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生产来自西班牙的大肠杆菌分离株
抗生素耐药性大肠杆菌是导致社区获得性和院内感染的主要病原体之一，发病率和死亡率较高 ( Hu et al., 2022 )。它们被认为是泌尿道感染 (UTI)、菌血症和腹腔内感染 (IAI) 的主要原因之一 ( Balasubramanian et al., 2023 )。大肠杆菌具有获得抗生素耐药基因 (ARG) 的能力，例如 bla CTX-M-15 超广谱 b -内酰胺酶 (ESBL)，并迅速在整个社区传播它们 ( Gonza ́ lez et al., 2020 )。与其他产碳青霉烯酶的肠杆菌（如肺炎克雷伯菌和阴沟肠杆菌复合体）相比，产碳青霉烯酶大肠杆菌 (CP-Eco) 在临床环境中分离的频率并不高，但尤其令人担忧。这是因为它们的患病率正在上升（Cañada-Garc ı ́ a 等人，2022 年），人们担心它们会以类似于 ESBLs 的方式在社区中传播碳青霉烯酶基因（Gonza ́ lez 等人，2020 年）。此外，这些分离株通常对其他几种抗生素具有耐药性，因此难以治疗相关感染（Boutzoukas 等人，2023 年）。所有主要的碳青霉烯酶家族均已在 CP-Eco 中检测到 (Grundmann 等人，2017 年)，此外还有多种对临床结果产生负面影响的毒力决定因素 (C ̌ urova ́ 等人，2020 年)。所有这些促使世界卫生组织宣布 CP-Eco 是一个关键的优先问题 (Tacconelli 等人，2018 年)。在全球范围内，抗生素耐药性大肠杆菌在中高收入国家医院内感染的发生率最高，每年造成 300 万至 2500 万人感染 (Balasubramanian 等人，2023 年)。在欧洲，2015 年 CP-Eco 引起的感染人数中位数为 2,619 人，死亡人数中位数为 141 人 (Cassini 等人，2019 年)。在西班牙，CP-Eco 的发病率已从 2013 年的孤立病例（ Oteo 等人，2015 年）发展到 2019 年在西班牙 10 个不同的省份中被发现（ Cañada-Garc ı ́ a 等人，2022 年）。
功能多样性对哥斯达黎加可可农林系统中生态系统服务的影响
结果：PCR和整个基因组分析证实了MCR-1基因在10个大肠杆菌分离株中的存在。colistin的最小抑制浓度范围为4 ug/ml至32 ug/ml。分解分析表明，存在多种耐药性决定因素，赋予β-内酰胺，氨基糖苷，甲氧苄胺，磺胺酰胺，四环素，四环素，喹诺酮类，氟烯甲苯甲酸和大乙二醇化的多种耐药性决定因素。杂交基因组组装表明MCR-1在INCI2质粒上携带。质粒复制子键入表明INCI2型质粒（n = 10）是这些菌株中最普遍的质粒，其次是Incfib（n = 8），Incfic（n = 7），Incfia（n = 6），INCFII（incfii（incfii（incfii）（4），INCQ1（n = 3），INCQ1（n = 3），INCI1（N = 1），IN = 1），IN = 1（n = 1），IN = 1（n = 1），IN = 1（n = 1），（n = 1），（n = 1），（n = 1），（n = 1），（n = 1）（n = 1），（n = 1）（n = 1），（n = 1）。Achtman MLST打字方案在MCR -1阳性大肠杆菌中揭示了STS的大量多样性。毒力芬德分析表明，存在范围为4到19的许多毒力因子。
