男性不育症是大约40%的经历原发性或继发性不育症的夫妇的重要因素,构成了主要的生物医学和社会挑战。基于世界卫生组织(WHO)标准的传统精子评估提供了精液集中,运动和形态的基本评估。然而,这些方法面临着相当大的局限性,包括在观察者间和观察者内和分子洞察力有限,功能和分子见解的缺乏以及涵盖临床,基因组和表观遗传数据的整合标准。在最近几十年中,人工智能(AI)的模型已成为一个potivotal ands的模型。在生殖医学中,AI通过提高诊断和预后的准确性,同时为个性化的生殖医疗保健铺平道路,从而发挥了变革性的作用。机器学习和深度学习应用是自动化的过程,这些过程几乎完全依赖于人类专业知识,从而在评估精子形态,运动性和功能方面具有前所未有的精度。本文在精子分析中对AI应用程序进行了全面和多学科的评论,涵盖了常规方法及其对高级分类和预测模型的局限性。它还探讨了AI与“ OMICS”技术(基因组学,转录组学,蛋白质组学和表观基因组学),微流体设备的发展以及在临床实践中采用大数据技术的整合。评论以道德考虑的讨论结束,需求
2型糖尿病(T2D)是一种异质性疾病,它通过不同的病理生理过程1,2和通常针对细胞3,4型特定的分子机制而发展。在这里,为了表征跨祖先群体对这些过程的遗传贡献,我们汇总了来自2,535,601个个体(39.7%不是欧洲血统)的全基因组关联研究数据,包括428,452例T2D病例。我们识别出1,289个独立的关联信号,该信号在全基因组显着性(p <5×10 -8)上,映射到611个基因座,据我们所知,其中145个基因座先前未报告。我们定义了T2D信号的八个非重叠簇,其特征是心脏代谢性状关联的不同曲线。这些簇在开放染色质的细胞类型特异性区域差异富集,包括胰岛,脂肪细胞,内皮细胞和肠内分泌细胞。我们在另外279,552个不同血统的个体中,包括30,288例T2D病例,并在另外279,552个个体中建立了特定于集群的多基因分数5,并测试了它们与T2D与T2D相关的血管结局的关联。特定于群集的多基因评分与跨祖先组的冠状动脉疾病,外周动脉疾病和终末期糖尿病性肾病有关,强调了与肥胖相关过程在血管癌症发展中的重要性。我们的发现表明,将多功能基因组研究数据与单细胞表观基因组学进行了整合,以解散驱动T2D发展和发展的病因异质性。这可能会提供一条优化全球访问遗传知情糖尿病护理的途径。
花生(Arachis hypogaea)是一种以其独特的发育过程而闻名的精油作物,其特征是空中浮动,其特征是地下水果的发展。该作物是多倍体,由A和B亚基因组组成,这使其遗传分析变得复杂。OMICS技术的出现和进步 - 包括基因组学,转录组学,蛋白质组学,表观基因组学和代谢组学 - 显着提高了我们对花生生物学的理解,尤其是在种子发育以及种子相关性状的调节的背景下。在完成花生参考基因组完成后,研究利用OMICS数据来阐明与种子重量,油含量,蛋白质含量,脂肪酸成分,蔗糖含量和种子外套的颜色以及调节性机制的定量性状基因座(QTL)。本综述旨在总结基于参考基因组指导的OMICS研究的花生种子发展调节和性状分析的进步。它概述了在理解花生种子发育的分子基础中取得的显着进步,从而洞悉了影响关键的农艺特征的复杂遗传和表观遗传机制。这些研究强调了法律数据的重要性,以深刻阐明花生种子发育的调节机制。此外,它们为未来与性状相关功能基因的研究奠定了基础,强调了综合基因组分析在促进我们对植物生物学的理解方面的关键作用。
