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Kauffman模型中关闭与开放式演变之间因果关系的证据
进化是一个以新颖性产生为标志的高度复杂的过程，这需要个人的历史和集体组织。在本文中，我们研究了生物组织与开放式进化（OEE）之间的关系，特别关注两者之间的因果关系。为了在化学系统中提供这种因果关系的定量证据，我们应用集装理论来评估自动催化集的出现如何影响Kauffman模型中的复杂性动态。在本文的第二部分中，我们通过分析最简单的自动催化设置对Kauffman模型中复杂性动力学的影响，特别是在没有参数相关性的情况下，加强了这种猜想。通过将自动催化集解释为化学系统中的组织结构，我们的发现为研究生物组织与OEE之间的因果关系提供了第一个数值支持。这项工作代表了对OEE与生物组织之间动态关系的初步研究的一个有希望的领域，并可能会促进其在理论生物学中的联系。
机器人体进化设计的新生物形态发生方法
我们提出了一些目前未使用的形态发生机制，从进化生物学和转移到进化机器人技术的指南中。（1）提供可突变性突变的DNA模式，通过亲属选择导致可转化的Bauplans的引导。（2）形态发生机制（I）表观遗传细胞系提供功能性细胞类型，并鉴定细胞下降。（ii）基于形态剂扩散的局部解剖坐标，促进了对机械力的复杂表型（III）重塑的可转化遗传参数化（III），促进了比基因组更复杂的良好整合表型的强劲产生。提出了一种方法，用于在进化机器人技术中处理突变性和形态发生机制。这些方法的目的是促进动物肌肉骨骼和皮肤系统的微妙，效率和效率的机器人机制的产生。
从进化的角度看分子伴侣介导的自噬
分子伴侣介导的自噬 (CMA) 是溶酶体蛋白水解的主要途径，被认为是控制多种细胞功能的关键因素，其缺陷与多种人类疾病有关。迄今为止，由于非四足动物缺乏可识别的溶酶体相关膜蛋白 2A (LAMP2A)，而 LAMP2A 是 CMA 的限制和必需蛋白，因此推测这种细胞功能仅限于哺乳动物和鸟类。然而，最近在几种鱼类中发现的表达序列与哺乳动物 LAMP2A 具有高度同源性，这挑战了这种观点，并表明 CMA 在进化过程中出现的时间可能比最初认为的要早。在本研究中，我们全面描述了脊椎动物中 LAMP2 基因的进化史，并证明 LAMP2 确实出现在脊椎动物谱系的根源中。利用青鳉 (Oryzias latipes) 的成纤维细胞系，我们进一步表明，剪接变体 lamp2a 在长期饥饿状态下控制着一种荧光报告基因在溶酶体中的积累，这种荧光报告基因通常用于追踪哺乳动物细胞中的 CMA。最后，为了阐明 Lamp2a 在鱼类中的生理作用，我们生成了该特定剪接变体的敲除青鳉，并发现这些缺陷鱼的碳水化合物和脂肪代谢发生了严重改变，这与肝脏中缺乏 CMA 的小鼠的现有数据一致。总之，我们的数据为鱼类中存在 CMA 样通路提供了第一个证据，并为使用互补遗传模型（如斑马鱼或青鳉）从进化角度研究 CMA 带来了新视角。
evorl：一个GPU加速框架，用于进化增强学习
进化增强学习（EVORL）已成为一种有前途的方法，可以通过将进化计算（EC）与RL整合（EC）范式来克服传统强化学习（RL）的局限性。但是，基于人群的EC的性质大大提高了计算成本，从而限制了大规模设置中算法设计选择和可扩展性的探索。为了应对这一挑战，我们介绍了Evorl 1，这是针对GPU加速的第一个端到端EVORL框架。该框架对加速器（包括环境模拟和EC过程）执行了整个培训管道，通过矢量化和编译技术利用层次并行性，以实现较高的速度和可扩展性。此设计可以在一台计算机上进行有效培训。In addition to its performance-oriented design, EvoRL offers a comprehensive platform for EvoRL research, encompassing implementations of traditional RL algorithms (e.g., A2C, PPO, DDPG, TD3, SAC), Evolutionary Algorithms (e.g., CMA-ES, OpenES, ARS), and hybrid EvoRL paradigms such as Evolutionary-guided RL （例如，ERL，CEM-RL）和基于群体的自动（例如PBT）。该框架的模块化体系结构和用户友好的接口使研究人员可以无缝整合新组件，自定义算法并进行公平的基准测试和消融研究。该项目是开源的，可在以下网址找到：https：//github.com/emi-group/evorl。