大肠杆菌中磷脂生物合成的温度控制
增加饱和脂肪酸与磷脂的相对结合。因此，利用脂肪酸进行磷脂生物合成的步骤之一是温度控制的。在体内观察到的 3H-油酸和“C-棕榈酸混合物的温度效应可以通过使用这些脂肪酸的辅酶 A 衍生物的混合物将 a-甘油磷酸酰化为溶血磷脂和磷脂酸来在体外证实。在大肠杆菌提取物中，棕榈酰和油酰辅酶 A 的相对转酰速率随孵育温度而变化，其方式模拟体内观察到的温度控制。体外合成的磷脂酸在 d 位显示出油酸的显著富集，类似于体内合成的磷脂中观察到的位置特异性。
CRISPR/Cas 技术及其在大肠杆菌中的应用
大肠杆菌是生产生物燃料和大宗化学品（如乙醇、高级醇、脂肪酸、氨基酸、莽草酸衍生物、萜类化合物、聚酮化合物和聚合物前体（如 1,4-丁二醇））的最广泛使用的细胞工厂之一（Yang 等人，2021 年）。生产这些生化物质的代谢工程需要对细胞代谢进行大量调节以提高生产率。基因组编辑需要高效的工具来执行节省时间的顺序或多重操作。大肠杆菌有许多基因编辑工具，但它们都有特定的优点和缺点。使用双链 DNA（dsDNA）进行基因工程重组通常需要选择标记，这些标记应在下一步中被消除，以便进行后续修改（Datsenko 和 Wanner，2000 年；Sharan 等人，2009 年）。与双链DNA相比，单链DNA（ssDNA）介导的重组效率更高，并已进一步发展为可进行多重编辑的基因编辑工具，如多重自动基因组工程（MAGE）（Wang et al.，2009）和可追踪多重重组（TRMR）（Warner et al.，2010）。但这些方法不适用于没有选择标记的20bp以上的多个靶基因插入，通常需要强大的高通量筛选方法（Li et al.，2015）。近来发展的成簇的规律间隔的短回文重复序列（CRISPR）/CRISPR相关蛋白（Cas）系统被广泛应用于大肠杆菌的基因工程，极大地促进了其应用。成熟的 CRISPR RNA (crRNA) 和反式激活 crRNA (tracrRNA) 双链（或单个合成向导 RNA，sgRNA）或仅 crRNA 引导 Cas 核酸酶切割具有所需原型间隔区相邻基序 (PAM) 的靶 DNA 序列 (Jiang et al., 2013)。我们之前的文章 (Liu et al., 2020) 总结了不同类型的 CRISPR 系统的机制。CRISPR/Cas 系统持续切割靶位点，直到成功编辑或未编辑的细胞死亡，从而无需使用选择标记。
大肠杆菌中的 CRISPR-Cas：受 H-NS、LeuO 的调节……
CRISPR-Cas 适应性免疫系统存在于许多细菌和古细菌中，可保护细菌免受噬菌体和质粒等 DNA 入侵。这些系统的基因组成和基因组结构非常灵活和复杂。CRISPR-Cas 系统分为 2 类、6 种类型和 33 种亚型，尽管这个数字尚不确定，研究仍在进行中。所有 CRISPR-Cas 系统都经过了彻底研究，以便更好地了解 CRISPR 免疫机制，使其可用作基因组编辑和其他生物技术应用的工具。然而，CRISPR-Cas 系统的调控也非常复杂，目前仍未完全了解；它必须提供最佳保护，而不会给宿主带来有害后果。在本综述中，我们概述了大肠杆菌中 CRISPR-Cas 系统 1 类 IE 型的调控，重点介绍了温度在调节 CRISPR-Cas 活性中的作用，以及关键调节剂 H-NS 和 StpA 阻遏物与 LeuO 抗阻遏物在调节 cas 基因表达中的相互作用以及 HtpG 分子伴侣在维持 Cas3 功能水平中的相互作用。
