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Chroma_ EASL 2024_表观遗传编辑靶向体内 HBV
Nuñez JK、Chen J、Pommier GC 等人。基于 CRISPR 的表观基因组编辑实现全基因组可编程转录记忆。Cell。2021；184(9):2503-2519.e17。doi:10.1016/j.cell.2021.03.025
阿尔茨海默氏病的表观遗传表现：DNA甲基化
阿尔茨海默氏病（AD）是痴呆症的最常见形式，具有复杂的发病机理。近年来，由于人口增加，AD患者的数量有所增加，而出现了年轻年龄的趋势，对社会和家庭造成了重大负担，并引起了广泛的关注。DNA甲基化已被揭示出在AD发作和进展中起重要作用。DNA甲基化是调节基因表达的关键机制，并且这种机械性的改变基因表达失调并破坏了重要的途径，包括氧化应激反应，炎症反应和蛋白质降解过程，疾病导致蛋白质降解过程。研究表明，AD患者的DNA甲基化在外围血液和脑组织中的广泛变化，影响了多个信号通路，并严重影响神经元细胞和突触功能。本综述总结了DNA甲基化在AD发病机理中的作用，旨在为其早期预防和治疗提供理论基础。
个体年龄相关 CpG 的表观遗传编辑会影响全基因组的表观遗传衰老状况
PDE4C 中的区域保持稳定超过三个月。此外，表观遗传编辑引发了许多全基因组脱靶效应，这些效应具有高度可重复性，并在其他与年龄相关的 CpG 中富集 - 因此，它们不是随机的脱靶效应，而似乎类似于共同调节的表观遗传旁观者修饰。年龄相关位点的 4C 染色质构象分析显示与旁观者修饰和其他与年龄相关的 CpG 位点的相互作用增加。随后，我们在 HEK293T 和原代 T 细胞中的五个基因组区域多重分析了表观遗传修饰，这些区域在衰老时会变得高甲基化或低甲基化。虽然在年龄低甲基化的 CpG 处进行的表观遗传编辑似乎不太稳定，但它也导致其他与年龄相关的 CpG 处旁观者修饰明显富集。相反，表观遗传时钟往往会在靶向 DNA 甲基化后长达十年内加速，尤其是在高甲基化的 CpG 处。这些结果表明，有针对性的表观基因组编辑可以调节整个表观遗传衰老网络，从而干扰表观遗传时钟。
表观遗传学，微生物群和乳腺癌：系统评价
摘要：乳腺癌是全球女性最常被诊断出的癌症。根据最近的研究，微生物群和表观遗传调制的改变是该疾病的危险因素。这项系统评价旨在确定肠道和乳腺微生物种群，表观遗传修饰和乳腺癌之间的可能关联。为了实现这一目标，我们按照PRISMA指南进行了PubMed，Science和Science Direct数据库的文献搜索。尽管人类尚无结果，但对小鼠的研究表明，生物活性化合物对后代乳腺肿瘤发展的孕产妇饮食干预措施具有保护作用。这些饮食干预措施还改变了肠道微生物群，增加了短链脂肪酸产生的分类单群的相对丰度并预防乳腺癌发生。此外，菌群产生的短链脂肪酸是表观遗传调节剂。此外，一些作者表明，压力会改变肠道菌群，通过表观遗传和基因表达在乳腺肿瘤微环境中促进乳腺肿瘤的生长。综上所述，这些发现表明了与环境因素相关的菌群的表观遗传修饰和改变乳腺癌发展，侵略性和进展的能力。
表观遗传调节在神经退行性疾病中的作用：植物化学干预的影响
1个天然产品，用于神经保护和抗衰老研究部门，夏隆大学，曼谷10330，泰国； prasanth.m.iyer@gmail.com（M.I.P.）; clerancecheong@gmail.com（c.s.y.c.）; kanika.honey.verma@gmail.com（K.V.）; tewin.t@chula.ac.th（t.t。）; james.b@chula.ac.th（J.M.B。）2盟军健康科学学院临床化学系，尚隆龙大学，曼谷10330，泰国3号研究管理办公室，清迈大学，泰国，泰国50200； sivamaruthi.b@cmu.ac.th 4 4整体健康中心，营养学和宇宙学院，药学学院，清迈大学，Chiang Mai 50200，泰国5研究，创新，创新，创新和国际事务Chulalongkorn University，曼谷10330，泰国 *通信：anchalee.pr@chula.ac.ac.th;电话。： +66-218-8048
