AML 是一种恶性造血祖细胞疾病,治疗效果不理想,尤其是对于不适合进行强化化疗的患者。免疫疗法包括检查点抑制、T 细胞结合抗体构建体和细胞疗法,已显著改善实体瘤和淋巴肿瘤患者的治疗效果。在 AML 中,这些方法的成功率要低得多。讨论的原因是 AML 母细胞的突变负担相对较低,并且难以确定造血祖细胞上未表达的 AML 特异性抗原。另一方面,表观遗传失调是白血病形成的重要驱动因素,非选择性低甲基化剂 (HMA) 是目前非强化治疗的支柱。首次临床试验评估了 HMA 是否可以改善免疫检查点抑制剂的疗效,结果显示,除了抗 CD47 抗体与阿扎胞苷联合使用时对 AML 的疗效显著更高之外,其他抗体的疗效均不理想。将双特异性抗体或细胞治疗与 HMA 联合使用仍在进行临床研究中,疗效数据即将公布。针对特定染色质调节剂的更具选择性的第二代抑制剂已显示出对抗 AML 的良好临床前活性,目前正在临床试验中进行评估。这些通常会导致白血病细胞分化的药物通过共同调节免疫检查点、提供促炎环境和诱导(新)抗原表达,可能使 AML 对免疫治疗敏感。因此,将选择性靶向表观遗传药物与(细胞)免疫疗法相结合是一种避免意外影响和增强疗效的有前途的方法。未来的研究将提供有关这些化合物如何影响特定免疫功能的详细信息,以便转化为临床评估。
流行病学研究表明,创伤性脑损伤(TBI)增加了发展神经退行性疾病(NDS)的风险。但是,这种风险是基本不明的分子机制。TBI触发了广泛的表观遗传修饰。同样,诸如阿尔茨海默氏症或帕金森氏症之类的NDS与许多表观遗传变化有关。尽管表观遗传变化在TBI之后可能会持续存在,但如果这些修饰增加后来ND发育和/或痴呆症的风险,则尚未解决。我们简要回顾了与TBI相关的表观遗传变化,并指出了可能有助于某些修改的长期持久性的推定反馈回路。然后,我们专注于表明持续性TBI相关的表观遗传变化的证据可能有助于病理过程(例如,神经炎症),这可能有助于促进特定NDS的发展 - 阿尔茨海默氏病,帕金森氏病或慢性创伤性脑瘤。最后,我们讨论了可能有助于预防或延迟NDS开发的TBI疗法的可能方向。
1 KOC大学翻译医学研究中心; bcevatemre@ku.edu.tr 2 KOC大学健康科学研究生院; ipekbulut18@ku.edu.tr,aisiklar17@ku.edu.tr 3 KOC大学科学与工程学研究生院; bdedeoglu21@ku.edu.tr 4 KOC大学医学院; hsyed@ku.edu.tr,tuonder@ku.edu.tr
GATA2表达是一种复杂的多系统疾病,患有骨髓增生综合征(MDS)和急性髓样白血病(AML)具有高风险,并且寿命几乎完全完整。1,2 GATA2载体表现出高度可变的表达性,一些人在早期发作MD中发育,而其他人则在整个生命中仍然无症状。尽管不存在预后生物标志物,但合作遗传和表观遗传驱动因素可能会塑造疾病的进程。3尽管在一组白血病驱动基因(即Stag2,setBP1,ASXL1和ETV6)中鉴定出复发的体细胞突变的进展,但了解GATA22携带者中与白血病相关的molecu Lar机制存在重大差距。4此外,DNA甲基化改变有助于在成人PA和AML的成年PA含量中发生白血病克隆和异常高甲基化的启动和扩展。5,6迄今为止,尚未进行GATA2患者的基因组宽DNA甲基分析。在这项研究中,招募了7家西班牙医院的20个临床注释的GATA2载体(表1;在线SUP培养图S1)。诊断时中位年龄为36(范围6-75)。主要初始表现为MDS(n = 12,55%),其次是免疫效率(n = 3,15%)和AML(n = 2,10%)。在细胞遗传学上,三个患者中的三体术在两个患者中进行了复杂的核型,而有11例患者的核型正常(在线补充图S1A-F)。