摘要:晚期皮肤黑色素瘤被认为是最具侵袭性的皮肤癌类型,治疗反应率各不相同。目前,有几类免疫疗法和靶向疗法可用于治疗。免疫疗法可以通过触发宿主的免疫系统来抑制肿瘤生长及其复发,而靶向疗法则抑制特定分子或信号通路。然而,黑色素瘤对这些治疗的反应高度异质性,患者可能会产生耐药性。表观基因组学(DNA/组蛋白修饰)有助于癌症的发生和发展。表观遗传改变分为四个基因表达调控水平:DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质重塑和非编码RNA调控。赖氨酸甲基转移酶的失调与肿瘤的发生、侵袭、转移的发展、免疫微环境的变化和耐药性有关。赖氨酸组蛋白甲基转移酶 (KMT) 和烟酰胺 N-甲基转移酶 (NNMT) 抑制剂的研究对于理解癌症表观遗传机制和生物过程非常重要。除了免疫疗法和靶向疗法之外,KMT 和 NNMT 抑制剂的研究和开发也在进行中。许多研究正在探索这些化合物的治疗意义和可能的副作用,以及它们对目前已获批准的疗法的辅助潜力。重要的是,与任何药物开发一样,安全性、有效性和特异性是开发用于临床应用的甲基转移酶抑制剂时的关键考虑因素。因此,这篇综述文章介绍了最近可用的疗法和正在开发的用于晚期皮肤黑色素瘤治疗的疗法。
糖尿病性肾脏疾病(DKD)正在成为慢性肾脏疾病的主要原因,尤其是在工业化世界中。尽管有越来越多的证据表明,免疫力和炎症高度参与了DKD的发病机理和进展,但基本机制仍未完全理解。通过整合到复杂的调节网络中,实质性分子,信号通路和细胞类型参与DKD量弹药。大多数研究都集中在各个组件上,而没有呈现其在基于全球或系统的过程中的重要性,这在很大程度上会阻碍临床翻译。此外,传统技术未能监测居民肾细胞和免疫细胞的不同行为,因此很难理解它们对DKD中炎症的贡献。最近,OMICS技术的发展,包括基因组学,表观基因组学,转录组学,蛋白质组学和代谢组学已彻底改变了生物医学研究,该研究允许对DNA,RNA,蛋白质和代谢物在疾病环境中,甚至在单细胞和空间分辨率中的全球变化进行全球分析。他们帮助我们确定了炎症过程的关键调节因子,并提供了DKD中细胞异质性的概述。本综述旨在总结多种麦克数在DKD领域的应用,并强调这些技术揭示了有关渗透和DKD相互作用的最新证据,这些技术将提供新的见解,从而为Inflamation在DKD中的致病作用提供了新的见解,并导致了新颖的疗养方法和诊断的发展。
复杂生物系统中的分子机制和功能目前仍难以捉摸。最近的高通量技术,如新一代测序,已经生成了各种各样的多组学数据集,从而能够通过多个方面识别生物功能和机制。然而,整合这些大规模多组学数据并发现功能见解仍然是一项具有挑战性的任务。为了应对这些挑战,机器学习已被广泛应用于分析多组学。本综述介绍了多视角学习——一个新兴的机器学习领域——并展望了其在多组学中的潜在强大应用。特别是,多视角学习比以前的整合方法更有效地学习数据的异质性和揭示串扰模式。尽管多视角学习已应用于计算机视觉和语音识别等各种环境,但尚未广泛应用于生物数据——特别是多组学数据。因此,本文首先回顾了最近的多视角学习方法,并将它们统一在一个称为多视角经验风险最小化 (MV-ERM) 的框架中。我们进一步讨论了每种方法在多组学(包括基因组学、转录组学和表观基因组学)中的潜在应用,旨在发现跨组学的功能和机制解释。其次,我们探索了对不同生物系统的可能应用,包括人类疾病(例如脑部疾病和癌症)、植物和单细胞分析,并讨论了使用多视角学习发现这些系统的分子机制和功能的好处和注意事项。
•人遗传疾病的分子基础(神经肌肉和神经退行性疾病,肾脏疾病,骨骼疾病和遗传性肿瘤倾向综合征)和罕见发育综合征的鉴定和表征。Subtopics: disease gene location (linkage studies), identification of disease genes (targeted (Panel) and whole exome sequencing using next generation sequencing), identification of underlying mutations, functional analysis of disease genes in vitro and in vivo, functional analysis of the disease relevant protein complexes • Identification of disease modifying/protective factors • Therapeutic approaches (pharmacotherapy, epigenetic approaches, gene疗法)•分子遗传技术(PCR,测序,实时PCR,多态性标记的基因分型,RT-PCR,焦磷酸测序,Southern-Clotting等)•分析测序数据和突变,单倍型的构建,引物的构造,序列的组装和对齐等。