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174 个 SARS-CoV-2 表位的预测与验证
最近爆发的 SARS-CoV-2 (2019-nCoV) 病毒凸显了快速有效疫苗开发的必要性。刺激导致保护的适当免疫反应高度依赖于通过 HLA 复合物向循环 T 细胞呈递表位。SARS-CoV-2 是一种大型 RNA 病毒，体外测试所有重叠肽以反卷积免疫反应是不可行的。因此，通常使用 HLA 结合预测工具来缩小要测试的肽的数量。我们测试了 19 种表位-HLA 结合预测工具，并使用体外肽 MHC 稳定性测定法，我们评估了 777 种预测为 11 种 MHC 同种异型良好结合剂的肽。在这项对潜在 SARS-CoV-2 表位的研究中，我们发现当前的预测工具在评估结合稳定性时的性能各不相同，并且它们高度依赖于所讨论的 MHC 同种异型。因此，设计一种仅包含少数表位靶标的 COVID-19 疫苗是一项非常具有挑战性的任务。在这里，我们展示了 174 个具有高预测结合分数的 SARS-CoV-2 表位，这些表位经验证可与 11 种 HLA 同种型稳定结合。我们的研究结果可能有助于设计一种有效的 COVID-19 疫苗。
174 个 SARS-CoV-2 表位的预测与验证
最近爆发的 SARS-CoV-2 (2019-nCoV) 病毒凸显了快速有效疫苗开发的必要性。刺激导致保护的适当免疫反应高度依赖于通过 HLA 复合物向循环 T 细胞呈递表位。SARS-CoV-2 是一种大型 RNA 病毒，体外测试所有重叠肽以反卷积免疫反应是不可行的。因此，通常使用 HLA 结合预测工具来缩小要测试的肽的数量。我们测试了 15 种表位-HLA 结合预测工具，并使用体外肽 MHC 稳定性测定法，我们评估了 777 种预测为 11 种 MHC 同种异型良好结合剂的肽。在这项对潜在 SARS-CoV-2 表位的研究中，我们发现当前的预测工具在评估结合稳定性时的性能各不相同，并且它们高度依赖于所讨论的 MHC 同种异型。因此，设计一种仅包含少数表位靶标的 COVID-19 疫苗是一项非常具有挑战性的任务。在这里，我们展示了 174 个具有高预测结合分数的 SARS-CoV-2 表位，这些表位经验证可与 11 种 HLA 同种型稳定结合。我们的研究结果可能有助于设计一种有效的 COVID-19 疫苗。
表观遗传工具可预测男性激素暴露的持续时间
本研究的结果表明，激活雄激素时钟需要细胞中有足够的雄激素以及雄激素受体的表达。该工具具有临床和非临床应用潜力，从疾病筛查和监测到检测运动员滥用合成代谢雄激素类固醇的证据。来源：美国国家科学院院刊 (2025)。DOI：10.1073/pnas.2420087121
使用高保真纳米孔测序的正hantavirus hantanense的流行病学监测和系统发育多样性，韩国共和国
1韩国大学医学院微生物学系，韩国共和国，韩国共和国2病毒疾病研究所，韩国大学医学院，韩国北部共和国，韩国共和国，3韩国研究生课程，韩国大学医学院研究生课程3加拿大伯纳比西蒙·弗雷泽大学分子生物学与生物化学系，韩国康奇大学，汉奇大学，汉奇大学，北加拿大大学，北加拿大大学，第7次预防医学单位，韩国，韩国，韩国第五，韩国第一个预防医学，韩国共和国共和国第一个预防医学部，第三次预防医学部，第三次预防医学部，第三次预防医学，韩国共和国第三次预防医学，第三次预防医院大韩民国Chuncheon，大韩民国Chuncheon，大韩民国陆军总部，大韩民国总部，大韩民国大韩民国，大韩民国的第二次预防医学部门，大韩民国，大韩民国12
epinext™DNA库制备套件（Illumina）
用途：EPINEXT™DNA库制备试剂盒（Illumina）适合使用Illumina Sequencer制备下一代测序应用的DNA库，其中包括基因组DNA-SEQ，chip-seq，chip-seq，medip/hmedip-seq，bisulfite-seq，bisulfite-seq，bisulfite-seq，targeted reparted reqe reqecencess。该套件的优化协议和组件允许使用偏置减少的偏差快速构建非标语（单个复合）和条形码（多重）DNA库。起始材料和输入量：起始材料可以包括从各种组织或细胞样品中分离出的碎片dsDNA，从芯片反应，MEDIP/HMEDIP反应或外显子捕获中富集的dsDNA。DNA应该相对不含RNA，因为大的RNA部分会损害末端修复和DA尾巴，从而降低了连接能力。DNA的输入量可以从5 ng到1 ug。为了获得最佳准备，输入量应为100 ng至200 ng。对于无扩增，需要500 ng或更多。预防措施：避免交叉污染，将样品或溶液仔细移液管中。使用气溶胶式移液器尖端，并始终在液体转移之间更改移液器。在整个过程中戴上手套。如果手套与样品之间接触，请立即更换手套。