氢进化反应过渡态的偏差依赖性
摘要：氢进化反应（HER）是绿色能量转变的最突出的电催化反应之一。然而，跨材料和电解质pH的动力学以及高电流密度下的氢覆盖率仍然鲜为人知。在这里，我们研究了她在工业相关的酸性和碱性膜电极组件中的大量纳米颗粒催化剂上的动力学，这些催化剂仅由纯水加湿的气体运行。我们发现了铁三合会（Fe，Ni，Co），造币（AU，Cu，Ag）和铂类金属（IR，PT，PT，PD，RH）之间的不同动力学指纹。重要的是，所应用的偏差不仅改变了激活能（E A），还会改变指数前因子（a）。我们将这些变化解释为界面溶剂的熵变化，由于氢的覆盖率变化，酸和碱之间的差异和熵变化。最后，我们观察到阴离子可以诱导酸中造币金属的巴特勒 - 沃尔默行为。我们的结果为了解她的动力学提供了新的基础，更广泛地强调了迫切需要更新对电催化领域基本概念的共同理解。■简介
大流行霍乱在其全球来源的演变
。CC-BY 4.0国际许可证可永久提供。是作者/资助者，他已授予Medrxiv的许可证，以显示预印本（未经同行评审证明）预印版本的版权所有者此版本于2025年2月4日发布。 https://doi.org/10.1101/2025.02.03.25321585 doi：medrxiv preprint
利用 CRISPR/Cas9 揭示巨型潘多拉病毒的进化过程
HAL 是一个多学科开放存取档案库，用于存放和传播科学研究文献，无论这些文献是否已出版。这些文献可能来自法国或国外的教学和研究机构，也可能来自公共或私人研究中心。
矿物皮质受体的进化和心血管病理学中性别差异
回顾矿物皮质激素受体的演变（MR）有义务使我们有一个启发性和引人入胜的飞跃。这一旅程告诉我们，MRS与我们认为其自然配体醛固酮之间的关系并不总是独家的。MRS在海洋中工作了很长时间，无论如何，在水生环境中，由醛固酮以外的其他配体刺激，并且锻炼我们仍然不太了解的功能，但它们肯定与目前在陆生脊椎动物中进行的那些肯定有所不同。最初，MRS的历史与女性性激素的历史交织在一起，尤其是孕酮，孕激素是MRS的第一个激动剂之一，然后成为重要的对抗者陆地环境的过渡。这种最初的交织可能是造成性二态性的原因，当这些受体被过度刺激时，可以瞥见，因为从许多实验研究和某些临床数据中出现和/或研究这些受体的拮抗剂药物时。必须考虑到临床研究的规划，尤其是随机对照试验，其中两个性别的存在必须始终保持良好的平衡，并且在解释结果必须始终进行的解释中，必须充分意识到参与者的性别。这并不总是发生。
对强化学习进化的评论
摘要 - 强化学习（RL）已成为人工智能（AI）和自我足够结构的迅速发展的领域，彻底改变了机器分析和进行选择的方式。在过去的几年中，RL显着提高了更复杂的算法和方法，这些算法和方法解决了越来越复杂的实际世界问题。这一进展是通过使用计算能力的增强，大数据集的可用性以及改进机器获得策略的驱动来驱动的，可以使RL解决从机器人技术和自动驾驶系统到医疗保健和财务的广泛行业的挑战。RL的效果在优化不确定和动态环境中优化选择制定程序的能力方面显而易见。通过从与环境的互动中了解，RL代理可以做出最大化冗长的时间奖励，适应转换情况并随着时间的推移增强的决策。这种适应性使RL在传统方法短暂落后，尤其是在复杂的，过度的空间和安排后的言论中的情况下成为宝贵的工具。本评论旨在提供有关当前RL国家的根本信息，强调其跨学科贡献以及它如何塑造AI和自主技术的命运。它讨论了RL如何影响机器人技术，自然语言处理和娱乐的改进，同时探索其部署的道德和实践要求的情况。此外，它研究了众多领域的主要研究，这些研究促成了RL的发展。