物）。虽然营养循环是维持土壤服务质量的高度好处，但进行性变暖会导致土壤嗜热剂及其细胞外酶的过度活性。如果这种活动太高，则可能导致土壤有机物，营养贫困和干旱风险增加。这是一个明显的例子，说明了未来预测气候变暖的潜在影响直接由土壤微生物引起的，这对我们对生态系统功能，土壤健康和土壤干燥风险的理解产生了重大影响。
从清真角度生产酶和起动培养物
起始培养物是用于生产酸奶和奶酪等培养乳制品的微生物。乳酸开胃菜的主要功能是乳糖产生乳酸。起动培养物的其他功能可能包括以下内容： - 风味，香气生产和产品结构的改进 - 抑制不良生物
音调酸通过调节碳水化合物的肝钥匙酶来减轻高血糖
背景：背景：糖尿病是一种复杂的代谢疾病，其特征是由于胰岛素产生，胰岛素作用或两者兼而有之导致高血糖症。与糖尿病相关的持续性高血糖会导致患有严重健康问题的风险增加。这项研究检查了生物活性酚类化合物酸（SA）是否会减轻链蛋白酶诱导的糖尿病大鼠的高血糖。材料和方法：材料和方法：调查中总共使用了30个雄性Sprague-Dawley大鼠，它们分为五组：正常（N），正常+肌酸（N+SA），糖尿病对照（DC），糖尿病患者，糖尿病+肌酸（D+SA）和糖尿病+糖尿病+糖尿病+Glimepiride（diabetic+Glimepiride（D+GM）。使用单剂量的链蛋白酶（40 mg/kg）注射的腹膜内注射糖尿病。色调酸（SA）每天口服一次，持续60天，剂量为50 mg/kg体重。检查了血浆胰岛素，葡萄糖，糖化血红蛋白的水平和碳水化合物代谢酶的活性。结果与标准药物玻璃液螺旋体（0.1 mg/kg）的糖尿病大鼠进行了比较。结果：结果：在糖尿病大鼠中以50 mg/kg体重给药时，在糖尿病大鼠中，音调酸治疗大大降低了高血糖，增强的胰岛素水平和HBA 1C的降低。此外，音序酸具有大大降低果糖1,6-双磷酸酶和葡萄糖-6磷酸酶的活性，同时显着增加了丙酮酸激酶和己糖苷酶等糖酵解酶的活性。结论：结论：这些结果表明，音调酸可能通过调节碳水化合物代谢，潜在地减弱链蛋白酶诱导的糖尿病大鼠的高血糖症。
改变了神经性疼痛大鼠模型中DNA甲基化和羟甲基化表观遗传酶的大脑表达
摘要：表观遗传学在慢性疼痛上的作用尚未充分表征。DNA组蛋白甲基化受到从头甲基转移酶（DNMT1-3）和十种二加氧酶（TET1-3）至关重要的调节。证据表明，与伤害感受相关的不同中枢神经系统区域，即背根神经节，脊髓和不同的大脑区域都改变了甲基化标记。在DRG，前额叶皮层和杏仁核中发现了全局甲基化的降低，这与DNMT1/3A表达降低有关。相比之下，TET1和TET3的甲基化水平和mRNA水平升高与炎性和神经性疼痛模型中的增强性疼痛性超敏反应和异常性有关。由于表观遗传机制可能负责慢性疼痛状态中描述的各种转录修饰的调节和协调，因此，通过这项研究，我们旨在评估几个大脑区域中神经性疼痛中TET1-3和DNMT1/3A基因的功能作用。在神经性疼痛的不幸的神经损伤大鼠模型中，手术后21天，我们发现内侧前额叶皮层中的TET1表达增加，并且在尾甲状腺肿和杏仁核中的表达降低。 TET2在内侧丘脑中被上调。内侧前额叶皮层和尾状甲状腺中的TET3 mRNA水平降低；在尾状药物和内侧丘脑中，DNMT1被下调。使用DNMT3A观察到表达的统计学显着变化。我们的结果表明，在神经性疼痛的背景下，这些基因在不同大脑区域中具有复杂的功能作用。DNA甲基化和羟甲基的概念是细胞类型的特定细胞类型，而不是组织特定的，以及在建立神经性疼痛模型后的时间顺序差异基因表达的可能性。
酶和酶抑制剂 - 医学和诊断的应用
这是有关酶和酶抑制剂及其在医学和诊断中的应用的第一期的第一部分。第一篇论文着重于在需要长时间存储蛋白质的情况下维持MBCOMT的稳定性。膜结合的儿茶酚 - 甲基转移酶（MBCOMT）负责儿茶酚神经素 - 米特脱位的主要途径。该酶与几种类型的人类痴呆有关，新的，有效的无毒抑制剂已开发用于帕金森氏病治疗。，这种酶的不稳定性代表了新药开发的主要障碍，因为它倾向于迅速失去其生物学活性。离子液体可以帮助保持蛋白质稳定性和折叠，并由于其多种离子组合而预防蛋白质聚集。在酶缓冲液中添加添加剂，例如半胱氨酸，甘油和海藻糖，在最小化MBCOMT损伤并增强其稳定性方面显示出令人鼓舞的结果。结果表明，作者使用的缓冲液不仅导致HMBComt活性维持高达32.4 h，因此可以在-80℃下储存，而且与原始水平相比，生物学活性在-80℃下的储存量最高约40％[1]。第二篇论文的目的是在需要长时间存储蛋白质的情况下评估HMBCOMT的稳定性。作者测试了几个健康对照样品以验证测定法，然后研究了诊断出患有白内障，青光眼，过敏，干眼和叶博天腺功能障碍的患者的20个撕裂样本。获得的结果证实了ABMAS检验的可靠性，以量化人撕裂样品中MMP-9浓度的定量。因此，作者得出的结论是，生物标志物检测技术的使用对于评估预后和使眼科医生的工作更加容易，从而使患者健康的改善更大[2]也是有利的[2]。第三篇论文探讨了mpelanin浓度的激素1（MCHR1）拮抗剂的发展，这对于治疗肥胖症很有用。考虑到其结合位点类似于人类（HERG）通道的事实，并且由于HERG引起的心脏毒性，基于机器学习的预测模型在临床发育中开发的大多数药物在临床发展中失败了，这对于克服这些困难而言是有用的。考虑到这一点，作者试图使用基于DNN的机器学习模型发现新的MCHR1拮抗剂，而没有心脏毒性，并通过分析基因表达来识别新的适应症。结果，作者确定了具有心脏毒性的KRX-104130 MCHR1拮抗剂。此外，发现通过使用基于转录组的药物重新定位方法，可以识别该拮抗剂的新指示。因此，作者表明KRX-104130增加了低密度脂蛋白受体（LDLR）的表达，这是胆固醇水平降低的原因。此外，有人提到，这种拮抗剂通过降低肝脂质积累的程度，肝脏