小胶质细胞免疫反应的表观遗传控制
fi g u r e 1表观遗传分析可以产生除其他OMIC方法外的生物学见解。（a）健康与患病大脑中的小胶质细胞表观遗传态的比较分析，可以构建转录因子（TF）和基因调节网络，并可以绘制与疾病相关的单核苷酸多态性（SNP）的映射到小胶质细胞亚型及其功能注释。（b）表观遗传特征还可以用来揭示小胶质细胞的当前免疫反应，并告知如何通过短期（即在急性炎症期间）和长期通过表观遗传水平的小胶质细胞整合免疫信号。长期重编程被称为“先天免疫记忆”，在首次侮辱之后是难治阶段，其特征在于持续的表观遗传修饰，随后的刺激会触发改性的小胶质细胞反应，该反应是对初始表性刺激的先前表观遗传重编程的结果。
招聘职位：比较表观基因组学组（Bourque 组）项目助理教授
7. 职位描述：ASHBi 将研究人类生物学的核心概念，重点关注基因组调控和疾病建模，为开发创新和独特的以人为本的疗法奠定知识基础。主要目标是：1）在生殖、发育、生长和衰老以及遗传和进化领域，在人类生物学的关键个人主题上取得杰出研究成果；2）阐明人类、非人类灵长类动物和啮齿动物之间出现物种差异的原理，以便将模型生物的发现适当地推广到人类；3）为关键基因功能和难治性疾病生成灵长类动物模型；4）在体外重建关键人类细胞谱系和组织，并根据综合信息验证其特性；5）为使用人类/非人类灵长类动物材料的伦理规范做出贡献，并创建一种哲学来指导研究所研究成果的价值。 ASHBi Bourque 小组旨在了解人类表观基因组，它是复杂生物现象（如细胞分化、发育、进化和人类疾病）的基础。为了实现这一目标，我们使用尖端的生物信息学和基因组技术，例如 RNA-seq、ChIP-seq、Cut&Tag、ATAC-seq、lentiMPRA 和 CRISPR（表观）基因组编辑，结合 iPS 细胞和单细胞技术。候选人有望与 Bourque 小组的联合 PI Fumitaka Inoue 副教授一起进行高水平研究和研究相关工作（https://ashbi.kyoto-u.ac.jp/lab-sites/inoue_lab/en/），并担任人类生物学和相关领域的首席研究员。
Epi-321-A-Novel-epbepenetic-Gene-gene-for-fshd- ...
我们的临时性研究表明，Epi-321的给药可在十种不同的FSHD患者衍生的患者衍生的永生化和原发性成肌细胞中对Dux4和Dux4-Downstream基因表达的稳健和剂量抑制，无论D4Z4重复序列的数量如何，并且表现出抗iapoptication Asspase 3 Inge caspase 3 ige。从机械上讲，Epi-321显示了D4Z4靶基因座的重新甲基化，从而导致DUX4表达抑制。此外，在人源化FSHD小鼠模型中对Epi-321的体内评估显示，在mRNA和蛋白质水平上对Dux4-Pathway的剂量依赖性抑制作用，以及肌肉组织中的抗凋亡活性。此外，使用FSHD患者衍生的永生化的成肌细胞（Epi-321）进行了3D设计的人体肌肉组织（3D EMT），从而有效地抑制了DUX4和DUX4-PATHWAY基因长达46天，并显示出肌肉缩减性的剂量依赖性，表现出了肌肉缩减的显着改善，表现出受肌肉的增长和Teteratient poptertic posteatial posteat posteat teteat teteat awteat aTteat aTteat aTeat eateat aTeat酸味。
肌酸转运蛋白缺乏症的表观遗传改变