大肠杆菌在癌症治疗中的创新策略
摘要背景和目标：基于大肠杆菌（大肠杆菌）的新癌症疗法最近引起了人们的重大兴趣。大肠杆菌，以治疗癌症的潜力。方法：进行了当前的系统综述，以收集有关基于大肠杆菌的癌症疗法的相关文献。当前的研究搜索了几个数据库进行临床前研究和早期临床试验。这些研究包括对用于癌症治疗的基因工程大肠杆菌的体内和体内评估。此外，当前的研究还评估了基于大肠杆菌的疗法与其他疗法结合治疗癌症的潜力，并使用了个性化方法。结果：经过精心审查13,064篇出版物后，包括301项研究以进行定量分析，包括44篇文章。活肿瘤的细菌有可能彻底改变癌症治疗剂。尽管与常规癌症治疗相关的挑战，但大肠杆菌提供了一种可以在肿瘤内积累和增加的替代策略。大肠杆菌可以通过基因操纵和合成生物工程来携带多种抗癌药，使其成为量身定制的治疗方法的理想载体。研究人员发现，它们可以用作单一疗法或联合疗法，并提供了多方面的解决方案，以增强临床结果。结论：得出结论，靶向肿瘤的细菌可能能够解决现有癌症治疗的局限性。1。正在进行多项大肠杆菌靶向肿瘤的临床试验，表明理论上的承诺已转化为实际应用。其抗肿瘤免疫反应，可编程性和诱导抗肿瘤免疫反应的能力的选择性表明了显着进步。尽管存在这些挑战，但持续的临床试验表明，将大肠杆菌纳入癌症治疗方案的方式存在明显的转变。需要更多的研究和开发来利用这些新的目标抗癌策略，以充分发挥其潜力。关键字：大肠杆菌，癌症疗法，系统评价，体内，体内资金：无。*这项工作已根据CC BY-NC-SA许可发布。版权所有©作者引用本文为：Ameli N，Shahriari A，Yousefi M，Alaghi A，Gorgestani O，Hatami B.大肠杆菌在癌症中的创新策略：系统评价。伊朗红月MED J.2024,20.1-13。 简介伊朗红月MED J.2024,20.1-13。简介
激活大肠杆菌中的无声糖酵解旁路
所有活生物体在其中央代谢中都有类似的反应，为所有19个基本构件和降低力量提供了前体。确定糖酵解20的替代代谢途径是否可以在大肠杆菌中运行，我们在硅设计，合理的工程和自适应21实验室进化中互补。首先，我们使用了一个基因组规模模型，并在该生物体的22个代谢网络中鉴定了两种潜在途径，取代了规范的Embden-Meyerhof-Parnas（EMP）糖酵解，将23个转化为有机酸的磷酸化。这些糖酵解路线之一是通过甲基乙二醇（通过丝氨酸生物合成和降解）进行的。然后，我们在大肠杆菌菌株中实施了两种途径25具有缺陷的EMP糖酵解。令人惊讶的是，通过甲基乙二醇的途径立即在26个三氧磷酸异构酶缺失菌株中培养在甘油上。相比之下，在磷酸甘油酸激酶27缺失菌株中，对于实现功能性28甲基甘氨酸途径的过表达是必要的。此外，我们设计了“丝氨酸分流”，该“丝氨酸分流”通过丝氨酸生物合成和降解转换为丙酮酸，绕过烯醇酶缺失。最后，为了探索30种这些替代方案中的哪些替代方法，我们使用烯醇酶缺失菌株进行了自适应实验室31进化研究。证明进化的突变体使用丝氨酸分流。32我们的研究揭示了代谢途径的灵活性重新定位，以建立新的代谢产物链接和重新连接33中央代谢。34
大肠杆菌和志贺氏菌的抗生素敏感性测试...