基于DNA的可用性,因此在17 GATA2载体的总外周血(Pb)或骨髓(BM)中进行了乳酸突变。因此,在71%(12/17)测试的患者中鉴定了髓样恶性基因中的乳酸突变(在线补充图S1F)。该分析证实了GATA2缺乏效率中获得的体细胞突变的异质性,stag2,asxl1和setBP1作为经常影响的基因。,我们获得了通过使用矿体内甲基化史诗850 K平台(Illumina)进行完全遗传表征的患者的全球DNA甲基化pro纤维。我们为八个BM(P1,P3,P5,P6,P10,P11,P11,P12,P13)和八个PB样品(P1,P1,P4,P7,P7,P8,P9,P9,P13,P13,P16和P17)的LED DNA进行了比较,并与12(5 pb和7 BM)的队列进行了比较(5 pb和7 bm)老年人(Hefleped Donor)(hded donor)(高维数据可视化表明,GATA2患者的射击性紧密聚集在一起,并从HD隔离。属于同一家族的无症状载体P1,P1,P16和P17(分别为6、40和75岁)被包含在HD组上(图1A)。此外,我们将HD与无症状
摘要:额颞叶变性(FTLD)包括通过额叶和颞叶变性的病理学来表征的异质疾病。除了FTLD的主要遗传贡献者(例如MAPT,GRN和C9orf72中的突变)外,最近的工作还鉴定了几种表观遗传学修改,包括DLX1中的显着差异DNA甲基化,以及OTUD4的位置。由于衰老仍然是FTLD的主要危险因素之一,因此我们研究了与对照组相比,FTLD中FTLD加速的表观遗传衰老的存在。We calculated epigenetic age in both peripheral blood and brain tissues of multiple FTLD subtypes using several DNA methylation clocks, i.e., DNAmClock Multi , DNAmClock Hannum , DNAmClock Cortical , GrimAge, and PhenoAge, and determined age acceleration and its association with different cellular proportions and clinical traits.在额颞痴呆(FTD)的外周血中观察到了显着的表观遗传年龄加速,即使在核算混杂因素后,与Dnamclock hannum的对照组相比,与患有Dnamclock Hannum的对照组相比,与Dnamclock Hannum的对照组相比,观察到了进行性上的核次核(FTD)和进行性表观遗传年龄的加速。在PSP患者的验尸后皮层组织中,dnamclock多和dnamclock皮质都观察到了类似的趋势,并且在具有GRN突变的FTLD病例中。我们的发现支持,增加外周血中表观遗传年龄加速度的加速可能是PSP的指标,并且在较小程度上是FTD。
摘要:2型糖尿病(T2D)是一个日益增长的全球健康问题,需要新的有效的预防和管理策略。最近的研究强调了表观遗传变化在T2D的发育和发展中的作用,以及功能性食品作为该疾病的补充疗法的潜力。本综述旨在概述T2D功能性食品的预防性表观遗传机制的当前知识状态。我们提供了有关T2D及其当前治疗方法的背景信息,对表观遗传学概念的解释以及对T2D中具有预防性表观遗传效应的不同功能性食品的概述。我们还讨论了这些功能性食品预防或管理T2D的表观遗传机制,以及研究了其预防性表观遗传作用的研究。此外,我们重新访问功能性食品的利益影响对父母触发后代糖尿病的编程和并发症的利益影响。我们还建议,尽管基于稀缺数据,表观遗传遗传学会介导功能营养对后代糖尿病的代谢风险的影响。最后,我们的评论重点介绍了将功能性食品的预防性表观遗传机制视为开发T2D新预防和管理策略的潜在途径的重要性。
