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大肠杆菌的
先前的工作归因于降低的脂多糖水平和脂质双层的暴露归因于降低的脂多糖水平。在此处介绍的Enva渗透性表型的详细表征中，Enval突变被证明可以赋予周质酶，-lactamase和RNaseI。在三种不同的遗传背景中观察到泄漏，包括原始的Enkal菌株及其母体。相反，未观察到细胞质酶i8-乳糖苷酶的可检测到可检测的泄漏。测试了Enkal菌株对先前未报告的一系列抗生素的敏感性，并确定了多种抗生素的亲脂性（分区系数）。根据对大型亲水性抗生素和溶菌酶的敏感性的观察结果，提议ENK突变体的渗透性表型的一部分是由于短暂的破裂和EDTA敏感性外膜的重新密封。在这方面，Enva渗透性表型属于大肠杆菌和鼠伤寒沙门氏菌的一般渗透性/渗漏突变体。
在Escherichia col
一种理论模型，该模型试图考虑到革兰氏阴性细菌中的周质 / - 乳糖确定的青霉素抗性水平（22）。The relevant parameters are the kinetic characteristics (Ki,m Vmax, and amount of enzyme produced) of the /)-lactamase, a perme- ability parameter (C) for the diffusion of the antibiotic across the outer membrane, and the concentration of the ,8-lactam antibiotic in the periplasmic space (Sp), specifically the concen- tration, SP, necessary for lethal inhibition内膜中的位点（一个或多个青霉素结合蛋白[17]）。使用这种方法Zimmermann和Rosselet（22）成功地解释了TEM，B-乳糖果酶（在这种情况下，由R Plasmid RTEM编码）赋予Escherichia coli K-12的Ampicilin抗性，以及该enzyme diseme concememe conceporance conceporance的无能为力。对于阴茎lin g，该方法失败了。作者考虑了这样的解释，即在微型抑制浓度（MIC）检测过程中，外膜的屏障功能发生了变化（22）。但是，他们对SP的估计也可能是错误的。此处报告的实验为模型提供了不同的测试。通过使用对几种底物的亲和力改变的突变Fi-内酰胺酶，我们避免了估算SP的必要性，而是比较了由突变体直接确定的青霉素耐药性与由野生型酶确定的抗性。
新型大肠杆菌毒素的合成——……
大肠杆菌是人体肠道正常菌群的一部分，具有重要功能；然而，某些菌株会导致宿主患病，损害肠道功能并对整体健康产生不利影响。大肠杆菌 B2 血清群中的 pks 基因簇编码大肠杆菌素，这是一种次级代谢物和潜在的肠道毒素。然而，大肠杆菌中大肠杆菌素产生的机制很复杂，pks 基因簇的功能尚未完全了解。本综述探讨了大肠杆菌中 pks 岛产生大肠杆菌素的复杂机制和过程，阐明了其中 clbA-S 基因所起的具体作用。并揭示了colibactin对宿主细胞DNA的毒性作用，阐述了可能在诱导结直肠癌发展中起重要作用的机制，如单碱基替换（SBS）、小插入/缺失（small indel）特征（ID-pks）、染色体间连锁（ICLs）、DNA双链断裂（DSBs），这些机制的阐明对相关药物的进一步探索和开发具有重要意义。
对抗大肠杆菌和沙门氏菌。
