摘要癌症的分类已经在数千年中演变而成,几个世纪的工作为现代癌症分类奠定了基础,随着我们对癌症生物学的理解,随着技术,工具和框架的改进,这种分类的发展继续发展。本文通过整合单细胞转录组方法来探索癌症的分子复杂性和肿瘤内异质性(ITH),建立在癌症分类的历史遗产上。通过定义和分析三种侵袭性癌症类型的多种转录态(GB),三个阴性乳腺癌(TNBC)(TNBC)和弥漫性中线胶质瘤(DMG) - 这项工作可提供更精良和精确的透镜,从而使象征性的策略更加精确。使用高分辨率的单细胞RNA测序(SCRNA-SEQ),空间分辨的转录组学(SRT)和患者衍生的类器官模型,我们确定了塑造肿瘤进展,耐药性和患者结果的不同元图。从DMG开始,我们使用空间转录组学来映射肿瘤特异性表型,发现与肿瘤微环境相互作用的新型神经干细胞样种群。由关键祖细胞标记定义的这种表型表现出可塑性,可能导致DMG对治疗的抗性。通过研究DMG微环境中的非恶性细胞,我们提出特定的细胞类型支持肿瘤生长和进化,强调潜在的治疗干预措施。然后,我们将SCRNA-SEQ应用于GB,揭示了多个元图的存在,包括与茎状特性,侵袭和免疫逃避相关的元图。这些元图提供了有关GB细胞如何根据其微环境适应和进化的见解,从而发现了这种高度抗性癌症的潜在治疗靶标。在TNBC中,我们通过整合来自患者活检的单细胞数据库来开发全面的TNBC-MAP,从而确定了九个核心恶性元图。这些元图涵盖了生物学过程,例如免疫调节,上皮到间质转变(EMT)和血管生成模仿。通过将这些元图与患者存活相关联,我们确定了分子活性的不同模式,可以指导TNBC的更个性化和有效的治疗方法的发展。在这些研究中,我们评估了元数据分析剖析癌症异质性的能力,从而更深入地了解驱动肿瘤进展的功能状态。此知识可以识别患者特定的分子特征,为精确医学方法铺平了道路。本论文为基于元图的癌症诊断奠定了基础,并为未来的多摩尼克精度医学策略整合奠定了基础,该策略以特定的癌细胞状态为目标,最终改善了患者的结果。
ErbB 受体家族(包括 EGFR 和 HER2)在细胞生长和存活中起着至关重要的作用,并与乳腺癌和肺癌等各种癌症的进展有关。在本研究中,我们开发了一个深度学习模型,使用基于 SMILES 表示的分子指纹来预测 ErbB 抑制剂的结合亲和力。每种 ErbB 抑制剂的 SMILES 表示均来自 ChEMBL 数据库。我们首先从 SMILES 字符串生成 Morgan 指纹,并应用 AutoDock Vina 对接来计算结合亲和力值。根据结合亲和力过滤数据集后,我们训练了一个深度神经网络 (DNN) 模型来根据分子指纹预测结合亲和力值。该模型取得了显著的性能,训练集上的均方误差 (MSE) 为 0.2591,平均绝对误差 (MAE) 为 0.3658,R 平方 (R²) 值为 0.9389。尽管在测试集上性能略有下降(R² = 0.7731),但该模型仍然表现出强大的泛化能力。这些结果表明深度学习方法对于预测 ErbB 抑制剂的结合亲和力非常有效,为虚拟筛选和药物发现提供了宝贵的工具。
占澳大利亚葡萄酒生命周期期间生产的温室气体排放的74%的运输和玻璃包装,这些区域是改善该行业减少碳足迹的努力的明显目标。在我们的“ net net Zero”系列的第四篇也是最后一篇文章中,作者比较了不同包装选项的碳足迹以及其选择中涉及的技术考虑。
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“现在是美国建设的时候了。现在是释放被误导和过时的基础设施政策所扼杀的增长和机遇的时候了。回顾过去四年。拜登-哈里斯政府提出的让数百万美国人享受高速互联网服务的目标因大量繁文缛节和进步的政策议程而失败,这些议程不必要地推迟了新基础设施建设的承诺。
埃里克·努森的职业生涯一直致力于研究大脑如何处理信息、从经验中学习以及选择信息以引起注意。他早期的研究绘制了鸟类处理听觉空间信息和调节定向行为的神经通路。一项重大进展是他与加州理工学院的马克·科尼西 (Mark Konishi) 一起发现了仓鸮中脑听觉空间的地形图,该图是复杂的神经计算的结果。随后,他与斯坦福大学的同事展示了早期生活经历如何塑造创建此计算图的电路,确定了适应性可塑性的特定位置以及学习规则和机制,并发现了增加成年动物可塑性的方法。后来,他的研究转向控制选择性注意的机制。他与斯坦福大学的同事一起开发了量化鸟类空间注意力影响的行为范式,并建立了操纵前脑信号的方法,以类似注意力的方式调节感官信息。通过将计算方法与脑切片技术相结合,他展示了特定脑回路如何选择信息以进行认知决策,以及其他脑回路如何抑制分散注意力的信息。
肺癌是死亡率最高的恶性肿瘤,而肺腺癌(LUAD)占所有肺癌的40%(1)。在亚洲,表皮生长因子受体(EGFR)是LUAD最常见的驱动突变,发生率为55%(2-4),其中EGFR激活突变在全球占17.4%,在中国占37.3%(5)。表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂(EGFR-TKI)目前是EGFR突变LUAD患者的标准一线治疗方案(6)。尽管使用EGFR-TKI已为晚期EGFR突变型NSCLC患者带来显著的临床获益和前所未有的生存率提高(7-10),但不可避免地会产生获得性耐药。继发性EGFR突变,包括EGFR-T790M突变和EGFR结构域内的其他突变、MAPK、PI3K和细胞周期基因的突变以及EGFR或其他致癌基因如MET的扩增,导致LUAD细胞获得性EGFR-TKI耐药(11-13)。但有些患者在缺乏已知耐药机制的情况下获得了EGFR-TKI耐药。因此,内在性EGFR-TKI耐药是临床上的一个挑战。据报道,大约20%-30%的EGFR突变型LUAD对EGFR-TKI具有内在性耐药(14)。因此,如何克服这些获得性和内在性的EGFR-TKI耐药一直是临床关注的焦点。
我们已审查了您根据第 510(k) 条提交的上述器械上市前意向通知,并确定该器械与 1976 年 5 月 28 日(即《医疗器械修正案》颁布日期)之前在州际贸易中合法销售的同类器械或已根据《联邦食品、药品和化妆品法案》(法案)的规定重新分类且无需获得上市前批准申请 (PMA) 批准的器械基本相同(就附件中所述的使用指征而言)。因此,您可以根据法案的一般控制规定销售该器械。虽然这封信将您的产品称为器械,但请注意,一些已获准的产品可能是组合产品。位于 https://www.accessdata.fda.gov/scripts/cdrh/cfdocs/cfpmn/pmn.cfm 的 510(k) 上市前通知数据库可识别组合产品提交。该法案的一般控制条款包括年度注册、设备清单、良好生产规范、标签以及禁止贴错标签和掺假的要求。请注意:CDRH 不评估与合同责任担保相关的信息。但是,我们提醒您,设备标签必须真实,不得误导。