气候变化给葡萄栽培带来了许多威胁。人们已经制定了不同的策略来减轻这些影响,从创新的葡萄园管理方法和精准葡萄栽培到培育更适应环境挑战的新品种和砧木。表观遗传学是指基因组功能的可遗传变化,不受 DNA 序列变异的影响。最近发现表观遗传记忆可以介导植物对环境的适应和适应,这为应对气候变化的植物改良提供了新的杠杆,而不会对遗传信息产生重大影响。这可以通过使用压力的表观遗传记忆和/或通过在不改变遗传信息的情况下以新的表观等位基因的形式创造表观遗传多样性来实现。事实上,葡萄藤是一种多年生嫁接克隆繁殖植物,因此具有表观遗传特异性。这些特异性需要已经在模型植物中开发的适应策略,但也提供了探索表观遗传记忆和多样性如何成为具有类似特性的植物快速适应环境的主要来源的机会。在这些策略中,使用不同类型的诱导剂进行一年一次和一年一次的植物启动可能提供有效的方式来更好地应对(非)生物胁迫。利用接穗和砧木之间的表观遗传交换和/或在基因组范围内创造非靶向表观遗传变异,或使用表观遗传编辑进行靶向变异,可能为葡萄树改良提供创新且有希望的途径,以应对气候变化带来的挑战。
Jennifer Kwon、Alec Knapp、Andrew Hill、Kristen Browoleit、Sai An、Stuart Sundsdeth、Tyler Goodwin、Michael Hefferan、Kendra Congdon、Charles Gersbach、Blythe Sather
表观基因组编辑的耐久性在心血管疾病靶基因中存在很大差异 Madelynn N. Whittaker, 1,2 Lauren C. Testa, 1 Aidan Quigley, 1 Ishaan Jindal, 1 Saúl V. Cortez- Alvarado, 1 Ping Qu, 1 Yifan Yang, 1 Mohamad-Gabriel Alameh, 3,4 Kiran Musunuru 1,5 & Xiao Wang 1,5 1. 宾夕法尼亚大学佩雷尔曼医学院心血管研究所,宾夕法尼亚州费城 19104,美国 2. 宾夕法尼亚大学生物工程系,宾夕法尼亚州费城 19104,美国 3. 乔治梅森大学生物工程系,弗吉尼亚州费尔法克斯 22030,美国 4. 宾夕法尼亚大学佩雷尔曼医学院医学系传染病分部,宾夕法尼亚州费城 19104,美国 5. 心血管医学分部,宾夕法尼亚大学佩雷尔曼医学院医学系,宾夕法尼亚州费城 19104,美国 运行标题:心血管基因的表观基因组编辑 通讯作者
摘要妊娠糖尿病(GDM)增加了孕妇及其后代的代谢疾病的风险。诸如营养或宫内环境之类的因素通过表观遗传机制在GDM的发展中起重要作用。这项工作的目的是确定与妊娠糖尿病有关的机制或途径涉及的表观遗传标记。总共选择了32名孕妇,其中16位患有GDM和16个非GDM。DNA甲基化模式是从光明甲基化史诗般的Beadchip获得的,在诊断性就诊时(26-28周)从外周血样本中获得。使用Champ和Limma套件在R 2.9.10中提取差异甲基化位置(DMP),其阈值为FDR <0.05,Deltabeta> | 5 |%|%和B> 0。总共发现了1.141 DMP,在基因中注释了714个。进行了功能分析,我们发现23个基因与碳水化合物代谢显着相关。最后,在口服葡萄糖耐受性测试的不同点,在怀孕期间和产后不同的访问时,总共与生化变量(例如不同点的葡萄糖耐受性测试,禁食葡萄糖,混蛋,homair和hba1c)相关。我们的结果表明,GDM和非GDM之间存在分化的甲基化模式。此外,注释到DMP的基因可能与GDM的发展以及相关代谢变量的变化有关。