3 ，阿拉伯酋长国沙迦大学药学学院，阿拉伯联合酋长国，医学与健康科学研究所4研究所沙迦，沙迦，阿拉伯联合艾米特斯，第7个外科和介入科学系，伦敦大学学院，伦敦，英国8号，阿布萨尔亚大学，阿拉伯酋长国，阿拉伯酋长国，阿布萨尔萨大学，阿布萨尔萨大学，阿拉伯大学9号，精密医学中心9阿拉伯联合酋长国沙迦大学的人工情报实验室，阿拉伯联合酋长国，阿拉伯酋长国沙迦大学药学学院，阿拉伯联合酋长国，医学与健康科学研究所4研究所沙迦，沙迦，阿拉伯联合艾米特斯，第7个外科和介入科学系，伦敦大学学院，伦敦，英国8号，阿布萨尔亚大学，阿拉伯酋长国，阿拉伯酋长国，阿布萨尔萨大学，阿布萨尔萨大学，阿拉伯大学9号，精密医学中心9阿拉伯联合酋长国沙迦大学的人工情报实验室，阿拉伯联合酋长国，阿拉伯酋长国沙迦大学药学学院，阿拉伯联合酋长国，医学与健康科学研究所4研究所沙迦，沙迦，阿拉伯联合艾米特斯，第7个外科和介入科学系，伦敦大学学院，伦敦，英国8号，阿布萨尔亚大学，阿拉伯酋长国，阿拉伯酋长国，阿布萨尔萨大学，阿布萨尔萨大学，阿拉伯大学9号，精密医学中心9阿拉伯联合酋长国沙迦大学的人工情报实验室，阿拉伯联合酋长国，阿拉伯酋长国沙迦大学药学学院，阿拉伯联合酋长国，医学与健康科学研究所4研究所沙迦，沙迦，阿拉伯联合艾米特斯，第7个外科和介入科学系，伦敦大学学院，伦敦，英国8号，阿布萨尔亚大学，阿拉伯酋长国，阿拉伯酋长国，阿布萨尔萨大学，阿布萨尔萨大学，阿拉伯大学9号，精密医学中心9阿拉伯联合酋长国沙迦大学的人工情报实验室，阿拉伯联合酋长国，阿拉伯酋长国沙迦大学药学学院，阿拉伯联合酋长国，医学与健康科学研究所4研究所沙迦，沙迦，阿拉伯联合艾米特斯，第7个外科和介入科学系，伦敦大学学院，伦敦，英国8号，阿布萨尔亚大学，阿拉伯酋长国，阿拉伯酋长国，阿布萨尔萨大学，阿布萨尔萨大学，阿拉伯大学9号，精密医学中心9阿拉伯联合酋长国沙迦大学的人工情报实验室，阿拉伯联合酋长国，阿拉伯酋长国沙迦大学药学学院，阿拉伯联合酋长国，医学与健康科学研究所4研究所沙迦，沙迦，阿拉伯联合艾米特斯，第7个外科和介入科学系，伦敦大学学院，伦敦，英国8号，阿布萨尔亚大学，阿拉伯酋长国，阿拉伯酋长国，阿布萨尔萨大学，阿布萨尔萨大学，阿拉伯大学9号，精密医学中心9阿拉伯联合酋长国沙迦大学的人工情报实验室，阿拉伯联合酋长国，阿拉伯酋长国沙迦大学药学学院，阿拉伯联合酋长国，医学与健康科学研究所4研究所沙迦，沙迦，阿拉伯联合艾米特斯，第7个外科和介入科学系，伦敦大学学院，伦敦，英国8号，阿布萨尔亚大学，阿拉伯酋长国，阿拉伯酋长国，阿布萨尔萨大学，阿布萨尔萨大学，阿拉伯大学9号，精密医学中心9阿拉伯联合酋长国沙迦大学的人工情报实验室，阿拉伯联合酋长国
表观基因组整个关联研究鉴定出与出生的儿童的两年注意力问题相关的新生儿DNA甲基化。
先前的研究已经确定了学龄儿童注意问题的表观遗传预测指标，但尚未在幼儿中调查这些问题，或者尚未对这些儿童进行调查，或者由于早产出生而患有注意力问题的风险较高。当前的研究评估了新生儿DNA甲基化与年龄在2岁时出生的儿童的关注问题之间的表观基因组广泛的关联。参与者包括来自新生儿神经行为的441名儿童和非常早产儿（NOVI）研究的结果，这是一项多个现场研究，对婴儿<30周的胎龄<30周。DNA甲基化是通过使用Illumina甲基化珠珠阵列在NICU放电时在NICU排放时收集的颊拭子测量的。使用儿童行为清单（CBCL）的注意力问题子量表在调整年龄的2岁时评估了注意力问题。进行多次测试调整后，在33个CpG位点的DNA甲基化与儿童注意问题有关。差异化甲基化的CpG位点位于先前与身体和心理健康相关的基因中，其中包括与先前全基因组和全基因组关联研究中与ADHD相关的几种基因。几个CpG位点位于以前与NOVI样本中与产前危险因素相关的基因中。对于确定有长期注意力问题和相关精神疾病风险的早产儿，他们可以从早期的预防和干预工作中受益。