摘要 植物天生具有产生多种化学化合物的内在能力，这些化合物可以抵御细菌、真菌、昆虫和大型动物。人类从各种植物中获取这些化合物，并将其用作许多传染性和非传染性疾病的传统疗法。其中一种植物是罗望子 (Tamarind)，这是一种常见于非洲的热带树种。许多研究都提取了这种植物的植物化学物质，并证明其具有止泻、抗氧化、抗炎和抗菌作用。在本研究中，我们从罗望子叶中提取了植物化学物质，并测试了它们对大肠杆菌和沙门氏菌的抗菌活性。提取物的抗菌敏感性测试表明，在含有不同浓度提取物的琼脂孔周围存在大量抑制区，表明对测试生物具有阳性抗菌活性。这里获得的结果可能在鉴定和开发可用于治疗细菌感染的药物化合物方面发挥重要作用。关键词：抗菌活性；罗望子；叶提取物；罗望子 引言 在人类发展过程中，植物一直被用作草药，用于治疗多种传染性和非传染性疾病。它们具有多种植物化学物质作为次生代谢产物，可作为植物抵御多种微生物入侵的防御机制。这些植物部分提取物表现出的抗菌活性可能有助于发现新的抗菌化合物来源，这些化合物可能有助于药物开发和治疗由这些微生物引起的疾病。抗生素耐药性是发展中国家大部分地区医疗保健行业面临的主要挑战。多重耐药 (MDR) 菌株在发展中国家的出现和传播
大肠杆菌基因分型的新方法
摘要：目前迫切需要一种操作简便、快速且成本低廉的大肠杆菌菌株种级鉴别方法。本文提出了两种用于大肠杆菌分离株基因分型的新型原始工具。所开发的第一种方法是 PCR-RFLP（聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性）检测，它使用一个高度可变的 fliC 基因，该基因编码 H 抗原作为分子靶标。在设计通用引物对和选择最佳限制性酶 Rsa I 之前，先对编码 53 种不同血清型 H 抗原（大肠杆菌鞭毛蛋白）的基因序列进行计算机比较分析。在对 16 个大肠杆菌基因组的完整序列进行生物信息学分析的基础上，选择了 MLST 方法的大肠杆菌基因组的目标片段。最初提出了七个分子靶点（七对引物），其中五种被发现可用于有效进行大肠杆菌菌株基因分型。两种开发的方法都显示出很高的区分能力，并且观察到所测试菌株的高度遗传多样性。在测试的 71 个菌株中，用 fliC RFLP-PCR 和 MLST 方法分别发现了 29 个和 47 个簇。用参考 BOX-PCR 方法区分菌株发现了 31 种不同的基因型。计算机分析显示，新 MLST 方法的鉴别能力与 Pasteur 和 Achtman 方案相当，并且高于 Clermont 开发的方法的鉴别能力。从流行病学的角度来看，我们的调查结果显示，在大多数情况下，患者感染了独特的菌株，可能来自环境来源。然而，从儿科、内科和神经内科病房的不同患者身上分离出的一些菌株在综合考虑三种方法的结果时被归类为同一基因型。这可能表明这些菌株在患者之间转移了。
大肠杆菌终结者的智能设计
终端是位于基因3'末端的特定核苷酸序列，并包含转录终止信息。作为基本的遗传调节元件，终结子在基因回路的设计中起着至关重要的作用。准确表征终结器强度对于提高基因电路设计的精度至关重要。终结器强度的实验表征是耗时的和劳动的；因此，有必要开发能够准确预测终结器强度的计算工具。当前的预测方法未完全考虑与终止者有关的序列或热力学信息，而缺乏可靠的模型来准确预测。同时，深层生成模型在生物序列的设计中表现出巨大的潜力，并有望应用于终结序列设计。本研究的重点是大肠杆菌终结剂的智能设计，主要进行以下研究：（1）为大肠杆菌构建固有的终结器强度预测模型，这项研究提取了大肠杆菌固有末端的序列特征和热力学特征。基于选定功能的机器学习模型实现了R 2 = 0.72的预测性能。（2）本研究采用生成对抗网络（GAN）来从内在的终结器序列训练数据中学习并生成终结器序列。评估表明，生成的终结器表现出与内在终结器相似的数据分布，这证明了Gan生成的终止序列的可靠性。（3）本研究使用构造的终结器强度预测模型从生成的集合中筛选出强终端。实验验证表明，在18个选定的终结者中，有72％的终止效率大于90％，证实了大肠杆菌终结者的智能设计方法的可靠性。总的来说，这项研究构建了大肠杆菌的终结器强度预测模型和终结器生成模型，为基因电路中的终结器设计提供了模型支持。这增强了生物成分设计的模块化，并促进了合成生物学的发展。
应用于大肠杆菌核心代谢