EpiNext™ DNA 文库制备试剂盒（Illumina）
用途：EpiNext™ DNA 文库制备试剂盒 (Illumina) 适用于使用 Illumina 测序仪为下一代测序应用制备 DNA 文库，包括基因组 DNA 测序、ChIP 测序、MeDIP/hMeDIP 测序、亚硫酸盐测序和靶向重测序。该试剂盒的优化方案和组件允许快速构建非条形码 (单重) 和条形码 (多重) DNA 文库，并减少偏差。起始材料和输入量：起始材料可以包括从各种组织或细胞样本中分离的碎片 dsDNA、从 ChIP 反应、MeDIP/hMeDIP 反应或外显子捕获中富集的 dsDNA。DNA 应相对不含 RNA，因为大量的 RNA 会损害末端修复和 dA 尾部，从而降低连接能力。DNA 的输入量可以是 5 ng 到 1 ug。为了获得最佳制备效果，输入量应为 100 ng 到 200 ng。对于无扩增，需要 500 ng 或更多。注意事项：为避免交叉污染，请小心地将样品或溶液移入试管/小瓶中。使用气溶胶屏障移液器吸头，并在液体转移之间始终更换移液器吸头。整个过程中都要戴手套。如果手套和样品接触，请立即更换手套。
EpiNext™ CUT&LUNCH 检测试剂盒
用途：EpiNext™ CUT&LUNCH 检测试剂盒是一套完整的优化试剂，旨在快速从细胞中直接富集蛋白质（组蛋白或强结合转录因子）特异性 DNA 复合物，以通过 qPCR 或使用 Illumina 平台的下一代测序分析蛋白质与 DNA 之间的相互作用。起始材料：起始材料可以包括各种哺乳动物细胞样本，例如来自烧瓶或培养皿的培养细胞、原代细胞或从血液、体液、新鲜/冷冻组织中分离的稀有细胞群，以及从整个细胞群和胚胎细胞中分选的特定细胞等。细胞输入量：每个反应的细胞量可以是 2 x 10 3 到 5 x 10 5 个细胞。为了获得最佳制备效果，细胞输入量应为 2 x 10 5 ，尽管只需 500 个细胞即可获得修饰组蛋白的结果。抗体：抗体应为 ChIP 级，以识别与 DNA 或其他蛋白质结合的蛋白质。如果您使用的抗体尚未经过 ChIP 验证，则应使用适当的对照抗体（例如抗 RNA 聚合酶 II、抗 H3K4me3 或抗 H3K9me3）来证明这些抗体适合 ChIP。
乙肝流行病学 - 核心概念
2022 年，美国估计有 13,000 例急性 HBV 感染病例（图 1）。[8] 报告的急性 HBV 病例发病率在 1985 年达到峰值，随后从 1985 年到 2010 年下降。HBV 发病率在 2010 年至 2019 年保持相对稳定，但随后在 2020-2022 年期间下降。[8,9] 从 1980 年代中期到 2010 年代初急性 HBV 发病率持续大幅下降，主要是由于常规 HBV 疫苗接种的实施和推广。[9,10] 自 2004 年以来，男性急性 HBV 发病率一直高于女性，2022 年，男性占急性 HBV 感染者的 60.3%。[8] 40-49 岁人群的急性乙型肝炎 (HBV)。[ 8 ] 2022 年，非西班牙裔黑人和非西班牙裔白人的急性乙型肝炎 (HBV) 发病率最高。[ 8 ] 在州一级，乙型肝炎 (HBV) 发病率存在很大差异，西弗吉尼亚州、佛罗里达州和缅因州在 2022 年报告的急性乙型肝炎病例率最高。[ 8 ]
利用分子束外延自生长的六方锗...
图 1：(a) GaAs 核（蓝色）- Ge 壳（红色）NW 示意图，具有受控晶相：纤锌矿 (WZ)、闪锌矿 (ZB)，具有堆垛层错 (SF) 区域。通过 RHEED 原位监测样品，以获得有关 GaAs/Ge NW 晶体结构的实时信息。在 WZ GaAs 生长期间（b）29 分钟（c）35 分钟和六方 Ge 生长期间（d）3 分钟（e）10 分钟，沿 [1-10] 方位角记录的 RHEED 图案。WZ 点以白色箭头突出显示。(f) 45° 倾斜 SEM 图像（二次电子对比度）显示 GaAs/Ge NW。比例尺为 1 m。
口服避孕类固醇通过靶向血管生成和上皮间质转化促进乳头状甲状腺癌转移
图 1. LNG 和 EE 组合对 VEGF 和 THSB 表达的影响。A：与未治疗组相比，治疗组的 VEGFA 表达增加，而两组之间 THBS1 的 mRNA 表达没有显著变化；B：与未治疗对照组相比，治疗组的 VEGFA 蛋白水平显著升高。如图所示，与对照组相比，治疗后的细胞 VEGFA 蛋白表达更高。所有数据均以平均值±SD 表示。*P < 0.05 被认为是具有统计学意义的水平。