抗生素敏感性测试是一种测试细菌对抗生素反应的方法。这项研究旨在确定抗生素针对微生物活性的有效性。使用两种方法，即扩散方法和稀释方法进行灵敏度测试。使用纸盘（Kirby-bauer）对大肠杆菌和Shigella Sonnei细菌与阿莫西林，新霉素和磺酰胺抗生素进行扩散法进行了扩散法。所需的数据是抑制区的直径。结果表明，大肠杆菌对阿莫西林敏感，但对磺酰胺和新霉素有抵抗力。同时，Shigella Sonnei对阿莫西林，新霉素和磺胺酰胺具有抵抗力。此外，使用液体稀释法测试了稀释法以测试阿莫西林对大肠杆菌细菌的效力。所需的数据是带有液体培养基的测试管，没有显示浊度。结果表明，阿莫西林对大肠杆菌的最小抑制浓度为0.25％。基于使用扩散和稀释方法的抗生素敏感性测试的结果，可以得出结论，阿莫西林对大肠杆菌细菌具有很高的有效性，最小抑制浓度为0.25％，而志贺氏菌对抗生素的耐药性具有抗性。
大肠杆菌在癌症治疗中的创新策略
摘要背景和目标：基于大肠杆菌 (E. coli) 的新型癌症疗法最近引起了广泛关注。本研究研究了具有转基因大肠杆菌治疗癌症的潜力。方法：进行本系统综述以收集有关基于大肠杆菌的癌症疗法的相关文献。本研究搜索了多个数据库以查找临床前研究和早期临床试验。这些研究包括用于癌症治疗的转基因大肠杆菌的体外和体内评估。此外，本研究评估了基于大肠杆菌的疗法与其他疗法结合并使用个性化方法治疗癌症的潜力。结果：在仔细审查了 13,064 篇出版物后，经过筛选过程，纳入了 301 项研究进行定量分析，其中包括 44 篇文章。该综述表明，活的肿瘤靶向细菌有可能彻底改变癌症治疗。尽管传统癌症治疗面临挑战，但大肠杆菌提供了一种可以在肿瘤内积聚和增加的替代策略。大肠杆菌可通过基因操作和合成生物工程携带多种抗癌剂，使其成为定制治疗方法的理想载体。研究人员发现它们可用作单一疗法或联合疗法，为增强临床效果提供多方面的解决方案。多项针对肿瘤的大肠杆菌临床试验正在进行中，表明理论前景已转化为实际应用。结论：总而言之，活的靶向肿瘤细菌可能能够解决现有癌症治疗的局限性。其抗肿瘤免疫反应的选择性、可编程性和诱导抗肿瘤免疫反应的能力表明了显著的进步。尽管存在这些挑战，但正在进行的临床试验表明，大肠杆菌融入癌症治疗方案的方式发生了切实的转变。需要进行更多的研究和开发，以充分利用这些新的靶向抗癌策略。关键词：大肠杆菌、癌症治疗、系统评价、体外、体内资金：无。*本作品已根据 CC BY-NC-SA 许可发表。版权所有 © 作者 引用本文为：Ameli N、Shahriari A、Yousefi M、Alaghi A、Gorgestani O、Hatami B。大肠杆菌在癌症治疗中的创新策略：系统评价。伊朗红新月会医学杂志，2024，20.1-13。一、简介
在香蕉皮中的大肠杆菌生存...
评估了次氯酸钠对香蕉卫生的功效，并评估了从哥斯达黎加到美国的模拟出口运输过程中大肠杆菌对香蕉的生存。香蕉（Musa spp。，AAA组，Cavendish子组）被大肠杆菌ATCC 25922（7 log cfu/g）接种，然后将五分钟浸入次氯酸钠溶液中（0、50、50、100、100、150和200 ppm）在模拟的出口运输条件下（14±1°C；相对湿度为85–90％；聚集在聚乙烯袋和纸板箱中）的在模拟出口传输条件下（14±1°C； 85–90％的相对湿度）监测了在香蕉表面上的大肠杆菌群体。 大肠杆菌在储存的0、1、5、7、12和14天以35±2°C孵育24小时以0、1、5、7、12和14天的储存。试验一式三份进行。 次氯酸钠浓度为100 ppm或更高的大肠杆菌减少至少3型。 在100至200 ppm的消毒剂之间没有发现显着差异（P≥0.05）。 储存时间显着影响（p≤0.05）大肠杆菌种群。 大约3-log在模拟出口传输条件下（14±1°C； 85–90％的相对湿度）监测了在香蕉表面上的大肠杆菌群体。大肠杆菌在储存的0、1、5、7、12和14天以35±2°C孵育24小时以0、1、5、7、12和14天的储存。试验一式三份进行。次氯酸钠浓度为100 ppm或更高的大肠杆菌减少至少3型。在100至200 ppm的消毒剂之间没有发现显着差异（P≥0.05）。储存时间显着影响（p≤0.05）大肠杆菌种群。大约3-log