摘要：基本通量模式（EFM）为系统地表征稳态，细胞表型以及代谢网络鲁棒性和脆弱性提供了严格的基础。但是，EFM的数量通常随代谢网络的大小而成倍增长，导致过度的计算需求，不幸的是，由于系统限制，这些EFM的很大一部分在生物学上是不可行的。这种组合爆炸通常阻止对基因组规模代谢模型的完整分析。传统上，EFM是通过Double Description方法计算的，这是一种基于矩阵计算的有效算法；但是，只能将少数几个约束集成到该计算中。他们必须对辅助的设定包含是单调的；否则，必须在后处理中对其进行处理，因此不能节省计算时间。我们提出ASPEFM，这是一种基于答案集编程（ASP）和线性编程（LP）的混合计算工具，允许在实施许多不同类型的约束时进行EFM的计算。我们将方法应用于包含226×10 6 EFM的大肠杆菌核心模型。在考虑转录和环境调节，热力学约束和资源使用方面的考虑时，解决方案空间被降低至可直接使用ASPEFM计算的1118 EFM。使用后处理和Pareto前部分析，可以将完全有氧厌氧的O大肠杆菌生长到O的2个完全有氧厌氧的O 2梯度上的大肠杆菌生长。
特刊大肠杆菌和动物
shiga毒素产生的大肠杆菌（STEC）感染导致疾病症状的无症状运输或发育，这可能会使次要后遗症衰弱。STEC感染已与消耗粪便污染的食物和水有关，尤其是在与受感染动物接触后的手到口水传播。农业食品链中的动物在STEC传播中起着重要作用，并且需要采取有效的控制措施，以防止农场分叉传播这些人类病原体。因此，几项研究旨在在动物宿主的背景下理解STEC生态，并利用洞察力来开发适当的控制和诊断措施。感染/疾病的动物模型也被用作人类疾病的替代物，以更好地了解STEC发病机理。本期特刊的目的是解决：i。动物-Stec相互作用； ii。STEC定植和/或致病性的动物模型； iii。动物中的控制和/或诊断； iv。替代动物模型研究文章，评论文章和与这些主题相关的简短沟通。
霍乱和产肠毒素大肠杆菌旅行者...
参考文献： DUKORAL® 产品专论 加拿大免疫指南 (CIG)：霍乱和产肠毒素大肠杆菌 (ETEC) 旅行者腹泻疫苗 加拿大政府 霍乱风险 CDC 黄皮书 旅行者腹泻、霍乱 CDC 旅行者健康 霍乱 CDC 霍乱 HealthLinkBC 旅行者腹泻和霍乱疫苗 MyHealthAlberta 旅行者腹泻 IAMAT 如何预防旅行者腹泻 TDN 旅行者腹泻 CIG：接种疫苗后的过敏反应和其他急性反应 CIG：怀孕和哺乳期免疫 SCPP 向父母/法定监护人披露未成年人的个人健康信息
构建大肠杆菌底盘以提高...
在基因设计的大肠杆菌中生产N连接的糖蛋白具有降低成本，简化生物程序和增强定制的显着潜力。然而，建造稳定和低成本的微生物细胞工厂，用于人性化的N-糖基化重组蛋白的有效产生仍然是一个巨大的挑战。In this study, we developed a glyco-engineered E. coli chassis to produce N -glycosylated proteins with the human-like glycan Gal- β -1,4-GlcNAc- β -1,3-Gal- β -1,3- GlcNAc-, containing the human glycoform Gal- β -1,4-GlcNAc- β -1,3-.我们最初的努力是用寡素胆汁含量pGLB和糖基转移酶LSGCDEF替换大肠杆菌XL1-蓝色菌株的基因组中的各种基因座，以构建大肠杆菌。此外，我们系统地优化了基因组中的启动子区域以调节转录水平。随后，利用带有靶蛋白的质粒，我们成功地获得了N-糖基化蛋白，其含量约为320 mg/L，其产量为100％四糖修饰。此外，我们使用含有质粒的质粒构建了代谢途径，该质粒含有靶蛋白的双表达盒和四糖底盘细胞中的CMP-Sialic酸合成，从而导致终端α-2,3- siAia llyag-65 miAia saimia saiia saimiA siaiia saimiA siaia saimia syaiia和65-My ly a f as 65 m s h 65 m s h 65 m s y 40％的功效糖蛋白会刺激。我们的发现铺平了进一步探索siAllated人类的n -like n-糖蛋白在插件大肠杆菌底盘中的含量中产生不同联系（α-2,3/α-2,6/α-2,8）的方式，为工业尺度生产奠定了基础。