•分子克隆(将PCR片段克隆到质粒中,质粒DNA的分离,转染); use of CRISPR/Cas-system • Cell culture technology (working with human and murine cell lines) • Working with inducible pluripotent stem cells (iPSC) and neuronal differentiation • Immunohistochemistry, fluorescence microscopy • Protein analysis and protein-interaction methods (Western blotting, co-immunoprecipitation of proteins, pull-down, chromatin-immunoprecipitations (ChIP) etc.)•分析敲除和转基因小鼠的解释性注释:上面的列表包括人类遗传学,CECAD,CMMC,CCG,CCG,表观基因组学和眼睛的实验免疫学的主题和技术。因此,参加该模块的每个学生都将面临其中的大部分子集。确切的内容将取决于学生和研究项目的研究项目。
慢性淋巴细胞白血病 (CLL) 是一种淋巴增生性恶性肿瘤,其特征是功能成熟但不健全的 B 细胞增殖。它是西方人群中最常见的白血病类型,约占新发白血病病例的 25%。尽管最近的进展(例如依鲁替尼和维奈克拉治疗)改善了患者的前景,但侵袭性 CLL 形式(例如 Richter 转化)仍然是一项重大挑战。这种差异可能是由于在多组学水平上导致 CLL 发展的因素存在异质性。然而,关于 CLL 组学的信息是零散的,阻碍了基于多组学的潜在治疗方案研究。为了解决这个问题,我们在这篇综述中汇总并介绍了该疾病各个组学水平的一些重要方面。本文献分析的目的是从不同的组学水平描述 CLL 研究的例子,包括基因组学、表观基因组学、转录组学、表观转录组学、蛋白质组学、表观蛋白质组学、代谢组学、糖组学和脂质组学,以及通过多组学方法确定的研究。该综述包括 102 个 CLL 相关基因及其相关基因组学信息。虽然单组学研究产生了大量有用的数据,但它们忽略了疾病中存在的大量复杂生物相互作用。由于多组学研究整合了几个不同的数据层,它们可能更适合 CLL 等复杂疾病,并且迄今为止已经取得了令人鼓舞的结果。未来的多组学研究可能有助于临床医生根据 CLL 亚型改善治疗选择,并允许识别新的生物标志物和治疗靶点。
Ph.D.经济学,赖斯大学。 2008年5月。 主管:HervéMoulin。 B.S. 数学,cimat-universidad de guanajuato。 2004年6月。 简介鲁本·华雷斯(Ruben Juarez)博士是夏威夷大学经济研究组织和夏威夷大学经济系的HMSA杰出教授。 他还担任夏威夷综合分析,联合导演和毛伊野火曝光研究的联合创始人以及对Covid-19的太平洋联盟的首席执行官。 学术贡献:Juarez博士是一位经济学家,以将微观经济学,行为经济学和网络经济学与公共卫生计划融合在一起而闻名。 自获得博士学位以来他于2008年获得赖斯大学的经济学专业,在《经济理论,游戏与经济行为杂志》和《美国公共卫生杂志》等期刊上广泛发表。 社区参与和领导力:Juarez博士致力于增强社区健康,尤其是服务不足的人群。 共同创建并共同导演了毛伊岛野火暴露研究,该研究涉及2023年毛伊岛野火的健康影响。 他还共同建立了针对Covid-19的太平洋联盟,改善了夏威夷原生和太平洋岛民社区的健康结果和疫苗接种率。 此外,他共同领导了早期糖尿病队列的夏威夷社会表观基因组学,以防止年轻人的糖尿病,并将UHero全州范围的迅速调查联合,研究了整个夏威夷健康的社会决定因素。 在其他十几个基于社区的项目中。Ph.D.经济学,赖斯大学。2008年5月。主管:HervéMoulin。B.S. 数学,cimat-universidad de guanajuato。 2004年6月。 简介鲁本·华雷斯(Ruben Juarez)博士是夏威夷大学经济研究组织和夏威夷大学经济系的HMSA杰出教授。 他还担任夏威夷综合分析,联合导演和毛伊野火曝光研究的联合创始人以及对Covid-19的太平洋联盟的首席执行官。 学术贡献:Juarez博士是一位经济学家,以将微观经济学,行为经济学和网络经济学与公共卫生计划融合在一起而闻名。 自获得博士学位以来他于2008年获得赖斯大学的经济学专业,在《经济理论,游戏与经济行为杂志》和《美国公共卫生杂志》等期刊上广泛发表。 社区参与和领导力:Juarez博士致力于增强社区健康,尤其是服务不足的人群。 共同创建并共同导演了毛伊岛野火暴露研究,该研究涉及2023年毛伊岛野火的健康影响。 他还共同建立了针对Covid-19的太平洋联盟,改善了夏威夷原生和太平洋岛民社区的健康结果和疫苗接种率。 此外,他共同领导了早期糖尿病队列的夏威夷社会表观基因组学,以防止年轻人的糖尿病,并将UHero全州范围的迅速调查联合,研究了整个夏威夷健康的社会决定因素。 在其他十几个基于社区的项目中。B.S.数学,cimat-universidad de guanajuato。2004年6月。简介鲁本·华雷斯(Ruben Juarez)博士是夏威夷大学经济研究组织和夏威夷大学经济系的HMSA杰出教授。他还担任夏威夷综合分析,联合导演和毛伊野火曝光研究的联合创始人以及对Covid-19的太平洋联盟的首席执行官。学术贡献:Juarez博士是一位经济学家,以将微观经济学,行为经济学和网络经济学与公共卫生计划融合在一起而闻名。自获得博士学位以来他于2008年获得赖斯大学的经济学专业,在《经济理论,游戏与经济行为杂志》和《美国公共卫生杂志》等期刊上广泛发表。社区参与和领导力:Juarez博士致力于增强社区健康,尤其是服务不足的人群。共同创建并共同导演了毛伊岛野火暴露研究,该研究涉及2023年毛伊岛野火的健康影响。他还共同建立了针对Covid-19的太平洋联盟,改善了夏威夷原生和太平洋岛民社区的健康结果和疫苗接种率。此外,他共同领导了早期糖尿病队列的夏威夷社会表观基因组学,以防止年轻人的糖尿病,并将UHero全州范围的迅速调查联合,研究了整个夏威夷健康的社会决定因素。在其他十几个基于社区的项目中。支持拉丁裔社区:作为非营利性西班牙裔商会的联合创始人和司库,华雷斯博士与其他
表观基因组学是研究整个基因组的表观遗传变化的学科,它对理解基因表达的控制及其对癌症生物学的影响大有裨益。表观遗传修饰,包括 DNA 甲基化、组蛋白修饰、染色质重塑和非编码 RNA 调控,与基因突变不同,会影响基因活性而不改变 DNA 序列。这些改变在控制基因表达方面起着关键作用,而基因表达会影响细胞功能,如生长、分化和死亡。表观遗传修饰在癌症中起着重要作用,它会导致基因表达失调,从而沉默肿瘤抑制基因,激活致癌基因,并加剧基因组不稳定。例如,肿瘤抑制基因(如 p16INK4a 和 BRCA1)启动子处 CpG 岛的高甲基化会导致这些基因的转录抑制。相反,整体低甲基化会激活致癌基因并导致染色体不稳定。组蛋白改变和染色质重塑也对基因表达和癌症的发展产生了重大影响。本文介绍了表征表观遗传变化(如 DNA 甲基化、组蛋白修饰、染色质可及性和非编码 RNA 相互作用)的方法。它强调了这些方法对于识别导致癌症发展和进展的表观遗传变化的重要性。通过解决治疗意义和 DNA 甲基化和组蛋白去乙酰化酶抑制剂等新疗法,本综述缩小了基本表观基因组变化与其在临床实践中的可能应用之间的差距。本研究旨在通过提供对表观基因组分析的全面了解来改善癌症检测、预后和治疗,为更加个性化和成功的治疗方法打开大门。